Use of brightness wavelet transformation for automated analysis of serum metallothioneins- and zinc-containing proteins by Western blots to subclassify childhood solid tumours

Electrophoresis

Volumn 34, Issue 11, 2013, Pages 1637-1648

  Vyslouzilova, Lenka ^a   Krizkova, Sona ^b,c   Anyz, Jiri ^a   Hynek, David ^b,c   Hrabeta, Jan ^d   Kruseova, Jarmila ^d   Eckschlager, Tomas ^d   Adam, Vojtech ^b,c   Stepankova, Olga ^a   Kizek, Rene ^b,c  

^a CZECH TECHNICAL UNIVERSITY IN PRAGUE   (Czech Republic)

^b MENDEL UNIVERSITY IN BRNO   (Czech Republic)

^c BRNO UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Czech Republic)

^d CHARLES UNIVERSITY   (Czech Republic)

Author keywords

Cancer; Metallothionein; Signal processing; Zinc

Indexed keywords

BODY FLUIDS; DECISION TREES; DIAGNOSIS; SIGNAL PROCESSING; VOLTAMMETRY; WAVELET TRANSFORMS; ZINC COMPOUNDS;

AUTOMATED ANALYSIS; CANCER; METALLOTHIONEINS; NEUROBLASTOMAS; SERUM LEVELS; SIGNAL-PROCESSING; SOLID TUMORS; WAVELET TRANSFORMATIONS; WESTERN BLOTS; ZINC;

TUMORS;

METALLOTHIONEIN; ZINC;

ACCURACY; ARTICLE; AUTOMATION; BIOINFORMATICS; BLOOD ANALYSIS; CHILD; CHILDHOOD CANCER; CLINICAL ARTICLE; CONTROLLED STUDY; DIFFERENTIAL PULSE VOLTAMMETRY; EMBRYONAL CARCINOMA; ENZYME LINKED IMMUNOSORBENT ASSAY; EWING SARCOMA; HODGKIN DISEASE; HUMAN; MATHEMATICAL ANALYSIS; MEDULLOBLASTOMA; NEPHROBLASTOMA; NEUROBLASTOMA; OSTEOSARCOMA; SOLID TUMOR; WAVELET ANALYSIS; WESTERN BLOTTING;

EID: 84878637605     PISSN: 01730835     EISSN: 15222683     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/elps.201200561     Document Type: Article

References (62)

1. Margoshes, M., Vallee, B. L., J. Am. Chem. Soc. 1957, 79, 4813-4814.
2. Thirumoorthy, N., Kumar, K. T. M., Sundar, A. S., Panayappan, L., Chatterjee, M., World J. Gastroenterol. 2007, 13, 993-996.
3. Theocharis, S. E., Margeli, A. P., Koutselinis, A., Int. J. Biol. Markers 2003, 18, 162-169.
4. Miles, A. T., Hawksworth, G. M., Beattie, J. H., Rodilla, V., Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2000, 35, 35-70.
5. Simpkins, C. O., Cell. Mol. Biol. 2000, 46, 465-488.
6. Ghoshal, K., Jacob, S. T., Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 2001, 66, 357-384.
7. Adam, V., Fabrik, I., Eckschlager, T., Stiborova, M., Trnkova, L., Kizek, R., TRAC-Trends Anal. Chem. 2010, 29, 409-418.
8. Capdevila, M., Bofill, R., Palacios, O., Atrian, S., Coord. Chem. Rev. 2012, 256, 46-62.
9. Jasani, B., Schmid, K. W., Histopathology 1997, 31, 211-214.
10. Theocharis, S. E., Margeli, A. P., Klijanienko, J. T., Kouraklis, G. P., Histopathology 2004, 45, 103-118.
11. Cherian, M. G., Jayasurya, A., Bay, B. H., Mutat. Res.-Fundam. Mol. Mech. Mutagen. 2003, 533, 201-209.
12. Eckschlager, T., Adam, V., Hrabeta, J., Figova, K., Kizek, R., Curr. Protein Pept. Sci. 2009, 10, 360-375.
13. Adam, V., Blastik, O., Krizkova, S., Lubal, P., Kukacka, J., Prusa, R., Kizek, R., Chem. Listy 2008, 102, 51-58.
14. Babula, P., Kohoutkova, V., Opatrilova, R., Dankova, I., Masarik, M., Kizek, R., Chim. Oggi-Chem. Today 2011, 28, 18-21.
15. Gumulec, J., Masarik, M., Krizkova, S., Adam, V., Hubalek, J., Hrabeta, J., Eckschlager, T., Stiborova, M., Kizek, R., Curr. Med. Chem. 2011, 18, 5041-5051.
16. Krejcova, L., Fabrik, I., Hynek, D., Krizkova, S., Gumulec, J., Ryvolova, M., Adam, V., Babula, P., Trnkova, L., Stiborova, M., Hubalek, J., Masarik, M., Binkova, H., Eckschlager, T., Kizek, R., Int. J. Electrochem. Sci. 2012, 7, 1767-1784.
17. Krizkova, S., Fabrik, I., Adam, V., Hrabeta, P., Eckschlager, T., Kizek, R., Bratisl. Med. J. 2009, 110, 93-97.
18. Krizkova, S., Fabrik, I., Adam, V., Kukacka, J., Prusa, R., Chavis, G. J., Trnkova, L., Strnadel, J., Horak, V., Kizek, R., Sensors 2008, 8, 3106-3122.
19. Krizkova, S., Masarik, M., Majzlik, P., Kukacka, J., Kruseova, J., Adam, V., Prusa, R., Eckschlager, T., Stiborova, M., Kizek, R., Acta Biochim. Pol. 2010, 57, 561-566.
20. Krizkova, S., Ryvolova, M., Hynek, D., Eckschlager, T., Hodek, P., Masarik, M., Adam, V., Kizek, R., Electrophoresis 2012, 33, 1824-1832.
21. Sochor, J., Hynek, D., Krejcova, L., Fabrik, I., Krizkova, S., Gumulec, J., Adam, V., Babula, P., Trnkova, L., Stiborova, M., Hubalek, J., Masarik, M., Binkova, H., Eckschlager, T., Kizek, R., Int. J. Electrochem. Sci. 2012, 7, 2136-2152.
22. Rickert, C. H., Paulus, W., Acta Neuropathol. 2005, 109, 69-92.
23. Rickert, C. H., J. Neuropathol. Exp. Neurol. 2004, 63, 1211-1224.
24. Trieb, K., Kotz, R., Int. J. Biochem. Cell Biol. 2001, 33, 11-17.
25. Woolston, C. M., Deen, S., Al-Attar, A., Shehata, M., Chan, S. Y., Martin, S. G., Free Radic. Biol. Med. 2010, 49, 1263-1272.
26. Jin, R. X., Huang, J. X., Tan, P. H., Bay, B. H., Pathol. Oncol. Res. 2004, 10, 74-79.
27. Gomulkiewicz, A., Podhorska-Okolow, M., Szulc, R., Smorag, Z., Wojnar, A., Zabel, M., Dziegiel, P., Folia Histochem. Cytobiol. 2010, 48, 242-248.
28. Tomita, T., Pathol. Int. 2002, 52, 425-432.
29. Theocharis, S., Klijanienko, J., Giaginis, C., Rodriguez, J., Jouffroy, T., Girod, A., Point, D., Tsourouflis, G., Sastre-Garau, X., Histopathology 2011, 59, 514-525.
30. Krizkova, S., Ryvolova, M., Gumulec, J., Masarik, M., Adam, V., Majzlik, P., Hubalek, J., Provaznik, I., Kizek, R., Electrophoresis 2011, 32, 1952-1961.
31. Masarik, M., Gumulec, J., Sztalmachova, M., Hlavna, M., Babula, P., Krizkova, S., Ryvolova, M., Jurajda, M., Sochor, J., Adam, V., Kizek, R., Electrophoresis 2011, 32, 3576-3588.
32. Krolicka, A., Kobierzycki, C., Pula, B., Podhorska-Okolow, M., Piotrowska, A., Rzeszutko, M., Rzeszutko, W., Rabczynski, J., Domoslawski, P., Wojtczak, B., Dawiskiba, J., Dziegiel, P., Anticancer Res. 2010, 30, 4945-4949.
33. El Sharkawy, S. L., Abbas, N. F., Badawi, M. A., El Shaer, M. A., J. Clin. Pathol. 2006, 59, 1171-1174.
34. Soo, E. T. L., Ng, C. T., Yip, G. W. C., Koo, C. Y., Nga, M. E., Tan, P. H., Bay, B. H., Anat. Rec. 2011, 294, 267-272.
35. Thirumoorthy, N., Sunder, A. S., Kumar, K. T. M., Kumar, M. S., Ganesh, G. N. K., Chatterjee, M., World J. Surg. Oncol. 2011, 9, 54.
36. Ghoshal, K., Majumder, S., Jacob, S. T., Methods Enzymol. 2002, 353, 476-486.
37. Krizkova, S., Adam, V., Kizek, R., Electrophoresis 2009, 30, 4029-4033.
38. Krizkova, S., Masarik, M., Eckschlager, T., Adam, V., Kizek, R., J. Chromatogr. A 2010, 1217, 7966-7971.
39. Masarik, M., Gumulec, J., Kuchtickova, S., Kudlackova, V., Cernei, N., Zitka, O., Babula, P., Adam, V., Krizkova, S., Hrabec, R., Rovny, A., Kizek, R., Int. J. Mol. Med. 2010, 26, S47.
40. Malvy, D. J. M., Arnaud, J., Burtschy, B., Sommelet, D., Leverger, G., Dostalova, L., AmedeeManesme, O., Med. Ped. Oncol. 1997, 29, 213-217.
41. Malvy, D. J. M., Arnaud, J., Burtschy, B., Sommelet, D., Leverger, G., Dostalova, L., AmedeeManesme, O., Int. J. Vitam. Nutr. Res. 1997, 67, 267-271.
42. Krizkova, S., Adam, V., Eckschlager, T., Kizek, R., Electrophoresis 2009, 30, 3726-3735.
43. Ryvolova, M., Krizkova, S., Adam, V., Beklova, M., Trnkova, L., Hubalek, J., Kizek, R., Curr. Anal. Chem. 2011, 7, 243-261.
44. Ryvolova, M., Adam, V., Kizek, R., J. Chromatogr. A 2012, 1226, 31-42.
45. Ryvolova, M., Hynek, D., Skutkova, H., Adam, V., Provaznik, I., Kizek, R., Electrophoresis 2012, 33, 270-279.
46. Tesar, M., Hoch, C., Moore, E. R. B., Timmis, K. N., Syst. Appl. Microbiol. 1996, 19, 577-588.
47. Brooks, B. W., Garcia, M. M., Robertson, R. H., Lior, H., Vet. Microbiol. 1996, 51, 105-114.
48. Talebi, A., Avian Pathol. 1995, 24, 731-735.
49. He, H., Tang, B., Sun, C., Yang, S. G., Zheng, W. J., Hua, Z. C., Front. Environ. Sci. Eng. China 2011, 5, 409-416.
50. Petrlova, J., Potesil, D., Mikelova, R., Blastik, O., Adam, V., Trnkova, L., Jelen, F., Prusa, R., Kukacka, J., Kizek, R., Electrochim. Acta 2006, 51, 5112-5119.
51. Bradford, M. M., Anal. Biochem. 1976, 72, 248-254.
52. Majzlik, P., Strasky, A., Adam, V., Nemec, M., Trnkova, L., Zehnalek, J., Hubalek, J., Provaznik, I., Kizek, R., Int. J. Electrochem. Sci. 2011, 6, 2171-2191.
53. Hynek, D., Krejcova, L., Krizkova, S., Ruttkay-Nedecky, B., Pikula, J., Adam, V., Hajkova, P., Trnkova, L., Sochor, J., Pohanka, M., Hubalek, J., Beklova, M., Vrba, R., Kizek, R., Int. J. Electrochem. Sci. 2012, 7, 943-964.
54. Adam, V., Krizkova, S., Zitka, O., Trnkova, L., Petrlova, J., Beklova, M., Kizek, R., Electroanalysis 2007, 19, 339-347.
55. Lin, C. N., Wilson, A., Church, B. B., Ehman, S., Roberts, W. L., McMillin, G. A., Clin. Chim. Acta 2012, 413, 612-615.
56. Cavdar, A. O., Gozdasoglu, S., Babacan, E., Mengubas, K., Unal, E., Yavuz, G., Tacyildiz, N., Nutr. Cancer 2009, 61, 888-890.
57. Dalvi, R., Bajaj, S., Pediatr. Blood Cancer 2010, 55, 954-954.
58. Yaprak, D., Yalcin, B., Pinar, A. A., Buyukpamukcu, M., Pediatr. Blood Cancer 2010, 55, 949-950.
59. Unal, E., Cavdar, A. O., Babacan, E., Gozdasoglu, S., Yavuz, G., Ikinciogullari, A., Akar, E., Cin, S., J. Trace Elem. Exp. Med. 2001, 14, 25-30.
60. Krizkova, S., Masarik, M., Kukacka, J., Prusa, R., Eckschlager, T., Hubalek, J., Kizek, R., EJC Suppl. 2010, 8, 49-49.
61. Drexler, D. M., Reily, M. D., Shipkova, P. A., Anal. Bioanal. Chem. 2011, 399, 2645-2653.
62. Hazarika, P., Russell, D. A., Angew. Chem.-Int. Ed. 2012, 51, 3524-3531.