Analytic gradient for density functional theory based on the fragment molecular orbital method

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 10, Issue 12, 2014, Pages 5297-5307

  Brorsen, Kurt R ^a   Zahariev, Federico ^a   Nakata, Hiroya ^b,c,d   Fedorov, Dmitri G ^e   Gordon, Mark S ^a  

^a IOWA STATE UNIVERSITY   (United States)

^b TOKYO INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (Japan)

^c RIKEN   (Japan)

^d JAPAN SOCIETY FOR THE PROMOTION OF SCIENCE   (Japan)

^e NATIONAL INSTITUTE OF ADVANCED INDUSTRIAL SCIENCE AND TECHNOLOGY AIST   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84916631121     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct500808p     Document Type: Article

References (50)

1. Kitaura, K.; Ikeo, E.; Asada, T.; Nakano, T.; Uebayasi, M. Chem. Phys. Lett. 1999, 313, 701-706.
2. Gordon, M. S.; Fedorov, D. G.; Pruitt, S. R.; Slipchenko, L. V. Chem. Rev. 2012, 112, 632-672.
3. Otto, P.; Ladik, J. Chem. Phys. 1975, 8, 192-200.
4. Yang, W. Phys. Rev. Lett. 1991, 66, 1438.
5. Gao, J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 657-663.
6. Kobayashi, M.; Nakai, H. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012 , 14, 7629-7639.
7. Aoki, Y.; Gu, F. L. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 7640-7668.
8. Kurbanov, E. K.; Leverentz, H. R.; Truhlar, D. G.; Amin, E. A. J. Chem. Theory Comput. 2012 , 8, 1-5.
9. Yeole, S. D.; Gadre, S. R. J. Chem. Phys. 2010, 132, 094102.
10. Jacob, C. R.; Visscher, L. J. Chem. Phys. 2008, 128 , 155102.
11. Hua, S.; Hua, W.; Li, S. J. Phys. Chem. A 2010, 114, 8126-8134.
12. Goedecker, S.; Scuseria, G. E. Comput. Sci. Eng. 2003, 5, 14-21.
13. Sawada, T.; Fedorov, D. G.; Kitaura, K. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 16862-16872.
14. Alexeev, Y.; P Mazanetz, M.; Ichihara, O.; Fedorov, D. G. Curr. Top. Med. Chem. 2012 , 12, 2013-2033.
15. Watanabe, T.; Inadomi, Y.; Fukuzawa, K.; Nakano, T.; Tanaka, S.; Nilsson, L.; Nagashima, U. J. Phys. Chem. B 2007 , 111, 9621-9627.
16. Carlson, P. J.; Bose, S.; Armstrong, D. W.; Hawkins, T.; Gordon, M. S.; Petrich, J. W. J. Phys. Chem. B 2011, 116, 503-512.
17. Avramov, P. V.; Fedorov, D. G.; Sorokin, P. B.; Sakai, S.; Entani, S.; Ohtomo, M.; Naramoto, H. J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 2003-2008.
18. Sugiki, S. I.; Kurita, N.; Sengoku, Y.; Sekino, H. Chem. Phys. Lett. 2003, 382, 611-617.
19. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2004, 389, 129-134.
20. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 6904-6914.
21. Fedorov, D. G.; Nagata, T.; Kitaura, K. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 7562-7577.
22. Tanaka, S.; Mochizuki, Y.; Komeiji, Y.; Okiyama, Y.; Fukuzaw, K. Phys. Chem. Chem. Phys. 2014, 16, 10310-10344.
23. Fedorov, D. G., Kitaura, K., Eds. The Fragment Molecular Orbital Method: Practical Applications to Large Molecular Systems ; CRC Press: Boca Raton, FL, 2009.
24. Kitaura, K.; Sugiki, S. I.; Nakano, T.; Komeiji, Y.; Uebayasi, M. Chem. Phys. Lett. 2001 , 336, 163-170.
25. Nagata, T.; Brorsen, K.; Fedorov, D. G.; Kitaura, K.; Gordon, M. S. J. Chem. Phys. 2011, 134, 124115.
26. Nagata, T.; Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2009, 475, 124-131.
27. Nagata, T.; Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2010, 492, 302-308.
28. Komeiji, Y.; Nakano, T.; Fukuzawa, K.; Ueno, Y.; Inadomi, Y.; Nemoto, T.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2003, 372, 342-347.
29. Komeiji, Y.; Mochizuki, Y.; Nakano, T.; Fedorov, D. G. J. Mol. Struct. THEOCHEM 2009, 898, 2-7.
30. Brorsen, K. R.; Minezawa, N.; Xu, F.; Windus, T. L.; Gordon, M. S. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 5008-5012.
31. Yamaguchi, Y.; Schaefer, H. F., III; Osamura, Y.; Goddard, J. A New Dimension to Quantum Chemistry: Analytical Derivative Methods in Ab Initio Molecular Electronic Structure Theory ; Oxford University Press: New York, 1994.
32. Handy, N. C.; Schaefer, H. F., III. J. Chem. Phys. 1984, 81, 5031-5033.
33. Ochsenfeld, C.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 1997 , 270, 399-405.
34. Nakata, H.; Fedorov, D. G.; Nagata, T.; Yokojima, S.; Ogata, K.; Kitaura, K.; Nakamura, S. J. Chem. Phys. 2012, 137, 044110.
35. Nagata, T.; Fedorov, D. G.; Ishimura, K.; Kitaura, K. J. Chem. Phys. 2011, 135, 044110.
36. Nagata, T.; Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2012, 544, 87-93.
37. Nakata, H.; Fedorov, D. G.; Yokojima, S.; Kitaura, K.; Nakamura, S. Theor. Chem. Acc. 2014, 133, 1-14.
38. Nagata, T.; Fedorov, D. G.; Li, H.; Kitaura, K. J. Chem. Phys. 2012 , 136, 204112.
39. Nagata, T.; Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Theor. Chem. Acc. 2012, 131, 1-15.
40. Nakata, H.; Fedorov, D. G.; Nagata, T.; Yokojima, S.; Ogata, K.; Kitaura, K.; Nakamura, S. J. Chem. Phys. 2012, 137, 044110.
41. Furche, F.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 2002, 117, 7433-7447.
42. Nagata, T.; Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2010, 492, 302-308.
43. Nakano, T.; Kaminuma, T.; Sato, T.; Fukuzawa, K.; Akiyama, Y.; Uebayasi, M.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2002, 351, 475-480.
44. Johnson, B. G.; Gill, P. M.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5612-5626.
45. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S.; et al. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347-1363.
46. Fedorov, D. G.; Olson, R. M.; Kitaura, K.; Gordon, M. S.; Koseki, S. J. Comput. Chem. 2004, 25, 872.
47. Fedorov, D. G.; Ishida, T.; Kitaura, K. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2638-2646.
48. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 6832-6840.
49. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2014, 597, 99-105.
50. Pruitt, S. R.; Steinmann, C.; Jensen, J. H.; Gordon, M. S. J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 2235-2249.