Nonadiabatic ensemble simulations of cis-stilbene and cis-azobenzene photoisomerization

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 10, Issue 1, 2014, Pages 14-23

  Neukirch, Amanda J ^a,b   Shamberger, Logan C ^b   Abad, Enrique ^c   Haycock, Barry J ^b   Wang, Hong ^b   Ortega, José ^d   Prezhdo, Oleg V ^a   Lewis, James P ^b  

^a UNIVERSITY OF ROCHESTER   (United States)

^b WEST VIRGINIA UNIVERSITY   (United States)

^c UNIVERSITY OF STUTTGART   (Germany)

^d Ciudad Universitaria de Cantoblanco   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84892584557     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct4009816     Document Type: Article

References (76)

1. Rau, H. Photochromism: Molecules and Systems; Durr, H., Bouas-Laurent, H., Eds.; Elsevier Science: Amsterdam, The Netherlands, 2003; p 1218.
2. Ikeda, T.; Tsutsumi, O. Science 1995, 268, 1873-1875
3. Berg, R. H.; Hvilsted, S.; Ramanujam, P. S. Nature 1996, 383, 505-508
4. Volgraf, M.; Gorostiza, P.; Numano, R.; Kramer, R. H.; Isacoff, E. Y.; Trauner, D. Nat. Chem. Bio. 2006, 2, 47-52
5. Choi, H. J.; Jeong, K.-U.; Chien, L.-C.; Lee, M.-H. J. Mater. Chem. 2009, 19, 7124
6. Böckmann, M.; Peter, C.; Site, L. D.; Doltsinis, N. L.; Kremer, K.; Marx, D. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 1789-1802
7. Renner, C.; Moroder, L. Chembiochem 2006, 7, 868-878
8. Pace, G.; Ferri, V.; Grave, C.; Elbing, M.; Von Hänisch, C.; Zharnikov, M.; Mayor, M.; Rampi, M. A.; Samorì, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 9937-9942
9. Park, J.; Yuan, D.; Pham, K. T.; Li, J.-R.; Yakovenko, A.; Zhou, H.-C. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 99-102
10. Bandara, H. M. D.; Burdette, S. C. Chem. Soc. Rev. 2012, 41, 1809-1825
11. Crecca, C. R.; Roitberg, A. E. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8188-8203
12. Rau, H.; Luddecke, E. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 1616-1620
13. Magee, J. L.; Shand, W.; Eyring, H. J. Am. Chem. Soc. 1941, 677-688
14. Curtin, D. Y.; Grubbs, E. J.; Mccarty, C. G. J. Am. Chem. Soc. 1966, 530, 2775-2786
15. Böckmann, M.; Doltsinis, N. L.; Marx, D. Phys. Rev. E 2008, 78, 036101
16. Böckmann, M.; Doltsinis, N. L.; Marx, D. J. Phys. Chem. A 2010, 114, 745-754
17. Böckmann, M.; Marx, D.; Peter, C.; Site, L. D.; Kremer, K.; Doltsinis, N. L. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 7604-7621
18. Repinec, S. T.; Sension, R. J.; Szarka, A. Z.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. 1991, 95, 10380-10385
19. Quenneville, J.; MartI, T. J. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 829-837
20. Frederick, J. H.; Penn, J. H.; Virginia, W. J. Phys. Chem. 1991, 95, 2845-2858
21. Rodier, J.-M.; Myers, A. B. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 10791-10795
22. Bortolus, P.; Monti, S. J. Phys. Chem. 1979, 83, 648-652
23. Nakamura, T.; Takeuchi, S.; Taketsugu, T.; Tahara, T. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 6225-6232
24. Rice, J. K.; Baronavski, A. P. J. Phys. Chem. 1992, 96, 3359-3366
25. Cattaneo, P.; Persico, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 1999, 1, 4739-4743
26. Toniolo, A.; Ciminelli, C.; Persico, M.; Martínez, T. J. J. Chem. Phys. 2005, 123, 234308
27. Ootani, Y.; Satoh, K.; Nakayama, A.; Noro, T.; Taketsugu, T. J. Chem. Phys. 2009, 131, 194306
28. Pederzoli, M.; Pittner, J.; Barbatti, M.; Lischka, H. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 11136-11143
29. Weingart, O.; Lan, Z.; Koslowski, A.; Thiel, W. J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 1506-1509
30. Nagele, T.; Hoche, R.; Zinth, W.; Wachtveitl, J. Chem. Phys. Lett. 1997, 272, 489-495
31. Satzger, H.; Spörlein, S.; Root, C.; Wachtveitl, J.; Zinth, W.; Gilch, P. Chem. Phys. Lett. 2003, 372, 216-223
32. Fuß, W.; Kosmidis, C.; Schmid, W..; Trushin, S.. Chem. Phys. Lett. 2004, 385, 423-430
33. Pedersen, S.; Bañares, L.; Zewail, A. H. J. Chem. Phys. 1992, 97, 8801
34. Baumert, T.; Frohnmeyer, T.; Kiefer, B.; Niklaus, P.; Strehle, M.; Gerber, G.; Zewail, A. H. App. Phys. B 2001, 72, 105-108
35. Greene, B. I.; Farrow, R. C. J. Chem. Phys. 1983, 78, 3336
36. Ciminelli, C.; Granucci, G.; Persico, M. Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) 2004, 10, 2327-2341
37. Zimmerman, G.; Chow, L.-Y.; Paik, U.-J. J. Am. Chem. Soc. 1958, 80, 3528-3531
38. Gegiou, D.; Muszkat, K. A.; Fischer, E. J. Am. Chem. Soc. 1968, 90, 12-18
39. Siampiringue, N.; Guyot, G.; Monti, S.; Bortolus, P. J. Photochem. 1987, 37, 185-188
40. Petek, H.; Yoshihara, K.; Fujiwara, Y.; Lin, Z.; Penn, J. H.; Frederick, J. H. J. Phys. Chem. 1990, 94, 7539-7543
41. Abad, E.; Lewis, J. P.; Zobač, V.; Hapala, P.; Jelínek, P.; Ortega, J. J. Chem. Phys. 2013, 138, 154106
42. Tully, J. C. J. Chem. Phys. 1990, 93, 1061
43. Isborn, C. M.; Li, X.; Tully, J. C. J. Chem. Phys. 2007, 126, 134307
44. Castro, A.; Isla, M.; Martínez, J. I.; Alonso, J. A. Chem. Phys. 2012, 399, 130-134
45. Meng, S.; Kaxiras, E. J. Chem. Phys. 2008, 129, 054110
46. Andrade, X.; Castro, A.; Zueco, D.; Alonso, J. L.; Echenique, P.; Falceto, F.; Rubio, A. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 728-742
47. Hammes-Schiffer, S.; Tully, J. C. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4657
48. Craig, C.; Duncan, W.; Prezhdo, O. Phys. Rev. Lett. 2005, 95, 163001
49. Doltsinis, N.; Marx, D. Phys. Rev. Lett. 2002, 88, 166402
50. Tapavicza, E.; Tavernelli, I.; Rothlisberger, U. Phys. Rev. Lett. 2007, 98, 023001
51. Tully, J. C. J. Chem. Phys. 1971, 55, 562
52. Herman, M. F. J. Chem. Phys. 1984, 81, 754
53. Kazaryan, A.; Lan, Z.; Sch, L. V; Thiel, W.; Filatov, M. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 2189-2199
54. Coker, D. F.; Xiao, L. J. Chem. Phys. 1995, 102, 496
55. Prezhdo, O. V.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 1997, 107, 825
56. Tavernelli, I.; Tapavicza, E.; Rothlisberger, U. J. Mol. Struc: THEOCHEM 2009, 914, 22-29
57. Horsfield, A. P.; Bowler, D. R.; Ness, H.; Sánchez, C. G.; Todorov, T. N.; Fisher, A. J. Rep. Prog. Phys. 2006, 69, 1195-1234
58. Sankey, O. F.; Niklewski, D. J. Phys. Rev. B 1989, 40, 3979
59. Lewis, J. P.; Jelínek, P.; Ortega, J.; Demkov, A. A.; Trabada, D. G.; Haycock, B.; Wang, H.; Adams, G.; Tomfohr, J. K.; Abad, E.; Wang, H.; Drabold, D. A. Phys. Status Solidi B 2011, 248, 1989-2007
60. Jelínek, P.; Wang, H.; Lewis, J.; Sankey, O.; Ortega, J. Phys. Rev. B 2005, 71, 235101
61. Demkov, A.; Ortega, J.; Sankey, O.; Grumbach, M. Phys. Rev. B 1995, 52, 1618-1630
62. Becke, A.. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098-3100
63. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789
64. Parandekar, P. V; Tully, J. C. J. Chem. Phys. 2005, 122, 094102
65. Parandekar, P. V.; Tully, J. C. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 229-235
66. Evans, D. J.; Hoover, W. G.; Failor, B. H.; Moran, B.; Ladd, A. J. C. Phys. Chem. Chem. Phys. 1983, 28, 1016-1021
67. García-Amorós, J.; Velasco, D. Beilstein J. Org. Chem. 2012, 8, 1003-1017
68. Yager, K. G.; Barrett, C. J. In Smart Light-Responsive Materials:Azobenzene-Containing Polymers and Liquid Crystals; Zhao, Y.; Ikeda, T., Eds.; John Wiley & Sons, Inc.: New York, 2009; pp 1-27.
69. Weingart, O.; Koslowski, A.; Thiel, W. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 2352-2358
70. Arenas, J. F.; Tocon, I.; Otero, J. C.; Marcos, J. J. Mol. Struct. 1995, 349, 29-32
71. Arenas, J. F.; Tocon, I. L.; Otero, J. C.; Marcos, J. I. J. Phys. Chem. 1995, 99, 11392-11398
72. Choi, C. H.; Kertesz, M. J. Phys. Chem. 1997, 101, 3823-3831
73. Matousek, P.; Parker, A. W.; Phillips, D. Chem. Phys. Lett. 1997, 278, 56-62
74. Dobryakov, A. L.; Ioffe, I.; Granovsky, A. A.; Ernsting, N. P.; Kovalenko, S. A. J. Chem. Phys. 2012, 137, 244505
75. Myers, A. B.; Mathies, R. A. J. Chem. Phys. 1984, 81, 1552
76. Stuart, C. M.; Frontiera, R. R.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 12072-80