Simulations of guest transport in clathrates of Dianin's compound and hydroquinone

Chemistry - A European Journal

Volumn 19, Issue 8, 2013, Pages 2676-2684

  Nemkevich, Alexandra ^a   Spackman, Mark A ^a   Corry, Ben ^a,b  

^a UNIVERSITY OF WESTERN AUSTRALIA   (Australia)

^b AUSTRALIAN NATIONAL UNIVERSITY   (Australia)

Author keywords

clathrates; guest transport; host guest systems; hydrogen bonds; molecular dynamics

Indexed keywords

CLATHRATES; GAS STORAGE; GUEST MOLECULES; GUEST TRANSPORT; HOST-GUEST SYSTEM; HYDROXYL GROUPS; INTERMEDIATE CONFORMATION; MIXTURE SEPARATION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; MOST LIKELY; NON-STOICHIOMETRIC; TEMPERATURE DEPENDENT;

ACETONITRILE; ETHANOL; HYDROGEN BONDS; METHANOL; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULES; PHENOLS;

COMPLEXATION;

4 P HYDROXYPHENYL 2,2,4 TRIMETHYLCHROMAN; 4-P-HYDROXYPHENYL-2,2,4-TRIMETHYLCHROMAN; CHROMAN DERIVATIVE; HYDROQUINONE; HYDROQUINONE DERIVATIVE;

ARTICLE; CHEMISTRY; CONFORMATION; HYDROGEN BOND; MOLECULAR DYNAMICS; TEMPERATURE;

CHROMANS; HYDROGEN BONDING; HYDROQUINONES; MOLECULAR CONFORMATION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; TEMPERATURE;

EID: 84873684407     PISSN: 09476539     EISSN: 15213765     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/chem.201202035     Document Type: Article

References (58)

1. V. Struzhkin, B. Militzer, W. L. Mao, H. K. Mao, R. J. Hemley, Chem. Rev. 2007, 107, 4133-4151.
2. P. Sozzani, S. Bracco, A. Comotti, L. Ferretti, R. Simonutti, Angew. Chem. 2005, 117, 1850-1854
3. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 1816-1820.
4. J. L. Atwood, L. J. Barbour, A. Jerga, Science 2002, 296, 2367-2369.
5. P. K. Thallapally, B. P. McGrail, J. L. Atwood, C. Gaeta, C. Tedesco, P. Neri, Chem. Mater. 2007, 19, 3355-3357.
6. P. Dornan, S. Alavi, T. K. Woo, J. Chem. Phys. 2007, 127, 124510.
7. H. K. Srivastava, G. N. Sastry, J. Phys. Chem. A 2011, 115, 7633-7637.
8. J. S. Seo, D. Whang, H. Lee, S. I. Jun, J. Oh, Y. J. Jeon, K. Kim, Nature 2000, 404, 982-986.
9. D. Bradshaw, T. J. Prior, E. J. Cussen, J. B. Claridge, M. J. Rosseinsky, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6106-6114.
10. Y. J. Lee, K. W. Han, J. S. Jang, T. I. Jeon, J. Park, T. Kawamura, Y. Yamamoto, T. Sugahara, T. Vogt, J. W. Lee, Y. Lee, J. H. Yoon, ChemPhysChem 2011, 12, 1056-1059.
11. Y. Jin, B. A. Voss, A. Jin, H. Long, R. D. Noble, W. Zhang, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 6650-6658.
12. A. Corma, Chem. Rev. 1997, 97, 2373-2419.
13. J. Y. Lee, O. K. Farha, J. Roberts, K. A. Scheidt, S. T. Nguyen, J. T. Hupp, Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 1450-1459.
14. A. Lan, K. Li, H. Wu, D. H. Olson, T. J. Emge, W. Ki, M. Hong, J. Li, Angew. Chem. 2009, 121, 2370-2374
15. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 2334-2338.
16. M. E. Franke, U. Simon, R. Moos, A. Knezevic, R. Mueller, C. Plog, Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 5195-5198.
17. M. D. Allendorf, R. J. T. Houk, L. Andruszkiewicz, A. A. Talin, J. Pikarsky, A. Choudhury, K. A. Gall, P. J. Hesketh, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 14404-14405.
18. J. L. Atwood, L. J. Barbour, A. Jerga, B. L. Schottel, Science 2002, 298, 1000-1002.
19. P. K. Thallapally, B. P. McGrail, S. J. Dalgarno, H. T. Schaef, J. Tian, J. L. Atwood, Nat. Mater. 2008, 7, 146-150.
20. J. S. Dryden, Trans. Faraday Soc. 1953, 49, 1333-1338.
21. H. Woll, M. C. Rheinstadter, F. Kruchten, K. Kiefer, M. Enderle, A. Klopperpieper, J. Albers, K. Knorr, Phys. Rev. B 2001, 63.
22. W. Baker, A. J. Floyd, J. F. W. McOmie, G. Pope, A. S. Weaving, J. H. Wild, J. Chem. Soc. 1956, 2010-2017.
23. K. D. Hammonds, H. Deng, V. Heine, M. T. Dove, Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 3701-3704.
24. J. Tian, P. K. Thallapally, S. J. Dalgarno, J. L. Atwood, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13216-13217.
25. A. A. Riddle, J. C. Bollinger, D. Lee, Angew. Chem. 2005, 117, 6847-6851
26. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 6689-6693.
27. A. Deak, T. Tunyogi, Z. Karoly, S. Klebert, G. Palinkas, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 13627-13629.
28. L. Dobrzanska, G. O. Lloyd, H. G. Raubenheimer, L. J. Barbour, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 698-699.
29. A. J. Fletcher, E. J. Cussen, T. J. Prior, M. J. Rosseinsky, C. J. Kepert, K. M. Thomas, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 10001-10011.
30. E. J. Cussen, J. B. Claridge, M. J. Rosseinsky, C. J. Kepert, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9574-9581.
31. X. Gu, L. Zhang, X. Gong, W. M. Lau, Z. F. Liu, J. Phys. Chem. B 2008, 112, 14851-14856.
32. J. L. Daschbach, T.-M. Chang, L. R. Corrales, L. X. Dang, P. McGrail, J. Phys. Chem. B 2006, 110, 17291-17295.
33. A. Demurov, R. Radhakrishnan, B. L. Trout, J. Chem. Phys. 2002, 116, 702-709.
34. V. Buch, J. P. Devlin, I. A. Monreal, B. Jagoda-Cwiklik, N. Uras-Aytemiz, L. Cwiklik, Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 10245-10265.
35. S. Alavi, R. Susilo, J. A. Ripmeester, J. Chem. Phys. 2009, 130, 174501.
36. A. Nemkevich, H. B. Buergi, M. A. Spackman, B. Corry, Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 14916-14929.
37. A. Nemkevich, M. A. Spackman, B. Corry, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 18880-18888.
38. A. Nemkevich, B. Corry, M. A. Spackman, Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 1570-1572.
39. H. F. Clausen, personal communication, 2011.
40. J. L. Flippen, J. Karle, I. L. Karle, J. Am. Chem. Soc. 1970, 92, 3749-3755.
41. A. Laio, M. Parrinello, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 12562-12566.
42. J. M. Wang, R. M. Wolf, J. W. Caldwell, P. A. Kollman, D. A. Case, J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157-1174.
43. J. C. Phillips, R. Braun, W. Wang, J. Gumbart, E. Tajkhorshid, E. Villa, C. Chipot, R. D. Skeel, L. Kale, K. Schulten, J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781-1802.
44. M. Bonomi, D. Branduardi, G. Bussi, C. Camilloni, D. Provasi, P. Raiteri, D. Donadio, F. Marinelli, F. Pietrucci, R. A. Broglia, M. Parrinello, Comput. Phys. Commun. 2009, 180, 1961-1972.
45. V. E. Zubkus, I. L. Shamovsky, E. E. Tornau, J. Chem. Phys. 1992, 97, 8617-8627.
46. J. Wang, W. Wang, P. A. Kollman, D. A. Case, J. Mol. Graphics Modell. 2006, 25, 247-260.
47. A. Jakalian, B. L. Bush, D. B. Jack, C. I. Bayly, J. Comput. Chem. 2000, 21, 132-146.
48. A. Jakalian, D. B. Jack, C. I. Bayly, J. Comput. Chem. 2002, 23, 1623-1641.
49. S. Matsui, T. Terao, A. Saika, J. Chem. Phys. 1982, 77, 1788-1799.
50. T. C. W. Mak, J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2 1982, 1435-1437.
51. T. Bernhard, H. Zimmermann, U. Haeberlen, J. Chem. Phys. 1990, 92, 2178-2186.
52. T. Bernhard, H. Zimmermann, U. Haeberlen, Mol. Phys. 1992, 77, 1123-1152.
53. K. J. Harrington, J. Therm. Anal. 1983, 28, 121-130.
54. J. E. D. Davies, J. Inclusion Phenom. 1985, 3, 269-279.
55. A. Goldup, G. W. Smith, Sep. Sci. 1971, 6, 791-817.
56. G. Mirth, J. A. Lercher, M. W. Anderson, J. Klinowski, J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1990, 86, 3039-3044.
57. R. Shah, J. D. Gale, M. C. Payne, J. Phys. Chem. B 1997, 101, 4787-4797.
58. M. J. Turner, J. J. McKinnon, D. Jayatilaka, M. A. Spackman, CrystEngComm 2011, 13, 1804-1813.