Visualization of plasma membrane compartmentalization by high-speed quantum dot tracking

Nano Letters

Volumn 13, Issue 6, 2013, Pages 2332-2337

  Clausen, Mathias P ^a,b   Lagerholm, B Christoffer ^a,b  

^a UNIVERSITY OF SOUTHERN DENMARK   (Denmark)

^b UNIVERSITY OF OXFORD   (United Kingdom)

Author keywords

Fluorescence; hop diffusion; microdomains; plasma membrane; quantum dot; single particle tracking

Indexed keywords

HOP-DIFFUSION; MEAN SIZE; MICRO-DOMAINS; SAMPLING FREQUENCIES; SINGLE MOLECULE; SINGLE PARTICLE TRACKING; TRAJECTORY ANALYSIS; WIDE-FIELD;

FLUORESCENCE; MOLECULES; SEMICONDUCTOR QUANTUM DOTS;

CELL MEMBRANES;

QUANTUM DOT;

CELL COMPARTMENTALIZATION; CELL MEMBRANE; METABOLISM; ARTICLE;

CELL COMPARTMENTATION; CELL MEMBRANE; QUANTUM DOTS;

EID: 84879111316     PISSN: 15306984     EISSN: 15306992     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/nl303151f     Document Type: Article

References (52)

1. Saxton, M. J.; Jacobson, K. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1997, 26, 373-99
2. Pinaud, F.; Clarke, S.; Sittner, A.; Dahan, M. Nat. Methods 2010, 7, 275-85
3. Wieser, S.; Schutz, G. J. Methods 2008, 46, 131-40
4. Brameshuber, M.; Schutz, G. J. Nat. Methods 2008, 5, 133-4
5. Alcor, D.; Gouzer, G.; Triller, A. Eur. J. Neurosci. 2009, 30, 987-97
6. Owen, D. M.; Williamson, D.; Rentero, C.; Gaus, K. Traffic 2009, 10, 962-71
7. Andrews, N. L.; Lidke, K. A.; Pfeiffer, J. R.; Burns, A. R.; Wilson, B. S.; Oliver, J. M.; Lidke, D. S. Nat. Cell Biol. 2008, 10, 955-63
8. Fujiwara, T.; Ritchie, K.; Murakoshi, H.; Jacobson, K.; Kusumi, A. J. Cell Biol. 2002, 157, 1071-81
9. Itano, M. S.; Neumann, A. K.; Liu, P.; Zhang, F.; Gratton, E.; Parak, W. J.; Thompson, N. L.; Jacobson, K. Biophys. J. 2011, 100, 2662-70
10. Jaqaman, K.; Kuwata, H.; Touret, N.; Collins, R.; Trimble, W. S.; Danuser, G.; Grinstein, S. Cell 2011, 146, 593-606
11. Wieser, S.; Weghuber, J.; Sams, M.; Stockinger, H.; Schutz, G. J. Soft Matter 2009, 5, 3287-3294
12. Chen, Y.; Thelin, W. R.; Yang, B.; Milgram, S. L.; Jacobson, K. J. Cell Biol. 2006, 175, 169-78
13. Pinaud, F.; Michalet, X.; Iyer, G.; Margeat, E.; Moore, H. P.; Weiss, S. Traffic 2009, 10, 691-712
14. Kusumi, A.; Sako, Y.; Yamamoto, M. Biophys. J. 1993, 65, 2021-40
15. Jacobson, K.; Mouritsen, O. G.; Anderson, R. G. Nat. Cell Biol. 2007, 9, 7-14
16. Clausen, M. P.; Lagerholm, B. C. Curr. Protein Pept. Sci. 2011, 12, 699-713
17. Chen, Y.; Yang, B.; Jacobson, K. Lipids 2004, 39, 1115-9
18. Simson, R.; Sheets, E. D.; Jacobson, K. Biophys. J. 1995, 69, 989-93
19. Sheets, E. D.; Lee, G. M.; Simson, R.; Jacobson, K. Biochemistry 1997, 36, 12449-58
20. Dietrich, C.; Yang, B.; Fujiwara, T.; Kusumi, A.; Jacobson, K. Biophys. J. 2002, 82, 274-84
21. Simons, K.; Gerl, M. J. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2010, 11, 688-99
22. Wieser, S.; Moertelmaier, M.; Fuertbauer, E.; Stockinger, H.; Schutz, G. J. Biophys. J. 2007, 92, 3719-28
23. Murase, K.; Fujiwara, T.; Umemura, Y.; Suzuki, K.; Iino, R.; Yamashita, H.; Saito, M.; Murakoshi, H.; Ritchie, K.; Kusumi, A. Biophys. J. 2004, 86, 4075-93
24. Suzuki, K.; Ritchie, K.; Kajikawa, E.; Fujiwara, T.; Kusumi, A. Biophys. J. 2005, 88, 3659-80
25. Umemura, Y. M.; Vrljic, M.; Nishimura, S. Y.; Fujiwara, T. K.; Suzuki, K. G.; Kusumi, A. Biophys. J. 2008, 95, 435-50
26. Kusumi, A.; Nakada, C.; Ritchie, K.; Murase, K.; Suzuki, K.; Murakoshi, H.; Kasai, R. S.; Kondo, J.; Fujiwara, T. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2005, 34, 351-78
27. Wawrezinieck, L.; Rigneault, H.; Marguet, D.; Lenne, P. F. Biophys. J. 2005, 89, 4029-42
28. Lenne, P. F.; Wawrezinieck, L.; Conchonaud, F.; Wurtz, O.; Boned, A.; Guo, X. J.; Rigneault, H.; He, H. T.; Marguet, D. EMBO J. 2006, 25, 3245-56
29. Dahan, M.; Levi, S.; Luccardini, C.; Rostaing, P.; Riveau, B.; Triller, A. Science 2003, 302, 442-5
30. Rosenthal, S. J.; Chang, J. C.; Kovtun, O.; McBride, J. R.; Tomlinson, I. D. Chem Biol 2011, 18, 10-24
31. Arnspang Christensen, E.; Brewer, J. R.; Lagerholm, B. C. PLoS One 2012, 7, e48521
32. Wu, C.; Asokan, S. B.; Berginski, M. E.; Haynes, E. M.; Sharpless, N. E.; Griffith, J. D.; Gomez, S. M.; Bear, J. E. Cell 2012, 148, 973-87
33. Kenworthy, A. K. Methods Mol. Biol. 2007, 398, 179-92
34. Howarth, M.; Ting, A. Y. Nat. Protoc 2008, 3, 534-45
35. Howarth, M.; Takao, K.; Hayashi, Y.; Ting, A. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 7583-8
36. Sbalzarini, I. F.; Koumoutsakos, P. J. Struct. Biol. 2005, 151, 182-95
37. Lagerholm, B. C.; Averett, L.; Weinreb, G. E.; Jacobson, K.; Thompson, N. L. Biophys. J. 2006, 91, 3050-60
38. Bannai, H.; Levi, S.; Schweizer, C.; Dahan, M.; Triller, A. Nat. Protoc. 2006, 1, 2628-34
39. Saxton, M. J. Biophys. J. 1994, 66, 394-401
40. Powles, J. G.; Mallett, M. J. D.; Rickayzen, G.; Evans, W. A. B. Proc. R. Soc. London, Ser. A 1992, 436, 391-403
41. Kusumi, A.; Shirai, Y. M.; Koyama-Honda, I.; Suzuki, K. G.; Fujiwara, T. K. FEBS Lett. 2010, 584, 1814-23
42. Mascalchi, P.; Haanappel, E.; Carayon, K.; Mazeres, S.; Salome, L. Soft Matter 2012, 8, 4462-4470
43. Machan, R.; Hof, M. Biochim. Biophys. Acta 2010, 1798, 1377-91
44. Peters, R.; Cherry, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 4317-21
45. Ramadurai, S.; Holt, A.; Krasnikov, V.; van den Bogaart, G.; Killian, J. A.; Poolman, B. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 12650-6
46. Niemela, P. S.; Miettinen, M. S.; Monticelli, L.; Hammaren, H.; Bjelkmar, P.; Murtola, T.; Lindahl, E.; Vattulainen, I. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 7574-5
47. Adler, J.; Shevchuk, A. I.; Novak, P.; Korchev, Y. E.; Parmryd, I. Nat. Methods 2010, 7, 170-1
48. Sahl, S. J.; Leutenegger, M.; Hilbert, M.; Hell, S. W.; Eggeling, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 6829-34
49. Eggeling, C.; Ringemann, C.; Medda, R.; Schwarzmann, G.; Sandhoff, K.; Polyakova, S.; Belov, V. N.; Hein, B.; von Middendorff, C.; Schonle, A.; Hell, S. W. Nature 2009, 457, 1159-62
50. Mueller, V.; Ringemann, C.; Honigmann, A.; Schwarzmann, G.; Medda, R.; Leutenegger, M.; Polyakova, S.; Belov, V. N.; Hell, S. W.; Eggeling, C. Biophys. J. 2011, 101, 1651-60
51. Howarth, M.; Liu, W.; Puthenveetil, S.; Zheng, Y.; Marshall, L. F.; Schmidt, M. M.; Wittrup, K. D.; Bawendi, M. G.; Ting, A. Y. Nat. Methods 2008, 5, 397-9
52. Mittal, R.; Bruchez, M. P. Bioconjugate Chem. 2011, 22, 362-8