High affinity phosphopeptides enrichment and desalting of biological materials on newly engineered poly(Glycidyl Propargyl Ether/Divinyl Benzene)

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 19, 2013, Pages 8979-8986

  Saeed, Adeela ^a,b   Najam Ul Haq, Muhammad ^a   Jabeen, Fahmida ^a   Svec, Frantisek ^b  

^a BAHAUDDIN ZAKARIYA UNIVERSITY   (Pakistan)

^b LAWRENCE BERKELEY NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIFUNCTIONAL MONOMERS; ENERGY DISPERSIVE X RAY SPECTROSCOPY; IMMOBILIZED METAL ION AFFINITY CHROMATOGRAPHIES; PHOSPHOPEPTIDE ENRICHMENT; PHYSICAL AND CHEMICAL PROPERTIES; SELECTIVITY AND SENSITIVITY; SEPARATION SCIENCE; SYNTHESIZED POLYMERS;

AFFINITY CHROMATOGRAPHY; BODY FLUIDS; DESALINATION; DIAGNOSIS; FOURIER TRANSFORM INFRARED SPECTROSCOPY; METAL IONS; SCANNING ELECTRON MICROSCOPY; SURFACE CHEMISTRY; X RAY SPECTROSCOPY;

POLYMERS;

ETHER DERIVATIVE; PHOSPHOPEPTIDE; POLY(GLYCIDYL PROPARGYL ETHER DIVINYL BENZENE); POLY(GLYCIDYL PROPARGYL ETHER-DIVINYL BENZENE); VINYL DERIVATIVE;

ARTICLE; BLOOD; CHEMISTRY; FEMALE; HUMAN; ISOLATION AND PURIFICATION; MASS SPECTROMETRY; OVARY TUMOR; SYNTHESIS;

ETHERS; FEMALE; HUMANS; OVARIAN NEOPLASMS; PHOSPHOPEPTIDES; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION; VINYL COMPOUNDS;

EID: 84884997401     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac4015484     Document Type: Article

References (62)

1. Graves, J. D.; Krebs, E. G. Pharmacol Ther. 1999, 82, 111-121
2. Bollen, M.; Beullens, M. Trends Cell Biol. 2002, 12, 138-145
3. Manning, G.; Plowman, G. D.; Hunter, T.; Sudarsanam, S. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 514-520
4. Guo, M. Q.; Huang, B. X. Curr. Anal. Chem. 2012, 8, 3-21
5. Mithoe, S. C.; Boersema, P. J.; Berke, L.; Snel, B.; Heck, A. J. R.; Menke, F. L. H. J. Proteome Res. 2012, 11, 438-448
6. Li, Y.; Xu, X.; Qi, D.; Deng, C.; Yang, P.; Zhang, X. J. Proteome Res. 2008, 7, 2526-2538
7. Najam-ul-Haq, M.; Jabeen, F.; Hussain, D.; Saeed, A.; Musharraf, S. G.; Huck, C. W.; Bonn, G. K. Anal. Chim. Acta 2012, 747, 7-18
8. Pietrowska, M.; Widłak, P. Int. J. Proteomics 2012, org/10.1155/2012/926427
9. Ludwig, J. A.; Weinstein, J. N. Nat. Rev. Cancer 2005, 5, 845-856
10. Chen, X.; Andersson, R.; Cho, W. C. S.; Christiani, D.; Coico, R.; Drazen, J.; Ege, M.; Fehniger, T.; Gao, H.; Jin, K.; Liebman, M. N.; Lopez, E.; Marraro, G.; Marko-Varga, G.; Marincola, F. M.; Popescu, L. M.; Spada, C.; Shahzad, A.; Wang, E.; Wang, W.; Wang, X.; Wang, Y.-X.; Xia, J.; Qu, J. Clin. Transl. Med. 2012, 1, 15
11. Calvano, C. D.; Zambonin, C. G. Adv. Dairy Res. 2013, 1, 101
12. Gatlin-Bunai, G. L.; Cazares, L. H.; Cooke, W. E.; Semmes, O. J.; Malyarenko, D. I. J. Proteome Res. 2011, 6, 4517-4524
13. Sun, L.; Duan, J.; Tao, D.; Liang, Z.; Zhang, W.; Zhang, L.; Zhang, Y. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008, 22, 2391-2397
14. Jia, W.; Huixia, W.; Haojie, L.; Li, N.; Zhang, Y.; Cai, R.; Yang, P. Proteomics. 2007, 7, 2497-2506
15. Gustafsson, M.; Hirschberg, D.; Palmberg, C.; Jornvall, H.; Bergman, T. Anal. Chem. 2004, 76, 345-350
16. Thingholm, T. E.; Jensen, O. N.; Larsen, M. R. Proteomics 2009, 9, 1451-1468
17. Fíla, J.; Honys, D. Amino Acids 2012, 43, 1025-1047
18. Machida, M.; Kosako, H.; Shirakabe, K.; Kobayashi, M.; Ushiyama, M.; Inagawa, J.; Hirano, J.; Nakano, T.; Bando, Y.; Nishida, E.; Hattori, S. FEBS J. 2007, 274, 576-587
19. Tan, F.; Zhang, Y.; Mi, W.; Wang, J.; Wei, J.; Cai, Y.; Qian, X. J. Proteome Res. 2008, 7, 1078-1087
20. Feng, S.; Ye, M.; Zhou, H.; Jiang, X.; Zhou, H.; Jiang, X.; Jiang, X.; Gong, B. Mol. Cell Proteomics 2007, 6, 1656-1665
21. Moser, K.; White, F. M. J. Proteome Res. 2006, 5, 98-104
22. Zhang, B.; Liu, J.-Y. PLoS One 2013, 8 e58758
23. Kapustin, D. M.; Prostyakova, A.; Ryazantsev, D. Y.; Zubov1, V. P. Nanomedicine 2011, 6, 241-255
24. Metzner, M.; Schuh, W.; Roth, E.; Jäck, H. M.; Wabl, M. PLoS One 2010, 5 e8883
25. Barbey, R.; Laporte, V.; Alnabulsi, S.; Klok, H.-A. Macromolecules 2013, 46, 6151-6158
26. Comelles, J.; Estévez, M.; Martínez, E.; Samitier, J. Nanomedicine 2010, 6, 44-51
27. Simon, C. G., Jr; Kumar, G.; Chatterjee, K.; Hung, S. Biomaterials 2012, 3, 372-381
28. Xu, Y.; Bruening, M. L.; Watson, J. T. Anal. Chem. 2004, 76, 3106-3111
29. Xu, Y.; Watson, J. T.; Bruening, M. L. Anal. Chem. 2003, 75, 185-190
30. Denis, M. F. L.; Carballo, R. R.; Spiaggi, A. J.; Dabas, P. C.; Orto, V. C. D.; MartInez, J. M. L.; Buldain, G. Y. React. Funct. Polym. 2008, 68, 169-181
31. Chen, Z.; Xu, L.; Liang, Y.; Wang, J.; Zhao, M.; Li, Y. Chromatogr. A 2008, 1182, 128-131
32. Jiang, X. Y.; Bai, S.; Sun, Y. J. Chromatogr. B 2007, 852, 62-68
33. Owino, J. H. O.; Arotiba, O. A.; Baker, P. G. L.; Guiseppi-Elie, A.; Iwuoha, E. I. React. Funct. Polym. 2008, 68, 1239-1244
34. Goddard, J. M.; Hotchkiss, J. H. J. Appl. Polym. Sci. 2008, 108, 2940-2949
35. Jain, P.; Sun, L.; Dai, J.; Baker, G. L.; Bruening, M. L. Biomacromolecules 2007, 8, 3102-3107
36. Liu, J.; Sun, X.; Lee, M. L. Anal. Chem. 2005, 77, 6280-6287
37. Liu, J.; Sun, X.; Farnsworth, P. B.; Lee, M. L. Anal. Chem. 2006, 78, 4654-4662
38. Sundberg, L.; Porath, J. J. Chromatogr. 1974, 171, 87-98
39. Dunnill, P.; Lilly, M. D. Biotechnol. Bioeng. 1974, 16, 987-989
40. Turkova, J.; Blaha, K.; Horacek, J.; Vajener, J.; Frydrychova, A.; Coupek, J. J. Chromatogr. 1981, 215, 165-179
41. Rainer, M.; Najam-ul-Haq, M.; Bakry, R.; Huck, C. W.; Bonn, G. K. J. Proteome Res. 2007, 6, 382-386
42. López, E.; López, I.; Ferreira, A.; Sequí, J. Proteome Sci. 2011, 9, 27
43. Toss, A.; Matteis, E. D.; Rossi, E.; Casa, L. D.; Iannone, A.; Federico, M.; Cortesi, L. Int. J. Mol. Sci. 2013, 14, 8271-8290
44. Hu, L.; Zhou, H.; Li, Y.; Sun, S.; Guo, L.; Ye, M.; Tian, X.; Gu, J.; Yang, S.; Zou, H. Anal. Chem. 2009, 81, 94-104
45. López, E.; Wesselink, J.-J.; López, I.; Mendieta, J.; Gómez-Puertas, P.; Muñoz, S. R. J. Clin. Bioinf. 2011, 1, 26
46. Rainer, M.; Najam-ul-Haq, M.; Huck, C. W.; Feuerstein, I.; Bakry, R.; Huber, L. A.; Gjerde, D. T.; Xiajuan, Z.; Honggang, Q.; Xiaojuan, D.; Fang, W. G.; Yang, K.; Bonn, G. K. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2006, 20, 2954-2960
47. Feuerstein, I.; Najam-ul-Haq, M.; Rainer, M.; Trojer, L.; Bakry, R.; Aprilita, N. H.; Stecher, G.; Huck, C. W.; Bonn, G. K.; Klocker, H.; Bartsch, G.; Guttman, A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006, 17, 1203-1208
48. Najam-ul-Haq, M.; Rainer, M.; Schwarzenauer, T.; Huck, C. W.; Bonn, G. K. Anal. Chim. Acta 2006, 561, 32-39
49. Najam-ul-Haq, M.; Rainer, M.; Huck, C. W.; Stecher, G.; Feuerstein, I.; Steinmüller, D.; Bonn, G. K. Curr. Nanosci. 2006, 2, 1-7
50. Vallant, R. M.; Szabo, Z.; Trojer, L.; Najam-ul-Haq, M.; Rainer, M.; Huck, C. W.; Bakry, R.; Bonn, G. K. J. Proteome Res. 2007, 6, 44-53
51. Najam-ul-Haq, M.; Rainer, M.; Trojer, L.; Feuerstein, I.; Vallant, R. M.; Huck, C. W.; Bakry, R.; Bonn, G. K. Exp. Rev. Proteomics 2007, 4, 447-452
52. Najam-ul-Haq, M.; Rainer, M.; Huck, C. W.; Ashiq, M. N.; Bonn, G. K. Amino Acids 2012, 43, 823-831
53. Maneula, C.; Gitta, S.; Giuseppina, C.; Livia, M. J. Mass Spectrom. 2007, 42, 1069-1078
54. Yamamoto, D.; Takai, S.; Miyazaki, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2007, 4, 981-984
55. Han, Y.; Levkin, P.; Abarientos, I.; Liu, H.; Svec, F.; Fréchet, J. M. J. Anal. Chem. 2010, 82, 2520-2528
56. Zhou, H.; Ye, M.; Dong, J.; Han, G.; Jiang, X.; Wu, R.; Zou, H. J. Proteome Res. 2008, 7, 3957-3967
57. Wang, H.; Duan, J.; Xu, H.; Zhao, L.; Liang, Y.; Shan, Y.; Zhang, L.; Liang, Z.; Zhang, Y. J. Sep. Sci. 2011, 34, 2113-2121
58. Li, H.; Guo, M.; Tian, H.; He, F. -Y.; Lee, G. -H.; Peng, S. -M. J. Solid State Chem. 2006, 179, 3511-3517
59. Zhang, B.; Liu, X.; Shi, Q.; Liang, Q.; Wu, C.; Chen J. Anal. Methods 2012, 4, 652-658
60. Jabeen, F.; Hussain, D.; aaFatima, B.; Musharraf, S. G.; Huck, C. W.; Bonn, G. K.; Najam-ul-Haq, M. Anal. Chem. 2012, 84, 10180-10185
61. Hussain, D.; Najam-ul-Haq, M.; Jabeen, F.; Ashiq, M. N.; Athar, M.; Rainer, M.; Huck, C. W.; Bonn, G. K. Anal. Chim. Acta 2013, 775, 75-84
62. Bailey, M. J.; Shield-Artin, K. L.; Oliva, K.; Ayhan, M.; Reisman, S.; Rice, G. E. J. Carcinog. 2013, 12, 10