A convenient method for selective detection of 5-hydroxymethylcytosine and 5-formylcytosine sites in DNA sequences

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 11, Issue 21, 2013, Pages 3568-3572

  Mao, Wuxiang ^a   Hu, Jianlin ^a   Hong, Tingting ^a   Xing, Xiwen ^a   Wang, Sen ^a   Chen, Xi ^a   Zhou, Xiang ^a,b  

^a WUHAN UNIVERSITY   (China)

^b PEKING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHEMISTRY; POSITIVE IONS;

5-HYDROXYMETHYLCYTOSINE; HYDROXYMETHYLCYTOSINE; SELECTIVE DETECTION;

DNA SEQUENCES;

EID: 84877674569     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3ob40447a     Document Type: Article

References (22)

1. S. Kriaucionis N. Heintz Science 2009 324 929 930
2. M. Tahiliani K. P. Koh Y. Shen W. A. Pastor H. Bandukwala Y. Brudno S. Agarwal L. M. Iyer D. R. Liu L. Aravind A. Rao Science 2009 324 930 935
3. N. Bhutani D. M. Burns H. M. Blau Cell 2011 146 866 872
4. C. E. Nestor R. Ottaviano J. Reddington D. Sproul D. Reinhardt D. Dunican E. Katz J. M. Dixon J. Harrison R. R. Meehan Genome Res. 2012 22 467 477
5. M. G. Goll T. H. Bestor Annu. Rev. Biochem. 2005 74 481 514
6. C. Yi C. G. Yang C. He Acc. Chem. Res. 2009 42 519 529
7. R. P. Hausinger Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2004 39 21 68
8. M. Yu G. C. Hon K. E. Szulwach C. X. Song L. Zhang A. Kim X. Li Q. Dai Y. Shen B. Park J. H. Min P. Jin B. Ren C. He Cell 2012 149 1368 1380
9. C. X. Song K. E. Szulwach Y. Fu Q. Dai C. Yi X. Li Y. Li C. H. Chen W. Zhang X. Jian J. Wang L. Zhang T. J. Looney B. Zhang L. A. Godley L. H. Hicks B. T. Lahn P. Jin C. He Nat. Biotechnol. 2011 29 68 72
10. C. X. Song T. A. Clark X. Y. Lu A. Kislyuk Q. Dai S. W. Turner J. Korlach C. He Nat. Methods 2012 9 75 77
11. N. Bhutani D. M. Burns H. M. Blau Cell 2011 146 6 866 872
12. G. Ficz M. R. Branco S. Seisenberger F. Santos F. Krueger T. A. Hore C. J. Marques S. Andrews W. Reik Nature 2011 473 398 401
13. Y. Huang W. A. Pastor Y. Shen M. Tahiliani D. R. Liu A. Rao PLoS One 2010 5 1 e8888
14. T. Pfaffeneder B. Hackner M. Truß M. Münzel M. Müller C. A. Deiml C. Hagemeier T. Carell Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 7008 7012
15. M. W. Kellinger C. X. Song J. Chong X. Y. Lu C. He D. Wang Nat. Struct. Mol. Biol. 2012 19 8 831 834
16. M. J. Booth M. R. Branco G. Ficz D. Oxley F. Krueger W. Reik S. Balasubramanian Science 2012 336 934 937
17. A. Joy A. K. Ghosh G. B. Schuster J. Am. Chem. Soc. 2006 128 5346 5347
18. S. Bjelland L. Eide R. W. Time R. Stote I. Eftedal G. Volden E. Seeberg Biochemistry 1995 34 14758 14764
19. D. K. Rogstad J. Heo N. Vaidehi W. A. Goddard III A. Burdzy L. C. Sowers Biochemistry 2004 43 5688 5697
20. K. Tanabe H. Yamada S. I. Nishimoto J. Am. Chem. Soc. 2007 129 8034 8040
21. K. Kikugawa I. Kawada M. Ichino Chem. Pharm. Bull. 1975 23 1 35 41
22. T. L. Wang T. T. Hong T. Tang Q. Q. Zhai X. W. Xing W. X. Mao X. L. Zheng L. Xu J. J. Wu X. C. Weng S. R. Wang T. Tian B. F. Yuan B. Huang L. Zhuang X. Zhou J. Am. Chem. Soc. 2013 135 1240 1243