Raman microspectroscopy of live cells under autophagy-inducing conditions

Analyst

Volumn 137, Issue 20, 2012, Pages 4662-4668

  Konorov, Stanislav O ^a,b   Jardon, Mario A ^a,b   Piret, James M ^a,b   Blades, Michael W ^b   Turner, Robin F B ^a,b  

^a UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA   (Canada)

^b UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84866488061     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2an35477b     Document Type: Article

References (23)

1. N. Mizushima T. Yoshimori B. Levine Methods in mammalian autophagy research Cell 2010 140 313 326
2. G. Kroemer G. Mariño B. Levine Autophagy and the integrated stress response Mol. Cell 2010 40 280 293
3. N. Kourtis N. Tavernarakis Autophagy and cell death in model organisms Cell Death Differ. 2009 16 21 30
4. J. J. Lum D. E. Bauer M. Kong M. H. Harris C. Li T. Lindsten C. B. Thompson Growth factor regulation of autophagy and cell survival in the absence of apoptosis Cell 2005 120 237 248
5. D. J. Klionsky H. Abeliovich P. Agostinis D. K. Agrawal G. Aliev D. S. Askew M. Baba E. H. Baehrecke B. A. Bahr A. Ballabio B. A. Bamber D. C. Bassham E. Bergamini X. N. Bi M. Biard-Piechaczyk J. S. Blum D. E. Breclesen J. L. Brodsky J. H. Brumell U. T. Brunk W. Bursch N. Camougrand E. Cebollero F. Cecconi Y. Y. Chen L. S. Chin A. Choi C. T. Chu J. K. Chung P. G. H. Clarke R. S. B. Clark S. G. Clarke C. Clave J. L. Cleveland P. Codogno M. I. Colombo A. Coto-Montes J. M. Cregg A. M. Cuervo J. Debnath F. Demarchi P. B. Dennis P. A. Dennis V. Deretic R. J. Devenish F. Di Sano J. F. Dice M. DiFiglia S. Dinesh-Kumar C. W. Distelhorst M. Djavaheri-Mergny F. C. Dorsey W. Droge M. Dron W. A. Dunn M. Duszenko N. T. Eissa Z. Elazar A. Esclatine E. L. Eskelinen L. Fesues K. D. Finley J. M. Fuentes J. Fueyo K. Fujisaki B. Galliot F. B. Gao D. A. Gewirtz S. B. Gibson A. Gohla A. L. Goldberg R. Gonzalez C. Gonzalez-Estevez S. Gorski R. A. Gottlieb D. Haussinger Y. W. He K. Heidenreich J. A. Hill M. Hoyer-Hansen X. Hu W. P. Huang A. Iwasaki M. Jaattela W. T. Jackson X. Jiang S. K. Jin T. Johansen J. U. Jung M. Kadowaki C. Kang A. Kelekar D. H. Kessel J. A. K. W. Kiel H. P. Kim A. Kimchi T. J. Kinsella K. Kiselyov K. Kitamoto E. Knecht M. Komatsu E. Kominami S. Konclo A. L. Kovacs G. Kroemer C. Y. Kuan R. Kumar M. Kundu J. Landry M. Laporte W. D. Le H. Y. Lei M. J. Lenardo B. Levine A. Lieberman K. L. Lim F. C. Lin W. Liou L. F. Liu G. Lopez-Berestein C. Lopez-Otin B. Lu K. F. Macleod W. Malorni W. Martinet K. Matsuoka J. Mautner A. J. Meijer A. Melendez P. Michels G. Miotto W. P. Mistiaen N. Mizushima B. Mograbi I. Monastyrska M. N. Moore P. I. Moreira Y. Moriyasu T. Motyl C. Munz L. O. Murphy N. I. Naqvi T. P. Neufeld I. Nishino R. A. Nixon T. Noda B. Nurnberg M. Ogawa N. L. Oleinick L. J. Olsen B. Ozpolat S. Paglin G. E. Palmer I. Papassideri M. Parkes D. H. Perlmutter G. Perry M. Piacentini R. Pinkas-Kramarski M. Prescott T. Proikas-Cezanne N. Raben A. Rami F. Reggiori B. Rohrer D. C. Rubinsztein K. M. Ryan J. Sadoshima H. Sakagami Y. Sakai M. Sandri C. Sasakawa M. Sass C. Schneider P. O. Seglen O. Seleverstov J. Settleman J. J. Shacka I. M. Shapiro A. Sibirny E. C. M. Silva-Zacarin H. U. Simon C. Simone A. Simonsen M. A. Smith K. Spanel-Borowski V. Srinivas M. Steeves H. Stenmark P. E. Stromhaug C. S. Subauste S. Sugimoto D. Sulzer T. Suzuki M. S. Swanson I. Tabas F. Takeshita N. J. Talbot Z. Talloczy K. Tanaka K. Tanaka I. Tanida G. S. Taylor J. P. Taylor A. Terman G. Tettamanti C. B. Thompson M. Thumm A. M. Tolkovsky S. A. Tooze R. Truant L. V. Tumanovska Y. Uchiyama T. Ueno N. L. Uzcategui I. van der Klei E. C. Vaquero T. Vellai M. W. Vogel H. G. Wang P. Webster J. W. Wiley Z. J. Xi G. Xiao J. Yahalom J. M. Yang G. Yap X. M. Yin T. Yoshimori L. Yu Z. Y. Yue M. Yuzaki O. Zabirnyk X. X. Zheng X. Zhu R. L. Deter Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy in higher eukaryotes Autophagy 2008 4 151 175
6. A. Zoladek F. C. Pascut P. Patel I. Notingher Non-invasive time-course imaging of apoptotic cells by confocal Raman micro-spectroscopy J. Raman Spectrosc. 2011 42 251 258
7. J. Baik G. R. Rosania Molecular imaging of intracellular drug-membrane aggregate formation Mol. Pharmaceutics 2011 8 1742 1749
8. H. G. Schulze S. O. Konorov N. J. Caron J. M. Piret M. W. Blades R. F. B. Turner Assessing differentiation status of human embryonic stem cells noninvasively using Raman microspectroscopy Anal. Chem. 2010 82 5020 5027
9. A. F. Setiadi K. Omilusik M. D. David R. P. Seipp J. Hartikainen R. Gopaul K. B. Choi W. A. Jefferies Epigenetic enhancement of antigen processing and presentation promotes immune recognition of tumors Cancer Res. 2008 68 9601 9607
10. M. A. Jardon B. Sattha K. Braasch A. O. Leung H. C. F. Côté M. Butler S. M. Gorski J. M. Piret Inhibition of glutamine-dependent autophagy increases t-PA production in CHO cell fed-batch processes Biotechnol. Bioeng. 2012 109 1228 1238
11. S. O. Konorov H. G. S. Schulze N. J. Caron J. M. Piret M. W. Blades R. F. B. Turner Raman microspectroscopic evidence that dry-fixing preserves the temporal pattern of non-specific differentiation in live human embryonic stem cells J. Raman Spectrosc. 2011 42 576 579
12. S. O. Konorov H. G. Schulze J. M. Piret R. F. B. Turner M. W. Blades Evidence of marked glycogen variations in the characteristic Raman signatures of human embryonic stem cells J. Raman Spectrosc. 2011 42 1135 1141
13. H. G. Schulze A. Jirasek M. M. L. Yu A. Lim R. F. B. Turner M. W. Blades Investigation of selected baseline removal techniques as candidates for automated implementation Appl. Spectrosc. 2005 59 545 574
14. H. G. Schulze F. B. Foist A. Ivanov R. F. B. Turner Fully automated high-performance signal-to-noise ratio enhancement based on an iterative three-point zero-order Savitzky-Golay filter Appl. Spectrosc. 2008 62 1160 1166
15. Z. Movasaghi S. Rehman I. U. Rehman Raman spectroscopy of biological tissues Appl. Spectrosc. Rev. 2007 42 493 541
16. J. De Gelder K. De Gussem P. Vandenabeele L. Moens Reference database of Raman spectra of biological molecules J. Raman Spectrosc. 2007 38 1133 1147
17. P. Nicklin P. Bergman B. Zhang E. Triantafellow H. Wang B. Nyfeler H. Yang M. Hild C. Kung C. Wilson V. E. Myer J. P. MacKeigan J. A. Porter K. Wang L. C. Cantley P. M. Finan L. O. Murphy Bidirectional transport of amino acids regulates mTOR and autophagy Cell 2009 136 521 534
18. M. C. Maiuri E. Zalckvar A. Kimchi G. Kroemer Self-eating and self-killing: crosstalk between autophagy and apoptosis Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2007 8 741 752
19. H. N. Kung J. R. Marks J. T. Chi Glutamine synthetase is a genetic determinant of cell type-specific glutamine independence in breast epithelia PLoS Genet. 2011 7 e1002229
20. T. Matsuno H. Hirai Glutamine synthetase and glutaminase activities in various hepatoma cells Biochem. Int. 1989 19 219 225
21. V. K. Todorova Y. Kaufmann S. Luo V. S. Klimberg Tamoxifen and raloxifene suppress the proliferation of estrogen receptor-negative cells through inhibition of glutamine uptake Cancer Chemother. Pharmacol. 2011 67 285 291
22. R. J. DeBerardinis T. Cheng Q's next: the diverse functions of glutamine in metabolism, cell biology and cancer Oncogene 2010 29 313 324
23. S. O. Konorov H. G. Schulze J. M. Piret S. A. Aparicio R. F. B. Turner M. W. Blades Raman microscopy-based cytochemical investigations of potential niche-forming inhomogeneities present in human embryonic stem cell colonies Appl. Spectrosc. 2011 65 1009 1016