Rapid Slow Off-Rate Modified Aptamer (SOMAmer)-Based Detection of C-Reactive Protein Using Isotachophoresis and an Ionic Spacer

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 13, 2015, Pages 6736-6743

  Eid, Charbel ^a   Palko, James W ^a   Katilius, Evaldas ^b   Santiago, Juan G ^a  

^a Stanford University   (United States)

^b SomaLogic Inc   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ASSAYS; BODY FLUIDS; ELECTROPHORESIS; PROTEINS; REACTION KINETICS;

C-REACTIVE PROTEINS; CLINICAL APPLICATION; ELECTROPHORETIC ASSAY; ISOTACHOPHORESIS; LIMIT OF DETECTION; PROTEIN COMPLEXES; PROTEIN DETECTION; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

CHEMICAL REACTIONS;

APTAMER; C REACTIVE PROTEIN; ION;

CHEMISTRY; ISOTACHOPHORESIS;

APTAMERS, NUCLEOTIDE; C-REACTIVE PROTEIN; IONS; ISOTACHOPHORESIS;

EID: 84936877712     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.5b00886     Document Type: Article

References (49)

1. Gold, L.; Walker, J. J.; Wilcox, S. K.; Williams, S. Nat. Biotechnol. 2012, 29, 543-549
2. Taguchi, A.; Hanash, S. M. Clin. Chem. 2013, 59, 119-126
3. Vidal, M.; Chan, D. W.; Gerstein, M.; Mann, M.; Omenn, G. S.; Tagle, D.; Sechi, S.; Workshop, P. Clin. Proteomics 2012, 9, 6
4. Anderson, N. L.; Anderson, N. G. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 845-867
5. Surinova, S.; Schiess, R.; Huttenhain, R.; Cerciello, F.; Wollscheid, B.; Aebersold, R. J. Proteome Res. 2011, 10, 5-16
6. Gerszten, R. E.; Carr, S. A.; Sabatine, M. Clin. Chem. 2010, 56, 194-201
7. Liotta, L. A.; Petricoin, E. F. Clin. Chem. 2010, 56, 1641-1642
8. Jayasena, S. D. Clin. Chem. 1999, 45, 1628-1650
9. Ellington, A. D.; Szostak, J. W. Nature 1990, 346, 818-822
10. Tuerk, C.; Gold, L. Science 1990, 249, 505-510
11. Gold, L.; Ayers, D.; Bertino, J.; Bock, C.; Bock, A.; Brody, E. N.; Carter, J.; Dalby, A. B.; Eaton, B. E.; Fitzwater, T.; Flather, D.; Forbes, A.; Foreman, T.; Fowler, C.; Gawande, B.; Goss, M.; Gunn, M.; Gupta, S.; Halladay, D.; Heil, J.; Heilig, J.; Hicke, B.; Husar, G.; Janjic, N.; Jarvis, T.; Jennings, S.; Katilius, E.; Keeney, T. R.; Kim, N.; Koch, T. H.; Kraemer, S.; Kroiss, L.; Le, N.; Levine, D.; Lindsey, W.; Lollo, B.; Mayfield, W.; Mehan, M.; Mehler, R.; Nelson, S. K.; Nelson, M.; Nieuwlandt, D.; Nikrad, M.; Ochsner, U.; Ostroff, R. M.; Otis, M.; Parker, T.; Pietrasiewicz, S.; Resnicow, D. I.; Rohloff, J.; Sanders, G.; Sattin, S.; Schneider, D.; Singer, B.; Stanton, M.; Sterkel, A.; Stewart, A.; Stratford, S.; Vaught, J. D.; Vrkljan, M.; Walker, J. J.; Watrobka, M.; Waugh, S.; Weiss, A.; Wilcox, S. K.; Wolfson, A.; Wolk, S. K.; Zhang, C.; Zichi, D. PLoS One 2010, 5, e15004
12. Rohloff, J. C.; Gelinas, A. D.; Jarvis, T. C.; Ochsner, U. A.; Schneider, D. J.; Gold, L.; Janjic, N. Mol. Ther.-Nucleic Acids 2014, 3, e201
13. German, I.; Buchanan, D. D.; Kennedy, R. T. Anal. Chem. 1998, 70, 4540-4545
14. Pavski, V.; Le, X. C. Anal. Chem. 2001, 73, 6070-6076
15. Zhao, Q.; Li, X. F.; Le, X. C. Anal. Chem. 2008, 80, 3915-3920
16. Wang, L.; Ma, W.; Chen, W.; Liu, L.; Ma, W.; Zhu, Y.; Xu, L.; Kuang, H.; Xu, C. Biosens. Bioelectron. 2011, 26, 3059-3062
17. Wang, J.; Zhang, Y.; Okamoto, Y.; Kaji, N.; Tokeshi, M.; Baba, Y. Analyst 2011, 136, 1142-1147
18. Cheow, L. F.; Han, J. Anal. Chem. 2011, 83, 7086-7093
19. Garcia-Schwarz, G.; Rogacs, A.; Bahga, S. S.; Santiago, J. G. J. Vis. Exp. 2012, e3890
20. Garcia-Schwarz, G.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2012, 84, 6366-6369
21. Garcia-Schwarz, G.; Santiago, J. G. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2013, 52, 11534-11537
22. Bahga, S. S.; Han, C. M.; Santiago, J. G. Analyst 2013, 138, 87-90
23. Han, C. M.; Katilius, E.; Santiago, J. G. Lab Chip 2014, 14, 2958-2967
24. Khnouf, R.; Goet, G.; Baier, T.; Hardt, S. Analyst 2014, 139, 4564-4571
25. Kawabata, T.; Wada, H. G.; Watanabe, M.; Satomura, S. Electrophoresis 2008, 29, 1399-1406
26. Kagebayashi, C.; Yamaguchi, I.; Akinaga, A.; Kitano, H.; Yokoyama, K.; Satomura, M.; Kurosawa, T.; Watanabe, M.; Kawabata, T.; Chang, W.; Li, C.; Bousse, L.; Wada, H. G.; Satomura, S. Anal. Biochem. 2009, 388, 306-311
27. Bercovici, M.; Kaigala, G. V.; Mach, K. E.; Han, C. M.; Liao, J. C.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2011, 83, 4110-4117
28. Khurana, T. K.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2008, 80, 6300-6307
29. Martin, A. J.; Everaerts, F. M. Anal. Chim. Acta 1967, 38, 233-237
30. Khurana, T. K.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2008, 80, 279-286
31. Chambers, R. D.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2009, 81, 3022-3028
32. Eid, C.; Garcia-Schwarz, G.; Santiago, J. G. Analyst 2013, 138, 3117-3120
33. Bercovici, M.; Han, C. M.; Liao, J. C.; Santiago, J. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 11127-11132
34. Martin, A. J. P.; Everaert, F. M. Proc. R. Soc. London, Ser. A 1970, 316, 493-514
35. Bercovici, M.; Kaigala, G. V.; Backhouse, C. J.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2010, 82, 1858-1866
36. Hellman, L. M.; Fried, M. G. Nat. Protoc. 2007, 2, 1849-1861
37. Ruscher, K.; Reuter, M.; Kupper, D.; Trendelenburg, G.; Dirnagl, U.; Meisel, A. J. Biotechnol. 2000, 78, 163-170
38. Kraemer, S.; Vaught, J. D.; Bock, C.; Gold, L.; Katilius, E.; Keeney, T. R.; Kim, N.; Saccomano, N. A.; Wilcox, S. K.; Zichi, D.; Sanders, G. M. PLoS One 2011, 6, e26332
39. Clyne, B.; Olshaker, J. S. J. Emerg. Med. 1999, 17, 1019-1025
40. Ridker, P. M.; Haughie, P. J. Invest. Med. 1998, 46, 391-395
41. de Beer, F. C.; Hind, C. R.; Fox, K. M.; Allan, R. M.; Maseri, A.; Pepys, M. B. Br. Heart J. 1982, 47, 239-243
42. Pepys, M. B.; Hirschfield, G. M. J. Clin. Invest. 2003, 111, 1805-1812
43. Lee, M. H.; Lee, D. H.; Jung, S. W.; Lee, K. N.; Park, Y. S.; Seong, W. K. Nanomedicine 2010, 6, 78-83
44. Potempa, L. A.; Maldonado, B. A.; Laurent, P.; Zemel, E. S.; Gewurz, H. Mol. Immunol. 1983, 20, 1165-1175
45. Krebs, H. A. Annu. Rev. Biochem. 1950, 19, 409-430
46. Psychogios, N.; Hau, D. D.; Peng, J.; Guo, A. C.; Mandal, R.; Bouatra, S.; Sinelnikov, I.; Krishnamurthy, R.; Eisner, R.; Gautam, B.; Young, N.; Xia, J.; Knox, C.; Dong, E.; Huang, P.; Hollander, Z.; Pedersen, T. L.; Smith, S. R.; Bamforth, F.; Greiner, R.; McManus, B.; Newman, J. W.; Goodfriend, T.; Wishart, D. S. PLoS One 2011, 6, e16957
47. Travis, J.; Pannell, R. Clin. Chim. Acta 1973, 49, 49-52
48. Steel, L. F.; Trotter, M. G.; Nakajima, P. B.; Mattu, T. S.; Gonye, G.; Block, T. Mol. Cell. Proteomics 2003, 2, 262-270
49. Stellwagen, N. C.; Gelfi, C.; Righetti, P. G. Biopolymers 1997, 42, 687-703