Optimization-based design of metal-organic framework materials

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 9, Issue 6, 2013, Pages 2816-2825

  Martin, Richard Luis ^a   Haranczyk, Maciej ^a  

^a LAWRENCE BERKELEY NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84879116716     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct400255c     Document Type: Article

References (50)

1. Handbook of Zeolite Science and Technology; Auerbach, S. M., Carrado, K. A., Dutta, P. K., Eds.; Marcel Dekker: New York, USA, 2004.
2. Smit, B.; Maesen, T. L. M. Nature 2008, 457, 671-677
3. Smit, B.; Maesen, T. L. M. Chem. Rev. 2008, 108, 4125-4184
4. Krishna, R.; van Baten, J. M. Chem. Eng. J. 2007, 133, 121-131
5. Eddaoudi, M.; Kim, J.; Rosi, N.; Vodak, D.; Wachter, J.; O'Keeffe, M.; Yaghi, O. M. Science 2002, 295, 469
6. Matsuda, R.; Kitaura, R.; Kitagawa, S.; Kubota, Y.; Belosludov, R. V.; Kobayashi, T. C.; Sakamoto, H.; Chiba, T.; Takata, M.; Kawazoe, Y.; Mita, Y. Nature 2005, 436, 238
7. Millward, A. R.; Yaghi, O. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17998
8. Furukawa, H.; Miller, M. A.; Yaghi, O. M. J. Mater. Chem. 2007, 17, 3197
9. Morris, R. E.; Wheatley, P. S. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 4966
10. Murray, L. J.; Dinca, M.; Long, J. R. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 1294 and references therein
11. Sumida, K.; Hill, M. R.; Horike, S.; Dailly, A.; Long, J. R. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15120
12. Demessence, A.; D'Alessandro, D. M.; Foo, M. L.; Long, J. R. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 8784
13. Yazaydin, A. Ö.; Snurr, R. Q.; Park, T.-H.; Koh, K.; Liu, J.; LeVan, M. D.; Benin, A. I.; Jakubczak, P.; Lanuza, M.; Galloway, D. B.; Low, J. J.; Willis, R. R. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 18198
14. Britt, D.; Furukawa, H.; Wang, B.; Glover, T. G.; Yaghi, O. M. Proc. Natl. Acad. Sci. 2009, 106, 20637
15. Lee, J.; Farha, O. K.; Roberts, J.; Scheidt, K. A.; Nguyen, S. T.; Hupp, J. T. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 1450-1459
16. Deem, M. W.; Pophale, R.; Cheeseman, P. A.; Earl, D. J. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 21353-21360
17. Pophale, R.; Cheeseman, P. A.; Deem, M. W. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 12407-12412
18. Wilmer, C. E.; Leaf, M.; Lee, C. Y.; Farha, O. K.; Hauser, B. G.; Hupp, J. T.; Snurr, R. Q. Nat. Chem. 2012, 4, 83-89
19. Martin, R. L.; Lin, L.-C.; Jariwala, K.; Smit, B.; Haranczyk, M. J. Phys. Chem. C 2013, 10.1021/jp401920y
20. Snarey, M.; Terrett, N. K.; Willett, P.; Wilton, D. J. J. Mol. Graphics Modell. 1997, 15, 372-385
21. Leach, A. R.; Gillet, V. J. An Introduction to Chemoinformatics; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 2003; pp 103-104, 134-136.
22. Martin, R. L.; Smit, B.; Haranczyk, M. J. Chem. Inf. Model. 2012, 52 (2) 308-318
23. Martin, R. L.; Willems, T. F.; Lin, L.-C.; Kim, J.; Swisher, J. A.; Smit, B.; Haranczyk, M. ChemPhysChem 2012, 13 (16) 3595-3597
24. Pinheiro, M.; Martin, R. L.; Rycroft, C. H.; Jones, A.; Iglesia, E.; Haranczyk, M. J. Mol. Graph. Model (in press).
25. Franceschetti, Z.; Zunger, A. Nature 1999, 402, 60-63
26. Kim, K.; Graf, P. A.; Jones, W. B. J. Comput. Phys. 2005, 208, 735-760
27. Rinderspacher, B. C.; Andzelm, J.; Rawlett, A.; Dougherty, J.; Beratan, D. N.; Yang, W. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 3321-3329
28. O'Boyle, N. M.; Campbell, C. M.; Hutchison, G. R. J. Phys. Chem. C 2011, 115 (32) 16200-16210
29. Wang, M.; Hu, X.; Beratan, D. N.; Yang, W. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128 (10) 3228-3232
30. Dantzig, G. B. Linear Programming and Extensions; Princeton Univ. Press: Princeton, NJ, 1963.
31. Kirkpatrick, S.; Gelatt, C. D.; Vecchi, M. P. Science 1983, 220, 671-680
32. Muhlenbein, H.; Gorgesschleuter, M.; Kramer, O. Parallel Comput. 1988, 7, 65-85
33. von Lilienfeld, O. A.; Tuckerman, M. E. J. Chem. Phys. 2006, 125, 154104
34. Pérez, A.; von Lilienfeld, O. A. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7 (8) 2358-2369
35. Martin, R. L.; Haranczyk, M. Chem. Sci. 2013, 4, 1781-1785
36. Yuan, D.; Zhao, D.; Sun, D.; Zhou, H.-C. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5357-5361
37. O'Keeffe, M.; Peskov, M. A.; Ramsden, S. J.; Yaghi, O. M. Acc. Chem. Res. 2008, 41, 1782-1789
38. O'Keeffe, M.; Yaghi, O. M. Chem. Rev. 2012, 112, 675-702
39. Chui, S. S.-Y.; Lo, S. M.-F.; Charmant, J. P. H.; Orpen, A. G.; Williams, I. D. Science 1999, 283, 1148-1150
40. Kim, J.; Chen, B.; Reineke, T. M.; Li, H.; Eddaoudi, M.; Moler, D. B.; O'Keeffe, M.; Yaghi, O. M. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 8239-8247
41. Chen, B.; Ockwig, N. W.; Millward, A. R.; Contreras, D. S.; Yaghi, O. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 4745-4749
42. Uribe-Romo, F. J.; Hunt, J. R.; Furukawa, H.; Klöck, C.; O'Keeffe, M.; Yaghi, O. M. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131 (13) 4570-4571
43. http://www.emolecules.com (accessed 10/02/ 12).
44. Mayo, S. L.; Olafson, B. D.; Goddard, W. A. J. Phys. Chem. 1990, 94 (26) 8897-8909
45. Martin, M. G.; Siepmann, J. I. J. Phys. Chem. B 1998, 102 (14) 2569-2577
46. Willems, T. F.; Rycroft, C. H.; Kazi, M.; Meza, J. C.; Haranczyk, M. Microporous Mesoporous Mater. 2012, 149, 134-141
47. Bondi, A. J. Phys. Chem. 1964, 68, 441-452
48. Rowland, R. S.; Taylor, R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 7384-7391
49. Allen, F. H. Acta Crystallogr., Sect. B 2002, 58, 380-388
50. Pophale, R.; Daeyaert, F.; Deem, M. W. J. Mater. Chem. A 2013, 10.1039/C3TA10626H