Recent advances in solid-state nuclear magnetic resonance techniques to quantify biomolecular dynamics

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 1, 2014, Pages 58-64

  Watt, Eric D ^a   Rienstra, Chad M ^a,b  

^a UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

^b UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MEMBRANE PROTEIN;

ANIMAL; CHEMISTRY; HUMAN; METHODOLOGY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; REVIEW;

ANIMALS; HUMANS; MEMBRANE PROTEINS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY;

EID: 84891785171     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac403956k     Document Type: Review

References (52)

1. Comellas, G.; Rienstra, C. M. Annu. Rev. Biophys. 2013, 42, 515-536
2. Tang, M.; Comellas, G.; Rienstra, C. M. Acc. Chem. Res. 2013, 46, 2080-2088
3. McDermott, A.; Polenova, T.; Bockmann, A.; Zilm, K. W.; Paulson, E. K.; Martin, R. W.; Montelione, G. T. J. Biomol. NMR 2000, 16, 209-219
4. Pauli, J.; Baldus, M.; van Rossum, B.; de Groot, H.; Oschkinat, H. ChemBioChem 2001, 2, 101-110
5. Castellani, F.; van Rossum, B.; Diehl, A.; Schubert, M.; Rehbein, K.; Oschkinat, H. Nature 2002, 420, 98-102
6. Igumenova, T. I.; McDermott, A. E.; Zilm, K. W.; Martin, R. W.; Paulson, E. K.; Wand, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6720-6727
7. Igumenova, T. I.; Wand, A. J.; McDermott, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5323-5331
8. Lange, A.; Becker, S.; Seidel, K.; Giller, K.; Pongs, O.; Baldus, M. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 2089-2092
9. Franks, W. T.; Zhou, D. H.; Wylie, B. J.; Money, B. G.; Graesser, D. T.; Frericks, H. L.; Sahota, G.; Rienstra, C. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12291-12305
10. Franks, W. T.; Wylie, B. J.; Schmidt, H. L. F.; Nieuwkoop, A. J.; Mayrhofer, R. M.; Shah, G. J.; Graesser, D. T.; Rienstra, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 4621-4626
11. Wylie, B. J.; Sperling, L. J.; Nieuwkoop, A. J.; Franks, W. T.; Oldfield, E.; Rienstra, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 16974-16979
12. Wasmer, C.; Lange, A.; Van Melckebeke, H.; Siemer, A. B.; Riek, R.; Meier, B. H. Science 2008, 319, 1523-1526
13. Jehle, S.; Rajagopal, P.; Bardiaux, B.; Markovic, S.; Kuhne, R.; Stout, J. R.; Higman, V. A.; Klevit, R. E.; van Rossum, B. J.; Oschkinat, H. Nat. Struct. Mol. Biol. 2010, 17, 1037-U1
14. Cady, S. D.; Schmidt-Rohr, K.; Wang, J.; Soto, C. S.; Degrado, W. F.; Hong, M. Nature 2010, 463, 689-692
15. Shahid, S. A.; Bardiaux, B.; Franks, W. T.; Krabben, L.; Habeck, M.; van Rossum, B. J.; Linke, D. Nat. Methods 2012, 9, 1212-1217
16. Wang, S.; Munro, R. A.; Shi, L.; Kawamura, I.; Okitsu, T.; Wada, A.; Kim, S. Y.; Jung, K. H.; Brown, L. S.; Ladizhansky, V. Nat. Methods 2013, 10, 1007-1012
17. Fitzpatrick, A. W.; Debelouchina, G. T.; Bayro, M. J.; Clare, D. K.; Caporini, M. A.; Bajaj, V. S.; Jaroniec, C. P.; Wang, L.; Ladizhansky, V.; Muller, S. A.; MacPhee, C. E.; Waudby, C. A.; Mott, H. R.; De Simone, A.; Knowles, T. P.; Saibil, H. R.; Vendruscolo, M.; Orlova, E. V.; Griffin, R. G.; Dobson, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 5468-5473
18. Lu, J. X.; Qiang, W.; Yau, W. M.; Schwieters, C. D.; Meredith, S. C.; Tycko, R. Cell 2013, 154, 1257-1268
19. Tycko, R. Acc. Chem. Res. 2013, 46, 1923-1932
20. Ullrich, S. J.; Hellmich, U. A.; Ullrich, S.; Glaubitz, C. Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 263-270
21. Chimon, S.; Ishii, Y. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13472-13473
22. Chimon, S.; Shaibat, M. A.; Jones, C. R.; Calero, D. C.; Aizezi, B.; Ishii, Y. Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 1157-1164
23. Comellas, G.; Lemkau, L. R.; Zhou, D. H.; George, J. M.; Rienstra, C. M. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 5090-5099
24. deAzevedo, E. R.; Hu, W. G.; Bonagamba, T. J.; Schmidt-Rohr, K. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8411-8412
25. deAzevedo, E. R.; Hu, W. G.; Bonagamba, T. J.; Schmidt-Rohr, K. J. Chem. Phys. 2000, 112, 8988-9001
26. Krushelnitsky, A.; deAzevedo, E.; Linser, R.; Reif, B.; Saalwächter, K.; Reichert, D. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 12097-12099
27. Buffy, J. J.; Waring, A. J.; Hong, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4477-4483
28. Luo, W.; Hong, M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 7242-7251
29. Li, W.; McDermott, A. J. Magn. Res. 2012, 222, 74-80
30. Carr, H.; Purcell, E. Phys. Rev. 1954, 94, 630-638
31. Meiboom, S.; Gill, D. Rev. Sci. Instrum. 1958, 29, 688-691
32. Baldwin, A. J.; Religa, T. L.; Hansen, D. F.; Bouvignies, G.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 10992-10995
33. Beach, H.; Cole, R.; Gill, M. L.; Loria, J. P. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 9167-9176
34. Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2331-2332
35. Hansen, D. F.; Vallurupalli, P.; Kay, L. E. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 5898-5904
36. Mulder, F. A.; Mittermaier, A.; Hon, B.; Dahlquist, F. W.; Kay, L. E. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 932-935
37. Watt, E. D.; Shimada, H.; Kovrigin, E. L.; Loria, J. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 11981-11986
38. Boehr, D. D.; McElheny, D.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Science 2006, 313, 1638-1642
39. Loria, J. P.; Berlow, R. B.; Watt, E. D. Acc. Chem. Res. 2008, 41, 214-221
40. Palmer, A. G., III Chem. Rev. 2004, 104, 3623-3640
41. Kempf, J. G.; Loria, J. P. Methods Mol. Biol. (Clifton, NJ) 2004, 278, 185-231
42. Baldwin, A. J.; Kay, L. E. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 808-814
43. Tollinger, M.; Sivertsen, A. C.; Meier, B. H.; Ernst, M.; Schanda, P. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 14800-14807
44. Quinn, C. M.; McDermott, A. E. J. Magn. Reson. 2012, 222, 1-7
45. Lewandowski, J. z. R.; Sass, H. J.; Grzesiek, S.; Blackledge, M.; Emsley, L. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 16762-16765
46. deAzevedo, E. R.; Saalwächter, K.; Pascui, O.; de Souza, A. A.; Bonagamba, T. J.; Reichert, D. J. Chem. Phys. 2008, 128, 104505
47. Hohwy, M.; Jaroniec, C. P.; Reif, B.; Rienstra, C. M.; Griffin, R. G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3218-3219
48. Vinogradov, E.; Madhu, P. K.; Vega, S. J. Chem. Phys. 2001, 115, 8983-9000
49. Lorieau, J. L.; McDermott, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 11505-11512
50. Hu, F.; Luo, W.; Hong, M. Science 2010, 330, 505-508
51. Lorieau, J. L.; Day, L. A.; McDermott, A. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 10366-10371
52. Mollica, L.; Baias, M.; Lewandowski, J. z. R.; Wylie, B. J.; Sperling, L. J.; Rienstra, C. M.; Emsley, L.; Blackledge, M. J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 3657-3662