High temperature SELMA: Evolution of DNA-supported oligomannose clusters which are tightly recognized by HIV bnAb 2G12

Journal of the American Chemical Society

Volumn 136, Issue 5, 2014, Pages 1726-1729

  Temme, J Sebastian ^a   MacPherson, Iain S ^a   Decourcey, John F ^a   Krauss, Isaac J ^a  

^a BRANDEIS UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

APTAMERS; DIRECTED EVOLUTION METHODS; ENVELOPE PROTEINS; HIGH TEMPERATURE; IMMUNOGENS; NEUTRALIZING ANTIBODIES; OLIGOMANNOSE; TARGET RECOGNITION;

POLYSACCHARIDES;

ANTIBODIES;

DNA; GLYCAN; GLYCOPROTEIN GP 120; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS ANTIBODY; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS ANTIBODY 2G12; MANNOSE OLIGOSACCHARIDE; NEUTRALIZING ANTIBODY; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; BINDING AFFINITY; BINDING SITE; CYCLOADDITION; DIRECTED MOLECULAR EVOLUTION; GLYCOSYLATION; HIGH TEMPERATURE; MOLECULAR RECOGNITION; SELECTION WITH MODIFIED APTAMERS;

ANTIBODIES, MONOCLONAL; ANTIBODIES, NEUTRALIZING; BASE SEQUENCE; BINDING SITES, ANTIBODY; DNA; HIV ANTIBODIES; HIV ENVELOPE PROTEIN GP120; HIV-1; HOT TEMPERATURE; HUMANS; MANNOSE; MOLECULAR MIMICRY; MOLECULAR SEQUENCE DATA;

EID: 84893781966     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja411212q     Document Type: Article

References (36)

1. Trkola, A.; Purtscher, M.; Muster, T.; Ballaun, C.; Buchacher, A.; Sullivan, N.; Srinivasan, K.; Sodroski, J.; Moore, J. P.; Katinger, H. J. Virol. 1996, 70, 1100-1108
2. Binley, J. M.; Wrin, T.; Korber, B.; Zwick, M. B.; Wang, M.; Chappey, C.; Stiegler, G.; Kunert, R.; Zolla-Pazner, S.; Katinger, H.; Petropoulos, C. J.; Burton, D. R. J. Virol. 2004, 78, 13232-13252
3. Mascola, J. R.; Stiegler, G.; VanCott, T. C.; Katinger, H.; Carpenter, C. B.; Hanson, C. E.; Beary, H.; Hayes, D.; Frankel, S. S.; Birx, D. L.; Lewis, M. G. Nat. Med. 2000, 6, 207-210
4. Hessell, A. J.; Rakasz, E. G.; Poignard, P.; Hangartner, L.; Landucci, G.; Forthal, D. N.; Koff, W. C.; Watkins, D. I.; Burton, D. R. PLoS Pathog 2009, 5, e1000433
5. Sanders, R. W.; Venturi, M.; Schiffner, L.; Kalyanaraman, R.; Katinger, H.; Lloyd, K. O.; Kwong, P. D.; Moore, J. P. J. Virol. 2002, 76, 7293-7305
6. Scanlan, C. N.; Pantophlet, R.; Wormald, M. R.; Ollmann Saphire, E.; Stanfield, R.; Wilson, I. A.; Katinger, H.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M.; Burton, D. R. J. Virol. 2002, 76, 7306-7321
7. Calarese, D. A.; Scanlan, C. N.; Zwick, M. B.; Deechongkit, S.; Mimura, Y.; Kunert, R.; Zhu, P.; Wormald, M. R.; Stanfield, R. L.; Roux, K. H.; Kelly, J. W.; Rudd, P. M.; Dwek, R. A.; Katinger, H.; Burton, D. R.; Wilson, I. A. Science 2003, 300, 2065-2071
8. Li, H. G.; Wang, L. X. Org. Biomol. Chem. 2004, 2, 483-488
9. Wang, L. X.; Ni, J.; Singh, S.; Li, H. Chem. Biol. 2004, 11, 127-134
10. Ni, J. H.; Song, H. J.; Wang, Y. D.; Stamatos, N. M.; Wang, L. X. Bioconjugate Chem. 2006, 17, 493-500
11. Krauss, I. J.; Joyce, J. G.; Finnefrock, A. C.; Song, H. C.; Dudkin, V. Y.; Geng, X.; Warren, J. D.; Chastain, M.; Shiver, J. W.; Danishefsky, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 11042-11044
12. Wang, J.; Li, H.; Zou, G.; Wang, L. X. Org. Biomol. Chem. 2007, 5, 1529-1540
13. Joyce, J. G.; Krauss, I. J.; Song, H. C.; Opalka, D. W.; Grimm, K. M.; Nahas, D. D.; Esser, M. T.; Hrin, R.; Feng, M. Z.; Dudkin, V. Y.; Chastain, M.; Shiver, J. W.; Danishefsky, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 15684-15689
14. Luallen, R. J.; Lin, J. Q.; Fu, H.; Cai, K. K.; Agrawal, C.; Mboudjeka, I.; Lee, F. H.; Montefiori, D.; Smith, D. F.; Doms, R. W.; Geng, Y. J. Virol. 2008, 82, 6447-6457
15. Wang, S. K.; Liang, P. H.; Astronomo, R. D.; Hsu, T. L.; Hsieh, S. L.; Burton, D. R.; Wong, C. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 3690-3695
16. Gorska, K.; Huang, K.-T.; Chaloin, O.; Winssinger, N. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 7695-7700
17. Astronomo, R. D.; Kaltgrad, E.; Udit, A. K.; Wang, S. K.; Doores, K. J.; Huang, C. Y.; Pantophlet, R.; Paulson, J. C.; Wong, C. H.; Finn, M. G.; Burton, D. R. Chem. Biol. 2010, 17, 357-370
18. Doores, K. J.; Fulton, Z.; Hong, V.; Patel, M. K.; Scanlan, C. N.; Wormald, M. R.; Finn, M. G.; Burton, D. R.; Wilson, I. A.; Davis, B. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 17107-17112
19. Agrawal-Gamse, C.; Luallen, R. J.; Liu, B.; Fu, H.; Lee, F.-H.; Geng, Y.; Doms, R. W. J. Virol. 2011, 85, 470-480
20. Ciobanu, M.; Huang, K. T.; Daguer, J. P.; Barluenga, S.; Chaloin, O.; Schaeffer, E.; Mueller, C. G.; Mitchell, D. A.; Winssinger, N. Chem. Commun. 2011, 47, 9321-9323
21. Marradi, M.; Di Gianvincenzo, P.; Enriquez-Navas, P. M.; Martinez-Avila, O. M.; Chiodo, F.; Yuste, E.; Angulo, J.; Penades, S. J. Mol. Biol. 2011, 410, 798-810
22. Clark, B. E.; Auyeung, K.; Fregolino, E.; Parrilli, M.; Lanzetta, R.; De Castro, C.; Pantophlet, R. Chem. Biol. 2012, 19, 254-263
23. MacPherson, I. S.; Temme, J. S.; Habeshian, S.; Felczak, K.; Pankiewicz, K.; Hedstrom, L.; Krauss, I. J. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 11238-11242
24. Temme, J. S.; Drzyzga, M. G.; MacPherson, I. S.; Krauss, I. J. Chem.-Eur. J 2013, 19, 17291-17295
25. Kolb, H. C.; Finn, M. G.; Sharpless, K. B. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 2004-2021
26. Rostovtsev, V. V.; Green, L. G.; Fokin, V. V.; Sharpless, K. B. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 2596-2599
27. Gierlich, J.; Burley, G. A.; Gramlich, P. M.; Hammond, D. M.; Carell, T. Org. Lett. 2006, 8, 3639-3642
28. Gierlich, J.; Gutsmiedl, K.; Gramlich, P. M.; Schmidt, A.; Burley, G. A.; Carell, T. Chem.-Eur. J. 2007, 13, 9486-9494
29. Hoorelbeke, B.; van Montfort, T.; Xue, J.; LiWang, P. J.; Tanaka, H.; Igarashi, Y.; Van Dammef, E. J. M.; Sanders, R. W.; Balzarini, J. FEBS Lett. 2013, 587, 860-866
30. Rio, D. C. Cold Spring Harbor Protocols 2012, 2012, pdb.prot071449.
31. Abdiche, Y.; Malashock, D.; Pinkerton, A.; Pons, J. Anal. Biochem. 2008, 377, 209-217
32. Huber, M.; Le, K. M.; Doores, K. J.; Fulton, Z.; Stanfield, R. L.; Wilson, I. A.; Burton, D. R. J. Virol. 2010, 84, 10700-10707
33. Doores, K. J.; Huber, M.; Le, K. M.; Wang, S. K.; Doyle-Cooper, C.; Cooper, A.; Pantophlet, R.; Wong, C. H.; Nemazee, D.; Burton, D. R. J. Virol. 2013, 87, 2234-2241
34. Mammen, M.; Choi, S.-K.; Whitesides, G. M. Angew. Chem., Int. Ed. 1998, 37, 2754-2794
35. Kiessling, L. L.; Gestwicki, J. E.; Strong, L. E. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 2348-2368
36. Fasting, C.; Schalley, C. A.; Weber, M.; Seitz, O.; Hecht, S.; Koksch, B.; Dernedde, J.; Graf, C.; Knapp, E. W.; Haag, R. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 10472-10498