Molecular threading and tunable molecular recognition on DNA origami nanostructures

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 33, 2013, Pages 12172-12175

  Wu, Na ^a   Czajkowsky, Daniel M ^b   Zhang, Jinjin ^a   Qu, Jianxun ^b   Ye, Ming ^a   Zeng, Dongdong ^a   Zhou, Xingfei ^c   Hu, Jun ^a   Shao, Zhifeng ^b   Li, Bin ^a   Fan, Chunhai ^a  

^a SHANGHAI INSTITUTE OF APPLIED PHYSICS   (China)

^b SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY   (China)

^c NINGBO UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMIC FORCE; BIOCHEMICAL REACTIONS; CRITICAL DESIGN; DNA ORIGAMIS; FUNCTIONAL CAPABILITIES; MOLECULAR THREADING; RELIABLE MEASUREMENT; SINGLE MOLECULE LEVEL;

FUNCTIONAL MATERIALS; NANOSTRUCTURES; PROTEINS; SCAFFOLDS;

DNA;

STREPTAVIDIN;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CRYOELECTRON MICROSCOPY; DNA ORIGAMI NANOSTRUCTURE; DNA STRUCTURE; FREQUENCY MODULATION; MOLECULAR RECOGNITION; POLARIZATION;

DNA, SINGLE-STRANDED; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; NANOSTRUCTURES; NUCLEIC ACID CONFORMATION;

EID: 84883100160     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja403863a     Document Type: Article

References (27)

1. Rothemund, P. W. K. Nature 2006, 440, 297
2. Torring, T.; Voigt, N. V.; Nangreave, J.; Yan, H.; Gothelf, K. V. Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 5636
3. Saccà, B.; Niemeyer, C. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 58
4. Ding, B. Q.; Deng, Z. T.; Yan, H.; Cabrini, S.; Zuckermann, R. N.; Bokor, J. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 3248
5. Voigt, N. V.; Torring, T.; Rotaru, A.; Jacobsen, M. F.; Ravnsbaek, J. B.; Subramani, R.; Mamdouh, W.; Kjems, J.; Mokhir, A.; Besenbacher, F.; Gothelf, K. V. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 200
6. Pal, S.; Deng, Z. T.; Ding, B. Q.; Yan, H.; Liu, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 2700
7. Pearson, A. C.; Liu, J.; Pound, E.; Uprety, B.; Woolley, A. T.; Davis, R. C.; Harb, J. N. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 10551
8. Rajendran, A.; Endo, M.; Sugiyama, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 874
9. Kershner, R. J.; Bozano, L. D.; Micheel, C. M.; Hung, A. M.; Fornof, A. R.; Cha, J. N.; Rettner, C. T.; Bersani, M.; Frommer, J.; Rothemund, P. W. K.; Wallraff, G. M. Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 557
10. Hung, A. M.; Micheel, C. M.; Bozano, L. D.; Osterbur, L. W.; Wallraff, G. M.; Cha, J. N. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 121
11. Kim, K. N.; Sarveswaran, K.; Mark, L.; Lieberman, M. Soft Matter 2011, 7, 4636
12. Lund, K.; Manzo, A. J.; Dabby, N.; Michelotti, N.; Johnson-Buck, A.; Nangreave, J.; Taylor, S.; Pei, R. J.; Stojanovic, M. N.; Walter, N. G.; Winfree, E.; Yan, H. Nature 2010, 465, 206
13. Wickham, S. F. J.; Endo, M.; Katsuda, Y.; Hidaka, K.; Bath, J.; Sugiyama, H.; Turberfield, A. J. Nat. Nanotechnol. 2011, 6, 166
14. Qian, L.; Wang, Y.; Zhang, Z.; Zhao, J.; Pan, D.; Zhang, Y.; Liu, Q.; Fan, C.; Hu, J.; He, L. Chin. Sci. Bull. 2006, 51, 2973
15. Sacca, B.; Meyer, R.; Erkelenz, M.; Kiko, K.; Arndt, A.; Schroeder, H.; Rabe, K. S.; Niemeyer, C. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 9378
16. Yamada, H.; Kobayashi, K.; Fukuma, T.; Hirata, Y.; Kajita, T.; Matsushige, K. Appl. Phys. Express 2009, 2, 95007
17. Zhang, C.; He, Y.; Chen, Y.; Ribbe, A. E.; Mao, C. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 14134
18. Babin, V.; Baucom, J.; Darden, T. A.; Sagui, C. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 11571
19. Bai, X. C.; Martin, T. G.; Scheres, S. H. W.; Dietz, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 20012
20. Weber, P. C.; Ohlendorf, D.; Wendoloski, J.; Salemme, F. Science 1989, 243, 85
21. Wu, N.; Zhou, X. F.; Czajkowsky, D. M.; Ye, M.; Zeng, D. D.; Fu, Y. M.; Fan, C. H.; Hu, J.; Li, B. Nanoscale 2011, 3, 2481
22. Zhang, Z.; Wang, Y.; Fan, C. H.; Li, C.; Li, Y.; Qian, L. L.; Fu, Y. M.; Shi, Y. Y.; Hu, J.; He, L. Adv. Mater. 2010, 22, 2672
23. Murphy, M.; Rasnik, I.; Cheng, W.; Lohman, T. M.; Ha, T. Biophys. J. 2004, 86, 2530
24. Chen, H.; Meisburger, S. P.; Pabit, S. A.; Sutton, J. L.; Webb, W. W.; Pollack, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 799
25. Ko, S. H.; Gallatin, G. M.; Liddle, J. A. Adv. Funct. Mater. 2012, 22, 1015
26. Maune, H. T.; Han, S. P.; Barish, R. D.; Bockrath, M.; Goddard, W. A.; Rothemund, P. W. K.; Winfree, E. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 61
27. Kuzyk, A.; Schreiber, R.; Fan, Z.; Pardatscher, G.; Roller, E.-M.; Högele, A.; Simmel, F. C.; Govorov, A. O.; Liedl, T. Nature 2012, 483, 311