Glycoproteomic analysis of tissues from patients with colon cancer using lectin microarrays and nanoLC-MS/MS

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 7, 2013, Pages 1877-1887

  Li, Yangguang ^a   Wen, Ti ^b   Zhu, Minzhi ^c   Li, Lixin ^d   Wei, Jun ^a   Wu, Xiaoli ^a   Guo, Mingzhou ^e   Liu, Shuangping ^f   Zhao, Huiyuan ^a   Xia, Siyuan ^a   Huang, Weili ^g   Wang, Puyue ^a   Wu, Zhenzhou ^a   Zhao, Liqing ^a   Shui, Wenqing ^a,d   Li, Zheng ^b   Yin, Zhinan ^a  

^a NANKAI UNIVERSITY   (China)

^b CHINA MEDICAL UNIVERSITY   (China)

^c NORTHWEST UNIVERSITY   (China)

^d High throughput Molecular Drug Discovery Center   (China)

^e CHINESE PLA GENERAL HOSPITAL   (China)

^f YANBIAN UNIVERSITY   (China)

^g BEIHUA UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

SOLANUM TUBEROSUM;

GLYCOPROTEIN; LECTIN; PROTEOME;

AGED; ARTICLE; CANCER STAGING; CHEMISTRY; COLON; COLON TUMOR; FEMALE; HUMAN; MALE; METABOLISM; METHODOLOGY; MIDDLE AGED; PATHOLOGY; PROTEIN MICROARRAY; PROTEOMICS; REPRODUCIBILITY; TANDEM MASS SPECTROMETRY; VERY ELDERLY; PROCEDURES;

AGED; AGED, 80 AND OVER; COLON; COLONIC NEOPLASMS; FEMALE; GLYCOPROTEINS; HUMANS; LECTINS; MALE; MIDDLE AGED; NEOPLASM STAGING; PROTEIN ARRAY ANALYSIS; PROTEOME; PROTEOMICS; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 84878697447     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3mb00013c     Document Type: Article

References (52)

1. D. M. Parkin F. Bray J. Ferlay P. Pisani Ca-Cancer J. Clin. 2005 55 74 108
2. J. B. O'Connell M. A. Maggard C. Y. Ko J. Natl. Cancer Inst. 2004 96 1420 1425
3. J. A. Luna Coronell P. Syed K. Sergelen I. Gyurjan A. Weinhausel J. Proteomics 2012 10.1016/j.jprot.2012.07.022
4. R. S. Haltiwanger J. B. Lowe Annu. Rev. Biochem. 2004 73 491 537
5. J. W. Dennis M. Granovsky C. E. Warren BioEssays 1999 21 412 421
6. M. Butler Cytotechnology 2006 50 57 76
7. N. Sharon H. Lis Sci. Am. 1993 268 82 89
8. C. M. Fletcher M. J. Coyne O. F. Villa M. Chatzidaki-Livanis L. E. Comstock Cell 2009 137 321 331
9. F. Dall'olio Mol. Pathol. 1996 49 M126 M135
10. S. Hakomori Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 10231 10233
11. C. A. Reis H. Osorio L. Silva C. Gomes L. David J. Clin. Pathol. 2010 63 322 329
12. Y. J. Kim A. Varki Glycoconjugate J. 1997 14 569 576
13. S. Hakomori Adv. Cancer Res. 1989 52 257 331
14. R. Saldova M. R. Wormald R. A. Dwek P. M. Rudd Dis. Markers 2008 25 219 232
15. R. Saldova L. Royle C. M. Radcliffe U. M. Abd Hamid R. Evans J. N. Arnold R. E. Banks R. Hutson D. J. Harvey R. Antrobus S. M. Petrescu R. A. Dwek P. M. Rudd Glycobiology 2007 17 1344 1356
16. Z. Zeng M. Hincapie B. B. Haab S. Hanash S. J. Pitteri S. Kluck J. M. Hogan J. Kennedy W. S. Hancock J. Chromatogr., A 2010 1217 3307 3315
17. Z. Kyselova Y. Mechref P. Kang J. A. Goetz L. E. Dobrolecki G. W. Sledge L. Schnaper R. J. Hickey L. H. Malkas M. V. Novotny Clin. Chem. 2008 54 1166 1175
18. C. Li E. Zolotarevsky I. Thompson M. A. Anderson D. M. Simeone J. M. Casper M. C. Mullenix D. M. Lubman Electrophoresis 2011 32 2028 2035
19. M. A. Comunale M. Wang J. Hafner J. Krakover L. Rodemich B. Kopenhaver R. E. Long O. Junaidi A. M. Bisceglie T. M. Block A. S. Mehta J. Proteome Res. 2009 8 595 602
20. C. I. Balog K. Stavenhagen W. L. Fung C. A. Koeleman L. A. McDonnell A. Verhoeven W. E. Mesker R. A. Tollenaar A. M. Deelder M. Wuhrer Mol. Cell. Proteomics 2012 11 571 585
21. Y. Sato K. Nakata Y. Kato M. Shima N. Ishii T. Koji K. Taketa Y. Endo S. Nagataki N. Engl. J. Med. 1993 328 1802 1806
22. J. S. Ross J. A. Fletcher G. P. Linette J. Stec E. Clark M. Ayers W. F. Symmans L. Pusztai K. J. Bloom Oncologist 2003 8 307 325
23. J. Hernandez I. M. Thompson Cancer 2004 101 894 904
24. P. Chen Y. Liu X. Kang L. Sun P. Yang Z. Tang J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2008 134 851 860
25. S. C. Tao Y. Li J. Zhou J. Qian R. L. Schnaar Y. Zhang I. J. Goldstein H. Zhu J. P. Schneck Glycobiology 2008 18 761 769
26. J. Wu X. Xie Y. Liu J. He R. Benitez R. J. Buckanovich D. M. Lubman J. Proteome Res. 2012 11 4541 4552
27. S. Fry B. Afrough A. Leathem M. Dwek Methods Mol. Biol. 2012 878 267 272
28. B. B. Gao L. Stuart E. P. Feener Mol. Cell. Proteomics 2008 7 2399 2409
29. Y. Qin Y. Zhong L. Dang M. Zhu H. Yu W. Chen J. Cui H. Bian Z. Li J. Proteomics 2012 75 4114 4123
30. T. Wen Y. Li M. Wu X. Sun X. Bao Y. Lin J. Hao L. Han G. Cao Z. Wang Y. Liu Z. Wu Z. Hong P. Wang L. Zhao Z. Li Q. Wang Z. Yin Arthritis Rheum. 2012 64 2896 2906
31. K. L. Abbott J. M. Lim L. Wells B. B. Benigno J. F. McDonald M. Pierce Proteomics 2010 10 470 481
32. Z. Shen P. Li R. J. Ni M. Ritchie C. P. Yang G. F. Liu W. Ma G. J. Liu L. Ma S. J. Li Z. G. Wei H. X. Wang B. C. Wang Mol. Cell. Proteomics 2009 8 2443 2460
33. Z. Dai Y. K. Liu J. F. Cui H. L. Shen J. Chen R. X. Sun Y. Zhang X. W. Zhou P. Y. Yang Z. Y. Tang Proteomics 2006 6 5857 5867
34. X. Liu L. Ye J. Wang D. Fan Chin. Med. J. 1999 112 1133 1137
35. Z. Milicevic D. Bogojevic M. Mihailovic M. Petrovic Z. Krivokapic Int. J. Oncol. 2008 32 1169 1178
36. F. Jahns A. Wilhelm K. O. Greulich H. Mothes M. Radeva A. Wolfert M. Glei Genes Nutr. 2012 7 235 246
37. W. Mi Y. Gu C. Han H. Liu Q. Fan X. Zhang Q. Cong W. Yu Biochim. Biophys. Acta, Mol. Basis Dis. 2011 1812 514 519
38. G. Yehezkel L. Cohen A. Kliger E. Manor I. Khalaila J. Biol. Chem. 2012 287 28755 28769
39. S. Hu D. T. Wong Proteomics: Clin. Appl. 2009 3 148 154
40. H. Tateno A. Kuno Y. Itakura J. Hirabayashi Methods Enzymol. 2010 478 181 195
41. M. Sobrinho-Simoes I. Damjanov Arch. Pathol. Lab. Med. 1986 110 722 729
42. V. Gerke S. E. Moss Physiol. Rev. 2002 82 331 371
43. L. H. Lim S. Pervaiz FASEB J. 2007 21 968 975
44. S. Mussunoor G. I. Murray J. Pathol. 2008 216 131 140
45. T. Y. Cheng M. S. Wu J. T. Lin M. T. Lin C. T. Shun H. Y. Huang K. T. Hua M. L. Kuo Cancer 2012 10.1002/cncr.27565
46. C. P. Paweletz D. K. Ornstein M. J. Roth V. E. Bichsel J. W. Gillespie V. S. Calvert C. D. Vocke S. M. Hewitt P. H. Duray J. Herring Q. H. Wang N. Hu W. M. Linehan P. R. Taylor L. A. Liotta M. R. Emmert-Buck E. F. Petricoin III Cancer Res. 2000 60 6293 6297
47. X. F. Bai X. G. Ni P. Zhao S. M. Liu H. X. Wang B. Guo L. P. Zhou F. Liu J. S. Zhang K. Wang Y. Q. Xie Y. F. Shao X. H. Zhao World J. Gastroenterol. 2004 10 1466 1470
48. N. Hu M. J. Flaig H. Su J. Z. Shou M. J. Roth W. J. Li C. Wang A. M. Goldstein G. Li M. R. Emmert-Buck P. R. Taylor Clin. Cancer Res. 2004 10 6013 6022
49. K. L. Wang T. T. Wu E. Resetkova H. Wang A. M. Correa W. L. Hofstetter S. G. Swisher J. A. Ajani A. Rashid S. R. Hamilton C. T. Albarracin Clin. Cancer Res. 2006 12 4598 4604
50. R. Duncan B. Carpenter L. C. Main C. Telfer G. I. Murray Br. J. Cancer 2008 98 426 433
51. L. H. Pearl C. Prodromou Adv. Protein Chem. 2001 59 157 186
52. T. Overath U. Kuckelkorn P. Henklein B. Strehl D. Bonar A. Kloss D. Siele P. M. Kloetzel K. Janek Mol. Cell. Proteomics 2012 11 467 477