Detection and verification of glycosylation patterns of glycoproteins from clinical specimens using lectin microarrays and lectin-based immunosorbent assays

Analytical Chemistry

Volumn 83, Issue 22, 2011, Pages 8509-8516

  Li, Yan ^a,d   Tao, Sheng Ce ^b,e   Bova, G Steven ^a   Liu, Alvin Y ^c   Chan, Daniel W ^a   Zhu, Heng ^b   Zhang, Hui ^c  

^a JOHNS HOPKINS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

^b JOHNS HOPKINS UNIVERSITY   (United States)

^c UNIVERSITY OF WASHINGTON SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

^d INSTITUTE OF BIOPHYSICS   (China)

^e Shanghai Jiao Tong University   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTICAL PERFORMANCE; ANALYTICAL STRATEGY; DIAGNOSTIC PERFORMANCE; DISEASE DEVELOPMENT; FUNDAMENTAL CHARACTERISTICS; HIGH-DENSITY; IMMUNOSORBENT ASSAYS; LECTIN MICROARRAYS; MULTIPLEX ASSAYS; NANOGRAMS; PATTERN DISCOVERY; PROSTATE CANCERS; PROSTATE SPECIFIC ANTIGEN; PROTEIN GLYCOSYLATION; SPECIFIC BINDING;

ASSAYS; DIAGNOSIS; DISEASES; ESTERIFICATION; GLYCOPROTEINS; HISTOLOGY; MICROARRAYS; PROTEINS; TISSUE;

GLYCOSYLATION;

GLYCOPROTEIN; LECTIN;

ARTICLE; CHEMISTRY; ENZYME LINKED IMMUNOSORBENT ASSAY; GLYCOSYLATION; IMMUNOLOGY; METHODOLOGY; PROTEIN MICROARRAY;

GLYCOPROTEINS; GLYCOSYLATION; IMMUNOSORBENT TECHNIQUES; LECTINS; PROTEIN ARRAY ANALYSIS;

EID: 81255146498     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac201452f     Document Type: Article

References (37)

1. Arnold, J. N.; Wormald, M. R.; Sim, R. B.; Rudd, P. M.; Dwek, R. A. Annu. Rev. Immunol. 2007, 25, 21-50
2. Roth, J. Chem. Rev. 2002, 102, 285-303
3. Lowe, J. B. Immunol Rev. 2002, 186, 19-36
4. Orntoft, T. F.; Vestergaard, E. M. Electrophoresis. 1999, 20, 362-371
5. Dennis, J. W.; Granovsky, M.; Warren, C. E. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1473, 21-34
6. Gorelik, E.; Galili, U.; Raz, A. Cancer Metastasis Rev. 2001, 20, 245-277
7. Kannagi, R.; Izawa, M.; Koike, T.; Miyazaki, K.; Kimura, N. Cancer Sci. 2004, 95, 377-384
8. Sokoll, L. J.; Chan, D. W. Abeloff's Clinical Oncology, 4 th ed.; Elsevier Inc.: Philadelphia, PA, 2008.
9. Chan, D. W.; Bruzek, D. J.; Oesterling, J. E.; Rock, R. C.; Walsh, P. C. Clin. Chem. 1987, 33, 1916-1920
10. Presti, J. C., Jr. Nat. Clin. Pract. Urol. 2007, 4, 505-511
11. Keetch, D. W.; Catalona, W. J.; Smith, D. S. J. Urol. 1994, 151, 1571-1574
12. Andriole, G. L.; Crawford, E. D.; Grubb, R. L., 3rd; Buys, S. S.; Chia, D.; Church, T. R.; Fouad, M. N.; Gelmann, E. P.; Kvale, P. A.; Reding, D. J.; Weissfeld, J. L.; Yokochi, L. A.; O'Brien, B.; Clapp, J. D.; Rathmell, J. M.; Riley, T. L.; Hayes, R. B.; Kramer, B. S.; Izmirlian, G.; Miller, A. B.; Pinsky, P. F.; Prorok, P. C.; Gohagan, J. K.; Berg, C. D.; PLCO Project Team. N. Engl. J. Med. 2009, 360, 1310-1319.
13. Peracaula, R; Tabarés, G.; Royle, L.; Harvey, D. J.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M.; de Llorens, R. Glycobiology 2003, 13, 457-470
14. Ohyama, C.; Hosono, M.; Nitta, K.; Oh-eda, M.; Yoshikawa, K.; Habuchi, T.; Arai, Y.; Fukuda, M. Glycobiology 2004, 14, 671-679
15. Tabarés, G.; Radcliffe, C. M.; Barrabés, S.; Ramírez, M.; Aleixandre, R. N.; Hoesel, W.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M.; Peracaula, R.; de Llorens, R. Glycobiology 2006, 16, 132-145
16. Wada, Y.; Azadi, P.; Costello, C. E.; Dell, A.; Dwek, R. A.; Geyer, H.; Geyer, R.; Kakehi, K.; Karlsson, N. G.; Kato, K.; Kawasaki, N.; Khoo, K. H.; Kim, S.; Kondo, A.; Lattova, E.; Mechref, Y.; Miyoshi, E.; Nakamura, K.; Narimatsu, H.; Novotny, M. V.; Packer, N. H.; Perreault, H.; Peter-Katalinic, J.; Pohlentz, G.; Reinhold, V. N.; Rudd, P. M.; Suzuki, A.; Taniguchi, N. Glycobiology 2007, 17 (4) 411-422
17. Nwosu, C. C.; Seipert, R. R.; Strum, J. S.; Hua, S. S.; An, H. J.; Zivkovic, A. M.; German, B. J.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2011, 10 (5) 2612-2624
18. Chen, S.; LaRoche, T.; Hamelinck, D.; Bergsma, D.; Brenner, D.; Simeone, D.; Brand, R. E.; Haab, B. B. Nat. Methods 2007, 4 (5) 437-444
19. Meany, D. L.; Zhang, Z.; Sokoll, L. J.; Zhang, H.; Chan, D. W. J. Proteome Res. 2009, 8, 613-619
20. Zeng, Z.; Hincapie, M.; Pitteri, S. J.; Hanash, S.; Schalkwijk, J.; Hogan, J. M.; Wang, H.; Hancock, W. S. Anal. Chem. 2011, 83 (12) 4845-4854
21. Feng, S.; Yang, N.; Pennathur, S.; Goodison, S.; Lubman, D. M. Anal. Chem. 2009, 81 (10) 3776-3783
22. Tao, S. C.; Li, Y.; Zhou, J.; Qian, J.; Schnaar, R. L.; Zhang, Y.; Goldstein., I. J.; Zhu, H.; Schneck, J. P. Glycobiology 2008, 18, 761-769
23. Kuno, A.; Kato, Y.; Matsuda, A.; Kaneko, M. K.; Ito, H.; Amano, K.; Chiba, Y.; Narimatsu, H.; Hirabayashi, J. Mol. Cell. Proteomics. 2009, 8, 99-108
24. Li, C.; Simeone, D. M.; Brenner, D. E.; Anderson, M. A.; Shedden, K. A.; Ruffin, M. T.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2009, 8, 483-492
25. Li, Y.; Sokoll, L. J.; Rush, J.; Zou, N.; Chan, D. W.; Zhang, H. Proteomics: Clin. Appl. 2009, 3, 597-608
26. Liu, W.; Laitinen, S.; Khan, S.; Vihinen, M.; Kowalski, J.; Yu, G.; Chen, L.; Ewing, C. M.; Eisenberger, M. A.; Carducci, M. A.; Nelson, W. G.; Yegnasubramanian, S.; Luo, J.; Wang, Y.; Xu, J.; Isaacs, W. B.; Visakorpi, T.; Bova, G. S. Nat. Med. 2009, 15, 559-565
27. Zou, Z.; Ibisate, M.; Zhou, Y.; Aebersold, R.; Xia, Y.; Zhang, H. Anal. Chem. 2008, 80, 1228-1234
28. Tajiri, M.; Ohyama, C.; Wada, Y. Glycobiology 2008, 18, 2-8
29. Fukushima, K.; Satoh, T.; Baba, S.; Yamashita, K. Glycobiology 2010, 20, 452-460
30. Zheng, R.; Iwase, A.; Shen, R.; Goodman, O. B., Jr.; Sugimoto, N.; Takuwa, Y.; Lerner, D. J.; Nanus, D. M. Oncogene 2006, 25, 5942-5952
31. Osman, I.; Dai, J.; Mikhail, M.; Navarro, D.; Taneja, S. S.; Lee, P.; Christos, P.; Shen, R.; Nanus, D. M. Cancer 2006, 107, 2628-2636
32. Dall'Era, M. A.; True, L. D.; Siegel, A. F.; Porter, M. P.; Sherertz, T. M.; Liu, A. Y. BMC Urol. 2007, 7, 3
33. Zhang, H.; Loriaux, P.; Eng, J.; Campbell, D.; Keller, A.; Moss, P.; Bonneau, R.; Zhang, N.; Zhou, Y.; Wollscheid, B.; Cooke, K.; Yi, E. C.; Lee, H.; Peskind, E. R.; Zhang, J.; Smith, R. D.; Aebersold, R. Genome Biol. 2006, 7, R73
34. Tian, Y.; Kelly-Spratt, K. S.; Kemp, C. J.; Zhang, H. J. Proteome Res. 2010, 9, 5837-5847
35. Zhang, H.; Chan, D. W. Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 2007, 16, 1915-1917
36. Tawfic, S.; Niehans, G. A.; Manivel, J. C. Hum. Pathol. 2003, 34, 450-456
37. Fleischmann, A.; Schlomm, T.; Huland, H.; Köllermann, J.; Simon, P.; Mirlacher, M.; Salomon, G.; Chun, F. H.; Steuber, T.; Simon, R.; Sauter, G.; Graefen, M.; Erbersdobler, A. Clin. Cancer Res. 2008, 14, 7838-7842