New insights into the mechanism of electron transfer within flavohemoglobins: Tunnelling pathways, packing density, thermodynamic and kinetic analyses

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 14, Issue 40, 2012, Pages 13872-13880

  Hammi, Emna El ^a   Houée Lévin, Chantal ^a   Řezáč, Jan ^b   Lévy, Bernard ^a   Demachy, Isabelle ^a   Baciou, Laura ^a   De La Lande, Aurélien ^a  

^a UNIVERSITÉ PARIS SUD   (France)

^b INSTITUTE OF ORGANIC CHEMISTRY AND BIOCHEMISTRY   (Czech Republic)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL PROTEIN; FLAVINE ADENINE NUCLEOTIDE; FLAVOHEMOPROTEIN, BACTERIA; HEMOPROTEIN;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CUPRIAVIDUS NECATOR; ELECTRON TRANSPORT; KINETICS; METABOLISM; THERMODYNAMICS;

BACTERIAL PROTEINS; CUPRIAVIDUS NECATOR; ELECTRON TRANSPORT; FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE; HEMEPROTEINS; KINETICS; MODELS, MOLECULAR; THERMODYNAMICS;

EID: 84867017278     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp41261f     Document Type: Article

References (45)

1. R. K. Poole M. N. Hughe Mol. Microbiol. 2000 36 775
2. P. R. Gardner A. M. Gardner L. A. Martin A. L. Salzman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 10378
3. One-electron redox processes in proteins. C. Houée-Levin, in Selectivity, Control, and Fine Tuning in High-Energy Chemistry, ed., D. I. Stass, and, V. I. Feldman, Research Signpost, 2011
4. A. de la Lande N. S. Babcock J. Řezáč B. Lévy B. C. Sanders D. R. Salahub Phys. Chem. Chem. Phys. 2012 14 5902
5. E. El Hammi E. Warkentin U. Demmer F. Limam N. M. Marzouki U. Ermler L. Baciou Biochemistry 2011 50 1255
6. R. A. Marcus N. Sutin Biochim. Biophys. Acta 1985 811 265
7. H. B. Gray J. R. Winkler Q. Rev. Biophys. 2003 36 341
8. U. Ermler R. A. Siddiqui R. Cramm B. Friedrich EMBO J. 1995 14 6067
9. J. Lin I. A. Balabin D. N. Beratan Science 2005 310 1311
10. I. A. Balabin S. S. Skourtis D. N. Beratan Phys. Rev. Lett. 2009 101 158102
11. I. M. C. van Amsterdam M. Ubbink O. Einsle A. Messerschmidt A. Merli D. Cavazzini G. Luigi Rossi G. W. Canters Nat. Struct. Biol. 2002 9 48
12. M. Miyashita M. Y. Okamura J. N. Onuchic Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 3558
13. T. Hayashi A. A. Stuchebrukhov Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 19157
14. A. de la Lande S. Martí O. Parisel V. Moliner J. Am. Chem. Soc. 2007 129 11700
15. A. de la Lande N. S. Babcock J. Řezáč B. C. Sanders D. R. Salahub Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 11799
16. D. N. Beratan J. N. Onuchic J. N. Betts B. E. Bowler H. B. Gray J. Am. Chem. Soc. 1990 112 7915
17. D. N. Beratan S. S. Skourtis I. A. Balabin A. Balaeff S. Keinan R. Venkatramani D. Xiao Acc. Chem. Res. 2009 42 1669
18. I. Balabin X. Hu D. N. Beratan J. Comput. Chem. 2012 33 906
19. T. R. Prytkova I. V. Kurnikov D. N. Beratan Science 2007 315 622
20. E. W. Dijkstra Numer. Math. 1959 1 269
21. C. C. Page C. C. Moser X. Chen P. L. Dutton Nature 1999 402 47
22. C. C. Moser C. C. Page P. L. Dutton Curr. Opin. Chem. Biol. 2003 7 551
23. C. C. Moser C. C. Page P. L. Dutton Philos. Trans. R. Soc., B 2006 361 1295
24. M. L. Jones I. V. Kurnikov D. N. Beratan J. Phys. Chem. A 2002 106 2002
25. T. Sakai Y. Ohgo T. Ikeue M. Takahashi M. Takeda M. Nakamura J. Am. Chem. Soc. 2003 125 13028
26. J. Conradie A. Ghosh Inorg. Chem. 2006 45 4902
27. N. C. Handy A. Cohen J. Mol. Phys. 2001 99 403
28. M. Swart A. W. Ehlers K. Lammertsma Mol. Phys. 2004 102 2467
29. M. M. Conradie J. Conradie A. Ghosh J. Inorg. Biochem. 2011 105 84
30. M. Swart J. Chem. Theory Comput. 2008 4 2057
31. W.-G. Han L. Noodleman Inorg. Chem. 2008 47 2975
32. A. M. Koster, G. Geudtner, P. Calaminici, M. E. Casida, V. D. Dominguez, R. Flores-Moreno, G. U. Gamboa, A. Goursot, T. Heine, A. Ipatov, F. Janetzko, J. Martin del Campo, J. U. Reveles, A. Vela, B. Zuniga-Gutierrez and D. R. Salahub, deMon2k, Version 3, The deMon developers, Cinvestav, Mexico City, 2011
33. A. M. Köster J. U. Reveles J. M. del Campo J. Chem. Phys. 2004 121 3417
34. A. Warshel J. Phys. Chem. 1982 86 2218
35. J. K. Hwang A. Warshel J. Am. Chem. Soc. 1987 109 715
36. I. Muegge P. X. Qi A. J. Wand Z. T. Chu A. Warshel J. Phys. Chem. B 1997 101 825
37. J. Blumberger M. K. Klein J. Am. Chem. Soc. 2006 128 13854
38. J. Blumberger Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 5651
39. V. Tipmanee H. Oberhofer M. Park K. S. Kim J. Blumberger J. Am. Chem. Soc. 2010 132 17032
40. P. Bultinck C. Van Alsenoy P. W. Ayers R. Carbó-Dorca J. Chem. Phys. 2007 126 144111
41. S. Van Damme P. Bultinck S. Fias J. Chem. Theor. Comput. 2009 5 334
42. S. Bhattacharyya M. T. Stankovich D. G. Truhlar J. Gao J. Phys. Chem. A 2007 111 5729
43. F. Cailliez P. Pernot J. Chem. Phys. 2011 134 054124
44. T. R. Prytkova I. V. Kurnikov D. N. Beratan J. Phys. Chem. B 2005 109 1618
45. D. R. Weinberg C. J. Gagliardi J. F. Hull C. F. Murphy C. A. Kent B. C. Westlake A. Paul D. H. Ess D. Granville McCafferty Th. J. Meyer Chem. Rev. 2012 112 4016