Models of anomalous diffusion in crowded environments

Soft Matter

Volumn 8, Issue 35, 2012, Pages 9043-9052

  Sokolov, Igor M ^a  

^a HUMBOLDT UNIVERSITY   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DIFFUSION; MATHEMATICAL MODELS; PARTIAL DIFFERENTIAL EQUATIONS;

A-PARTICLES; ANOMALOUS DIFFUSION; FRACTIONAL DIFFUSION EQUATION; MACROMOLECULAR STRUCTURES; PHYSICAL ASSUMPTIONS; PHYSICAL MODEL;

MODELS;

EID: 84874872145     PISSN: 1744683X     EISSN: 17446848     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2sm25701g     Document Type: Review

References (98)

1. J. A. Dix A. S. Verkman Annu. Rev. Biophys. 2008 37 247 263
2. J. Klafter I. M. Sokolov Phys. World 2005 18 29 32
3. P. R. Smith I. E. G. Morrison K. M. Wilson N. Fernandez R. J. Cherry Biophys. J. 1999 76 3331 3344
4. A. Caspi R. Granek M. Elbaum Phys. Rev. Lett. 2000 87 5655
5. G. Seisenberger M. U. Ried T. Endress H. Buning M. Hallek C. Brauchle Science 2001 294 1929 1932
6. M. Weiss E. Elsner F. Kartberg T. Nilson Biophys. J. 2004 87 3518
7. I. Golding E. Cox Phys. Rev. Lett. 2006 96 098102
8. M. J. Saxton Biophys. J. 2007 92 1178 1191
9. S. C. Weber A. J. Spakowitz J. A. Theriot Phys. Rev. Lett. 2010 104 238102
10. N. Malchus M. Weiss J. Fluoresc. 2010 20 19 26
11. F. Hofling K. U. Bamberg T. Franosch Soft Matter 2011 7 1358 1363
12. A. Bancaud S. Huet N. Daigle J. Mozziconacci J. Beaudouin J. Ellenberg EMBO J. 2009 28 3785 3798
13. M. J. Saxton K. Jacobsen Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1997 26 373 399
14. A. Fick Ann. Phys. Chem. 1855 170 59 86
15. A. Einstein Ann. Phys. 1905 17 549
16. J. Perrin Ann. de Chimie et de Physique, VIII 1909 18 5 114
17. M. Seddig Phys. Z. 1908 9 465 468
18. R. Maiocci The British Journal for the History of Science 1990 23 257 283
19. Mv. Smoluchowski Ann. Phys. 1906 21 756
20. G. I. Taylor Proc. London Math. Soc. 1922 20 196 212
21. M. S. Green J. Chem. Phys. 1954 22 398 413
22. R. Kubo J. Phys. Soc. Jpn. 1957 12 570
23. P. Langevin C. R. Acad. Sci. (Paris) 1908 146 530
24. W. Ebeling and I. M. Sokolov, Statistical thermodynamics and stochastic theory of nonlinear systems far from equilibrium, World Scientific, Singapore, 2005
25. R. D. Astumian P. Hänggi Phys. Today 2002 55 11 33 39
26. R. Zwanzig, Nonequilibrium statistical mechanics, Oxford University Press, Oxford, 2001
27. J. P. Bouchaud A. Georges Phys. Rep. 1990 195 127 293
28. J. Klafter and I. M. Sokolov, First steps in random walks, Oxford University Press, Oxford, 2011
29. M. J. Saxton Biophys. J. 1996 70 1250 1262
30. S. Burov E. Barkai Phys. Rev. Lett. 2011 106 140602
31. H. Scher M. F. Shlesinger J. T. Bendler Phys. Today 1991 44 1 26 34
32. I. M. Sokolov J. Klafter A. Blumen Phys. Today 2002 55 11 48 54
33. G. H. Weiss S. Havlin Phys. A 1986 134A 474
34. F. Santamaria S. Wils E. De Schutter G. J. Augustine Neuron 2006 52 635 648
35. S. Fedotov V. Mendez Phys. Rev. Lett. 2008 101 218102
36. F. Santamaria S. Wils E. De Schutter G. J. Augustine Eur. J. Neurosci. 2011 34 561 568
37. R. Metzler J. Klafter Phys. Rep. 2000 339 1
38. N. Destainville A. Saulière L. Salomé Biophys. J. 2008 95 3117 3119
39. G. I. Barenblatt, Scaling, self-similarity, and intermediate asymptotics, Cambridge University Press, Cambridge, 1996
40. M. J. Saxton Biophys. J. 2008 95 3120 3122
41. T. Wocjan J. Krieger O. Krichevsky J. Langowski Phys. Chem. Chem. Phys. 2009 11 10671 10681
42. S. Havlin D. Ben-Avraham Adv. Phys. 1987 36 695 798
43. B. P. Olvecky A. S. Verkman Biophys. J. 1998 74 2722 2730
44. M. J. Saxton Biophys. J. 1994 66 394 401
45. M. J. Saxton Biophys. J. 2001 81 2226 2240
46. K. W. Kehr R. Kutner Phys. A 1982 110A 535
47. Y. Meroz I. M. Sokolov J. Klafter Phys. Rev. Lett. 2011 107 260601
48. D. S. Banks C. Fradin Biophys. J. 2005 89 2960 2971
49. G. Guigas C. Kalla M. Weiss Biophys. J. 2008 93 316 323
50. J.-H. Jeon R. Metzler Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2010 81 021103
51. S. C. Kou X. S. Xie Phys. Rev. Lett. 2004 93 180603
52. W. Min G. Luo B. J. Cherayil S. C. Kou X. S. Xie Phys. Rev. Lett. 2005 94 198302
53. H. P. Lu L. Xun X. S. Xie Science 1998 282 1877
54. G. Luo I. Andricioaei X. S. Xie M. Karplus J. Phys. Chem. B 2006 110 9363 9367
55. S. C. Lim S. V. Muniandy Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 2002 66 021114
56. J. W. Dufty J. A. McLennan Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1974 9 1266 1272
57. B. J. Alder T. E. Wainwright J. Phys. Soc. Japan Suppl. 1968 26 267
58. B. J. Alder T. E. Wainwright Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1970 1 18 21
59. M. Ding W. Yang Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 1995 52 207
60. G. R. Kneller J. Chem. Phys. 2011 134 224106
61. B. B. Mandelbrot J. W. van Ness SIAM Rev. 1968 10 422
62. A. N. Kolmogorov Dokl. Akad. Nauk SSSR 1940 26 115
63. M. Doi and S. F. Edwards, The theory of polymer dynamics, Oxford University Press, Oxford, 1998
64. K. Hahn J. Kärger V. Kukla Phys. Rev. Lett. 1996 76 2762
65. K. Hanh J. Kärger J. Phys. A: Math. Gen. 1995 28 3061 3070
66. K. K. Mon J. K. Perkus J. Chem. Phys. 2002 117 2289 2292
67. K. K. Mon J. K. Percus J. Chem. Phys. 2005 122 214503
68. F. Gambale M. Bregante F. Stragapede A. M. Cantu J. Membr. Biol. 1996 154 69 79
69. D. Goulding J.-P. Hansen S. Melchionna Phys. Rev. Lett. 2000 85 1132 1135
70. P. H. Nelson S. M. Auerbach J. Chem. Phys. 1999 110 9235 9243
71. T. Neusius I. Daidone I. M. Sokolov J. C. Smith Phys. Rev. Lett. 2008 100 188103
72. T. Neusius I. Daidone I. M. Sokolov J. C. Smith Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2011 83 021902
73. H. Scher E. W. Montroll Phys. Rev. B: Solid State 1975 12 2455 2477
74. I. M. Sokolov A. Blumen J. Klafter Europhys. Lett. 2001 56 175
75. E. Barkai Y. C. Cheng J. Chem. Phys. 2003 118 6167
76. B. Rinn P. Maass J. P. Bouchaud Phys. Rev. Lett. 2000 84 5403 5406
77. B. Rinn P. Maass J. P. Bouchaud Phys. Rev. B: Condens. Matter 2001 64 104417
78. A. Lubelski I. M. Sokolov J. Klafter Phys. Rev. Lett. 2008 100 250602
79. Y. He S. Burov R. Metzler E. Barkai Phys. Rev. Lett. 2008 101 058101
80. J. Szymanski M. Weiss Phys. Rev. Lett. 2009 103 038102
81. M. Magdziarz A. Weron Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2011 84 051138
82. M. Magdziarz A. Weron B. Krzysztof J. Klafter Phys. Rev. Lett. 2009 103 180602
83. I. Bronstein Y. Israel E. Kepten S. Mai Y. Shav-Tal E. Barkai Y. Garini Phys. Rev. Lett. 2009 103 018102
84. M. Hellmann J. Klafter D. W. Heermann M. Weiss J. Phys.: Condens. Matter 2011 23 234113
85. M. J. Skaug R. Faller M. L. Longo J. Chem. Phys. 2011 134 215101
86. Y. Meroz I. M. Sokolov J. Klafter Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2010 81 010101
87. A. V. Weigel B. Simon M. M. Tamkun D. Krapf Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 6438 6443
88. G. Baumann R. F. Place Z. Foldes-Papp Curr. Pharm. Biotechnol. 2010 11 527 543
89. Z. Foeldes-Papp G. Baumann Curr. Pharm. Biotechnol. 2011 12 824 833
90. C. Monthus J. P. Bouchaud J. Phys. A: Math. Gen. 1996 29 3847 3869
91. I. M. Sokolov S. B. Yuste J. J. Ruiz-Lorenzo K. Lindenberg Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2009 79 051113
92. G. Bel E. Barkai Phys. Rev. Lett. 2005 94 240602
93. S. Burov E. Barkai Phys. Rev. Lett. 2007 98 250601
94. J.-H. Jeon V. Tejedor S. Burov E. Barkai C. Selhuber-Unkel K. Berg-Sørensen L. Oddershede R. Metzler Phys. Rev. Lett. 2011 106 048103
95. T. Neusius I. M. Sokolov J. C. Smith Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2009 80 011109
96. S. Burov J.-H. Jeon R. Metzler E. Barkai Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 1800 1812
97. Y. Yu S. M. Anthony S. C. Bae S. Granick J. Phys. Chem. B 2011 115 2748 2753
98. W. H. Deng E. Barkai Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2009 79 011112