Complementary biochemical approaches applied to the identification of plastidial calmodulin-binding proteins

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 6, 2013, Pages 1234-1248

  Dell'Aglio, Elisa ^a,b,c,d   Giustini, Cécile ^a,b,c,d   Salvi, Daniel ^a,b,c,d   Brugière, Sabine ^a,b,e   Delpierre, Faustine ^a,b,c,d   Moyet, Lucas ^a,b,c,d   Baudet, Mathieu ^a,b,e   Seigneurin Berny, Daphné ^a,b,c,d   Matringe, Michel ^a,b,c,d   Ferro, Myriam ^a,b,e   Rolland, Norbert ^a,b,c,d   Curien, Gilles ^a,b,c,d  

^a UNIV GRENOBLE ALPES   (France)

^b CEA GRENOBLE   (France)

^c CEMAGREF   (France)

^d Laboratoire de Physiologie Cellulaire Vegetale Grenoble   (France)

^e INSERM   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARABIDOPSIS PROTEIN; CALCIUM; CALMODULIN; CALMODULIN BINDING PROTEIN; NICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE KINASE; PHOSPHOTRANSFERASE; PROTEOME; VEGETABLE PROTEIN; PROTEIN BINDING;

ARABIDOPSIS; ARTICLE; CHEMISTRY; CHLOROPLAST; GENE EXPRESSION PROFILING; GENETICS; METABOLISM; PLANT LEAF; PROTEIN BINDING; SIGNAL TRANSDUCTION; SPINACH;

ARABIDOPSIS; ARABIDOPSIS PROTEINS; CALCIUM; CALMODULIN; CALMODULIN-BINDING PROTEINS; CHLOROPLASTS; GENE EXPRESSION PROFILING; PHOSPHOTRANSFERASES (ALCOHOL GROUP ACCEPTOR); PLANT LEAVES; PLANT PROTEINS; PROTEIN BINDING; PROTEOME; SIGNAL TRANSDUCTION; SPINACIA OLERACEA;

EID: 84877757886     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3mb00004d     Document Type: Article

References (67)

1. K. A. Skelding J. A. Rostas N. M. Verrills Cell Cycle 2011 10 631 639
2. M. Zik T. Arazi W. A. Snedden H. Fromm Plant Mol. Biol. 1998 37 967 975
3. M. Sola-Penna D. Da Silva W. S. Coelho M. M. Marinho-Carvalho P. Zancan IUBMB Life 2010 62 791 796
4. S. Shao R. S. Hegde Cell 2011 147 1576 1588
5. R. H. Kretsinger C. E. Nockolds J. Biol. Chem. 1973 248 3313 3326
6. P. Cohen Annu. Rev. Biochem. 1989 58 453 508
7. R. K. Sharma S. B. Das A. Lakshmikuttyamma P. Selvakumar A. Shrivastav Int. J. Mol. Med. 2006 18 95 105
8. J. Haiech E. Audran M. Fève R. Ranjeva M.-C. Kilhoffer Biochimie 2011 93 2029 2037
9. M. Mikhaylova J. Hradsky M. R. Kreutz J. Neurochem. 2011 118 695 713
10. D. J. O'Connell M. C. Bauer J. O'Brien W. M. Johnson C. A. Divizio S. L. O'Kane T. Berggard A. Merino K. S. Akerfeldt S. Linse D. J. Cahill Mol. Cell. Proteomics 2010 9 1118 1132
11. T. Berggard G. Arrigoni O. Olsson M. Fex S. Linse P. James J. Proteome Res. 2006 5 669 687
12. X. Shen C. A. Valencia J. Szostak B. Dong R. Liu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 5969 5974
13. X. Shen C. A. Valencia W. Gao S. W. Cotten B. Dong B.-c. Huang R. Liu Cell Calcium 2008 43 444 456
14. I. S. Day V. S. Reddy G. Shad Ali A. S. Reddy Genome Biol. 2002 3 1-0056
15. E. McCormack J. Braam New Phytol. 2003 159 585 598
16. R. Kushwaha A. Singh S. Chattopadhyay Plant Cell 2008 20 1747 1759
17. L. Liang S. Flury V. Kalck B. Hohn J. Molinier Plant Mol. Biol. 2006 61 345 356
18. F. Chigri S. Flosdorff S. Pilz E. Koelle E. Dolze C. Gietl U. C. Vothknecht Plant Mol. Biol. 2012 78 211 222
19. A. Perochon D. Aldon J. P. Galaud B. Ranty Biochimie 2011 93 2048 2053
20. S. C. Popescu G. V. Popescu S. Bachan Z. Zhang M. Seay M. Gerstein M. Snyder S. P. Dinesh-Kumar Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 4730 4735
21. G. S. Ali V. S. Reddy P. B. Lindgren J. L. Jakobek A. S. N. Reddy Plant Mol. Biol. 2003 51 803 815
22. N. A. Al-Quraan R. D. Locy N. K. Singh Plant Physiol. Biochem. 2010 48 697 702
23. T. N. Davis M. S. Urdea F. R. Masiarz J. Thorner Cell 1986 47 423 431
24. J. Bussemer F. Chigri U. C. Vothknecht FEBS J. 2009 276 4294 4304
25. J. Q. Sai C. H. Johnson Plant Cell 2002 14 1279 1291
26. S. Weinl K. Held K. Schlucking L. Steinhorst S. Kuhlgert M. Hippler J. Kudla New Phytol. 2008 179 675 686
27. D. Petroutsos A. Busch I. Janssen K. Trompelt S. V. Bergner S. Weinl M. Holtkamp U. Karst J. Kudla M. Hippler Plant Cell 2011 23 2950 2963
28. F. Chigri F. Hormann A. Stamp D. K. Stammers B. Bolter J. Soll U. C. Vothknecht Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 16051 16056
29. M. F. Chai Q. J. Chen R. An Y. M. Chen J. Chen X. C. Wang Plant Mol. Biol. 2005 59 553 564
30. W. L. Turner J. C. Waller B. Vanderbeld W. A. Snedden Plant Physiol. 2004 135 1243 1255
31. V. S. Reddy G. S. Ali A. S. N. Reddy J. Biol. Chem. 2002 277 9840 9852
32. N. A. Durso R. J. Cyr Plant Cell 1994 6 893 905
33. T. B. Yang B. W. Poovaiah Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000 275 601 607
34. V. S. Reddy A. S. N. Reddy Phytochemistry 2004 65 1745 1776
35. B. Seraphin, E. Puig, E. Bouveret, B. Rutz and F. Caspary, in Protein-Protein interactions: a molecular cloning manual, ed., E. Golemis, Cold Spring Harbor, NY, 2002, pp. 313-328
36. M. Ferro D. Salvi S. Brugiere S. Miras S. Kowalski M. Louwagie J. Garin J. Joyard N. Rolland Mol. Cell. Proteomics 2003 2 325 345
37. M. Ferro S. Brugiere D. Salvi D. Seigneurin-Berny M. Court L. Moyet C. Ramus S. Miras M. Mellal S. Le Gall S. Kieffer-Jaquinod C. Bruley J. Garin J. Joyard C. Masselon N. Rolland Mol. Cell. Proteomics 2010 9 1063 1084
38. M. Kato N. Nagasaki-Takeuchi Y. Ide M. Maeshima Plant Cell Physiol. 2010 51 366 379
39. D. H. O'Day Cell. Signalling 2003 15 347 354
40. O. Delumeau M. Renard F. Montrichard Plant, Cell Environ. 2000 23 1267 1273
41. M. Graindorge C. Giustini A. C. Jacomin A. Kraut G. Curien M. Matringe FEBS Lett. 2010 584 4357 4360
42. S. Abel T. Savchenko M. Levy BMC Evol. Biol. 2005 5 72
43. J. R. Lakowicz, in Principles of fluorescence spectroscopy, ed., S. Science, New york, 2006, ch. 10-12
44. N. Rolland G. Curien G. Finazzi R. Kuntz E. Maréchal M. Matringe S. Ravanel D. Seigneurin-Berny Annu. Rev. Genet. 2012 46 233 264
45. M. Sierla M. Rahikainen J. Salojarvi J. Kangasjarvi S. Kangasjarvi Antioxid. Redox Signaling 2013 10.1089/ars.2012.5016
46. S. Kangasjarvi J. Neukermans S. Li E. M. Aro G. Noctor J. Exp. Bot. 2012 63 1619 1636
47. J. M. Anderson M. J. Cormier Biochem. Biophys. Res. Commun. 1978 84 595 602
48. G. R. Slaughter and A. R. Means, in Methods Enzymol, ed., P. M. C. Anthony, and, R. Means, Academic Press, 1987, vol. 139, pp. 433-444
49. M. J. Hubbard C. B. Klee J. Biol. Chem. 1987 262 15062 15070
50. L. Nieba A. Krebber A. Pluckthun Anal. Biochem. 1996 234 155 165
51. R. Dagher S. Peng S. Gioria M. Fève M. Zeniou M. Zimmermann C. Pigault J. Haiech M.-C. Kilhoffer Biochim. Biophys. Acta 2011 1813 1059 1067
52. V. Bonardi P. Pesaresi T. Becker E. Schleiff R. Wagner T. Pfannschmidt P. Jahns D. Leister Nature 2005 437 1179 1182
53. S. Reiland G. Finazzi A. Endler A. Willig K. Baerenfaller J. Grossmann B. Gerrits D. Rutishauser W. Gruissem J. D. Rochaix S. Baginsky Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 12955 12960
54. H. Nomura T. Komori S. Uemura Y. Kanda K. Shimotani K. Nakai T. Furuichi K. Takebayashi T. Sugimoto S. Sano I. N. Suwastika E. Fukusaki H. Yoshioka Y. Nakahira T. Shiina Nat. Commun. 2012 3 926
55. M. Terashima D. Petroutsos M. Hudig I. Tolstygina K. Trompelt P. Gabelein C. Fufezan J. Kudla S. Weinl G. Finazzi M. Hippler Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 17717 17722
56. J. P. Vainonen Y. Sakuragi S. Stael M. Tikkanen Y. Allahverdiyeva V. Paakkarinen E. Aro M. Suorsa H. V. Scheller A. V. Vener E. M. Aro FEBS J. 2008 275 1767 1777
57. R. E. Sharwood M. Halpert S. Luro G. Schuster D. B. Stern RNA 2011 17 2165 2176
58. S. Contessi F. Haraux I. Mavelli G. Lippe J. Bioenerg. Biomembr. 2005 37 317 326
59. R. Douce and J. Joyard, in Methods in Chloroplast Molecular Biology, Elsevier, Amsterdam, 1982, pp. 239-256
60. M. A. Block A. J. Dorne J. Joyard R. Douce J. Biol. Chem. 1983 258 3273 3280
61. V. Dupierris C. Masselon M. Court S. Kieffer-Jaquinod C. Bruley Bioinformatics 2009 25 1980 1981
62. S. J. Elledge J. T. Mulligan S. W. Ramer M. Spottswood R. W. Davis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 1731 1735
63. S. Miras D. Salvi M. Ferro D. Grunwald J. Garin J. Joyard N. Rolland J. Biol. Chem. 2002 277 47770 47778
64. M. M. Bradford Anal. Biochem. 1976 72 248 254
65. G. Curien O. Bastien M. Robert-Genthon A. Cornish-Bowden M. L. Cardenas R. Dumas Mol. Syst. Biol. 2009 5 271
66. J. Zhao L. M. Weaver K. M. Herrmann Planta 2002 1 180 186
67. L. Blanchoin T. D. Pollard J. Biol. Chem. 1999 274 15538 15546