Target-triggered cyclic assembly of DNA-protein hybrid nanowires for dual-amplified fluorescence anisotropy assay of small molecules

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 23, 2013, Pages 11518-11523

  Yang, Bin ^a   Zhang, Xiao Bing ^a   Kang, Li Ping ^a   Shen, Guo Li ^a   Yu, Ru Qin ^a   Tan, Weihong ^a  

^a HUNAN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL SAMPLES; COMPLEX BIOLOGICAL SYSTEMS; ENVIRONMENTAL INTERFERENCE; FLUORESCENCE ANISOTROPY; HIGHLY SENSITIVE DETECTIONS; HYBRIDIZATION CHAIN REACTIONS; LIMIT OF DETECTION; NON-SPECIFIC INTERACTIONS;

ADENOSINETRIPHOSPHATE; ANISOTROPY; BODY FLUIDS; DNA; FLUORESCENCE; MOLECULES; NANOWIRES; PROBES; PROTEINS;

ASSAYS;

DNA; NANOWIRE; OLIGONUCLEOTIDE;

ARTICLE; CHEMISTRY; FLUORESCENCE POLARIZATION; GENE TARGETING; GENETICS; HUMAN; METHODOLOGY; MOLECULAR GENETICS; NUCLEOTIDE SEQUENCE;

BASE SEQUENCE; DNA; FLUORESCENCE POLARIZATION; GENE TARGETING; HUMANS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NANOWIRES; OLIGONUCLEOTIDES;

EID: 84889028470     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac402781g     Document Type: Article

References (46)

1. Smith, D. S.; Eremin, S. A. Anal. Bioanal. Chem. 2008, 391, 1499-1507
2. Jameson, D. M.; Ross, J. A. Chem. Rev. 2010, 110, 2685-2708
3. Ellington, A. D.; Szostak, J. W. Nature 1990, 346, 818-822
4. Tuerk, C.; Gold, L. Science 1990, 249, 505-510
5. Potyrailo, R. A.; Conrad, R. C.; Ellington, A. D.; Hieftje, G. M. Anal. Chem. 1998, 70, 3419-3425
6. Jayasena, S. D. Clin. Chem. 1999, 45, 1628-1650
7. Fang, X. H.; Cao, Z. H.; Beck, T.; Tan, W. H. Anal. Chem. 2001, 73, 5752-5757
8. Gokulrangan, G.; Unruh, J. R.; Holub, D. F.; Ingram, B.; Johnson, C. K.; Wilson, G. S. Anal. Chem. 2005, 77, 1963-1970
9. Zhang, D.; Lu, M.; Wang, H. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 9188-9191
10. Zhang, D. P.; Zhao, Q.; Zhao, B. L.; Wang, H. L. Anal. Chem. 2012, 84, 3070-3074
11. Deng, T.; Li, J.; Zhang, L.-L.; Jiang, J.-H.; Chen, J.-N.; Shen, G.-L.; Yu, R.-Q. Biosens. Bioelectron. 2010, 25, 1587-1591
12. Ye, B. C.; Yin, B. C. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 8386-8389
13. Yin, B. C.; Zuo, P.; Huo, H.; Zhong, X.; Ye, B. C. Anal. Biochem. 2010, 401, 47-52
14. Yu, Y.; Liu, Y.; Zhen, S. J.; Huang, C. Z. Chem. Commun. 2013, 49, 1942-1944
15. Perrier, S.; Ravelet, C.; Guieu, V.; Fize, J.; Roy, B.; Perigaud, C.; Peyrin, E. Biosens. Bioelectron. 2010, 25, 1652-1657
16. Cui, L.; Zou, Y.; Lin, N. H.; Zhu, Z.; Jenkins, G.; Yang, C. Y. Anal. Chem. 2012, 84, 5535-5541
17. Zhu, Z. Y.; Ravelet, C.; Perrier, S.; Guieu, V.; Fiore, E.; Peyrin, E. Anal. Chem. 2012, 84, 7203-7211
18. Liu, J. H.; Wang, C. Y.; Jiang, Y.; Hu, Y. P.; Li, J. S.; Yang, S.; Li, Y. H.; Yang, R. H.; Tan, W. H.; Huang, C. Z. Anal. Chem. 2013, 85, 1424-1430
19. Yurke, B.; Turberfield, A. J.; Mills, A. P.; Simmel, F. C.; Neumann, J. L. Nature 2000, 406, 605-608
20. Yin, P.; Choi, H. M. T.; Calvert, C. R.; Pierce, N. A. Nature 2008, 451, 318-322
21. Wang, Z.-G.; Elbaz, J.; Willner, I. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 4322-4326
22. Song, T. J.; Liang, H. J. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 10803-10806
23. Dirks, R. M.; Pierce, N. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 15275-15278
24. Venkataraman, S.; Dirks, R. M.; Rothemund, P. W. K.; Winfree, E.; Pierce, N. A. Nat. Nanotechnol. 2007, 2, 490-494
25. Zhu, G. Z.; Zheng, J.; Song, E. Q.; Donovan, M.; Zhang, K. J.; Liu, C.; Tan, W. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 7999-8003
26. Zhu, G. Z.; Zhang, S. F.; Song, E. Q.; Zheng, J.; Hu, R.; Fang, X. H.; Tan, W. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 5490-5496
27. Wang, F.; Elbaz, J.; Orbach, R.; Magen, N.; Willner, I. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 17149-17151
28. Chandran, H.; Rangnekar, A.; Shetty, G.; Schultes, E. A. Biotechnol. J. 2013, 8, 247-256
29. Nakayama, S.; Yan, L.; Sintim, H. O. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 12560-12561
30. Kong, R. M.; Zhang, X. B.; Chen, Z.; Meng, H. M.; Song, Z. L.; Tan, W. H.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. Anal. Chem. 2011, 83, 7603-7607
31. Zuo, X.; Xia, F.; Xiao, Y.; Plaxco, K. W. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1816-1818
32. Wang, G. L.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2012, 84, 7037-7042
33. Huang, J.; Wu, Y. R.; Chen, Y.; Zhu, Z.; Yang, X. H.; Yang, C. Y. J.; Wang, K.; Tan, W. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 401-404
34. Venkataraman, S.; Dirks, R. M.; Ueda, C. T.; Pierce, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 16777-16783
35. Choi, H.; Chang, J.; Trinh, L. A.; Padilla, J.; Fraser, S.; Pierce, N. Nat. Biotechnol. 2010, 28, 1208-1212
36. Yan, H.; Park, S. H.; Finkelstein, G.; Reif, J. H.; LaBean, T. H. Science 2003, 301, 1882-1884
37. Meyer, R.; Niemeyer, C. M. Small 2011, 7, 3211-3218
38. Wong, N. Y.; Xing, H.; Tan, L. H.; Lu, Y. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 2931-2934
39. Zhang, C.; Tian, C.; Guo, F.; Liu, Z.; Jiang, W.; Mao, C. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 3382-3385
40. Wieland, M.; Benz, A.; Haar, J.; Halder, K.; Hartig, J. S. Chem. Commun. 2010, 46, 1866-1868
41. Xing, Y. Z.; Yang, Z. Q.; Liu, D. S. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 11934-11936
42. Li, L. L.; Ge, P.; Selvin, P. R.; Lu, Y. Anal. Chem. 2012, 84, 7852-7856
43. Tan, X.; Chen, T.; Xiong, X.; Mao, Y.; Zhu, G.; Yasun, E.; Li, C.; Zhu, Z.; Tan, W. Anal. Chem. 2012, 84, 8622-8627
44. Pu, Y.; Zhu, Z.; Han, D.; Liu, H.; Liu, J.; Liao, J.; Zhang, K.; Tan, W. Analyst 2011, 136, 4138-4140
45. Duose, D. Y.; Schweller, R. M.; Zimak, J.; Rogers, A. R.; Hittelman, W. N.; Diehl, M. R. Nucleic Acids Res. 2012, 40, 3289-3298
46. Yang, C. J.; Martinez, K.; Lin, H.; Tan, W. J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 9986-9987