Energetic competition effects on thermodynamic properties of association between β-CD and Fc group: A potential of mean force approach

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 116, Issue 42, 2012, Pages 22350-22358

  Filippini, Gaëlle ^a   Goujon, Florent ^a   Bonal, Christine ^a   Malfreyt, Patrice ^a  

^a UNIVERSITÉ CLERMONT AUVERGNE   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ASSOCIATION REACTIONS; ENTHALPY; HYDROGEN BONDS; MOLECULAR DYNAMICS; PLASMA INTERACTIONS; VAN DER WAALS FORCES;

ASSOCIATION CONSTANT; COMPLEXATION THERMODYNAMICS; ELECTROSTATIC CONTRIBUTIONS; HETEROGENEOUS CONDITIONS; HETEROGENEOUS SYSTEMS; NUMERICAL EXPERIMENTS; POTENTIAL OF MEAN FORCE; VAN DER WAALS INTERACTIONS;

FREE ENERGY;

EID: 84867846768     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp3057724     Document Type: Article

References (55)

1. Szejtli, J. Comprehensive Supramolecular Chemistry; Atwood, J. L., Davis, J. E. D., Macnicol, D. D., Vögtle, F., Szejtli, J., Osa, T., Eds.; Pergamon: Oxford, UK, 1996; Vol. 5.
2. Szejtli Chem. Rev. 1998, 98, 1743-1753
3. Rojas, M. T.; Königer, R.; Stoddart, J. F.; Kaifer, A. E. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 336-343
4. Ludden, M. J. W.; Reinhould, D. N.; Huskens, J. J. Chem. Soc. Rev. 2006, 35, 1122-1134
5. Liu, J.; Ong, W.; Roman, E.; Lynn, M. J.; Xu, R.; Kaifer, A. E. Langmuir 2000, 16, 3000-3002
6. Thompson, D.; Larsson, J. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 16640-16645
7. Zuo, F.; Luo, C.; Zheng, Z.; Ding, X.; Peng, Y. Electroanalysis 2008, 894-899
8. Gannon, G.; Larsson, J. A.; Thompson, D. J. Phys. Chem C 2009, 113, 7298-7304
9. Frasconi, M.; Mazzei, F. Langmuir 2012, 28, 3322-3331
10. Matsue, T.; Evans, D. H.; Osa, T.; Kobayashi, N. J. Am. Chem. Soc. 1985, 25, 8094-8100
11. He, P.; Ye, J.; Fang, Y.; Suzuki, I.; Osa, T. Anal. Chem. Acta 1997, 337, 217-223
12. Liu, H.; Li, H.; Wing, T.; Sun, K.; Qin, Y.; Qi, D. Anal. Chem. Acta 1998, 358, 137-144
13. Kawajiri, Y.; Motohashi, N. J. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1989, 1336-1337
14. Fornasier, R.; Reniero, F.; Scrimin, P.; Tonellato, U. J. Org. Chem. 1985, 50, 3208-3209
15. Wang, J. T.; Feng, X.; Tang, L. F.; Li, Y. M. Polyhedron 1996, 15, 2997-2999
16. Rowe, G. K.; Creager, S. E. Langmuir 1991, 7, 2307-2312
17. Rekharsky, M. V.; Inoue, Y. Chem. Rev. 1998, 98, 1875-1917
18. Filippini, G.; Goujon, F.; Bonal, C.; Malfreyt, P. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 12897-12907
19. Filippini, G.; Goujon, F.; Bonal, C.; Malfreyt, P. Soft Matter 2011, 7, 8961-8968
20. Filippini, G.; Israeli, Y.; Goujon, F.; Limoges, B.; Bonal, C.; Malfreyt, P. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 11678-11687
21. Filippini, G.; Bonal, C.; Malfreyt, P. Mol. Phys. 2012, 110, 1081-1095
22. Filippini, G.; Bonal, C.; Malfreyt, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 10122-10124
23. Yeh, I.-C.; Berkowitz, M. L. J. Chem. Phys. 1999, 111, 3155-3162
24. A. D. MacKerell, J. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616
25. Kuttel, M.; Brady, J. W.; Naidoo, K. J. J. Comput. Chem. 2002, 23, 1236-1243
26. de Hatten, X.; I. Huc, Z. C.; Smith, J. C.; Metzler-Nolte, N. Chem.-Eur. J. 2007, 13, 8139-8152
27. Rai, B.; Sathish, P.; Malhotra, C. P.; Pradip; Ayappa, K. G. Langmuir 2004, 20, 3138-3144
28. Abascal, J. L. F.; Vega, C. J. Chem. Phys. 2005, 123, 234505-234516
29. Honenberg, P.; Kohn, W. Phys. Rev. A 1964, 136, 864-871
30. Kohn, W.; Sham, L. J. Phys. Rev. A 1965, 140, 1133-1138
31. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652
32. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789
33. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
34. Breneman, C. P.; Wiberg, K. B. J. Comput. Chem. 1990, 11, 361-373
35. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitch, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 98103, 8577-8593
36. Kirkwood, J. G. J. Chem. Phys. 1935, 3, 300-313
37. Straatsma, T. P.; Zacharias, M.; McCammon, J. A. Chem. Phys. Lett. 1992, 196, 297-301
38. Zwanzig, R. W. J. Chem. Phys. 1954, 22, 1420-1426
39. Mezei, M.; Beveridge, D. L. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1986, 482, 1-23
40. Mezei, M.; Swaminathan, S.; Beveridge, D. L. J. Am. Chem. Soc. 1978, 100, 3255-3256
41. Pearlman, D. A. J. Comput. Chem. 1994, 15, 105-123
42. Ghoufi, A.; Bonal, C.; Morel, J.-P.; Morel-Desrosiers, N.; Malfreyt, P. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 11744-11752
43. Ghoufi, A.; Malfreyt, P. Mol. Phys. 2006, 104, 2929-2943
44. Ghoufi, A.; Malfreyt, P. Mol. Phys. 2006, 104, 3787-3799
45. Prue, J. J. Chem. Educ. 1969, 46, 12-16
46. Shoup, D.; Szabo, A. Biophys. J. 1982, 40, 33-39
47. Auletta, T.; de Jong, M. R.; Mulder, A.; van Veggel, F. C. J. M.; Huskens, J.; Reinhoudt, D. N.; Zou, S.; Zapotoczny, S.; Schönherr, H.; Vancso, G. J.; Kuipers, L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1577-1584
48. Yu, Y.; Chipot, C.; Cai, W.; Shao, X. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 6372-6378
49. Ryckaert, J. P.; Cicotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341
50. Osella, D.; Caretta, A.; Nervi, C.; Ravera, M.; Gobetto, R. Organometallics 2000, 19, 2791-2797
51. M. R. de Jong, J. H.; Reinhoudt, D. N. Chem.-Eur. J. 2001, 7, 4164-4169
52. Domi, Y.; Yoshinaga, Y.; Shimatzu, K.; Porter, M. D. Langmuir 2009, 25, 8094-8100
53. Soper, A.; Phillips, M. J. Chem. Phys. 1986, 107, 47-60
54. Luzar, A.; Chandler, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 928-931
55. Chandra, A.; Chowdhuri, S. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6779-6783