Absolute and direct microRNA quantification using DNA-gold nanoparticle probes

Journal of the American Chemical Society

Volumn 136, Issue 6, 2014, Pages 2264-2267

  Degliangeli, Federica ^a   Kshirsagar, Prakash ^a   Brunetti, Virgilio ^a   Pompa, Pier Paolo ^a   Fiammengo, Roberto ^a  

^a ISTITUTO ITALIANO DI TECNOLOGIA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL ASSAY; CHEMISTRY TECHNIQUES, ANALYTICAL; DNA; FLUORESCENCE; GOLD; LIMIT OF DETECTION; METAL NANOPARTICLES; MICRORNAS; MOLECULAR PROBES;

EID: 84894141846     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja412152x     Document Type: Article

References (38)

1. Almeida, M. I.; Reis, R. M.; Calin, G. A. Mutat. Res., Fundam. Mol. Mech. Mutagen. 2011, 717, 1
2. Di Leva, G.; Croce, C. M. Curr. Opin. Genet. Dev. 2013, 23, 3
3. Farazi, T. A.; Spitzer, J. I.; Morozov, P.; Tuschl, T. J. Pathol. 2011, 223, 102
4. Chen, C.; Ridzon, D. A.; Broomer, A. J.; Zhou, Z.; Lee, D. H.; Nguyen, J. T.; Barbisin, M.; Xu, N. L.; Mahuvakar, V. R.; Andersen, M. R.; Lao, K. Q.; Livak, K. J.; Guegler, K. J. Nucleic Acids Res. 2005, 33, e179
5. Benes, V.; Castoldi, M. Methods 2010, 50, 244
6. Redshaw, N.; Wilkes, T.; Whale, A.; Cowen, S.; Huggett, J.; Foy, C. A. Biotechniques 2013, 54, 155
7. Git, A.; Dvinge, H.; Salmon-Divon, M.; Osborne, M.; Kutter, C.; Hadfield, J.; Bertone, P.; Caldas, C. RNA 2010, 16, 991
8. Jensen, S. G.; Lamy, P.; Rasmussen, M. H.; Ostenfeld, M. S.; Dyrskjøt, L.; Ørntoft, T. F.; Andersen, C. L. BMC Genomics 2011, 12, 435
9. Bissels, U.; Wild, S.; Tomiuk, S.; Holste, A.; Hafner, M.; Tuschl, T.; Bosio, A. RNA 2009, 15, 2375
10. Hafner, M.; Landgraf, P.; Ludwig, J.; Rice, A.; Ojo, T.; Lin, C.; Holoch, D.; Lim, C.; Tuschl, T. Methods 2008, 44, 3
11. Dong, H.; Lei, J.; Ding, L.; Wen, Y.; Ju, H.; Zhang, X. Chem. Rev. 2013, 113, 6207
12. Fang, S.; Lee, H. J.; Wark, A. W.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14044
13. Alhasan, A. H.; Kim, D. Y.; Daniel, W. L.; Watson, E.; Meeks, J. J.; Thaxton, C. S.; Mirkin, C. A. Anal. Chem. 2012, 84, 4153
14. Zhang, Y.; Zhang, C.-y. Anal. Chem. 2011, 84, 224
15. Liu, Y.-Q.; Zhang, M.; Yin, B.-C.; Ye, B.-C. Anal. Chem. 2012, 84, 5165
16. Yang, S. W.; Vosch, T. Anal. Chem. 2011, 83, 6935
17. Leshkowitz, D.; Horn-Saban, S.; Parmet, Y.; Feldmesser, E. RNA 2013, 19, 527
18. Sonkoly, E.; Wei, T.; Janson, P. C. J.; Sääf, A.; Lundeberg, L.; Tengvall-Linder, M.; Norstedt, G.; Alenius, H.; Homey, B.; Scheynius, A.; StaÌŠhle, M.; Pivarcsi, A. PLoS One 2007, 2, e0000610
19. Krichevsky, A. M.; Gabriely, G. J. Cell. Mol. Med. 2009, 13, 39
20. Jackson, S. J.; Zhang, Z.; Feng, D.; Flagg, M.; O'Loughlin, E.; Wang, D.; Stokes, N.; Fuchs, E.; Yi, R. Development 2013, 140, 1882
21. Dulkeith, E.; Ringler, M.; Klar, T. A.; Feldmann, J.; Muñoz Javier, A.; Parak, W. J. Nano Lett. 2005, 5, 585
22. Anisimova, V.; Rebrikov, D.; Shagin, D.; Kozhemyako, V.; Menzorova, N.; Staroverov, D.; Ziganshin, R.; Vagner, L.; Rasskazov, V.; Lukyanov, S.; Shcheglov, A. BMC Biochem. 2008, 9, 14
23. Ren, Y.; Deng, H.; Shen, W.; Gao, Z. Anal. Chem. 2013, 85, 4784
24. Yin, B.-C.; Liu, Y.-Q.; Ye, B.-C. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 5064
25. Tian, T.; Xiao, H.; Zhang, Z.; Long, Y.; Peng, S.; Wang, S.; Zhou, X.; Liu, S.; Zhou, X. Chem.-Eur. J. 2013, 19, 92
26. Maus, L.; Dick, O.; Bading, H.; Spatz, J. P.; Fiammengo, R. ACS Nano 2010, 4, 6617
27. Li, Z.; Jin, R.; Mirkin, C. A.; Letsinger, R. L. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 1558
28. Prigodich, A. E.; Alhasan, A. H.; Mirkin, C. A. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 2120
29. Cutler, J. I.; Auyeung, E.; Mirkin, C. A. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 1376
30. Swierczewska, M.; Lee, S.; Chen, X. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 9929
31. Dulkeith, E.; Morteani, A. C.; Niedereichholz, T.; Klar, T. A.; Feldmann, J.; Levi, S. A.; van Veggel, F. C. J. M.; Reinhoudt, D. N.; Möller, M.; Gittins, D. I. Phys. Rev. Lett. 2002, 89, 203002
32. Jennings, T. L.; Singh, M. P.; Strouse, G. F. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 5462
33. Fang, S.; Lee, H. J.; Wark, A. W.; Kim, H. M.; Corn, R. M. Anal. Chem. 2005, 77, 6528
34. Chan, H.-M.; Chan, L.-S.; Wong, R. N.-S.; Li, H.-W. Anal. Chem. 2010, 82, 6911
35. Ikenaga, N.; Ohuchida, K.; Mizumoto, K.; Yu, J.; Kayashima, T.; Sakai, H.; Fujita, H.; Nakata, K.; Tanaka, M. Ann. Surg. Oncol. 2010, 17, 3120
36. Yu, X.; Zhang, X.; Dhakal, I.; Beggs, M.; Kadlubar, S.; Luo, D. BMC Cancer 2012, 12, 29
37. Zhu, X.; Er, K.; Mao, C.; Yan, Q.; Xu, H.; Zhang, Y.; Zhu, J.; Cui, F.; Zhao, W.; Shi, H. Cell. Physiol. Biochem. 2013, 32, 64
38. Hemida, M. G.; Ye, X.; Zhang, H. M.; Hanson, P. J.; Liu, Z.; McManus, B. M.; Yang, D. Cell. Mol. Life Sci. 2013, 70, 277