Nanowire-mediated delivery enables functional interrogation of primary immune cells: Application to the analysis of chronic lymphocytic leukemia

Nano Letters

Volumn 12, Issue 12, 2012, Pages 6498-6504

  Shalek, Alex K ^a   Gaublomme, Jellert T ^a   Wang, Lili ^c,d   Yosef, Nir ^e   Chevrier, Nicolas ^e   Andersen, Mette S ^b   Robinson, Jacob T ^a   Pochet, Nathalie ^e   Neuberg, Donna ^d   Gertner, Rona S ^a   Amit, Ido ^e   Brown, Jennifer R ^c   Hacohen, Nir ^e   Regev, Aviv ^e,f   Wu, Catherine J ^c,d   Park, Hongkun ^a,b  

^a HARVARD UNIVERSITY   (United States)

^b HARVARD UNIVERSITY   (United States)

^c HARVARD MEDICAL SCHOOL   (United States)

^d DANA FARBER CANCER INSTITUTE   (United States)

^e BROAD INSTITUTE OF MIT AND HARVARD   (United States)

^f MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

Author keywords

chronic lymphocytic leukemia; delivery; immune cells; Nanowires; perturbation

Indexed keywords

CELL VIABILITY; CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIAS; CIRCUIT LEVELS; DELIVERY; FUNCTIONAL CLASSIFICATION; FUNCTIONAL HETEROGENEITY; GENE SILENCING; IMMUNE CELLS; MOLECULAR BASIS; PERTURBATION; PROGNOSTIC INDICATORS; SILICON NANOWIRES; WNT SIGNALING PATHWAYS;

CELLS; CYTOLOGY; DISEASES; GENE EXPRESSION; GENETIC ENGINEERING; NANOTECHNOLOGY; NANOWIRES; PATIENT TREATMENT;

MOLECULAR BIOLOGY;

LYMPHOID ENHANCER FACTOR 1; NANOWIRE; SILICON; SMALL INTERFERING RNA;

ANIMAL; ARTICLE; B LYMPHOCYTE; CELL CULTURE; CHEMISTRY; CHRONIC LYMPHATIC LEUKEMIA; GENETICS; HUMAN; METABOLISM; MOUSE; RNA INTERFERENCE;

ANIMALS; B-LYMPHOCYTES; CELLS, CULTURED; HUMANS; LEUKEMIA, LYMPHOCYTIC, CHRONIC, B-CELL; LYMPHOID ENHANCER-BINDING FACTOR 1; MICE; NANOWIRES; RNA INTERFERENCE; RNA, SMALL INTERFERING; SILICON;

EID: 84870908204     PISSN: 15306984     EISSN: 15306992     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/nl3042917     Document Type: Article

References (41)

1. Judge, A. D.; Sood, V.; Shaw, J. R.; Fang, D.; Mcclintock, K.; Maclachlan, I. Nat. Biotechnol. 2005, 23 (4) 457-462
2. Shayakhmetov, D. M.; Paolo, N. C. D.; Mossman, K. L. Mol. Ther. 2009, 18 (8) 1422-1429
3. Couto, L. B.; High, K. A. Curr. Opin. Pharmacol. 2010, 10 (5) 534-542
4. Guignet, E. G.; Meyer, T. Nat. Methods 2008, 5 (5) 393-395
5. Novina, C. D.; Murray, M. F.; Dykxhoorn, D. M.; Beresford, P. J.; Riess, J.; Lee, S.-K.; Collman, R. G.; Lieberman, J.; Shankar, P.; Sharp, P. A. Nat. Med. 2002, 1-7
6. Dardalhon, V.; Herpers, B.; Noraz, N.; Pflumio, F.; Guetard, D.; Leveau, C.; Dubart-Kupperschmitt, A.; Charneau, P.; Taylor, N. Gene Ther. 2001, 8 (3) 190-198
7. McManus, M.; Haines, B.; Dillon, C.; Whitehurst, C.; van Parijs, L.; Chen, J.; Sharp, P. J. Immunol. 2002, 169 (10) 5754
8. Seiffert, M.; Stilgenbauer, S.; Döhner, H.; Lichter, P. Leukemia 2007, 21 (9) 1977-1983
9. Kim, D. H.; Rossi, J. J. Nat. Rev. Genet. 2007, 8 (3) 173-184
10. Filion, M.; Phillips, N. Biochim. Biophys. Acta 1997, 1329 (2) 345-356
11. Takeuchi, O.; Akira, S. Cell 2010, 140 (6) 805-820
12. Gresch, O.; Engel, F.; Nesic, D.; Tran, T.; England, H.; Hickman, E.; Körner, I.; Gan, L.; Chen, S.; Castro-Obregon, S. Methods 2004, 33 (2) 151-163
13. Bowles, R.; Patil, S.; Pincas, H.; Sealfon, S. C. J. Immunol. Methods 2010, 363 (1) 21-28
14. Shalek, A. K.; Robinson, J. T.; Karp, E. S.; Lee, J. S.; Ahn, D.-R.; Yoon, M.-H.; Sutton, A.; Jorgolli, M.; Gertner, R. S.; Gujral, T. S.; Macbeath, G.; Yang, E. G.; Park, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107 (5) 1870-1875
15. Chevrier, N.; Mertins, P.; Artyomov, M. N.; Shalek, A. K.; Iannacone, M.; Ciaccio, M. F.; Gat-Viks, I.; Tonti, E.; DeGrace, M. M.; Clauser, K. R.; Garber, M.; Eisenhaure, T. M.; Yosef, N.; Robinson, J.; Sutton, A.; Andersen, M. S.; Root, D. E.; von Andrian, U.; Jones, R. B.; Park, H.; Carr, S. A.; Regev, A.; Amit, I.; Hacohen, N. Cell 2011, 147 (4) 853-867
16. Amit, I.; Garber, M.; Chevrier, N.; Leite, A. P.; Donner, Y.; Eisenhaure, T.; Guttman, M.; Grenier, J. K.; Li, W.; Zuk, O.; Schubert, L. A.; Birditt, B.; Shay, T.; Goren, A.; Zhang, X.; Smith, Z.; Deering, R.; McDonald, R. C.; Cabili, M.; Bernstein, B. E.; Rinn, J. L.; Meissner, A.; Root, D. E.; Hacohen, N.; Regev, A. Science 2009, 326 (5950) 257-263
17. Heidel, J. D.; Hu, S.; Liu, X. F.; Triche, T. J.; Davis, M. E. Nat. Biotechnol. 2004, 22 (12) 1579-1582
18. Zenz, T.; Mertens, D.; Küppers, R.; Döhner, H.; Stilgenbauer, S. Nat. Rev. Cancer 2010, 10 (1) 37-50
19. Gandhirajan, R. K.; Staib, P. A.; Minke, K.; Gehrke, I.; Plickert, G.; Schlösser, A.; Schmitt, E. K.; Hallek, M.; Kreuzer, K.-A. Neoplasia 2010, 12 (4) 326-335
20. Wang, L.; Lawrence, M. S.; Wan, Y.; Stojanov, P.; Sougnez, C.; Stevenson, K.; Werner, L.; Sivachenko, A.; DeLuca, D. S.; Zhang, L.; Zhang, W.; Vartanov, A. R.; Fernandes, S. M.; Goldstein, N. R.; Folco, E. G.; Cibulskis, K.; Tesar, B.; Sievers, Q. L.; Shefler, E.; Gabriel, S.; Hacohen, N.; Reed, R.; Meyerson, M.; Golub, T. R.; Lander, E. S.; Neuberg, D.; Brown, J. R.; Getz, G.; Wu, C. J. N. Engl. J. Med. 2011, 365 (26) 2497-2506
21. Pleyer, L.; Egle, A.; Hartmann, T. N.; Greil, R. Nat. Rev. Clin. Oncol. 2009, 6 (7) 405-418
22. Gutierrez, A.; Tschumper, R. C.; Wu, X.; Shanafelt, T. D.; Eckel-Passow, J.; Huddleston, P. M.; Slager, S. L.; Kay, N. E.; Jelinek, D. F. Blood 2010, 116 (16) 2975-2983
23. Lu, D.; Liu, J. X.; Endo, T.; Zhou, H.; Yao, S.; Willert, K.; Schmidt-Wolf, I. G. H.; Kipps, T. J.; Carson, D. A. PLoS ONE 2009, 4 (12) e8294
24. Wu, Q. L.; Zierold, C.; Ranheim, E. A. Blood 2009, 113 (13) 3031-3039
25. Rodríguez, A.; Villuendas, R.; Yáñez, L.; Gómez, M. E.; Díaz, R.; Pollán, M.; Hernández, N.; de la Cueva, P.; Marín, M. C.; Swat, A.; Ruiz, E.; Cuadrado, M. A.; Conde, E.; Lombardía, L.; Cifuentes, F.; Gonzalez, M.; García-Marco, J. A.; Piris, M. A. Leukemia 2007, 21 (9) 1984-1991
26. Dietrich, S.; Kramer, O. H.; Hahn, E.; Schafer, C.; Giese, T.; Hess, M.; Tretter, T.; Rieger, M.; Hullein, J.; Zenz, T.; Ho, A. D.; Dreger, P.; Luft, T. Clin. Cancer Res. 2012, 18 (2) 417-431
27. Angers, S.; Moon, R. T. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009, 10 (7) 468-477
28. Klaus, A.; Birchmeier, W. Nat. Rev. Cancer 2008, 8 (5) 387-398
29. Mosimann, C.; Hausmann, G.; Basler, K. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009, 10 (4) 276-286
30. Klein, U.; Tu, Y.; Stolovitzky, G. A.; Mattioli, M.; Cattoretti, G.; Husson, H.; Freedman, A.; Inghirami, G.; Cro, L.; Baldini, L.; Neri, A.; Califano, A.; Dalla-Favera, R. J. Exp. Med. 2001, 194 (11) 1625-1638
31. Ben-Porath, I.; Thomson, M. W.; Carey, V. J.; Ge, R.; Bell, G. W.; Regev, A.; Weinberg, R. A. Nat. Genet. 2008, 40 (5) 499-507
32. Kim, J.; Woo, A. J.; Chu, J.; Snow, J. W.; Fujiwara, Y.; Kim, C. G.; Cantor, A. B.; Orkin, S. H. Cell 2010, 143 (2) 313-324
33. Novershtern, N.; Regev, A.; Friedman, N. Bioinformatics 2011, 27 (13) i177-i185
34. Marson, A.; Levine, S. S.; Cole, M. F.; Frampton, G. M.; Brambrink, T.; Johnstone, S.; Guenther, M. G.; Johnston, W. K.; Wernig, M.; Newman, J.; Calabrese, J. M.; Dennis, L. M.; Volkert, T. L.; Gupta, S.; Love, J.; Hannett, N.; Sharp, P. A.; Bartel, D. P.; Jaenisch, R.; Young, R. A. Cell 2008, 134 (3) 521-533
35. Yochum, G. S. PLoS ONE 2011, 6 (4) e18966
36. Attisano, L.; Labbe, E. Cancer Metast. Rev. 2004, 23 (1) 53-61
37. Roarty, K.; Baxley, S. E.; Crowley, M. R.; Frost, A. R.; Serra, R. Breast Cancer Res. 2009, 11 (2) R19
38. Labbe, E.; Letamendia, A.; Attisano, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97 (15) 8358
39. Yamada, M.; Ohnishi, J.; Ohkawara, B.; Iemura, S.; Satoh, K.; Hyodo-Miura, J.; Kawachi, K.; Natsume, T.; Shibuya, H. J. Biol. Chem. 2006, 281 (30) 20749-20760
40. Irish, J. M.; Myklebust, J. H.; Alizadeh, A. A.; Houot, R.; Sharman, J. P.; Czerwinski, D. K.; Nolan, G. P.; Levy, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107 (29) 12747-12754
41. Piening, B. D.; Wang, P.; Subramanian, A.; Paulovich, A. G. Radiat. Res. 2009, 171 (2) 141-154