Isomer-specific LC/MS and LC/MS/MS profiling of the mouse serum N-glycome revealing a number of novel sialylated N-glycans

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 9, 2013, Pages 4636-4643

  Hua, Serenus ^a   Jeong, Ha Neul ^a   Dimapasoc, Lauren M ^b   Kang, Inae ^a   Han, Chanyoung ^a   Choi, Jong Soon ^a,c   Lebrilla, Carlito B ^b   An, Hyun Joo ^a  

^a Chungnam National University   (South Korea)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^c Korea Basic Science Institute (KBSI)   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AUTOMATED IDENTIFICATION; BIO-MARKER DISCOVERY; COMPLEX MIXTURE; HUMAN PHYSIOLOGY; N-LINKED GLYCANS; PHARMACEUTICAL DRUGS; POROUS GRAPHITIZED CARBONS; STRUCTURAL CHARACTERISTICS;

ACETYLATION; DRUG PRODUCTS; ISOMERS; MAMMALS;

POLYSACCHARIDES;

POLYSACCHARIDE;

ANIMAL; ARTICLE; BLOOD; FEMALE; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; MOUSE; STEREOISOMERISM; TRANSGENIC MOUSE;

ANIMALS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; FEMALE; MASS SPECTROMETRY; MICE; MICE, TRANSGENIC; POLYSACCHARIDES; STEREOISOMERISM;

EID: 84877358286     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac400195h     Document Type: Article

References (40)

1. Kim, J.; Coffey, D. M.; Creighton, C. J.; Yu, Z.; Hawkins, S. M.; Matzuk, M. M. Proc. Natl. Acad. Sci. 2012, 109, 3921-3926
2. Atkinson, M. A.; Leiter, E. H. Nat. Med. 1999, 5, 601-604
3. Ormrod, D. J.; Holmes, C. C.; Miller, T. E. Atherosclerosis 1998, 138, 329-334
4. Blake, J. A.; Bult, C. J.; Kadin, J. A.; Richardson, J. E.; Eppig, J. T.; Mouse Genome Database Group Nucleic Acids Res. 2011, 39, D842-D848
5. Krüger, M.; Moser, M.; Ussar, S.; Thievessen, I.; Luber, C. A.; Forner, F.; Schmidt, S.; Zanivan, S.; Fässler, R.; Mann, M. Cell 2008, 134, 353-364
6. Patterson, A. D.; Bonzo, J. A.; Li, F.; Krausz, K. W.; Eichler, G. S.; Aslam, S.; Tigno, X.; Weinstein, J. N.; Hansen, B. C.; Idle, J. R.; Gonzalez, F. J. J. Biol. Chem. 2011, 286, 19511-19522
7. Adamczyk, B.; Tharmalingam, T.; Rudd, P. M. Biochim. Biophys. Acta (BBA), Gen. Subj. 2012, 1820, 1347-1353
8. de Leoz, M. L. A.; Young, L. J. T.; An, H. J.; Kronewitter, S. R.; Kim, J.; Miyamoto, S.; Borowsky, A. D.; Chew, H. K.; Lebrilla, C. B. Mol. Cell. Proteomics 2011, 10, DOI: 10.1074/mcp.M110.002717.
9. Itoh, N.; Sakaue, S.; Nakagawa, H.; Kurogochi, M.; Ohira, H.; Deguchi, K.; Nishimura, S.-I.; Nishimura, M. Am. J. Physiol.-Endocrinol. Metab. 2007, 293, E1069-E1077
10. Chaze, T.; Slomianny, M.-C.; Milliat, F.; Tarlet, G.; Lefebvre-Darroman, T.; Gourmelon, P.; Bey, E.; Benderitter, M.; Michalski, J.-C.; Guipaud, O. Mol. Cell. Proteomics 2012, 10.1074/mcp.M111.014639
11. Hua, S.; Lebrilla, C.; An, H. J. Bioanalysis 2011, 3, 2573-2585
12. Wuhrer, M.; Koeleman, C. A. M.; Deelder, A. M.; Hokke, C. H. Anal. Chem. 2003, 76, 833-838
13. Pabst, M.; Bondili, J. S.; Stadlmann, J.; Mach, L.; Altmann, F. Anal. Chem. 2007, 79, 5051-5057
14. Campbell, M. P.; Royle, L.; Radcliffe, C. M.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Bioinformatics 2008, 24, 1214-1216
15. Aldredge, D.; An, H. J.; Tang, N.; Waddell, K.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2012, 11, 1958-1968
16. Wu, S.; Salcedo, J.; Tang, N.; Waddell, K.; Grimm, R.; German, J. B.; Lebrilla, C. B. Anal. Chem. 2012, 84, 7456-7462
17. An, H. J.; Gip, P.; Kim, J.; Wu, S.; Park, K. W.; McVaugh, C. T.; Schaffer, D. V.; Bertozzi, C. R.; Lebrilla, C. B. Mol. Cell. Proteomics 2012, 11, DOI: 10.1074/mcp.M111.010660.
18. Hua, S.; An, H. J. BMB Rep. 2012, 45, 323-330
19. Totten, S. M.; Zivkovic, A. M.; Wu, S.; Ngyuen, U.; Freeman, S. L.; Ruhaak, L. R.; Darboe, M. K.; German, J. B.; Prentice, A. M.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2012, 11, 6124-6133
20. Tao, N.; Wu, S.; Kim, J.; An, H. J.; Hinde, K.; Power, M. L.; Gagneux, P.; German, J. B.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2011, 10, 1548-1557
21. Hua, S.; An, H. J.; Ozcan, S.; Ro, G. S.; Soares, S.; DeVere-White, R.; Lebrilla, C. B. Analyst 2011, 136, 3663-3671
22. Hua, S.; Williams, C. C.; Dimapasoc, L. M.; Ro, G. S.; Ozcan, S.; Miyamoto, S.; Lebrilla, C. B.; An, H. J.; Leiserowitz, G. S. J. Chromatogr., A 2013, http://dx.doi.org/10.1016/j.chroma.2012.12.079
23. Oh, M. J.; Hua, S.; Kim, B. J.; Jeong, H. N.; Jeong, S. H.; Grimm, R.; Yoo, J. S.; An, H. J. Bioanalysis 2013, 5, 545-559
24. Kronewitter, S. R.; An, H. J.; de Leoz, M. L.; Lebrilla, C. B.; Miyamoto, S.; Leiserowitz, G. S. Proteomics 2009, 9, 2986-2994
25. Kronewitter, S. R.; de Leoz, M. L. A.; Peacock, K. S.; McBride, K. R.; An, H. J.; Miyamoto, S.; Leiserowitz, G. S.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2010, 9, 4952-4959
26. Hua, S.; Nwosu, C.; Strum, J.; Seipert, R.; An, H.; Zivkovic, A.; German, J.; Lebrilla, C. Anal. Bioanal. Chem. 2012, 403, 1291-1302
27. Kronewitter, S. R.; De Leoz, M. L. A.; Strum, J. S.; An, H. J.; Dimapasoc, L. M.; Guerrero, A.; Miyamoto, S.; Lebrilla, C. B.; Leiserowitz, G. S. Proteomics 2012, 12, 2523-2538
28. Kawano, T.; Koyama, S.; Takematsu, H.; Kozutsumi, Y.; Kawasaki, H.; Kawashima, S.; Kawasaki, T.; Suzuki, A. J. Biol. Chem. 1995, 270, 16458-16463
29. Lin, S.-Y.; Chen, Y.-Y.; Fan, Y.-Y.; Lin, C.-W.; Chen, S.-T.; Wang, A. H. J.; Khoo, K.-H. J. Proteome Res. 2008, 7, 3293-3303
30. Hsu, N.-Y.; Yang, W.-B.; Wong, C.-H.; Lee, Y.-C.; Lee, R. T.; Wang, Y.-S.; Chen, C.-H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2007, 21, 2137-2146
31. Ando, S.; Yu, R. K.; Scarsdale, J. N.; Kusunoki, S.; Prestegard, J. H. J. Biol. Chem. 1989, 264, 3478-3483
32. Green, E. D.; Adelt, G.; Baenziger, J. U.; Wilson, S.; Van Halbeek, H. J. Biol. Chem. 1988, 263, 18253-18268
33. Klein A, R. P. Biochimie 1998, 80, 49-57
34. Vlasak, R.; Luytjes, W.; Spaan, W.; Palese, P. Proc. Natl. Acad. Sci. 1988, 85, 4526-4529
35. Llop, E.; Gutiérrez-Gallego, R.; Segura, J.; Mallorquí, J.; Pascual, J. A. Anal. Biochem. 2008, 383, 243-254
36. Reuter, G.; Pfeil, R.; Kamerling, J. P.; Vliegenthart, J. F. G.; Schauer, R. Biochim. Biophys. Acta (BBA), Gen. Subj. 1980, 630, 306-310
37. Corfield, A. P.; Wagner, S. A.; Safe, A.; Mountford, R. A.; Clamp, J. R.; Kamerling, J. P.; Vliegenthart, J. F. G.; Schauer, R. Clin. Sci. (Lond) 1993, 84, 573-579
38. Mahapatra, S.; Yagi, T.; Belisle, J. T.; Espinosa, B. J.; Hill, P. J.; McNeil, M. R.; Brennan, P. J.; Crick, D. C. J. Bacteriol. 2005, 187, 2747-2757
39. Harvey, D. J.; Mattu, T. S.; Wormald, M. R.; Royle, L.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Anal. Chem. 2002, 74, 734-740
40. Franz, A.; Lebrilla, C. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002, 13, 325-337