Exposing the flexibility of human parainfluenza virus hemagglutinin- neuraminidase

Journal of the American Chemical Society

Volumn 134, Issue 44, 2012, Pages 18447-18452

  Winger, Moritz ^a   Von Itzstein, Mark ^a  

^a GRIFFITH UNIVERSITY   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIVE SITE; BRONCHIOLITIS; CAUSATIVE AGENTS; DRUG DISCOVERY; DYNAMICAL PROPERTIES; NEURAMINIDASE; OPEN CONFORMATION; SOLUTION DYNAMICS; X RAY CRYSTAL STRUCTURES;

MOLECULAR DYNAMICS;

VIRUSES;

HN PROTEIN;

ARTICLE; CRYSTAL STRUCTURE; MOLECULAR DYNAMICS; NONHUMAN; PARAINFLUENZA VIRUS 3; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN BINDING; PROTEIN STRUCTURE; SIMULATION;

CATALYTIC DOMAIN; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; HN PROTEIN; HUMANS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PARAINFLUENZA VIRUS 3, HUMAN; PROTEIN CONFORMATION; RESPIROVIRUS INFECTIONS;

EID: 84868573592     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja3084658     Document Type: Article

References (34)

1. von Itzstein, M.; Thomson, R. Handb. Explor. Pharmacol. 2009, 189, 111
2. Fendrick, A. M.; Monto, S. A. Arch. Intern. Med. 2003, 163, 487
3. Henrickson, K. J. Clin. Microbiol. Rev. 2003, 16, 242
4. Nichols, W. G.; Peck Campbell, A. J.; Boeckh, M. Clin. Microbiol. Rev. 2008, 21, 274
5. Reed, G.; Jewett, P. H.; Thompson, J.; Tollefson, S.; Wright, P. F. J. Infect. Dis. 1997, 175, 807
6. Heilman, C. A. J. Infect. Dis. 1990, 161, 402
7. Schmidt, A. C.; Schaap-Nutt, A.; Bartlett, E. J.; Schomacker, H.; Boonyaratanakornkit, J.; Karron, R. A.; Collins, P. L. Expert Rev. Respir. Med. 2011, 5, 515
8. DeLaMora, P.; Moscona, A. Pediatr. Transplant. 2007, 11, 121
9. Karron, R. A.; Thumar, B.; Schappell, E.; Surman, S.; Murphy, B. R. P.; Collins, L.; Schmidt, A. C. Vaccine 2012, 30, 3975
10. Lawrence, M. C. J. Mol. Biol. 2004, 335, 1343
11. Crennell, S.; Takimoto, T.; Portner, A.; Taylor, G. Nat. Struct. Biol. 2000, 7 (11) 1068
12. Yuan, P.; Thompson, T. B.; Wurzburg, B. A.; Paterson, R. G.; Lamb, R. A.; Jardetzky, T. S. Structure 2005, 13, 803
13. Langendijk, J. P. M. J. Virol. 1997, 71, 6155
14. Tindal, D. J.; Dyason, J. C.; Thomson, R. J.; Suzuki, T.; Ueyama, H.; Kuwahara, Y.; Maki, N.; Suzuki, Y.; von Itzstein, M. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2007, 17 (6) 1655
15. Suzuki, T.; Ikeda, K.; Koyama, N.; Hosokawa, C.; Kogure, T.; Takahashi, T.; Jwa Hidari, K. I.; Miyamoto, D.; Tanaka, K.; Suzuki, Y. Glycoconjugate J. 2001, 18 (4) 331
16. Holzer, C. T.; von Itzstein, M.; Jin, B.; Pegg, M. S.; Stewart, W. P.; Wu, W. Y. Glycoconjugate J. 1993, 10 (1) 40
17. Greengard, O.; Poltoratskaia, N. L., E.; Zimmerberg, J.; Moscona, A. J. Virol. 2000, 74, 11108
18. von Itzstein, M.; Wu, W. Y.; Kok, G. B.; Pegg, M. S.; Dyason, J. C.; Jin, B.; Van Phan, T.; Smythe, M. L. a. W., H. F.; Oliver, S. W.; Colman, P. M.; Varghese, J. N.; Ryan, D. M.; Woods, J. M.; Bethell, R. C.; Hotham, V. J.; Cameron, J. M.; Penn, C. R. Nature 1993, 363, 418
19. Levin Perlman, S.; Jordan, M.; Brossmer, R.; Greengard, O.; Moscona, A. Virology 1999, 265 (1) 57
20. Porotto, M.; Greengard, O.; Poltoratskaia, N.; Horga, M. A.; Moscona, A. J. Virol. 2001, 75 (16) 7481
21. von Itzstein, M. Nat. Rev. Drug Discovery 2007, 6, 967
22. Alymova, I. V.; Portner, A.; Mishin, V. P.; McCullers, J. A.; Freiden, P.; Taylor, G. L. Glycobiology 2012, 22, 174
23. Amonsen, M.; Smith, D. F.; Cummings, R. D.; Air, G. M. J. Virol. 2007, 81, 8341
24. Amaro, R. E.; Cheng, X.; Ivanov, I.; Xu, D.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4702
25. Amaro, R. E.; Swift, R. V.; Votapka, L.; W., L. W.; Walker, R. C.; Bush, R. M. Nat. Commun. 2011, 2:388, 1
26. van Gunsteren, W. F.; Billeter, S. R.; Eising, A. A.; Hünenberger, P. H.; Krüger, P.; Mark, A. E.; Scott, W. R. P.; Tironi, I. G. Biomolecular Simulation: The GROMOS Manual and User Guide; vdf Hochschulverlag, ETH Zürich: Switzerland, 1996.
27. Scott, W. R. P.; Hünenberger, P. H.; Tironi, I. G.; Mark, A. E.; Billeter, S. R.; Fennen, J.; Torda, A. E.; Huber, T.; Krüger, P.; van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 3596
28. Schmid, N.; Eichenberger, A.; Choutko, A.; Riniker, S.; Winger, M.; Mark, A. E.; van Gunsteren, W. F. Eur. Biophys. J. 2011, 40, 843
29. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. In Intermolecular forces; Pullman, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, 1981; p 331.
30. Ryckaert, J.-P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327
31. Tironi, I. G.; Sperb, R.; Smith, P. E.; van Gunsteren, W. F. J. Chem. Phys. 1995, 102, 5451
32. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Di Nola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684
33. Christen, M.; Hünenberger, P. H.; Bakowies, D.; Baron, R.; Bürgi, R.; Geerke, D. P.; Heinz, T. N.; Kastenholz, M. A.; Kräutler, V.; Oostenbrink, C.; Peter, C.; Trzesniak, D.; van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1719
34. Daura, X.; Jaun, B.; Seebach, D.; van Gunsteren, W. F.; Mark, A. E. J. Mol. Biol. 1998, 280, 925