Structure and dynamics of proton transfer in liquid imidazole. A molecular dynamics simulation

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 116, Issue 42, 2012, Pages 12793-12800

  Li, Ailin ^a   Cao, Zhen ^a   Li, Yao ^a   Yan, Tianying ^a   Shen, Panwen ^a  

^a NANKAI UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HYDROGEN BONDS; LIQUIDS; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR MECHANICS; PROTON TRANSFER;

CORRELATION FUNCTION; DIFFUSION MODEL; DYNAMICAL ANALYSIS; GEMINATE RECOMBINATION; GROTTHUSS MECHANISM; IMIDAZOLIUM; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; MULTI-STATE; POWER LAW DECAY; SOLVATION SHELL; STRUCTURE AND DYNAMICS; TIME-SCALES; VALENCE BONDS;

PLATINUM COMPOUNDS;

EID: 84867752720     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp302656a     Document Type: Article

References (63)

1. Kreuer, K. D.; Paddison, S. J.; Spohr, E.; Schuster, M. Chem. Rev. 2004, 104, 4637-4678
2. Asensio, J. A.; Sánchez, E. M.; Gómez-Romero, P. Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 3210-3239
3. Kreuer, K. D.; Fuchs, A.; Ise, M.; Spaeth, M.; Maier, J. Electrochim. Acta 1998, 43, 1281-1288
4. Agmon, N. Chem. Phys. Lett. 1995, 244, 456-462
5. Agmon, N.; Goldberg, S. Y.; Huppert, D. J. Mol. Liq. 1995, 64, 161-195
6. Iannuzzi, M. J. Chem. Phys. 2006, 124, 204710
7. Iannuzzi, M.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 025901
8. Munch, W.; Kreuer, K. D.; Silvestri, W.; Maier, J.; Seifert, G. Solid State Ionics 2001, 145, 437-443
9. Chen, H.; Yan, T.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 4507-4517
10. Vilĉiauskas, L.; Tuckerman, M. E.; Bester, G.; Paddison, S. J.; Kreuer, K. D. Nat. Chem. 2012, 4, 461-466
11. Voth, G. A. Acc. Chem. Res. 2006, 39, 143-150
12. Swanson, J. M. J.; Maupin, C. M.; Chen, H.; Petersen, M. K.; Xu, J.; Wu, Y.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 4300-4314
13. Wu, Y.; Chen, H.; Wang, F.; Paesani, F.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 467-482
14. Knight, C.; Voth, G. A. Acc. Chem. Res. 2012, 45, 101-109
15. Schuster, M.; Kreuer, K. D.; Steininger, H.; Maier, J. Solid State Ionics 2008, 179, 523-528
16. Deng, W.-Q.; Molinero, V.; Goddard, W. A., III. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 15644-15645
17. Viswanathan, U.; Basak, D.; Venkataraman, D.; Fermann, J. T.; Auerbach, S. M. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 5423-5434
18. Mangiatordi, G. F.; Hermet, J.; Adamo, C. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 2627-2634
19. Mangiatordi, G. F.; Butera, V.; Russo, N.; Laage, D.; Adamo, C. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 10910-10918
20. Marx, D. ChemPhysChem 2006, 7, 1848-1870
21. Marx, D. Addendum ChemPhysChem 2007, 8, 209-210
22. Agmon, N. Acc. Chem. Res. 2012, 45, 63-73
23. Kornyshev, A. A.; Kuznetsov, A. M.; Spohr, E.; Ulstrup, J. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 3351-3366
24. Marx, D.; Tuckerman, M. E.; Hutter, J.; Parrinello, M. Nature 1999, 397, 601-604
25. Marx, D.; Tuckerman, M. E.; Parrinello, M. J. Phys.: Condens. Matter 2000, 12, A153-A159
26. Markovitch, O.; Chen, H.; Izvekov, S.; Paesani, F.; Voth, G. A.; Agmon, N. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9456-9466
27. Lee, S. H.; Rasaiah, J. C. J. Chem. Phys. 2011, 135, 124505
28. Markovitch, O.; Agmon, N. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 2253-2256
29. Stoyanov, E. S.; Stoyanova, I. V.; Reed, C. A. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1484-1485
30. Stoyanov, E. S.; Stoyanova, I. V.; Reed, C. A. Chem. Sci. 2011, 2, 462-472
31. Tielrooij, K. J.; Timmer, R. L. A.; Bakker, H. J.; Bonn, M. Phys. Rev. Lett. 2009, 102, 198303
32. Lapid, H.; Agmon, N.; Petersen, M. K.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 014506
33. Chen, H.; Voth, G. A.; Agmon, N. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 333-339
34. Day, T. J. F.; Schmitt, U. W.; Voth, G. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12027-12028
35. Chandra, A.; Tuckerman, M. E.; Mark, D. Phys. Rev. Lett. 2007, 99, 145901
36. Berkelbach, T. C.; Lee, H. S.; Tuckerman, M. E. Phys. Rev. Lett. 2009, 103, 238302
37. Tuckerman, M. E.; Chandra, A.; Mark, D. J. Chem. Phys. 2010, 133, 124108
38. Woutersen, S.; Bakker, H. J. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 138305
39. Bonn, M.; Bakker, H. J.; Rago, G.; Pouzy, F.; Siekierzycka, J. R.; Brouwer, A. M.; Bonn, D. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17070-17071
40. Agmon, N. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 13-35
41. Tuckerman, M. E.; Laasonen, K.; Sprik, M.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1995, 103, 150-161
42. Tuckerman, M. E.; Laasonen, K.; Sprik, M.; Parrinello, M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 5749-5752
43. Brewer, M. L.; Schmitt, U. W.; Voth, G. A. Biophys. J. 2001, 80, 1691-1702
44. Dellago, C.; Naor, M. M.; Hummer, G. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 105902
45. Cao, Z.; Peng, Y.; Yan, T.; Li, S.; Li, A.; Voth, G. A. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 11395-11397
46. Cox, M. J.; Timmer, R. L. A.; Bakker, H. J.; Park, S.; Agmon, N. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 6599-6606
47. Asthagiri, D.; Pratt, L. R.; Kress, J. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 6704-6708
48. Shaik, M. S.; Liem, S. Y.; Yuan, Y.; Popelier, P. L. A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 15040-15055
49. Freier, E.; Wolf, S.; Gerwert, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108, 11435-11439
50. Kaila, V. R. I.; Hummer, G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 13207-13215
51. Kofinger, J.; Hummer, G.; Dellago, C. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 15403-15417
52. Tuckerman, M. E.; Mark, D.; Klein, M. L.; Parrinello, M. Science 1997, 275, 817-820
53. Luzar, A.; Chandler, D. Nature 1996, 379, 55-57
54. Luzar, A.; Chandler, D. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 928-931
55. Markovitch, O.; Agmon, N. J. Chem. Phys. 2008, 129, 084505
56. Eigen, M.; de Maeyer, L. Proc. R. Soc. London, Ser. A 1958, 247, 505-533
57. Eigen, M. Angew. Chem., Int. Ed. 1964, 3, 1-19
58. Agmon, N. J. Chem. Phys. 1984, 81, 2811-2817
59. Agmon, N.; Pines, E.; Huppert, D. J. Chem. Phys. 1988, 88, 5631-5638
60. Agmon, N.; Weiss, G. H. J. Chem. Phys. 1989, 91, 6937-6942
61. Gopich, I. V.; Solntsev, K. M.; Agmon, N. J. Chem. Phys. 1999, 110, 2164-2174
62. Agmon, N.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 1990, 92, 5270-5284
63. Krissinel, E. B.; Agmon, N. J. Comput. Chem. 1996, 17, 1085-1098