Graphene fluorescence switch-based cooperative amplification: A sensitive and accurate method to detection MicroRNA

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 11, 2014, Pages 5487-5493

  Liu, Haiyun ^a   Li, Lu ^a   Wang, Qian ^a   Duan, Lili ^a   Tang, Bo ^a  

^a SHANDONG NORMAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DIAGNOSIS; DNA; ENZYMES; FLUORESCENCE; GRAPHENE; SUBSTITUTION REACTIONS;

CLINICAL DIAGNOSTICS; DETECTION SENSITIVITY; DISPLACEMENT REACTIONS; DOUBLE-STRANDED DNA (DS-DNA); FLUORESCENCE QUENCHING; FLUORESCENCE SIGNALS; HIGH SIGNAL-TO-NOISE RATIO; STOICHIOMETRIC RATIO;

RNA;

DNA; GRAPHITE; MICRORNA; ORGANIC COMPOUND; SYBR GREEN I;

CHEMISTRY; CONFORMATION; FLUORESCENCE; HUMAN; KINETICS; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION; PROCEDURES; TUMOR CELL LINE;

CELL LINE, TUMOR; DNA; FLUORESCENCE; GRAPHITE; HUMANS; KINETICS; MICRORNAS; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES; NUCLEIC ACID CONFORMATION; ORGANIC CHEMICALS;

EID: 84901805430     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac500752t     Document Type: Article

References (53)

1. Ventura, A.; Jacks, T. Cell 2009, 136, 586
2. Rossi, J. J. Cell 2009, 137, 990
3. Johnson, S. M.; Grosshans, H.; Shingara, J.; Byrom, M.; Jarvis, R.; Cheng, A.; Labourier, E.; Reinert, K. L.; Brown, D.; Slack, F. J. Cell 2005, 120, 635
4. He, L.; Thomson, J. M.; Hemann, M. T.; Hernando-Monge, E.; Mu, D.; Goodson, S.; Powers, S.; Cordon-Cardo, C.; Lowe, S. W.; Hannon, G. J.; Hammond, S. M. Nature 2005, 435, 828
5. Calin, G. A.; Croce, C. M. Nat. Rev. Cancer 2006, 6, 857
6. Sawyers, C. L. Nature 2008, 452, 548
7. Tricoli, J. V.; Jacobson, J. W. Cancer Res. 2007, 67, 4553
8. Ryan, B. M.; Robles, A. I.; Harris, C. C. Nat. Rev. Cancer 2010, 10, 389
9. Mitchell, P. S.; Parkin, R. K.; Kroh, E. M.; Fritz, B. R.; Wyman, S. K.; Pogosova-Agadjanyan, E. L.; Peterson, A.; Noteboom, J.; O 'Briant, K. C.; Allen, A.; Lin, D. W.; Urban, N.; Drescher, C. W.; Knudsen, B. S.; Stirewalt, D. L.; Gentleman, R.; Vessella, R. L.; Nelson, P. S.; Martin, D. B.; Tewari, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 10513
10. Cao, Y.; DePinho, R. A.; Ernst, M.; Vousden, K. Nat. Rev. Cancer 2011, 11, 749
11. Chen, C.; Ridzon, D. A.; Broomer, A. J.; Zhou, Z.; Lee, D. H.; Nguyen, J. T.; Barbisin, M.; Xu, N. L.; Mahuvakar, V. R.; Andersen, M. R.; Lao, K. Q.; Livak, K. J.; Guegler, K. J. Nucleic Acids Res. 2005, 33, e179
12. Valoczi, A.; Hornyik, C.; Varga, N.; Burgyan, J.; Kauppinen, S.; Havelda, Z. Nucleic Acids Res. 2004, 32, e175
13. Varallyay, E.; Burgyan, J.; Havelda, Z. Methods 2007, 43, 140
14. Babak, T.; Zhang, W.; Morris, Q.; Blencowe, B. J.; Hughes, T. R. RNA 2004, 10, 1813
15. Nelson, P. T.; Baldwin, D. A.; Scearce, L. M.; Oberholtzer, J. C.; Tobias, J. W.; Mourelatos, Z. Nat. Methods 2004, 1, 155
16. Thomson, J. M.; Parker, J.; Perou, C. M.; Hammond, S. M. Nat. Methods 2004, 1, 47
17. Liang, R. Q.; Li, W.; Li, Y.; Tan, C. Y.; Li, J. X.; Jin, Y. X.; Ruan, K. C. Nucleic Acids Res. 2005, 33, e17
18. Beuvink, I.; Kolb, F. A.; Budach, W.; Garnier, A.; Lange, J.; Natt, F.; Dengler, U.; Hall, J.; Filipowicz, W.; Weiler, J. Nucleic Acids Res. 2007, 35, e52
19. Lee, J. M.; Jung, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 12487
20. Tu, Y. Q.; Wu, P.; Zhang, H.; Cai, C. X. Chem. Commun. 2012, 48, 10718
21. Xu, F.; Dong, C.; Xie, C.; Ren, J. Chem. - Eur. J. 2010, 16, 1010
22. Wang, Y.; Zheng, D.; Tan, Q.; Wang, M. X.; Gu, L. Q. Nat. Nanotechnol. 2011, 6, 668
23. Dong, H.; Lei, J.; Ju, H.; Zhi, F.; Wang, H.; Guo, W.; Zhu, Z.; Yan, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 4607
24. Degliangeli, F.; Kshirsagar, P.; Brunetti, V.; Pompa, P. P.; Fiammengo, R. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 2264
25. Cissell, K. A.; Rahimi, Y.; Shrestha, S.; Hunt, E. A.; Deo, S. K. Anal. Chem. 2008, 80, 2319
26. Allawi, H. T.; Dahlberg, J. E.; Olson, S.; Lund, E.; Olson, M.; Ma, W. P.; Takova, T.; Neri, B. P.; Lyamichev, V. I. RNA 2004, 10, 1153
27. Hartig, J. S.; Grune, I.; Najafi-Shoushtari, S. H.; Famulok, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 722
28. Hackenberg, M.; Sturm, M.; Langenberger, D.; Falcon-Perez, J. M.; Aransay, A. M. Nucleic Acids Res. 2009, 37, W68
29. Jia, H.; Li, Z.; Liu, C.; Cheng, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5498
30. Liu, H.; Li, L.; Duan, L.; Wang, X.; Xie, Y.; Tong, L.; Wang, Q.; Tang, B. Anal. Chem. 2013, 85, 7941
31. Bi, S.; Zhang, J.; Hao, S.; Ding, C.; Zhang, S. Anal. Chem. 2011, 83, 3696
32. Wang, G. L.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2012, 84, 7037
33. Zhu, X.; Zhou, X.; Xing, D. Chem. - Eur. J. 2013, 19, 5487
34. Cui, L.; Lin, X. Y.; Lin, N. H.; Song, Y. L.; Zhu, Z.; Chen, X.; Yang, C. J. Chem. Commun. 2012, 48, 194
35. Novoselov, K. S.; Geim, A. K.; Morozov, S. V.; Jiang, D.; Zhang, Y.; Dubonos, S. V.; Grigorieva, I. V.; Firsov, A. A. Science 2004, 306, 666
36. Li, D.; Kaner, R. B. Science 2008, 320, 1170
37. Tang, L.; Chang, H.; Liu, Y.; Li, J. Adv. Funct. Mater. 2012, 22, 3083
38. Swathi, R. S.; Sebastian, K. L. J. Chem. Phys. 2009, 130, 086101
39. Swathi, R. S.; Sebastian, K. L. J. Chem. Phys. 2008, 129, 054703
40. Cui, L.; Chen, Z.; Zhu, Z.; Lin, X.; Chen, X.; Yang, C. J. Anal. Chem. 2013, 85, 2269
41. Tang, Z.; Wu, H.; Cort, J. R.; Buchko, G. W.; Zhang, Y.; Shao, Y.; Aksay, I. A.; Liu, J.; Lin, Y. Small 2010, 6, 1205
42. Dong, H.; Zhang, J.; Ju, H.; Lu, H.; Wang, S.; Jin, S.; Hao, K.; Du, H.; Zhang, X. Anal. Chem. 2012, 84, 4587
43. Tu, Y.; Li, W.; Wu, P.; Zhang, H.; Cai, C. Anal. Chem. 2013, 85, 2536
44. Hu, X.; Mu, L.; Wen, J.; Zhou, Q. J. Hazard. Mater. 2012, 213-214, 387
45. Zipper, H.; Brunner, H.; Bernhagen, J.; Vitzthum, F. Nucleic Acids Res. 2004, 32, e103
46. He, S.; Song, B.; Li, D.; Zhu, C.; Qi, W.; Wen, Y.; Wang, L.; Song, S.; Fang, H.; Fan, C. Adv. Funct. Mater. 2010, 20, 453
47. Wang, Y.; Li, Z.; Wang, J.; Li, J.; Lin, Y. Trends Biotechnol. 2011, 29, 205
48. Wang, Y.; Chang, H.; Wu, H.; Liu, H. J. Mater. Chem. 2013, 1, 3521
49. Kumar, S.; Rosenberg, J. M.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011
50. Srinivasan, J.; Cheatham, T. E.; Cieplak, P.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 9401
51. Li, Y.; Breaker, R. R. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 5364
52. Cheng, Y.; Zhang, X.; Li, Z.; Jiao, X.; Wang, Y.; Zhang, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 3268
53. Bi, S.; Cui, Y.; Li, L. Anal. Chim. Acta 2013, 760, 69