13C NMR metabolomics: INADEQUATE network analysis

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 11, 2015, Pages 5698-5706

  Clendinen, Chaevien S ^a   Pasquel, Christian ^b   Ajredini, Ramadan ^a   Edison, Arthur S ^a  

^a UNIVERSITY OF FLORIDA   (United States)

^b Wolfram Research South America   (Peru)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHEMICAL ANALYSIS;

BIOLOGICALLY RELEVANT MOLECULES; CAENORHABDITIS ELEGANS; INADEQUATE DATA; INCREDIBLE NATURAL ABUNDANCE DOUBLE-QUANTUM TRANSFER EXPERIMENT; ISOTOPICALLY LABELED; LOW SENSITIVITY; NATURAL PRODUCTS; STRUCTURAL ELUCIDATION;

CHEMISTRY;

CARBON;

ANIMAL; CAENORHABDITIS ELEGANS; METABOLISM; METABOLOMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PROCEDURES;

ANIMALS; CAENORHABDITIS ELEGANS; CARBON ISOTOPES; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; METABOLOMICS;

EID: 84930677259     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.5b00867     Document Type: Article

References (33)

1. Choi, Y. H.; Kim, H. K.; Hazekamp, A.; Erkelens, C.; Lefeber, A. W. M.; Verpoorte, R. J. Nat. Prod. 2004, 67, 953
2. Cloarec, O.; Dumas, M. E.; Craig, A.; Barton, R. H.; Trygg, J.; Hudson, J.; Blancher, C.; Gauguier, D.; Lindon, J. C.; Holmes, E.; Nicholson, J. Anal. Chem. 2005, 77, 1282
3. Weljie, A. M.; Newton, J.; Mercier, P.; Carlson, E.; Slupsky, C. M. Anal. Chem. 2006, 78, 4430
4. Clendinen, C. S.; Lee-McMullen, B.; Williams, C. M.; Stupp, G. S.; Vandenborne, K.; Hahn, D. A.; Walter, G. A.; Edison, A. S. Anal. Chem. 2014, 86, 9242
5. Bingol, K.; Zhang, F.; Bruschweiler-Li, L.; Bruschweiler, R. Anal. Chem. 2012, 84, 9395
6. Bax, A.; Freeman, R.; Frenkiel, T. A. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 2102
7. Sørensen, O. W.; Freeman, R.; Frenkiel, T.; Mareci, T. H.; Schuck, R. J. Magn. Reson. (1969-1992) 1982, 46, 180
8. Buddrus, J.; Bauer, H. Angew. Chem., Int. Ed. 1987, 26, 625
9. Oh, B. H.; Westler, W. M.; Darba, P.; Markley, J. L. Science 1988, 240, 908
10. Takeuchi, K.; Sun, Z.-Y. J.; Wagner, G. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 17210
11. Sumner, S. C. J. Toxicol. Sci. 2003, 75, 260
12. Garner, C. E.; Sumner, S. C. J.; Davis, J. G.; Burgess, J. P.; Yueh, Y.; Demeter, J.; Zhan, Q.; Valentine, J.; Jeffcoat, A. R.; Burka, L. T. Toxicol. Appl. Pharmacol. 2006, 215, 23
13. Fennell, T. R. Toxicol. Sci. 2006, 93, 256
14. Sumner, S. C. J.; Stedman, D. B.; Clarke, D. O.; Welsch, F.; Fennell, T. R. Chem. Res. Toxicol. 1992, 5, 553
15. Ramaswamy, V.; Hooker, J. W.; Withers, R. S.; Nast, R. E.; Brey, W. W.; Edison, A. S. J. Magn. Reson. 2013, 235C, 58
16. Robinette, S. L.; Ajredini, R.; Rasheed, H.; Zeinomar, A.; Schroeder, F. C.; Dossey, A. T.; Edison, A. S. Anal. Chem. 2011, 83, 1649
17. Ulrich, E. L.; Akutsu, H.; Doreleijers, J. F.; Harano, Y.; Ioannidis, Y. E.; Lin, J.; Livny, M.; Mading, S.; Maziuk, D.; Miller, Z.; Nakatani, E.; Schulte, C. F.; Tolmie, D. E.; Kent Wenger, R.; Yao, H.; Markley, J. L. Nucleic Acids Res. 2008, 36, D402
18. Markley, J. L.; Ulrich, E. L.; Berman, H. M.; Henrick, K.; Nakamura, H.; Akutsu, H. J. Biomol. NMR 2008, 40, 153
19. Stupp, G. S.; Clendinen, C. S.; Ajredini, R.; Szewc, M. A.; Garrett, T.; Menger, R. F.; Yost, R. A.; Beecher, C.; Edison, A. S. Anal. Chem. 2013, 85, 11858
20. Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pfeifer, J.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1995, 6, 277
21. Dieterle, F.; Ross, A.; Schlotterbeck, G.; Senn, H. Anal. Chem. 2006, 78, 4281
22. Wolfram Research, Inc. Mathematica; Wolfram Research, Inc.: Champaign, IL, 2012.
23. Bain, A. D.; Hughes, D. W.; Anand, C. K.; Nie, Z.; Robertson, V. J. Magn. Reson. Chem. 2010, 48, 630
24. Ramaswamy, V.; Hooker, J. W.; Withers, R. S.; Nast, R. E.; Edison, A. S.; Brey, W. W. eMagRes 2013, 2, 215
25. Kaplan, F.; Badri, D. V.; Zachariah, C.; Ajredini, R.; Sandoval, F. J.; Roje, S.; Levine, L. H.; Zhang, F.; Robinette, S. L.; Alborn, H. T.; Zhao, W.; Stadler, M.; Nimalendran, R.; Dossey, A. T.; Bruschweiler, R.; Vivanco, J. M.; Edison, A. S. J. Chem. Ecol. 2009, 35, 878
26. Mejía, R.; Gómez-Eichelmann, M. C.; Fernández, M. Biochem. Mol. Biol. Int. 1999, 47, 835
27. álvarez-Ordóñez, A.; Fernández, A.; López, M.; Arenas, R.; Bernardo, A. Int. J. Food Microbiol. 2008, 123, 212
28. Mills, E.; ONeill, L. Trends Cell Biol. 2014, 24, 313
29. McGettrick, A. F.; ONeill, L. A. J. J. Biol. Chem. 2013, 288, 22893
30. Limonciel, A.; Aschauer, L.; Wilmes, A.; Prajczer, S. Toxicol. In Vitro 2011, 25, 1855
31. An, Y. J.; Xu, W. J.; Jin, X.; Wen, H.; Kim, H.; Lee, J.; Park, S. ACS Chem. Biol. 2012, 7, 2012
32. Robinette, S. L.; Bruschweiler, R.; Schroeder, F. C.; Edison, A. S. Acc. Chem. Res. 2012, 45, 288
33. Wang, B.; Dossey, A. T.; Walse, S. S.; Edison, A. S.; Merz, K. M. J. J. Nat. Prod. 2009, 72, 709