High-resolution droplet-based fractionation of nano-LC separations onto microarrays for MALDI-MS analysis

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 10, 2014, Pages 4848-4855

  Küster, Simon K ^a   Pabst, Martin ^a   Jefimovs, Konstantins ^b   Zenobi, Renato ^a   Dittrich, Petra S ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b SWISS FEDERAL LABORATORIES FOR MATERIALS SCIENCE AND TECHNOLOGY   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DROPS; ELECTROSPRAY IONIZATION; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY;

CHROMATOGRAPHIC PERFORMANCE; CHROMATOGRAPHIC SEPARATIONS; DROPLET-BASED DEVICES; HIGH FREQUENCY HF; HIGH TEMPORAL RESOLUTION; MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION/IONIZATION MASS SPECTROMETRY; NANOFLOW LIQUID CHROMATOGRAPHIES; PICOLITER DROPLETS;

MICROARRAYS;

PROTEIN HYDROLYSATE;

ANIMAL; CHEMISTRY; DEVICES; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; HUMAN; MASS SPECTROMETRY; MICROARRAY ANALYSIS; NANOTECHNOLOGY; PROCEDURES;

ANIMALS; CHROMATOGRAPHY, HIGH PRESSURE LIQUID; HUMANS; MICROARRAY ANALYSIS; NANOTECHNOLOGY; PROTEIN HYDROLYSATES; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 84901258812     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac4041982     Document Type: Article

References (51)

1. Korfmacher, W. A. Drug Discovery Today 2005, 10, 1357-1367
2. Aebersold, R.; Mann, M. Nature 2003, 422, 198-207
3. Careri, M.; Bianchi, F.; Corradini, C. J. Chromatogr. A 2002, 970, 3-64
4. Karlsson, K. E. K.; Novotny, M. M. Anal. Chem. 1988, 60, 1662-1665
5. Chen, H.-S.; Rejtar, T.; Andreev, V.; Moskovets, E.; Karger, B. L. Anal. Chem. 2005, 77, 2323-2331
6. Corso, T. N.; Van Pelt, C. K.; Li, J.; Ptak, C.; Huang, X. Anal. Chem. 2006, 78, 2209-2219
7. Mirgorodskaya, E. E.; Braeuer, C. C.; Fucini, P. P.; Lehrach, H. H.; Gobom, J. J. Proteomics 2005, 5, 399-408
8. Patterson, D.; Van Soest, R.; Van Gils, M.; Schwartz, H.; Swart, R.; Dragan, I.; Chervet, J. P. J. Lab. Autom. 2003, 8, 34-35
9. Mukhopadhyay, R. Anal. Chem. 2005, 77, 150A-152A
10. Young, J. B.; Li, L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006, 17, 325-334
11. Young, J. B.; Li, L. Anal. Chem. 2007, 79, 5927-5934
12. Ericson, C. C.; Phung, Q. T. Q.; Horn, D. M. D.; Peters, E. C. E.; Fitchett, J. R. J.; Ficarro, S. B. S.; Salomon, A. R. A.; Brill, L. M. L.; Brock, A. A. Anal. Chem. 2003, 75, 2309-2315
13. Kool, J.; de Kloe, G.; Denker, A. D.; van Altena, K.; Smoluch, M.; van Iperen, D.; Nahar, T. T.; Limburg, R. J.; Niessen, W. M. A.; Lingeman, H.; Leurs, R.; de Esch, I. J. P.; Smit, A. B.; Irth, H. Anal. Chem. 2011, 83, 125-132
14. Miliotis, T.; Kjellstrom, S.; Nilsson, J.; Laurell, T.; Edholm, L.; Marko-Varga, G. J. Mass Spectrom. 2000, 35, 369-377
15. Pereira, F.; Niu, X.; deMello, A. J. PLoS One 2013, 8, e63087
16. Peš, O. J.; Preisler, J. J. Chromatogr. A 2010, 1217, 3966-3977
17. Song, H.; Tice, J. D.; Ismagilov, R. F. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 768-772
18. Song, H.; Ismagilov, R. F. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14613-14619
19. Dittrich, P. S.; Jahnz, M.; Schwille, P. ChemBioChem 2005, 6, 811-814
20. Theberge, A. B.; Whyte, G.; Frenzel, M.; Fidalgo, L. M.; Wootton, R. C. R.; Huck, W. T. S. Chem. Commun. 2009, 6225-6227
21. Lombardi, D.; Dittrich, P. S. Anal. Bioanal. Chem. 2011, 399, 347-352
22. Sjostrom, S. L.; Joensson, H. N.; Svahn, H. A. Lab Chip 2013, 13, 1754
23. Baret, J. C.; Miller, O. J.; Taly, V.; Ryckelynck, M.; El-Harrak, A.; Frenz, L.; Rick, C.; Samuels, M. L.; Hutchison, J. B.; Agresti, J. J.; Link, D. R.; Weitz, D. A.; Griffiths, A. D. Lab Chip 2009, 9, 1850-1858
24. Brouzes, E.; Medkova, M.; Savenelli, N.; Marran, D.; Twardowski, M.; Hutchison, J. B.; Rothberg, J. M.; Link, D. R.; Perrimon, N.; Samuels, M. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 14195-14200
25. Baret, J. C.; Beck, Y.; Billas-Massobrio, I.; Moras, D.; Griffiths, A. D. Chem. Biol. 2010, 17, 528-536
26. Niu, X. Z.; Gielen, F.; Edel, J. B.; deMello, A. J. Nat. Chem. 2011, 3, 437-442
27. Fang, W.-F.; Ting, S.-C.; Hsu, C.-W.; Chen, Y.-T.; Yang, J.-T. Lab Chip 2012, 12, 923-931
28. Edgar, J. S.; Milne, G.; Zhao, Y.; Pabbati, C. P.; Lim, D. S.; Chiu, D. T. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 2719-2722
29. Theberge, A. B.; Whyte, G.; Huck, W. T. S. Anal. Chem. 2010, 82, 3449-3453
30. Kim, J.-Y.; Cho, S.-W.; Kang, D.-K.; Edel, J. B.; Chang, S.-I.; deMello, A. J.; O'Hare, D. Chem. Commun. 2012, 48, 9144-9146
31. Niu, X.; Pereira, F.; Edel, J. B.; deMello, A. J. Anal. Chem. 2013, 85, 8654-8660
32. Pei, J.; Li, Q.; Lee, M. S.; Valaskovic, G. A.; Kennedy, R. T. Anal. Chem. 2009, 81, 6558-6561
33. Smith, C. A.; Li, X.; Mize, T. H.; Sharpe, T. D.; Graziani, E. I.; Abell, C.; Huck, W. T. S. Anal. Chem. 2013, 85, 3812-3816
34. Küster, S. K.; Fagerer, S. R.; Verboket, P. E.; Eyer, K.; Jefimovs, K.; Zenobi, R.; Dittrich, P. S. Anal. Chem. 2013, 85, 1285-1289
35. Grass, J.; Pabst, M.; Chang, M.; Wozny, M.; Altmann, F. Anal. Bioanal. Chem. 2011, 400, 2427-2438
36. Urban, P. L.; Jefimovs, K.; Amantonico, A.; Fagerer, S. R.; Schmid, T.; Mädler, S.; Puigmarti-Luis, J.; Goedecke, N.; Zenobi, R. Lab Chip 2010, 10, 3206-3209
37. Pabst, M.; Fagerer, S. R.; Köhling, R.; Küster, S. K.; Steinhoff, R.; Badertscher, M.; Wahl, F.; Dittrich, P. S.; Jefimovs, K.; Zenobi, R. Anal. Chem. 2013, 85, 9771-9776
38. Wenig, P.; Odermatt, J. BMC Bioinf. 2010, 11, 405
39. Noga, M.; Sucharski, F.; Suder, P.; Silberring, J. J. Sep. Sci. 2007, 30, 2179-2189
40. Baroud, C. N.; Gallaire, F.; Dangla, R. Lab Chip 2010, 10, 2032-2045
41. Beavis, R. C.; Chaudhary, T.; Chait, B. T. Org. Mass Spectrom. 1992, 27, 156-158
42. Cohen, S. L.; Chait, B. T. Anal. Chem. 1996, 68, 31-37
43. Lewis, J. K.; Wei, J.; Siuzdak, G. In Encyclopedia of Analytical Chemistry; Meyers, R. A., Ed.; John Wiley & Sons: Chichester, 2000; pp 5880-5894.
44. Beavis, R. C.; Chait, B. T. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1989, 3, 432-435
45. Hillenkamp, F.; Karas, M. In MALDI MS: A Practical Guide to Instrumentation, Methods and Applications; Hillenkamp, F., Peter-Katalinic, J., Eds.; Wiley-VCH: Weinheim, 2007; pp 1-23.
46. Kussmann, M.; Lässing, U.; Stürmer, C. A.; Przybylski, M.; Roepstorff, P. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 483-493
47. Kjellström, S.; Jensen, O. N. Anal. Chem. 2004, 76, 5109-5117
48. Zhu, Y. F.; Lee, K. L.; Tang, K.; Allman, S. L.; Taranenko, N. I.; Chen, C. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1995, 9, 1315-1320
49. Gonnet, F.; Lemaître, G.; Waksman, G.; Tortajada, J. Proteome Sci. 2003, 1, 2
50. Steven, R. T.; Bunch, J. Anal. Bioanal. Chem. 2013, 405, 4719-4728
51. Selman, M. H. J.; Hoffmann, M.; Zauner, G.; McDonnell, L. A.; Balog, C. I. A.; Rapp, E.; Deelder, A. M.; Wuhrer, M. Proteomics 2012, 12, 1337-1348