Serial affinity chromatography as a selection tool in glycoproteomics

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 15, 2013, Pages 7125-7132

  Jung, Kwanyoung ^a   Cho, Wonryeon ^b  

^a Seoul Science High School   (South Korea)

^b Wonkwang University   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AFFINITY COLUMN; GLYCAN STRUCTURES; GLYCANS; GLYCOPROTEOMICS; GLYCOSYLATION SITES; PROTEIN GLYCOSYLATION;

AFFINITY CHROMATOGRAPHY; ESTERIFICATION; GLYCOPROTEINS; GLYCOSYLATION; OLIGOSACCHARIDES; PROTEINS; TOOLS;

POLYSACCHARIDES;

GLYCOPROTEIN;

AFFINITY CHROMATOGRAPHY; ARTICLE; BLOOD; HUMAN; ISOLATION AND PURIFICATION; METABOLISM; METHODOLOGY; PROTEIN DEGRADATION; PROTEOMICS;

CHROMATOGRAPHY, AFFINITY; GLYCOPROTEINS; HUMANS; PROTEOLYSIS; PROTEOMICS;

EID: 84881350603     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac400653z     Document Type: Article

References (40)

1. Qiu, R.; Regnier, F. E. Anal. Chem. 2005, 77, 7225-7231
2. Madera, M.; Mechref, Y.; Klouckova, I.; Novotny, M. V. J. Proteome Res. 2006, 5, 2348-2363
3. Drake, P. M.; Schilling, B.; Niles, R. K.; Prakobphol, A.; Li, B.; Jung, K.; Cho, W.; Braten, M.; Inerowicz, H. D.; Williams, K.; Albertolle, M.; Held, J. M.; Iacovides, D.; Sorensen, D. J.; Griffith, O. L.; Johansen, E.; Zawadzka, A. M.; Michael, P.; Cusack, S. A.; Gormley, M.; Hal, S. C.; Witkowska, H. E.; Gray, J. W.; Regnier, F.; Gibson, B. W.; Fisher, S. J. J. Proteome Res. 2012, 11, 2508-2520
4. Zeng, Z.; Hincapie, M.; Pitter, S. J.; Hanash, S.; Schalkwijk, J.; Hogan, J. M.; Wang, H.; Hancock, W. S. Anal. Chem. 2011, 83, 4845-4854
5. Donadio, S.; Pascual, A.; Thijssen, J. H. H.; Ronin, C. Clin. Chem. 2006, 52, 286-297
6. Wang, Y.; Ao, X.; Vuong, H.; Konanur, M.; Miller, F. R.; Goodison, S.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2008, 7, 4313-4325
7. Pan, S.; Wang, Y.; Quinn, J. F.; Peskind, E. R.; Waichunas, D.; Wimberger, J. T.; Jin, J.; Li, J. G.; Zhu, D.; Pan, C.; Zhang, J. J. Proteome Res. 2006, 5, 2769-2779
8. Kreunin, P.; Zhao, J.; Rosser, C.; Urquidi, V.; Lubman, D. M.; Goodison, S. J. Proteome Res. 2007, 6, 2631-2639
9. Mao, X.; Luo, Y.; Dai, Z.; Wang, K.; Du, Y.; Lin, B. Anal. Chem. 2004, 76, 6941-6947
10. Kullolli, M.; Hancock, W. S.; Hincapie, M. J. Sep. Sci. 2008, 31, 2733-2739
11. Dayarathna, M. K. D. R.; Hancock, W. S.; Hincapie, M. J. Sep. Sci. 2008, 31, 1156-1166
12. Plavina, T.; Wakshull, E.; Hancock, W. S.; Hincapie, M. J. Proteome Res. 2007, 6, 662-671
13. Ueda, K.; Fukase, Y.; Katagiri, T.; Ishikawa, N.; Irie, S.; Sato, T.-A.; Ito, H.; Nakayama, H.; Miyagi, Y.; Tsuchiya, E.; Kohno, N.; Shiwa, M.; Nakamura, Y.; Daigo, Y. Proteomics 2009, 9, 2182-2192
14. Julka, S.; Regnier, F. J. Proteome Res. 2004, 3, 350-363
15. Dube, D. H.; Bertozzi, C. R. Nat. Rev. Drug Discovery 2005, 4, 477-488
16. Caterson, B.; Mahmoodian, F.; Sorrell, J. M.; Hardingham, T. E.; Bayliss, M. T.; Carney, S. L.; Ratcliffe, A.; Muir, H. J. Cell Sci. 1990, 97 (Part 3) 411-417
17. Julien, S.; Adriaenssens, E.; Ottenberg, K.; Furlan, A.; Courtand, G.; Vercoutter-Edouart, A.-S.; Hanisch, F.-G.; Delannoy, P.; Bourhis, X. L. Glycobiology 2006, 16, 54-64
18. Cao, R.; Chen, K.; Song, Q.; Zang, Y.; Li, J.; Wang, X.; Chen, P.; Liang, S. J. Proteome Res. 2012, 11, 829-838
19. Gu, J.; Sato, Y.; Kariya, Y.; Isaji, T.; Taniguchi, N.; Fukuda, T. J. Proteome Res. 2009, 8, 431-435
20. Singh, R.; Subramanian, S.; Rhodes, J. M.; Campbell, B. J. Glycobiology 2006, 16, 594-601
21. Telford, J. E.; Bones, J.; McManus, C.; Saldova, R.; Manning, G.; Doherty, M.; Leweke, F. M.; Rothermundt, M.; Guest, P. C.; Rahmoune, H.; Bahn, S.; Rudd, P. M. J. Proteome Res. 2012, 11, 3743-3752
22. Stewart, E. M.; Aquilina, J. A.; Easterbrook-Smith, S. B.; Murphy-Durland, D.; Jacobsen, C.; Moestrup, S.; Wilson, M. R. Biochemistry 2007, 46, 1412-1422
23. Robinson, L. J.; Karlsson, N. G.; Weiss, A. S.; Packer, N. H. J. Proteome Res. 2003, 2, 556-557
24. Chandramouli, K. H.; Zhang, Y.; Wong, Y. H.; Qian, P.-Y. J. Proteome Res. 2012, 11, 1330-1340
25. Cho, W.; Jung, K.; Regnier, F. E. Anal. Chem. 2008, 80, 5286-5292
26. Jung, K.; Cho, W.; Regnier, F. E. J. Proteome Res. 2009, 8, 643-650
27. Cho, W.; Jung, K.; Regnier, F. E. J. Proteome Res. 2010, 9, 5960-5968
28. Cho, W.; Jung, K.; Regnier, F. E. J. Sep. Sci. 2010, 33, 1438-1447
29. Saeland, E.; van Vliet, S. J.; Bäckström, M.; van den Berg, V. C. M.; Geijtenbeek, T. B. H.; Meijer, G. A.; van Kooyk, Y. Cancer Immunol. Immunother. 2007, 56, 1225-1236
30. Avent, N.; Judson, P. A.; Parsons, S. F.; Mallinson, G.; Anstee, D. J.; Tanner, M. J.; Evans, P. R.; Hodges, E.; Maciver, A. G.; Holmes, C. Biochem. J. 1988, 251, 499-505
31. Zhang, X.; Teng, Y.; Fu, Y.; Xu, L.; Zhang, S.; He, B.; Wang, C.; Zhang, W. Anal. Chem. 2010, 82, 9455-9460
32. Li, Y.; Tao, S.-C.; Bova, G. S.; Liu, A. Y.; Chan, D. W.; Zhu, H.; Zhang, H. Anal. Chem. 2011, 83, 8509-8516
33. Belle, J. T. L.; Gerlach, J. Q.; Svarovsky, S.; Joshi, L. Anal. Chem. 2007, 79, 6959-6964
34. Wu, J.; Xie, X.; Liu, Y.; He, J.; Benitez, R.; Buckanovich, R. J.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2012, 11, 4541-4552
35. Chen, H.-H.; Wu, C.-H.; Tsai, M.-L.; Huang, Y.-J.; Chen, S.-H. Anal. Chem. 2012, 84, 8635-8641
36. Bouwman, L. H.; Eerligh, P.; Terpstra, O. T.; Daha, M. R.; de Knijff, P.; Ballieux, B. E. P. B.; Bruining, G. J.; van der Slik, A. R.; Roos, A.; Roep, B. O. Diabetes 2005, 54, 3002-3006
37. Jaisson, S.; Gillery, P. Clin. Chem. 2010, 56, 1401-1412
38. Saldova, R.; Wormald, M. R.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Dis. Markers 2008, 25 (4, 5) 219-232
39. St Hill, C. A.; Farooqui, M.; Mitcheltree, G.; Gulbahce, H. E.; Jessurun, J.; Cao, Q.; Walcheck, B. BMC Cancer 2009, 9, 79
40. Freeze, H. H. Nat. Rev. Genet. 2006, 7, 537-551