Target-catalyzed dynamic assembly-based pyrene excimer switching for enzyme-free nucleic acid amplified detection

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 10, 2014, Pages 4934-4939

  Qing, Zhihe ^a   He, Xiaoxiao ^a   Huang, Jin ^a   Wang, Kemin ^a   Zou, Zhen ^a   Qing, Taiping ^a   Mao, Zhengui ^a   Shi, Hui ^a   He, Dinggeng ^a  

^a HUNAN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOMOLECULES; CATALYSIS; DNA; ENZYMES; PYRENE;

ANALYTICAL APPLICATIONS; ASSEMBLY COMPONENT; BIOLOGICAL STUDIES; DETECTION CAPABILITY; FLUORESCENT SIGNALS; MEDICAL DIAGNOSTICS; SENSITIVE DETECTION; TARGET CONCENTRATIONS;

SIGNAL DETECTION;

FLUORESCENT DYE; NUCLEIC ACID; PYRENE; PYRENE DERIVATIVE;

CHEMISTRY; GENETIC PROCEDURES; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION; PROCEDURES; SPECTROFLUOROMETRY;

BIOSENSING TECHNIQUES; FLUORESCENT DYES; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES; NUCLEIC ACIDS; PYRENES; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE;

EID: 84901258003     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac500834g     Document Type: Article

References (57)

1. Whitesides, G. M.; Gryzbowski, B. Science 2002, 295, 2418-2421
2. Gothelf, K. V.; LaBean, T. H. Org. Biomol. Chem. 2005, 3, 4023-4037
3. Seeman, N. C. Nature 2003, 421, 427-431
4. Rothemund, P. W. K. Nature 2006, 440, 297-302
5. Lin, C.; Liu, Y.; Yan, H. Biochemistry 2009, 48, 1663-1674
6. Aldaye, F. A.; Palmer, A. L.; Sleiman, H. F. Science 2008, 321, 1795-1799
7. Zhang, D. Y.; Hariadi, R. F.; Choi, H. M.; Winfree, E. Nat. Commun. 2013, DOI: 10.1038/ncomms2965.
8. Ke, Y.; Ong, L. L.; Shih, W. M.; Yin, P. Science 2012, 338, 1177-1183
9. Lin, C.; Liu, Y.; Rinker, S.; Yan, H. ChemPhysChem. 2006, 7, 1641-1647
10. Dirks, R.; Pierce, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 15275-15278
11. Venkataraman, S.; Dirks, R.; Rothemund, P.; Winfree, E.; Pierce, N. Nat. Nanotechnol. 2007, 2, 490-494
12. Zhang, D. Y.; Turberfield, A. J.; Yurke, B.; Winfree, E. Science 2007, 318, 1121-1125
13. Yin, P.; Choi, H.; Calvert, C.; Pierce, N. Nature 2008, 451, 318-322
14. Zhang, L.; Zhu, J.; Zhou, Z.; Guo, S.; Li, J.; Dong, S.; Wang, E. Chem. Sci. 2013, 4, 4004-4010
15. Seelig, G.; Yurke, B.; Winfree, E. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12211-12220
16. Soloveichika, D.; Seeliga, G.; Winfree, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010, 107, 5393-5398
17. Niu, S.; Jiang, Y.; Zhang, S. Chem. Commun. 2010, 46, 3089-3091
18. Li, B.; Ellington, A. D.; Chen, X. Nucleic Acids Res. 2011, 39, e110
19. Shimron, S.; Wang, F.; Orbach, R.; Willner, I. Anal. Chem. 2012, 84, 1042-1048
20. Zhang, B.; Liu, B.; Tang, D.; Niessner, R.; Chen, G.; Knopp, D. Anal. Chem. 2012, 84, 5392-5399
21. Huang, J.; Su, X.; Li, Z. Anal. Chem. 2012, 84, 5939-5943
22. Chen, Y.; Xu, J.; Su, J.; Xiang, Y.; Yuan, R.; Chai, Y. Anal. Chem. 2012, 84, 7750-7755
23. Lin, C.; Nangreave, J. K.; Li, Z.; Liu, Y.; Yan, H. Nanomedicine 2008, 3, 521-528
24. Choi, H. M.; Chang, J. Y.; Trinh, L. A.; Padilla, J. E.; Fraser, S. E.; Pierce, N. Nat. Biotechnol. 2010, 28, 1208-1212
25. Zhu, G.; Zheng, J.; Song, E.; Donovan, M.; Zhang, K.; Liu, C.; Tan, W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110, 7998-8003
26. Zhu, G.; Zhang, S.; Song, E.; Zheng, J.; Hu, R.; Fang, X.; Tan, W. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 5490-5496
27. Zheng, J.; Zhu, G.; Li, Y.; Li, C.; You, M.; Chen, T.; Song, E.; Yang, R.; Tan, W. ACS Nano 2013, 7, 6545-6554
28. Huang, J.; Wu, Y.; Chen, Y.; Zhu, Z.; Yang, X.; Yang, C.; Wang, K.; Tan, W. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 401-404
29. Huang, J.; Yang, X.; He, X.; Wang, K.; He, Y.; Quan, K. Chem. Commun. 2013, 49, 9827-9829
30. Liu, P.; Yang, X.; Sun, S.; Wang, Q.; Wang, K.; Huang, J.; Liu, J.; He, L. Anal. Chem. 2013, 85, 7689-7695
31. Barany, F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991, 88, 189-193
32. Fire, A.; Xu, X. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1995, 92, 4641-4645
33. Ness, J.; Ness, L. K.; Galas, D. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 4504-4509
34. Weizmann, Y.; Beissenhirtz, M. K.; Cheglakov, Z.; Nowarski, R.; Kotler, M.; Willner, I. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 7384-7388
35. Guo, Q.; Yang, X.; Wang, K.; Tan, W.; Li, W.; Tan, H.; Li, H. Nucleic Acids Res. 2009, 37, e20
36. Zou, B.; Ma, Y.; Wu, H.; Zhou, G. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 7395-7398
37. Wang, Q.; Yang, L.; Yang, X.; Wang, K.; He, L.; Zhu, J.; Su, T. Chem. Commun. 2012, 48, 2982-2984
38. Eckhoff, G.; Codrea, V.; Ellington, D. A.; Chen, X. J. Syst. Chem. 2011, 1, 13
39. Shi, C.; Zhao, C.; Guo, Q.; Ma, C. Chem. Commun. 2011, 47, 2895-2897
40. Masuko, M.; Ohtani, H.; Ebata, K.; Shimadzu, A. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 5409-5416
41. Fujimoto, K.; Shimizu, H.; Inouye, M. J. Org. Chem. 2004, 69, 3271-3275
42. Trkulja, I.; Biner, S. M.; Langenegger, S. M.; Häner, R. ChemBioChem. 2007, 8, 25-27
43. Huang, J.; Zhu, Z.; Bamrungsap, S.; Zhu, G.; You, M.; He, X.; Wang, K.; Tan, W. Anal. Chem. 2010, 82, 10158-10163
44. Oh, K. J.; Cash, K. J.; Plaxco, K. W. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14018-14019
45. Conlon, P.; Yang, C. Y.; Wu, Y. R.; Chen, Y.; Martinez, K.; Kim, Y. M.; Stevens, N.; Marti, A. A.; Jockusch, S.; Turro, N. J.; Tan, W. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 336-342
46. Meng, H.; Fu, T.; Zhang, X.; Wang, N.; Tan, W.; Shen, G.; Yu, R. Anal. Chem. 2012, 84, 2124-2128
47. Zheng, J.; Li, J.; Gao, X.; Jin, J.; Wang, K.; Tan, W.; Yang, R. Anal. Chem. 2010, 82, 3914-3921
48. Qing, Z.; He, X.; Qing, T.; Wang, K.; Shi, H.; He, D.; Zou, Z.; Yan, L.; Xu, F.; Ye, X.; Mao, Z. Anal. Chem. 2013, 85, 12138-12143
49. Yang, C. J.; Jockusch, S.; Vicens, M.; Turro, N. J.; Tan, W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 17278-17283
50. Saejtli, J. Cyclodextrins and Their Inclusion Complexes; Akademia Kiado: Budapest, Hungary, 1982.
51. Kim, J. H.; Estabrook, R. A.; Braun, G.; Lee, B. R.; Reich, N. O. Chem. Commun. 2007, 4342-4344
52. Zhao, C.; Wu, L.; Ren, J.; Qu, X. Chem. Commun. 2011, 47, 5461-5463
53. Chen, H.; Wang, J.; Liang, G.; Zhang, P.; Kong, J. Chem. Commun. 2012, 48, 269-271
54. Zheng, X.; Liu, Q.; Jing, C.; Li, Y.; Li, D.; Luo, W.; Wen, Y.; He, Y.; Huang, Q.; Long, Y. T.; Fan, C. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 11994-11998
55. Xue, X.; Xu, W.; Wang, F.; Liu, X. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 11668-11669
56. Wang, H. Q.; Liu, W. Y.; Wu, Z.; Tang, L. J.; Xu, X. M.; Yu, R. Q.; Jiang, J. H. Anal. Chem. 2011, 83, 1883-1889
57. Cheng, Y.; Du, Q.; Wang, L.; Jia, H.; Li, Z. Anal. Chem. 2012, 84, 3739-3744