Single vesicle biochips for ultra-miniaturized nanoscale fluidics and single molecule bioscience

Lab on a Chip

Volumn 13, Issue 18, 2013, Pages 3613-3625

  Christensen, Andreas L ^a   Lohr, Christina ^a   Christensen, Sune M ^a,b   Stamou, Dimitrios ^a  

^a UNIVERSITY OF COPENHAGEN   (Denmark)

^b LAWRENCE BERKELEY NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOCHIP; CONTROLLED STUDY; ELECTRONICS; FLUORESCENCE MICROSCOPY; LIPID BILAYER; LIPID VESICLE; MICROELECTRODE; NANOFABRICATION; NANOFLUIDICS; PRIORITY JOURNAL; REVIEW;

BIOSENSING TECHNIQUES; LIPID BILAYERS; MICROFLUIDICS; MICROSCOPY, FLUORESCENCE; MINIATURIZATION; NANOTECHNOLOGY; PEPTIDES;

EID: 84882244912     PISSN: 14730197     EISSN: 14730189     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3lc50492a     Document Type: Review

References (99)

1. J. T. Groves J. Kuriyan Nat. Struct. Mol. Biol. 2010 17 659 665
2. P. S. Dittrich A. Manz Nat. Rev. Drug Discovery 2006 5 210 218
3. S. Sauer B. Lange J. Gobom L. Nyarsik H. Seitz H. Lehrach Nat. Rev. Genet. 2005 6 465 476
4. J. Eid A. Fehr J. Gray K. Luong J. Lyle G. Otto P. Peluso D. Rank P. Baybayan B. Bettman A. Bibillo K. Bjornson B. Chaudhuri F. Christians R. Cicero S. Clark R. Dalal A. deWinter J. Dixon M. Foquet A. Gaertner P. Hardenbol C. Heiner K. Hester D. Holden G. Kearns X. Kong R. Kuse Y. Lacroix S. Lin P. Lundquist C. Ma P. Marks M. Maxham D. Murphy I. Park T. Pham M. Phillips J. Roy R. Sebra G. Shen J. Sorenson A. Tomaney K. Travers M. Trulson J. Vieceli J. Wegener D. Wu A. Yang D. Zaccarin P. Zhao F. Zhong J. Korlach S. Turner Science 2009 323 133 138
5. A. Jain R. Liu B. Ramani E. Arauz Y. Ishitsuka K. Ragunathan J. Park J. Chen Y. K. Xiang T. Ha Nature 2011 473 484 U322
6. D. Psaltis S. R. Quake C. Yang Nature 2006 442 381 386
7. J. Atencia D. J. Beebe Nature 2005 437 648 655
8. H. Song D. L. Chen R. F. Ismagilov Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 7336 7356
9. D. R. Walt Chem. Soc. Rev. 2010 39 38
10. D. Stamou C. Duschl E. Delamarche H. Vogel Angew. Chem., Int. Ed. 2003 42 5580 5583
11. S. M. Christensen D. Stamou Soft Matter 2007 3 828 836
12. S. M. Christensen D. Stamou Sensors 2010 10 17
13. J. Gureasko W. J. Galush S. Boykevisch H. Sondermann D. Bar-Sagi J. T. Groves J. Kuriyan Nat. Struct. Mol. Biol. 2008 15 452 461
14. Y.-H. M. Chan S. G. Boxer Curr. Opin. Chem. Biol. 2007 11 581 587
15. M. Loose P. Schwille J. Struct. Biol. 2009 168 143 151
16. A. D. Bangham Prog. Biophys. Mol. Biol. 1968 18 29 95
17. E. Boukobza A. Sonnenfeld G. Haran J. Phys. Chem. B 2001 105 12165 12170
18. B. Okumus T. J. Wilson D. M. J. Lilley T. Ha Biophys. J. 2004 87 2798 2806
19. B. Okumus S. Arslan S. M. Fengler S. Myong T. Ha J. Am. Chem. Soc. 2009 131 14844 14849
20. H. P. Lu L. Y. Xun X. S. Xie Science 1998 282 1877 1882
21. N. S. Hatzakis L. Wei S. K. Jorgensen A. H. Kunding P.-Y. Bolinger N. Ehrlich I. Makarov M. Skjot A. Svendsen P. Hedegard D. Stamou J. Am. Chem. Soc. 2012 134 9296 9302
22. S. M. Christensen P. Y. Bolinger N. S. Hatzakis M. W. Mortensen D. Stamou Nat. Nanotechnol. 2012 7 51 55
23. H. Engelkamp N. S. Hatzakis J. Hofkens F. C. De Schryver R. Nolte A. E. Rowan Chem. Commun. 2006 935 940
24. B. Liu A. Mazouchi C. C. Gradinaru J. Phys. Chem. B 2010 114 15191 15198
25. F. Olson C. A. Hunt F. C. Szoka W. J. Vail D. Papahadjopoulos Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 1979 557 9 23
26. F. Szoka D. Papahadjopoulos Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 1980 9 467 508
27. A. H. Kunding M. W. Mortensen S. M. Christensen D. Stamou Biophys. J. 2008 95 1176 1188
28. M. Gonzalez C. E. Argarana G. D. Fidelio Biomol. Eng. 1999 16 67 72
29. E. Gizeli J. Glad Anal. Chem. 2004 76 3995 4001
30. I. Geissbuehler R. Hovius K. L. Martinez M. Adrian K. R. Thampi H. Vogel Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 1388 1392
31. C. Yoshina-Ishii G. P. Miller M. L. Kraft E. T. Kool S. G. Boxer J. Am. Chem. Soc. 2005 127 1356 1357
32. I. Pfeiffer F. Höök J. Am. Chem. Soc. 2004 126 10224 10225
33. M. R. Dusseiller B. Niederberger B. Stadler D. Falconnet M. Textor J. Voros Lab Chip 2005 5 1387 1392
34. B. Stadler D. Falconnet I. Pfeiffer F. Hook J. Voros Langmuir 2004 20 11348 11354
35. C. Yoshina-Ishii S. G. Boxer J. Am. Chem. Soc. 2003 125 3696 3697
36. P. M. Bendix M. S. Pedersen D. Stamou Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 12341 12346
37. R. Michel I. Reviakine D. Sutherland C. Fokas G. Csucs G. Danuser N. D. Spencer M. Textor Langmuir 2002 18 8580 8586
38. R. A. Vega D. Maspoch K. Salaita C. A. Mirkin Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 6013 6015
39. C. Lohr A. H. Kunding V. K. Bhatia D. Stamou Methods Enzymol. 2009 465 144 160
40. B. Lohse P. Y. Bolinger D. Stamou J. Am. Chem. Soc. 2008 130 14372 14373
41. T. Ha P. Tinnefeld Annu. Rev. Phys. Chem. 2012 63 595 617
42. M. L. Kraft P. K. Weber M. L. Longo I. D. Hutcheon S. G. Boxer Science 2006 313 1948 1951
43. A. Gunnarsson P. Sjovall F. Höök Nano Lett. 2010 10 732 737
44. J. Larsen N. S. Hatzakis D. Stamou J. Am. Chem. Soc. 2011 133 10685 10687
45. E. Elizondo J. Larsen N. S. Hatzakis I. Cabrera T. Bjornhorn J. Veciana D. Stamou N. Ventosa J. Am. Chem. Soc. 2012 134 1918 1921
46. B. Y. Sun D. T. Chiu Anal. Chem. 2005 77 2770 2776
47. P. L. Luisi M. Allegretti T. P. de Souza F. Steiniger A. Fahr P. Stano ChemBioChem 2010 11 1989 1992
48. D. T. Chiu C. F. Wilson F. Ryttsen A. Stromberg C. Farre A. Karlsson S. Nordholm A. Gaggar B. P. Modi A. Moscho R. A. Garza-Lopez O. Orwar R. N. Zare Science 1999 283 1892 1895
49. R. Karlsson A. Karlsson O. Orwar J. Am. Chem. Soc. 2003 125 8442 8443
50. M. Karlsson M. Davidson R. Karlsson A. Karlsson J. Bergenholtz Z. Konkoli A. Jesorka T. Lobovkina J. Hurtig M. Voinova O. Orwar Annu. Rev. Phys. Chem. 2004 55 613 649
51. L. Lizana Z. Konkoli B. Bauer A. Jesorka O. Orwar Annu. Rev. Phys. Chem. 2009 60 449 468
52. P. Y. Bolinger D. Stamou H. Vogel J. Am. Chem. Soc. 2004 126 8594 8595
53. P. van Hoogevest J. de Gier B. de Kruijff FEBS Lett. 1984 171 160 164
54. P. Y. Bolinger D. Stamou H. Vogel Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 5544 5549
55. A. Kyrsting P. M. Bendix D. G. Stamou L. B. Oddershede Nano Lett. 2011 11 888 892
56. E. Gouaux R. MacKinnon Science 2005 310 1461 1465
57. V. Noireaux A. Libchaber Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 17669 17674
58. A. Graff M. Winterhalter W. Meier Langmuir 2001 17 919 923
59. M. Yoshimoto S. Q. Wang K. Fukunaga D. Fournier P. Walde R. Kuboi K. Nakao Biotechnol. Bioeng. 2005 90 231 238
60. M. Branden S. R. Tabaei G. Fischer R. Neutze F. Höök Biophys. J. 2010 99 124 133
61. H. Pick E. L. Schmid A. P. Tairi E. Ilegems R. Hovius H. Vogel J. Am. Chem. Soc. 2005 127 2908 2912
62. J. M. Johnson T. Ha S. Chu S. G. Boxer Biophys. J. 2002 83 3371 3379
63. T. C. Sudhof Annu. Rev. Neurosci. 2004 27 509 547
64. J. E. Rothman Nat. Med. 2002 8 1059 1062
65. T.-Y. Yoon B. Okumus F. Zhang Y.-K. Shin T. Ha Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 19731 19736
66. J. Diao Y. Ishitsuka H. Lee C. Joo Z. Su S. Syed Y.-K. Shin T.-Y. Yoon T. Ha Nat. Protoc. 2012 7 921 934
67. T. Weber B. V. Zemelman J. A. McNew B. Westermann M. Gmachl F. Parlati T. H. Sollner J. E. Rothman Cell 1998 92 759 772
68. S. M. Christensen M. W. Mortensen D. G. Stamou Biophys. J. 2011 100 957 967
69. T.-Y. Yoon X. Lu J. Diao S.-M. Lee T. Ha Y.-K. Shin Nat. Struct. Mol. Biol. 2008 15 707 713
70. H.-K. Lee Y. Yang Z. Su C. Hyeon T.-S. Lee H.-W. Lee D.-H. Kweon Y.-K. Shin T.-Y. Yoon Science 2010 328 760 763
71. Y. H. M. Chan P. Lenz S. G. Boxer Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 18913 18918
72. T. T. Liu W. C. Tucker A. Bhalla E. R. Chapman J. C. Weisshaar Biophys. J. 2005 89 2458 2472
73. M. K. Domanska V. Kiessling A. Stein D. Fasshauer L. K. Tamm J. Biol. Chem. 2009 284 32158 32166
74. A. Kunding M. W. Mortensen S. M. Christensen V. K. Bhatia I. Makarov R. Metzler D. Stamou Biophys. J. 2011 101 2693 2703
75. H. T. McMahon J. L. Gallop Nature 2005 438 590 596
76. N. S. Hatzakis V. K. Bhatia J. Larsen K. L. Madsen P. Y. Bolinger A. H. Kunding J. Castillo U. Gether P. Hedegard D. Stamou Nat. Chem. Biol. 2009 5 835 841
77. V. K. Bhatia K. L. Madsen P. Y. Bolinger A. Kunding P. Hedegard U. Gether D. Stamou EMBO J. 2009 28 3303 3314
78. M. B. Jensen V. K. Bhatia C. C. Jao J. E. Rasmussen S. L. Pedersen K. J. Jensen R. Langen D. Stamou J. Biol. Chem. 2011 286 42603 42614
79. D. T. Chiu C. F. Wilson A. Karlsson A. Danielsson A. Lundqvist A. Stromberg F. Ryttsen M. Davidson S. Nordholm O. Orwar R. N. Zare Chem. Phys. 1999 247 133 139
80. N. Ehrlich A. L. Christensen D. Stamou Anal. Chem. 2011 83 8169 8176
81. E. Rhoades E. Gussakovsky G. Haran Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 3197 3202
82. U. B. Choi P. Strop M. Vrljic S. Chu A. T. Brunger K. R. Weninger Nat. Struct. Mol. Biol. 2010 17 318 U84
83. R. Roy S. Hohng T. Ha Nat. Methods 2008 5 507 516
84. M. Pirchi G. Ziv I. Riven S. S. Cohen N. Zohar Y. Barak G. Haran Nat. Commun. 2011 2 493 7
85. A. M. van Oijen Curr. Opin. Biotechnol. 2011 22 75 80
86. J. J. Benítez A. M. Keller P. Chen Methods Enzymol. 2010 472 41 60
87. J. J. Benítez A. M. Keller P. Ochieng L. A. Yatsunyk D. L. Huffman A. C. Rosenzweig P. Chen J. Am. Chem. Soc. 2008 130 2446 2447
88. A. M. Keller J. J. Benítez D. Klarin L. Zhong M. Goldfogel F. Yang T.-Y. Chen P. Chen J. Am. Chem. Soc. 2012 134 8934 8943
89. C. Ratzke M. Mickler B. Hellenkamp J. Buchner T. Hugel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 16101 16106
90. I. Cisse B. Okumus C. Joo T. J. Ha Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 12646 12650
91. H. M. Piwonski M. Goomanovsky D. Bensimon A. Horovitz G. Haran Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 E1437 E1443
92. M. L. Metzker Nat. Rev. Genet. 2010 11 31 46
93. M. A. Clark R. A. Acharya C. C. Arico-Muendel S. L. Belyanskaya D. R. Benjamin N. R. Carlson P. A. Centrella C. H. Chiu S. P. Creaser J. W. Cuozzo C. P. Davie Y. Ding G. J. Franklin K. D. Franzen M. L. Gefter S. P. Hale N. J. V. Hansen D. I. Israel J. Jiang M. J. Kavarana M. S. Kelley C. S. Kollmann F. Li K. Lind S. Mataruse P. F. Medeiros J. A. Messer P. Myers H. O'Keefe M. C. Oliff C. E. Rise A. L. Satz S. R. Skinner J. L. Svendsen L. Tang K. van Vloten R. W. Wagner G. Yao B. Zhao B. A. Morgan Nat. Chem. Biol. 2009 5 647 654
94. P. Walde BioEssays 2010 32 296 303
95. J. W. Szostak D. P. Bartel P. L. Luisi Nature 2001 409 387 390
96. U. J. Meierhenrich J. J. Filippi C. Meinert P. Vierling J. P. Dworkin Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 3738 3750
97. S. Rasmussen Science 2004 303 963 965
98. S. S. Mansy J. P. Schrum M. Krishnamurthy S. Tobé D. A. Treco J. W. Szostak Nature 2008 454 122 125
99. P. L. Luisi T. P. de Souza P. Stano ChemBioChem 2009 10 1056 1063