MALDI imaging and in situ identification of integral membrane proteins from rat brain tissue sections

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 15, 2013, Pages 7191-7196

  Nicklay, Joshua J ^a   Harris, Glenn A ^a   Schey, Kevin L ^a   Caprioli, Richard M ^a  

^a VANDERBILT UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTICAL CHALLENGE; IMAGING MASS SPECTROMETRY; INTEGRAL MEMBRANE PROTEINS; PEPTIDE EXTRACTION; PROTEIN DIGESTION; PROTEIN IDENTIFICATION; RAT BRAIN TISSUE; TRANS-MEMBRANE PROTEINS;

ACYLATION; BIOLOGICAL MEMBRANES; BRAIN; SECONDARY ION MASS SPECTROMETRY; TISSUE;

PROTEINS;

PLP1 PROTEIN, MOUSE; PROTEOLIPID PROTEIN; TRYPSIN;

ANIMAL; ARTICLE; BRAIN; MASS SPECTROMETRY; METABOLISM; METHODOLOGY; MOLECULAR IMAGING; RAT; SPRAGUE DAWLEY RAT;

ANIMALS; BRAIN; MOLECULAR IMAGING; MYELIN PROTEOLIPID PROTEIN; RATS; RATS, SPRAGUE-DAWLEY; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION; TRYPSIN;

EID: 84881322014     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac400902h     Document Type: Article

References (35)

1. Caprioli, R. M.; Farmer, T. B.; Gile, J. Anal. Chem. 1997, 69, 4751-4760
2. Cornett, D. S.; Frappier, S. L.; Caprioli, R. M. Anal. Chem. 2008, 80, 5648-5653
3. Reyzer, M. L.; Hsieh, Y.; Ng, K.; Korfmacher, W. A.; Caprioli, R. M. J. Mass Spectrom. 2003, 38, 1081-1092
4. Stoeckli, M.; Staab, D.; Schweitzer, A. Int. J. Mass Spectrom. 2007, 260, 195-202
5. Manna, J. D.; Reyzer, M. L.; Latham, J. C.; Weaver, C. D.; Marnett, L. J.; Caprioli, R. M. Anal. Chem. 2011, 83, 6683-6688
6. Burnum, K. E.; Cornett, D. S.; Puolitaival, S. M.; Milne, S. B.; Myers, D. S.; Tranguch, S.; Brown, H. A.; Dey, S. K.; Caprioli, R. M. J. Lipid Res. 2009, 50, 2290-2298
7. Groseclose, M. R.; Andersson, M.; Hardesty, W. M.; Caprioli, R. M. J. Mass Spectrom. 2007, 42, 254-262
8. Seeley, E. H.; Oppenheimer, S. R.; Mi, D.; Chaurand, P.; Caprioli, R. M. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 1069-1077
9. Seeley, E. H.; Caprioli, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105, 18126
10. Grey, A. C.; Chaurand, P.; Caprioli, R. M.; Schey, K. L. J. Proteome Res. 2009, 8, 3278-3283
11. Patra, M.; Salonen, E.; Terama, E.; Vattulainen, I.; Faller, R.; Lee, B. W.; Holopainen, J.; Karttunen, M. Biophys. J. 2006, 90, 1121-1135
12. Martosella, J.; Zolotarjova, N.; Liu, H.; Moyer, S. C.; Perkins, P. D.; Boyes, B. E. J. Proteome Res. 2006, 5, 1301-1312
13. Ruth, M. C.; Old, W. M.; Emrick, M. A.; Meyer-Arendt, K.; Aveline-Wolf, L. D.; Pierce, K. G.; Mendoza, A. M.; Sevinsky, J. R.; Hamady, M.; Knight, R. D.; Resing, K. A.; Ahn, N. G. J. Proteome Res. 2006, 5, 709-719
14. Rabilloud, T.; Adessi, C.; Giraudel, A.; Lunardi, J. Electrophoresis 1997, 18, 307-316
15. Pedersen, S. K.; Harry, J. L.; Sebastian, L.; Baker, J.; Traini, M. D.; McCarthy, J. T.; Manoharan, A.; Wilkins, M. R.; Gooley, A. A.; Righetti, P. G.; Packer, N. H.; Williams, K. L.; Herbert, B. R. J. Proteome Res. 2003, 2, 303-311
16. Wu, C. C.; MacCoss, M. J.; Howell, K. E.; Yates, J. R. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 532-538
17. Love, S. J. Clin. Pathol. 2006, 59, 1151-1159
18. Schiffmann, R.; van der Knaap, M. S. Curr. Opin. Neurol. 2004, 17, 187-192
19. Ceuppens, R.; Dumont, D.; Van Brussel, L.; Van de Plas, B.; Daniels, R.; Noben, J. P.; Verhaert, P.; Van der Gucht, E.; Robben, J.; Clerens, S. Int. J. Mass Spectrom. 2007, 260, 185-194
20. Bizzozero, O. A.; Leyba, J.; Nuñez, D. J. J. Biol. Chem. 1992, 267, 7886-7894
21. Tetzloff, S. U.; Bizzozero, O. A. J. Biol. Chem. 1998, 273, 279-285
22. Bizzozero, O. A.; Bixler, H. A.; Davis, J. D.; Espinosa, A.; Messier, A. M. J. Neurochem. 2001, 76, 1129-1141
23. Harris, G. A.; Nicklay, J. J.; Caprioli, R. M. Anal. Chem. 2013, 85, 2717-2723
24. Shevchenko, A.; Wilm, M.; Vorm, O.; Mann, M. Anal. Chem. 1996, 68, 850-858
25. Käll, L.; Canterbury, J. D.; Weston, J.; Noble, W. S.; MacCoss, M. J. Nat. Methods 2007, 4, 923-925
26. Larocca, J. N.; Norton, W. T. Curr. Protoc. Cell Biol. 2007, 33, 3.25.1-3.25.19
27. Folch, J.; Lees, M.; Sloane Stanley, G. H. J. Biol. Chem. 1957, 226, 497-509
28. Bizzozero, O. A.; Malkoski, S. P.; Mobarak, C.; Bixler, H. A.; Evans, J. E. J. Neurochem. 2002, 81, 636-645
29. Fannon, A. M.; Mastronardi, F. G.; Moscarello, M. A. Neurochem. Res. 1994, 19, 1005-1012
30. Rosinke, B.; Strupat, K.; Hillenkamp, F.; Rosenbusch, J.; Dencher, N.; Krüger, U.; Galla, H. J. J. Mass Spectrom. 1995, 30, 1462-1468
31. Farazi, T. A.; Waksman, G.; Gordon, J. I. J. Biol. Chem. 2001, 276, 39501-39504
32. Weimbs, T.; Stoffel, W. Biochemistry 1992, 31, 12289-12296
33. Greer, J. M.; Lees, M. B. Int. J. Biochem. Cell Biol. 2002, 34, 211-215
34. Agrawal, H. C.; Hartman, B.; Shearer, W.; Kalmbach, S.; Margolis, F. J. Neurochem. 1977, 28, 495-508
35. Resh, M. D. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1451, 1-16