Ground and excited state electronic spectra of perylenediimide dimers with flexible and rigid geometries in DNA conjugates

Chemical Science

Volumn 5, Issue 3, 2014, Pages 973-981

  Neelakandan, Prakash P ^a   Zeidan, Tarek A ^a   McCullagh, Martin ^a   Schatz, George C ^a   Vura Weis, Josh ^a   Kim, Chul Hoon ^a   Wasielewski, Michael R ^a   Lewis, Frederick D ^a  

^a NORTHWESTERN UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHROMOPHORES; DIMETHYL SULFOXIDE; DNA; EXCITED STATES; EXCITONS; FLEXIBLE STRUCTURES; FLUORESCENCE; MOLECULAR DYNAMICS;

CIRCULAR DICHROISM SPECTRA; ELECTRONIC SPECTRUM; EXCIMER FLUORESCENCE; EXCITON COUPLING; PERYLENEDIIMIDES; TETRA-HYDROFURAN; TORSIONAL ANGLE; TRANSIENT ABSORPTION;

DIMERS;

EID: 84893439325     PISSN: 20416520     EISSN: 20416539     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3sc52908h     Document Type: Article

References (36)

1. F. Wurthner Chem. Commun. 2004 1564 1579
2. T. Weil T. Vosch J. Hofkens K. Peneva K. Müllen Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 9068 9093
3. D. Görl X. Zhang F. Würthner Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 6328 6348
4. A. D. Q. Li, in Molecular Self-Assembly, ed., A. D. Q. Li, Pan Stanford Publishing, 2012, pp. 123-206
5. A. E. Clark C. Qin A. D. Q. Li J. Am. Chem. Soc. 2007 129 7586 7595
6. J. Seibt P. Marquetand V. Engel Z. Chen V. Dehm F. Wurthner Chem. Phys. 2006 328 354 362
7. R. F. Fink J. Seibt V. Engel M. Renz M. Kaupp S. Lochbrunner H.-M. Zhao J. Pfister F. Würthner B. Engels J. Am. Chem. Soc. 2008 130 12858 12859
8. H.-M. Zhao J. Pfister V. Settels M. Renz M. Kaupp V. C. Dehm F. Würthner R. F. Fink B. Engels J. Am. Chem. Soc. 2009 131 15660 15668
9. M. Kasha H. R. Rawls M. A. El-Bayoumi Pure Appl. Chem. 1965 11 371 392
10. N. Harada and K. Nakanishi, Circular Dichroic Spectroscopy. Exciton Coupling in Organic Stereochemistry, University Science Books, Mill Valley, CA, 1983
11. J. M. Giaimo J. V. Lockard L. E. Sinks A. M. Scott T. M. Wilson M. R. Wasielewski J. Phys. Chem. A 2008 112 2322 2330
12. Y. Zheng H. Long G. C. Schatz F. D. Lewis Chem. Commun. 2005 4795 4797
13. M. Hariharan Y. Zheng H. Long T. A. Zeidan G. C. Schatz J. Vura-Weis M. R. Wasielewski X. B. Zuo D. M. Tiede F. D. Lewis J. Am. Chem. Soc. 2009 131 5920 5929
14. P. P. Neelakandan Z. Pan M. Hariharan Y. Zheng H. Weissman B. Rybtchinski F. D. Lewis J. Am. Chem. Soc. 2010 132 15808 15813
15. T. M. Wilson T. A. Zeidan M. Hariharan F. D. Lewis M. R. Wasielewski Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 2385 2388
16. T. Seki S. Yagai T. Karatsu A. Kitamura J. Org. Chem. 2008 73 3328 3335
17. W. Wang L. S. Li G. Helms H. H. Zhou A. D. Q. Li J. Am. Chem. Soc. 2003 125 1120 1121
18. J. J. Han A. D. Shaller W. Wang A. D. Q. Li J. Am. Chem. Soc. 2008 130 6974 6982
19. R. Carmieli T. A. Zeidan R. F. Kelley Q. Mi F. D. Lewis M. R. Wasielewski J. Phys. Chem. A 2009 113 4691 4700
20. N. Rahe C. Rinn T. Carell Chem. Commun. 2003 2120 2121
21. T. A. Zeidan R. Carmieli R. F. Kelley T. M. Wilson F. D. Lewis M. R. Wasielewski J. Am. Chem. Soc. 2008 130 13945 13955
22. C. Wagner H.-A. Wagenknecht Org. Lett. 2006 8 4191 4194
23. F. D. Lewis L. Zhang X. Liu X. Zuo D. M. Tiede H. Long G. C. Schatz J. Am. Chem. Soc. 2005 127 14445 14453
24. M. McCullagh M. Hariharan F. D. Lewis D. Markovitsi T. Douki G. C. Schatz J. Phys. Chem. B 2010 114 5215 5221
25. D. Baumstark H.-A. Wagenknecht Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 2612 2614
26. F. Menacher H.-A. Wagenknecht Photochem. Photobiol. Sci. 2011 10 1275 1278
27. G. Bonner A. M. Klibanov Biotechnol. Bioeng. 2000 68 339 344
28. W. Wang W. Wan H. H. Zhou S. Q. Niu A. D. Q. Li J. Am. Chem. Soc. 2003 125 5248 5249
29. R. L. Letsinger T. Wu J. Am. Chem. Soc. 1995 117 7323 7328
30. V. L. Malinovskii D. Wenger R. Haner Chem. Soc. Rev. 2010 39 410 422
31. C. R. Cantor and P. R. Schimmel, Biophysical Chemistry, W. H. Freeman, New York, 1980, vol. 2, pp. 418-425
32. T. Heek C. Fasting C. Rest X. Zhang F. Wurthner R. Haag Chem. Commun. 2010 46 1884 1886
33. T. E. Cheatham P. Cieplak P. A. Kollman J. Biomol. Struct. Dyn. 1999 16 845 862
34. T. A. D. D. A. Case, I. Cheatham, T. E., C. L. Simmerling, J. Wang, R. E. Duke, R. Luo, R. C. W. M. Crowley, W. Zhang, K. M. Merz, B. Wang, S. Hayik, A. Roitberg, G. Seabra, I. K. F. W. Kolossváry, F. Paesani, J. Vanicek, X. Wu, S. R. Brozell, T. Steinbrecher, H. Gohlke, C. T. L. Yang, J. Mongan, V. Hornak, G. Cui, D. H. Mathews, M. G. Seetin, C. Sagui, V. Babin and P. A. Kollman, Amber 10, University of California, San Franscisco, 2008
35. Z. E. X. Dance Q. Mi D. W. McCamant M. J. Ahrens M. A. Ratner M. R. Wasielewski J. Phys. Chem. B 2006 110 25163 25173
36. B. Rybtchinski L. E. Sinks M. R. Wasielewski J. Phys. Chem. A 2004 108 7497 7505