Applying vibrational spectroscopy to the study of nucleobases-adenine as a case-study

New Journal of Chemistry

Volumn 37, Issue 9, 2013, Pages 2691-2699

  Lopes, Rui P ^a   Valero, Rosendo ^a   Tomkinson, John ^b   Marques, M Paula M ^a,c   Batista De Carvalho, Luís A E ^a  

^a UNIVERSITY OF COIMBRA   (Portugal)

^b RUTHERFORD APPLETON LABORATORY   (United Kingdom)

^c UNIVERSITY OF COIMBRA   (Portugal)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENINE; NUCLEIC ACID BASE;

ANALYTIC METHOD; ARTICLE; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; FOURIER TRANSFORM MASS SPECTROMETRY; NEUTRON SCATTERING; PRIORITY JOURNAL; QUANTUM CHEMISTRY; RAMAN SPECTROMETRY; SOLID STATE; SPECTROSCOPY; TAUTOMER; VIBRATIONAL SPECTROSCOPY;

EID: 84882417883     PISSN: 11440546     EISSN: 13699261     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3nj00445g     Document Type: Article

References (49)

1. J. E. Sponer J. Leszczynski F. Glahé B. Lippert J. Sponer Inorg. Chem. 2001 40 3269
2. M. G. Añorbe M. S. Lüth M. Roitzsch M. M. Cerdà P. Lax G. Kampf H. Sigel B. Lippert Chem.-Eur. J. 2004 10 1046
3. Z. Dhaouadi M. Ghomi J. Austin R. Girling R. Hester P. Mojzes L. Chinsky P. Turpin C. Coulombeau J. Phys. Chem. 1993 97 1074
4. A. Toyama H. Takeuchi I. Harada J. Mol. Struct. 1991 242 87
5. M. J. Nowak L. Lapinski J. S. Kwiatkowski J. Leszczynski J. Phys. Chem. 1996 100 3527
6. G. N. Ten V. V. Nechaev N. B. Zotov V. I. Baranov Opt. Spectrosc. 2009 107 58
7. T. Burova G. Ten V. Ermolenkov R. Shcherbakov I. Lednev Opt. Spectrosc. 2010 109 853
8. G. Ten T. Burova R. Shcherbakov V. Baranov Opt. Spectrosc. 2010 109 845
9. T. G. Burova V. V. Ermolenkov G. N. Ten R. S. Shcherbakov V. I. Baranov I. K. Lednev J. Phys. Chem. A 2011 115 10600
10. M. Hanus M. Kabeláč J. Rejnek F. Ryjáček P. Hobza J. Phys. Chem. B 2004 108 2087
11. C. F. Guerra F. M. Bickelhaupt S. Saha F. Wang J. Phys. Chem. A 2006 110 4012
12. M. Y. Choi F. Dong S. W. Han R. E. Miller J. Phys. Chem. A 2008 112 7185
13. Y. Xue D. Xu D. Xie G. Yan Spectrochim. Acta, Part A 2000 56 1929
14. C. Plützer E. Nir M. Vries K. Kleinermanns Phys. Chem. Chem. Phys. 2001 3 5466
15. K. Rajabi K. Theel E. A. L. Gillis G. Beran T. D. Fridgen J. Phys. Chem. A 2009 113 8099
16. T. J. Kistenmacher T. Shigematsu Acta Crystallogr., Sect. B: Struct. Crystallogr. Cryst. Chem. 1974 30 1528
17. T. C. Lewis D. A. Tocher Acta Crystallogr., Sect. E: Struct. Rep. Online 2005 61 o1052
18. R. J. Fram Curr. Opin. Oncol. 1992 4 1073
19. M. Majoube M. Henry G. Vergoten J. Raman Spectrosc. 1994 25 233
20. M. Majoube P. Millie L. Chinsky P. Y. Turpin G. Vergoten J. Mol. Struct. 1995 355 147
21. C. Lee K.-H. Park M. Cho J. Chem. Phys. 2006 125 114508
22. C. Lee M. Cho J. Chem. Phys. 2007 126 145102
23. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, Gaussian 03, Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 2003
24. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 1372
25. A. D. Becke Phys. Rev. A 1988 38 3098
26. A. D. Becke Chem. Phys. 1993 98 5648
27. G. Petersson A. Bennett T. G. Tensfeldt M. A. Al-Laham W. A. Shirley J. Mantzaris J. Chem. Phys. 1988 89 2193
28. C. Peng P. Y. Ayala H. B. Schlegel M. J. Frisch J. Comput. Chem. 1996 17 49
29. P. Giannozzi S. Baroni N. Bonini M. Calandra R. Car C. Cavazzoni D. Ceresoli G. L. Chiarotti M. Cococcioni I. Dabo A. S. de Gironcoli S. Fabris G. Fratesi R. Gebauer U. Gerstmann C. Gougoussis A. Kokalj M. Lazzeri L. Martin-Samos N. Marzari F. Mauri R. Mazzarello S. Paolini A. Pasquarello L. Paulatto C. Sbraccia S. Scandolo G. Sclauzero A. P. Seitsonen A. Smogunov P. Umari R. M. Wentzcovitch J. Phys.: Condens. Matter 2009 21 395502
30. J. P. Perdew A. Zunger Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1981 23 5048
31. S. Mahapatra S. K. Nayak S. J. Prathapa T. N. G. Row Cryst. Growth Des. 2008 8 1223
32. A. D. Corso S. Baroni R. Resta S. de Gironcoli Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1993 47 3588
33. N. Troullier J. L. Martins Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1991 43 1993
34. H. J. Monkhorst J. D. Pack Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1976 13 5188
35. P. Gianozzi and S. Baroni, Handbook of Materials Modeling. Methods and Models, Springer, 2005, p. 195
36. J. P. Merrick D. Moran L. Radom J. Phys. Chem. A 2007 111 11683
37. S. I. Gorelsky, http://www.sg-chem.net/, University of Ottawa, Ottawa, Canada, 2010
38. S. I. Gorelsky A. B. P. Lever J. Organomet. Chem. 2001 635 187
39. A. J. Ramirez-Cuesta Comput. Phys. Commun. 2004 157 226
40. ISIS-A world centre for neutrons and muons, http://www.isis.stfc.ac.uk/, 31 October, 2012, UK
41. A. Bondi J. Phys. Chem. 1964 68 441
42. R. P. Lopes M. P. M. Marques R. Valero J. Tomkinson L. A. E. Batista de Carvalho Spectrosc. Int. J. 2012 27 273
43. T. A. Mohamed I. A. Shabaan W. M. Zoghaib J. Husband R. S. Farag A. E. N. Alajhaz J. Mol. Struct. 2009 938 263
44. O. V. Shishkin L. Gorb J. Leszczynski Chem. Phys. Lett. 2000 330 603
45. R. Santamaria E. Charro A. Zacarías M. Castro J. Comput. Chem. 1999 20 511
46. M. Mathlouthi L. Seuvre Jack Carbohydr. Res. 1984 131 1
47. A. Hirakawa H. Okada S. Sasagawa M. Tsuboi Spectrochim. Acta, Part A: Mol. Spectrosc. 1985 41 209
48. ISIS-TOSCA, http://www.isis.stfc.ac.uk/instruments/tosca/tosca4715.html, 31 October, 2012, UK
49. T. G. Burova V. V. Ermolenkov G. N. Ten R. S. Shcherbakov V. I. Baranov I. K. Lednev J. Phys. Chem. A 2011 115 10600