An approach for separation and complete structural sequencing of heparin/heparan sulfate-like oligosaccharides

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 12, 2013, Pages 5787-5795

  Huang, Rongrong ^a   Liu, Jian ^b   Sharp, Joshua S ^a  

^a UNIVERSITY OF GEORGIA   (United States)

^b UNC Hamner Institute for Drug Safety Sciences   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL ACTIONS; BIOLOGICAL FUNCTIONS; CHEMICAL DERIVATIZATION; DERIVATIZATIONS; GLYCOSAMINOGLYCANS; GLYCOSIDIC BOND CLEAVAGE; HEPARAN SULFATES; SULFATE MODIFICATIONS;

POLYSACCHARIDES; SEPARATION; SULFUR COMPOUNDS;

OLIGOSACCHARIDES;

HEPARAN SULFATE; HEPARIN; OLIGOSACCHARIDE;

ARTICLE; CHEMISTRY; CONFORMATION; LIQUID CHROMATOGRAPHY; METHODOLOGY; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

CARBOHYDRATE CONFORMATION; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; HEPARIN; HEPARITIN SULFATE; OLIGOSACCHARIDES; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 84879217983     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac400439a     Document Type: Article

References (52)

1. Gandhi, N. S.; Mancera, R. L. Chem. Biol. Drug Des. 2008, 72, 455-482
2. Rabenstein, D. L. Nat. Prod. Rep. 2002, 19, 312-331
3. Tumova, S.; Woods, A.; Couchman, J. R. Int. J. Biochem. Cell Biol. 2000, 32, 269-288
4. Kresse, H.; Schönherr, E. J. Cell. Physiol. 2001, 189, 266-274
5. Lyon, M.; Gallagher, J. T. Matrix Biol. 1998, 17, 485-493
6. Li, J.-p.; Vlodavsk, I. Thromb. Haemostasis 2009, 102, 823-828
7. Dityatev, A.; Schachner, M. Nat. Rev. Neurosci. 2003, 4, 456-468
8. Capila, I.; Linhardt, R. J. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 390-412
9. Lever, R.; Page, C. P. Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 140-148
10. Theocharis, A. D.; Skandalis, S. S.; Tzanakakis, G. N.; Karamanos, N. K. FEBS J. 2010, 19, 3904-3923
11. Guerrini, M.; Beccati, D.; Shriver, Z.; Naggi, A.; Viswanathan, K. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 669-675
12. Carlsson, P.; Kjellén, L. Handb. Exp. Pharmacol. 2012, 207, 23-41
13. Chi, L. L.; Amster, J.; Linhardt, R. J. Curr. Anal. Chem. 2005, 1, 223-240
14. Mallis, L. M.; Wang, H. M.; Loganathan, D.; Linhardt, R. J. Anal. Chem. 1989, 61, 1453-1458
15. Linhardt, R. J.; Wang, H. M.; Loganathan, D.; Lamb, D. J.; Mallis, L. M. Carbohydr. Res. 1992, 225, 137-145
16. Tissot, B.; Gasiunas, N.; Powell, A. K.; Ahmed, Y.; Zhi, Z.-I.; Haslam, S. M.; Morris, H. R.; Turnbull, J. E.; Gallagher, J. T.; Dell, A. Glycobiology 2007, 17, 972-987
17. Laremore, T. N.; Linhardt, R. J. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2007, 21, 1315-1320
18. Minamisawa, T.; Hirabayashi, J. Trends Glycosci. Glyc 2006, 18, 293-312
19. Zaia, J.; Costello, C. E. Anal. Chem. 2003, 75, 2445-2455
20. Saad, O. M.; Leary, J. A. Anal. Chem. 2003, 75, 2985-2995
21. Zaia, J.; Costello, C. E. Anal. Chem. 2001, 73, 233-239
22. Jandik, K. A.; Gu, K. A.; Linhardt, R. J. Glycobiology 1994, 4, 289-296
23. Shively, J. E.; Conrad, H. E. Biochemistry 1976, 15, 3932-3942
24. Volpi, N.; Maccari, F.; Linhardt, R. J. Electrophoresis 2008, 29, 3095-3106
25. Zaia, J. Mass Spectrom. Rev. 2009, 28, 254-272
26. Vives, R. R.; Goodger, S.; Pye, D. A. Biochem. J. 2001, 354, 141-147
27. Bruggink, C.; Maurer, R.; Herrmann, H.; Cavalli, S.; Hoefler, F. J. Chromatogr., A 2005, 1085, 104-109
28. Hitchcock, A. M.; Costello, C. E.; Zaia, J. Biochemistry 2006, 45, 2350-2361
29. Staples, G. O.; Bowman, M. J.; Costello, C. E.; Hitchcock, A. M.; Lau, J. M.; Leymarie, N.; Miller, C.; Naimy, H.; Shi, X.; Zaia, J. Proteomics 2009, 9, 686-695
30. Naimy, H.; Leymarie, N.; Bowman, M. J.; Costello, C. E.; Zaia, J. Biochemistry 2008, 47, 31553161
31. Karlsson, N. G.; Schulz, B. L.; Pacher, N. H.; Whitelock, J. M. J. Chromatogr., B 2005, 824, 139-147
32. Estrella, R. P.; Whitelock, J. M.; pacher, N. H.; Karlsson, N. G. Anal. Biochem. 2007, 79, 3597-3606
33. Yang, B.; Chang, Y.; Weyers, A. M.; Sterner, E. S.; Linhardt, R. J. J.Chromatogr., A 2012, 1225, 91-98
34. Yang, B.; Weyers, A. M.; Baik, J. Y.; Sterner, E. S.; Sharfstein, S.; Mousa, S. A.; Zhang, F.; Dordick, J. S.; Linhardt, R. J. Anal. Biochem. 2011, 415, 59-66
35. Wei, W.; Niñonuevo, M. R.; Sharma, A.; Danan-Leon, L. M.; Leary, J. A. Anal. Chem. 2011, 83, 3703-3708
36. Yamada, S.; Yoshida, K.; Sugiura, M.; Sugahara, K. J. Biol. Chem. 1993, 268, 4780-4787
37. Leymarie, N.; McComb, M. E.; Naimy, H.; Staples, G. O.; Zaia, J. Int. J. Mass Spectrom. 2012, 312, 144-154
38. Ly, M.; Leach, F. E. r.; Laremore, T. N.; Toida, T.; Amster, I. J.; Linhardt, R. J. Nat. Chem. Biol. 2011, 11, 827-833
39. Kailemia, M. J.; Li, L.; Ly, M.; Linhardt, R. J.; Amster, I. J. Anal. Chem. 2012, 84, 5475-5478
40. Saad, O. M.; Leary, J. A. Anal. Chem. 2005, 77, 5902-5911
41. Wolff, J. J.; Chi, L. L.; Linhardt, R. J.; Amster, J. Anal. Chem. 2007, 79, 2015-2022
42. Dell, A.; Rogers, M. E.; Thomas-Oates, J. E. Carbohydr. Res. 1988, 179, 7-19
43. Barker, S. A.; Hurst, R. E.; Settine, J.; Fish, F. P.; Settine, R. L. Carbohydr. Res. 1984, 125, 291-300
44. Huang, R.; Pomin, V. H.; Sharp, J. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 1577-1587
45. Liu, R.; Xu, Y.; Chen, M.; Weiwer, M.; Zhou, X.; Bridges, A. S.; DeAngelis, P. L.; Zhang, Q.; Linhardt, R. J.; Liu, J. J. Biol. Chem. 2010, 285, 34240-34249
46. Xu, Y.; Masuko, S.; Takieddin, M.; Xu, H.; Liu, R.; Jing, J.; Mousa, S. A.; Linhardt, R. J.; Liu, J. Science 2011, 334, 498-501
47. Heiss, C.; Wang, Z.; Azadi, P. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2011, 25, 774-778
48. Nagasawa, K.; Inoue, Y.; Kamata, T. Carbohydr. Res. 1977, 58, 47-55
49. Bendiak, B.; Fang, T. T.; Jones, D. N. M. Can. J. Chem. 2002, 80, 1032-1050
50. Baldwin, M. A.; Stahl, N.; Reinders, L. G.; Gibson, B. W.; Prusiner, S. B.; Burlingame, A. L. Anal. Biochem. 1990, 191, 174-182
51. Lindahl, U.; Li, J. P. Int. Rev. Cell Mol. Biol. 2009, 276, 105-159
52. Langeslay, D. J.; Young, R. P.; Beni, S.; Beecher, C. N.; Mueller, L. J.; Larive, C. K. Glycobiology 2012, 22, 1173-1182