Evaluation of electrokinetic parameters for all DNA bases with sputter deposited nanocarbon film electrode

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 24, 2012, Pages 10607-10613

  Kato, Dai ^a   Sumimoto, Michinori ^b   Ueda, Akio ^a,d   Hirono, Shigeru ^a,c   Niwa, Osamu ^a  

^a NATIONAL INSTITUTE OF ADVANCED INDUSTRIAL SCIENCE AND TECHNOLOGY AIST   (Japan)

^b YAMAGUCHI UNIVERSITY   (Japan)

^c MES Afty Corporation   (Japan)

^d MITSUBISHI CHEMICAL CORPORATION   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BOND STRUCTURES; DNA BASIS; DNA MOLECULES; ELECTROCHEMICAL ACTIVITIES; ELECTROCHEMICAL EXPERIMENTS; ELECTROKINETIC; ELECTRON-CYCLOTRON-RESONANCE SPUTTERING; FILM ELECTRODES; K-VALUES; MONONUCLEOTIDES; NANO-CARBON; NANOCRYSTALLINES; OXIDATION POTENTIALS; POTENTIAL WINDOWS; PRE-TREATMENT; PURINE BASIS; PYRIMIDINE BASIS; ROTATING DISC ELECTRODE; SURFACE OXYGEN-CONTAINING GROUPS;

ADSORPTION; AROMATIC COMPOUNDS; DEPOSITS; DIFFUSION; ELECTRODES; ELECTRODYNAMICS; OXIDATION; RATE CONSTANTS;

DNA;

CARBON; CARBON NANOTUBE; DNA;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CHEMISTRY; ELECTRODE; METHODOLOGY; NUCLEOTIDE SEQUENCE;

BASE SEQUENCE; CARBON; DNA; ELECTRODES; MICROSCOPY, ATOMIC FORCE; NANOTUBES, CARBON;

EID: 84871277579     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac301964e     Document Type: Article

References (46)

1. Paleček, E. Nature 1960, 188, 656-657
2. Steenken, S. Chem. Rev. 1989, 89, 503-520
3. Boussicault, F.; Robert, M. Chem. Rev. 2008, 108, 2622-2645
4. Oliveira-Brett, A. M.; Piedade, J. A. P.; Silva, L. A.; Diculescu, V. C. Anal. Biochem. 2004, 332, 321-329
5. Ivandini, T. A.; Honda, K.; Rao, T. N.; Fujishima, A.; Einaga, Y. Talanta 2007, 71, 648-655
6. Zhou, M.; Zhai, Y. M.; Dong, S. J. Anal. Chem. 2009, 81, 5603-5613
7. Hirono, S.; Umemura, S.; Tomita, M.; Kaneko, R. Appl. Phys. Lett. 2002, 80, 425-427
8. Niwa, O.; Jia, J.; Sato, Y.; Kato, D.; Kurita, R.; Maruyama, K.; Suzuki, K.; Hirono, S. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 7144-7145
9. Jia, J. B.; Kato, D.; Kurita, R.; Sato, Y.; Maruyama, K.; Suzuki, K.; Hirono, S.; Ando, T.; Niwa, O. Anal. Chem. 2007, 79, 98-105
10. Kato, D.; Sekioka, N.; Ueda, A.; Kurita, R.; Hirono, S.; Suzuki, K.; Niwa, O. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 3716-3717
11. Kato, D.; Sekioka, N.; Ueda, A.; Kurita, R.; Hirono, S.; Suzuki, K.; Niwa, O. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 6681-6684
12. Goto, K.; Kato, D.; Sekioka, N.; Ueda, A.; Hirono, S.; Niwa, O. Anal. Biochem. 2010, 405, 59-66
13. Kato, D.; Goto, K.; Fujii, S.; Takatsu, A.; Hirono, S.; Niwa, O. Anal. Chem. 2011, 83, 7595-7599
14. Armistead, P. M.; Thorp, H. H. Anal. Chem. 2001, 73, 558-564
15. Johnston, D. H.; Thorp, H. H. J. Phys. Chem. 1996, 100, 13837-13843
16. Abbaspour, A.; Mehrgardi, M. A. Anal. Chem. 2004, 76, 5690-5696
17. Abbaspour, A.; Mehrgardi, M. A.; Kia, R. J. Electroanal. Chem. 2004, 568, 261-266
18. Kelley, S. O.; Barton, J. K.; Jackson, N. M.; Hill, M. G. Bioconjugate Chem. 1997, 8, 31-37
19. Katz, E.; Willner, I. Electroanalysis 2003, 15, 913-947
20. Palecek, E.; Bartosik, M. Chem. Rev. 2012, 112, 3427-3481
21. Sekioka, N.; Kato, D.; Ueda, A.; Kamata, T.; Kurita, R.; Umemura, S.; Hirono, S.; Niwa, O. Carbon 2008, 46, 1918-1926
22. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098-3100
23. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652
24. Perdew, J. P.; Burke, K.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1996, 54, 16533-16539
25. Perdew, J. P.; Chevary, J. A.; Vosko, S. H.; Jackson, K. A.; Pederson, M. R.; Singh, D. J.; Fiolhais, C. Phys. Rev. B 1992, 46, 6671-6687
26. Perdew, J. P.; Chevary, J. A.; Vosko, S. H.; Jackson, K. A.; Pederson, M. R.; Singh, D. J.; Fiolhais, C. Phys. Rev. B 1993, 48, 4978-4978
27. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244-13249
28. Paukku, Y.; Hill, G. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 4804-4810
29. Gerenkamp, M.; Grimme, S. Chem. Phys. Lett. 2004, 392, 229-235
30. Grimme, S. J. Chem. Phys. 2003, 118, 9095-9102
31. Grimme, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 3067-3077
32. Frisch, M. J.; Trucks, G.W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, J. A., Jr.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, N. J.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, Ö.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian 09, Revision A.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2009.
33. Ueda, A.; Kato, D.; Sekioka, N.; Kamata, T.; Kurita, R.; Uetsuka, H.; Hattori, Y.; Hirono, S.; Umemura, S.; Niwa, O. Carbon 2009, 47, 1943-1952
34. Show, Y.; Witek, M. A.; Sonthalia, P.; Swain, G. M. Chem. Mater. 2003, 15, 879-888
35. Blackstock, J. J.; Rostami, A. A.; Nowak, A. M.; McCreery, R. L.; Freeman, M. R.; McDermott, M. T. Anal. Chem. 2004, 76, 2544-2552
36. Ranganathan, S.; McCreery, R. L. Anal. Chem. 2001, 73, 893-900
37. Fernandez, J. L.; Walsh, D. A.; Bard, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 357-365
38. Schmidt, T. J.; Gasteiger, H. A.; Stab, G. D.; Urban, P. M.; Kolb, D. M.; Behm, R. J. J. Electrochem. Soc. 1998, 145, 2354-2358
39. Nassef, H. M.; Radi, A. E.; O'Sullivan, C. K. Electrochem. Commun. 2006, 8, 1719-1725
40. Lima, P. R.; Santos, W. D. R.; de Oliveira, A. B.; Goulart, M. O. F.; Kubota, L. T. Biosens. Bioelectron. 2008, 24, 448-454
41. Oliveira-Brett, A. M.; da Silva, L. A.; Brett, C. M. A. Langmuir 2002, 18, 2326-2330
42. Cysewski, P. THEOCHEM 2005, 714, 29-34
43. Yang, W. S.; Auciello, O.; Butler, J. E.; Cai, W.; Carlisle, J. A.; Gerbi, J.; Gruen, D. M.; Knickerbocker, T.; Lasseter, T. L.; Russell, J. N.; Smith, L. M.; Hamers, R. J. Nat. Mater. 2002, 1, 253-257
44. Teofilo, R. F.; Ceragioli, H. J.; Peterlevitz, A. C.; Da Silva, L. M.; Damos, F. S.; Ferreira, M. M. C.; Baranauskas, V.; Kubota, L. T. J. Solid State Electrochem. 2007, 11, 1449-1457
45. Subramanian, P.; Dryhurst, G. J. Electroanal. Chem. 1987, 224, 137-162
46. Prado, C.; Flechsig, G. U.; Grundler, P.; Foord, J. S.; Marken, F.; Compton, R. G. Analyst 2002, 127, 329-332