Porphyrin-Encapsulated Metal-Organic Frameworks as Mimetic Catalysts for Electrochemical DNA Sensing via Allosteric Switch of Hairpin DNA

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 7, 2015, Pages 3957-3963

  Ling, Pinghua ^a   Lei, Jianping ^a   Zhang, Lei ^a   Ju, Huangxian ^a  

^a NANJING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOCHEMISTRY; CHLORINE COMPOUNDS; CRYSTALLINE MATERIALS; ELECTROCHEMICAL SENSORS; ELECTRODES; JAVA PROGRAMMING LANGUAGE; ORGANIC POLYMERS; ORGANOMETALLICS; PORPHYRINS; PROBES; PROTEINS; SIGNAL DETECTION; SIGNAL TRANSDUCTION;

ELECTROCHEMICAL BIOSENSING; ELECTROCHEMICAL SIGNALS; ELECTRODE SURFACES; METAL ORGANIC FRAMEWORK; O- PHENYLENEDIAMINE; RECOGNITION ELEMENT; SIGNAL READOUTS; SPECIFIC RECOGNITION;

DNA;

COPPER; DNA; FERROUS ION; ORGANOMETALLIC COMPOUND; PORPHYRIN;

ALLOSTERISM; CATALYSIS; CHEMISTRY; ELECTROCHEMICAL ANALYSIS; METABOLISM; SYNTHESIS;

ALLOSTERIC REGULATION; CATALYSIS; COPPER; DNA; ELECTROCHEMICAL TECHNIQUES; FERROUS COMPOUNDS; ORGANOMETALLIC COMPOUNDS; PORPHYRINS;

EID: 84926668366     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.5b00001     Document Type: Article

References (68)

1. Li, H.; Eddaoudi, M.; O'Keeffe, M.; Yaghi, O. M. Nature 1999, 402, 276 - 279
2. Dinca, M.; Long, J. R. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 6766 - 6779
3. Rosi, N. L.; Kim, J.; Eddaoudi, M.; Chen, B. L.; O'Keeffe, M.; Yaghi, O. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1504 - 1518
4. Lee, J.; Farha, O. K.; Roberts, J.; Scheidt, K. A.; Nguyen, S. T.; Hupp, J. T. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 1450 - 1459
5. Wang, Z. Q.; Cohen, S. M. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 1315 - 1329
6. Kitagawa, S.; Kitaura, R.; Noro, S. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 2334 - 2375
7. Robson, R. Dalton Trans. 2008, 38, 5113 - 5131
8. Kathryn, M. L.; Pashow, T.; Rocca, J. D.; Xie, Z. G.; Tran, S.; Lin, W. B. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 14261 - 14263
9. Horcajada, P.; Chalati, T.; Serre, C.; Gillet, B.; Sebrie, C.; Baati, T.; Eubank, J. F.; Heurtaux, D.; Clayette, P.; Kreuz, C. Nat. Mater. 2010, 9, 172 - 178
10. He, C. B.; Lu, K. D.; Lin, W. B. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 12253 - 12256
11. Dinca, M.; Long, J. R. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 6766 - 6779
12. Rieter, W. J.; Pott, K. M.; Taylor, K. M.; Lin, W. B. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11584 - 11585
13. He, C. B.; Lu, K. D.; Lin, W. B. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 5181 - 5184
14. Rowe, M. D.; Thamm, D. H.; Kraft, S. L.; Boyes, S. G. Biomacromolecules 2009, 10, 983 - 993
15. Huxford, R. C.; Della, R. J.; Lin, W. B. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 262 - 268
16. Liu, D. M.; Huxford, R. C.; Lin, W. B. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 3696 - 3700
17. Moulton, B.; Zaworotko, M. J. Chem. Rev. 2001, 101, 1629 - 1658
18. Yaghi, O. M.; O'Keeffe, M.; Ockwig, N. W.; Chae, H. K.; Eddaoudi, M.; Kim, J. Nature 2003, 423, 705 - 714
19. Perry, J. J., IV; Perman, J. A.; Zaworotko, M. J. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 1400 - 1417
20. O'Keeffe, M.; Yaghi, O. M. Chem. Rev. 2012, 112, 675 - 702
21. Larsen, R. W.; Wojtas, L.; Perman, J.; Musselman, R. L.; Zaworotko, M. J.; Vetromile, C. M. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 10356 - 10359
22. Kreno, L. E.; Leong, K.; Farha, O. K.; Allendorf, M.; Van Duyne, R. P.; Hupp, J. T. Chem. Rev. 2012, 112, 1105 - 1125
23. Sun, F.; Yin, Z.; Wang, Q. Q.; Sun, D.; Zeng, M. H.; Kurmoo, M. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 4538 - 4543
24. Morris, W.; Briley, W. E.; Auyeung, E.; Cabezas, M. D.; Mirkin, C. A. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 7261 - 7264
25. Das, M. C.; Xiang, S. C.; Zhang, Z. J.; Chen, B. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 10510 - 10520
26. Zhu, C. F.; Yuan, G. Z.; Chen, X.; Yang, Z. W.; Cui, Y. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 8058 - 8061
27. Lei, J. P.; Qian, R. C.; Ling, P. H.; Cui, L.; Ju, H. X. Trends Anal. Chem. 2014, 58, 71 - 78
28. Qi, X. L.; Liu, S. Y.; Lin, R. B.; Liao, P. Q.; Ye, J. W.; Lai, Z. H.; Guan, Y. Y.; Cheng, X. N.; Zhang, J. P.; Chen, X. M. Chem. Commun. 2013, 49, 6864 - 6866
29. Lee, J. H.; Jaworski, J.; Jung, J. H. Nanoscale 2013, 5, 8533 - 8540
30. Beletskaya, I.; Tyurin, V. S.; Tsivadze, A. Y.; Guilard, R.; Stern, C. Chem. Rev. 2009, 109, 1659 - 1713
31. Collman, J. P.; Zhang, X. M.; Lee, V. J.; Uffelman, E. S.; Brauman, J. I. Science 1993, 261, 1404 - 1411
32. Guo, C. C.; Song, J. X.; Chen, X. B.; Jiang, G. F. J. Mol. Catal. A: Chem. 2000, 157, 31 - 40
33. Bell, S. E. J.; Hester, R. E.; Hill, J. N.; Shawcross, D. R.; Smith, J. R. L. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1990, 86, 4017 - 4023
34. Sacco, H. C.; Iamamoto, Y.; Lindsay Smith, J. R. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2001, 2, 181 - 190
35. Vinhado, F. S.; Prado-Manso, C. M. C.; Sacco, H. C.; Iamamoto, Y. J. Mol. Catal. A 2001, 174, 279 - 288
36. Li, Z.; Xia, C. G.; Zhang, X. M. J. Mol. Catal. A 2002, 185, 47 - 56
37. Battioni, P.; Cardin, E.; Louloudi, M.; Schöllhorn, B.; Spyroulias, G. A.; Mansuy, D.; Traylor, T. G. Chem. Commun. 1996, 2037 - 2038
38. Holland, B. T.; Walkup, C.; Stein, A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 4301 - 4309
39. Nestler, O.; Severin, K. Org. Lett. 2001, 3, 3907 - 3909
40. Suslick, K. S.; Bhyrappa, P.; Chou, J. H.; Kosal, M. E.; Nakagaki, S.; Smithenry, D. W.; Wilson, S. R. Acc. Chem. Res. 2005, 38, 283 - 291
41. Goldberg, I. Chem. Commun. 2005, 1243 - 1254
42. Farha, O. K.; Shultz, A. M.; Sarjeant, A. A.; Nguyen, S. T.; Hupp, J. T. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 5652 - 5655
43. Burnett, B. J.; Barron, P. M.; Hu, C.; Choe, W. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 9984 - 9987
44. Zou, C.; Zhang, Z.; Xu, X.; Gong, Q.; Li, J.; Wu, C. D. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 87 - 90
45. Feng, D. W.; Gu, Z. Y.; Li, J. R.; Jiang, H. L.; Wei, Z. W.; Zhou, H. C. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 10307 - 10310
46. Modak, A.; Nandi, M.; Mondal, J.; Bhaumik, A. Chem. Commun. 2012, 48, 248 - 250
47. Sun, C. Y.; Liu, S. X.; Liang, D. D.; Shao, K. Z.; Ren, Y. H.; Su, Z. M. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1883 - 1888
48. Zhang, Z. J.; Zhang, L. P.; Wojtas, L.; Nugent, P.; Eddaoudi, M.; Zaworotko, M. J. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 924 - 927
49. Zhang, Z. J.; Zhang, L. P.; Wojtas, L.; Eddaoudi, M.; Zaworotko, M. J. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 928 - 933
50. Fan, C. H.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 9134 - 9137
51. Farjami, E.; Clima, L.; Gothelf, K.; Ferapontova, E. E. Anal. Chem. 2011, 83, 1594 - 1602
52. Xiao, Y.; Qu, X. G.; Plaxco, W. K.; Heeger, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 11896 - 11897
53. Wang, Q.; Yang, L. J.; Yang, X. H.; Wang, K. M.; He, L. L.; Zhu, J. Q.; Su, T. Y. Chem. Commun. 2012, 48, 2982 - 2984
54. Shen, Z. L.; Nakayama, S.; Semancik, S.; Sintim, H. O. Chem. Commun. 2012, 48, 7580 - 7582
55. Hu, Y. H.; Xu, X. Q.; Liu, Q. H.; Wang, L.; Lin, Z. Y.; Chen, G. N. Anal. Chem. 2014, 86, 8785 - 8790
56. Liu, Y. T.; Lei, J. P.; Huang, Y.; Ju, H. X. Anal. Chem. 2014, 86, 8735 - 8741
57. Zheng, J.; Li, J. S.; Jiang, Y.; Jin, J. Y.; Wang, K. M.; Yang, R. H.; Tan, W. H. Anal. Chem. 2011, 83, 6586 - 6592
58. Song, Y. L.; Cui, L.; Wu, J.; Zhang, W. T.; Zhang, W. Y.; Kang, H. Z.; Yang, C. J. Chem.-Eur. J. 2011, 17, 9042 - 9046
59. Wang, Q. B.; Lei, J. P.; Deng, S. Y.; Zhang, L.; Ju, H. X. Chem. Commun. 2013, 49, 916 - 918
60. Chui, S. S. Y.; Lo, S. M. F.; Charmant, J. P. H.; Orpen, A. G.; Williams, I. D. Science 1999, 283, 1148 - 1150
61. Mao, J. J.; Yang, L. F.; Yu, P.; Wei, X. W.; Mao, L. Q. Electrochem. Commun. 2012, 19, 29 - 31
62. Feng, D. W.; Chung, W. C.; Wei, Z. W.; Gu, Z. Y.; Jiang, H. L.; Chen, Y. P.; Darensbourg, D. J.; Zhou, H. C. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 17105 - 17110
63. Larsen, R. W.; Miksovska, J.; Musselman, R. L.; Wojtas, L. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 11519 - 11524
64. Zhang, Y. F.; Bo, X. J.; Luhana, C.; Wang, H. A.; Li, M. A.; Guo, L. P. Chem. Commun. 2013, 49, 6885 - 6887
65. Gao, L. Z.; Zhuang, J.; Nie, L.; Zhang, J. B.; Zhang, Y.; Gu, N.; Wang, T. H.; Feng, J.; Yang, D. L.; Perrett, S.; Yan, X. Y. Nat. Nanotechnol. 2007, 2, 577 - 583
66. Cui, H. F.; Cheng, L.; Zhang, J.; Liu, R. H.; Zhang, C.; Fan, H. Biosens. Bioelectron. 2014, 56, 124 - 128
67. Kwon, S. J.; Bard, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 10777 - 10779
68. Yang, Y. C.; Li, C.; Yin, L.; Liu, M. Y.; Wang, Z. X.; Shu, Y. Q.; Li, G. X. ACS Appl. Mater. Interfaces 2014, 6, 7579 - 7584