Anesthetic molecules embedded in a lipid membrane: A computer simulation study

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 14, Issue 37, 2012, Pages 12956-12969

  Darvas, Mária ^a,b   Hoang, Paul N M ^a   Picaud, Sylvain ^a   Sega, Marcello ^c,d   Jedlovszky, Pál ^a,e,f  

^a UNIVERSITÉ DE FRANCHE COMTÉ   (France)

^b EÖTVÖS LORÁND UNIVERSITY   (Hungary)

^c UNIVERSITY OF STUTTGART   (Germany)

^d UNIVERSITY OF ROME TOR VERGATA   (Italy)

^e INSTITUTE OF EXPERIMENTAL MEDICINE   (Hungary)

^f EKF Department of Chemistry   (Hungary)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANESTHETIC AGENT; DIPALMITOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; HALOTHANE;

ARTICLE; CHEMISTRY; HYDROGEN BOND; LIPID BILAYER; MOLECULAR DYNAMICS; PRESSURE;

1,2-DIPALMITOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; ANESTHETICS; HALOTHANE; HYDROGEN BONDING; LIPID BILAYERS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PRESSURE;

EID: 84865773880     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp41581j     Document Type: Article

References (98)

1. L. J. Mullins Chem. Rev. 1954 54 289
2. S. M. Johnson K. W. Miller Nature 1970 228 75
3. M. K. Jain N. Y. Wu L. V. Wray Nature 1975 255 494
4. K. W. Miller K. Pang Nature 1976 263 253
5. J. M. Boggs T. Yoong J. C. Hsia Mol. Pharmacol. 1976 12 127
6. D. A. Haydon B. M. Hendry S. R. Levinson J. Requena Nature 1977 268 356
7. R. G. Ashcroft H. G. L. Coster J. R. Smith Nature 1977 269 819
8. C. Y. Kao Pharmacol. Rev. 1966 18 987
9. A. G. Lee Nature 1976 262 545
10. N. P. Franks W. R. Lieb Nature 1978 274 339
11. N. P. Franks W. R. Lieb Nature 1994 367 607
12. D. C. Mitchell J. T. R. Lawrence B. J. Litman J. Biol. Chem. 1996 32 19033
13. F. H. Johnson E. A. Flagler Science 1950 112 91
14. M. J. Lever K. W. Miller W. D. M. Paton E. B. Smith Nature 1971 231 368
15. M. J. Halsey B. Wardley-Smith Nature 1975 257 811
16. J. R. Trudell D. G. Payan J. H. Chin E. N. Cohen Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1975 72 210
17. D. J. Bell H. G. L. Coster J. R. Smith J. Phys. E: Sci. Instrum. 1975 8 66
18. R. G. Ashcroft H. G. L. Coster J. R. Smith Biochim. Biophys. Acta 1977 469 13
19. N. P. Franks W. R. Lieb J. Mol. Biol. 1979 133 469
20. G. L. Turner E. Oldfield Nature 1979 277 669
21. J. R. Trudell W. L. Hubbell E. N. Cohen Biochim. Biophys. Acta 1973 291 321
22. B. J. Forrest D. K. Rodham Biochim. Biophys. Acta 1985 814 281
23. R. M. Venable Y. Zhang B. J. Hardy R. W. Pastor Science 1993 262 223
24. H. Heller M. Schaefer K. Schulten J. Phys. Chem. 1993 97 8343
25. S. J. Marrink H. J. C. Berendsen J. Phys. Chem. 1994 98 4155
26. K. Tu D. J. Tobias M. L. Klein Biophys. J. 1995 69 2558
27. S. E. Feller Y. Zhang R. W. Pastor J. Chem. Phys. 1995 103 10267
28. D. P. Tieleman H. J. C. Berendsen J. Chem. Phys. 1996 105 4871
29. M. Pasenkiewitz-Gierula Y. Takaoka H. Miyagawa K. Kitamura A. Kusumi J. Phys. Chem. A 1997 101 3677
30. M. T. Hyvönnen T. T. Rantala M. Ala-Korpela Biophys. J. 1997 73 2907
31. T. J. Husslein D. M. News P. C. Pattnaik Q. Zhong P. B. Moore M. L. Klein J. Chem. Phys. 1998 109 2826
32. S. W. Chiu M. M. Clark E. Jakobsson S. Subramaniam H. L. Scott J. Comput. Chem. 1999 20 1153
33. P. Jedlovszky M. Mezei J. Chem. Phys. 1999 111 10770
34. I. Z. Zubrzycki Y. Xu M. Madrid P. Tang J. Chem. Phys. 2000 112 3437
35. P. Jedlovszky M. Mezei J. Am. Chem. Soc. 2000 122 5125
36. P. Jedlovszky M. Mezei J. Phys. Chem. B 2001 105 3614
37. L. Saiz M. L. Klein J. Chem. Phys. 2002 116 3052
38. K. Åman E. Lindahl O. Edholm P. Håkansson P. O. Westlund Biophys. J. 2003 84 102
39. C. Anézo A. H. de Vries H. D. Höltje D. P. Tieleman S. J. Marrink J. Phys. Chem. B 2003 107 9424
40. W. Shinoda M. Mikami T. Baba M. Hato J. Phys. Chem. B 2003 107 14030
41. M. G. Alinchenko A. V. Anikeenko N. N. Medvedev V. P. Voloshin M. Mezei P. Jedlovszky J. Phys. Chem. B 2004 108 19056
42. A. L. Rabinovich N. K. Balabaev M. G. Alinchenko V. P. Voloshin N. N. Medvedev P. Jedlovszky J. Chem. Phys. 2005 122 084906
43. P. Jedlovszky L. Pártay M. Mezei J. Mol. Liq. 2007 131-132 225
44. B. W. Lee R. Faller A. K. Sum I. Vattulainen M. Patra M. Karttunen Fluid Phase Equilib. 2005 228-229 135
45. M. Patra E. Salonen E. Terama I. Vattulainen R. Faller B. W. Lee J. Holopainen M. Karttunen Biophys. J. 2006 90 1121
46. A. M. Smondyrev M. L. Berkowitz Biophys. J. 1999 77 2075
47. M. Pasenkiewicz-Gierula T. Róg K. Kitamura A. Kusumi Biophys. J. 2000 78 1376
48. S. W. Chiu E. Jakobsson H. L. Scott J. Chem. Phys. 2001 114 5435
49. C. Hofsäβ E. Lindahl O. Edholm Biophys. J. 2003 84 2192
50. P. Jedlovszky M. Mezei J. Phys. Chem. B 2003 107 5311
51. P. Jedlovszky M. Mezei J. Phys. Chem. B 2003 107 5322
52. M. G. Alinchenko V. V. Voloshin N. N Medvedev M. Mezei L. Pártay P. Jedlovszky J. Phys. Chem. B 2005 109 16490
53. E. Falck M. Patra M. Karttunen M. T. Hyvönen I. Vattulainen Biophys. J. 2004 87 1076
54. S. A. Pandit S. Vasudevan S. W. Chiu R. J. Mashl E. Jakobsson H. L. Scott Biophys. J. 2004 87 1092
55. T. H. Duong E. L Mehler H. Weinstein J. Comput. Phys. 1991 151 358
56. S. Bandyopadhyay M. Tarek M. L. Klein J. Phys. Chem. B 1999 103 10075
57. J. A. Söderhäll A. Laaksonen J. Phys. Chem. B 2001 105 9308
58. C. J. Högberg A. Maliniak A. P. Lyubartsev Biophys. Chem. 2007 125 416
59. C. J. Högberg A. P. Lyubartsev Biophys. J. 2008 94 525
60. V. Castro B. Stevensson S. V. Dvinskikh C. J. Högberg A. P. Lyubartsev H. Zimmermann D. Sandström A. Maliniak Biochim. Biophys. Acta 2008 1778 2604
61. E. H. Mojumdar A. P. Lyubartsev Biophys. Chem. 2010 153 27
62. P. Huang E. Bertaccini G. H. Loew J. Biomol. Struct. Dyn. 1995 12 725
63. J. J. López Cascales J. G. Hernández Cifre J. García de la Torre J. Phys. Chem. B 1998 102 625
64. K. Tu M. Tarek M. L. Klein D. Scharf Biophys. J. 1998 75 2123
65. L. Koubi M. Tarek M. L. Klein D. Scharf Biophys. J. 2000 78 800
66. M. Pickholz L. Saiz M. L. Klein Biophys. J. 2005 88 1524
67. P. L. Chau P. N. M. Hoang S. Picaud P. Jedlovszky Chem. Phys. Lett. 2007 438 294
68. P. L. Chau P. N. M. Hoang S. Picaud P. Jedlovszky J. Mol. Liq. 2009 147 128
69. R. D. Porasso W. F. Drew Bennett S. D. Oliveira-Costa J. J. López Cascales J. Phys. Chem. B 2009 113 9988
70. K. J. Oh M. L. Klein Bull. Korean Chem. Soc. 2009 30 2087
71. A. P. Lyubartsev A. L. Rabinovich Soft Matter 2011 7 25
72. Z. Liu Y. Xu P. Tang Biophys. J. 2005 88 3784
73. S. Vemparala L. Saiz R. G. Eckenhoff M. L. Klein Biophys. J. 2006 91 2815
74. S. Vemparala C. Domene M. L. Klein Biophys. J. 2008 94 4260
75. H. Zou J. Liu K. Blasie Biophys. J. 2009 96 4188
76. S. Vemparala C. Domene M. L. Klein Acc. Chem. Res. 2010 43 103
77. J. F. Nagle S. Tristram-Nagle Biochim. Biophys. Acta 2000 1469 591
78. E. Lindahl B. Hess D. van der Spoel J. Mol. Model. 2001 7 306
79. O. Berger O. Edholm F. Jähnig Biophys. J. 1997 72 2002
80. W. F. van Gunsteren, S. R. Billeter, A. A. Eising, P. H. Hünenberger, P. Krüger, A. E. Mark, W. R. P. Scott and I. G. Tironi, Biomolecular Simulation: The GROMOS96 Manual and User Guide; vdf Hochschulverlag A.G. an der ETH Zürich and BIOMOS b.v.: Zürich, Groningen, 1996
81. L. D. Schuler X. Daura W. F. van Gunsteren J. Comput. Chem. 2001 22 1205
82. A. W. Schuettelkopf D. M. F. van Aalten Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2004 60 1355
83. C. Oostenbrink A. Villa A. E. Mark W. F. van Gunsteren J. Comput. Chem. 2004 25 1656
84. D. Scharf K. Laasonen Chem. Phys. Lett. 1996 258 276
85. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. van Gunsteren and J. Hermans, in Intermolecular Forces, ed., B. Pullman, Reidel, Dordrecht, 1981, p. 331
86. S. Miyamoto P. A. Kollman J. Comput. Chem. 1992 13 952
87. B. Hess H. Bekker H. J. C. Berendsen J. G. E. M. Fraaije J. Comput. Chem. 1997 18 1463
88. U. Essman L. Perera M. L. Berkowitz T. Darden H. Lee L. G. Pedersen J. Chem. Phys. 1995 103 8577
89. S. Nosé Mol. Phys. 1984 52 255
90. W. G. Hoover Phys. Rev. A 1985 31 1695
91. M. Parinello A. Rahman J. Appl. Phys. 1981 52 7182
92. S. J. Marrink R. M. Sok H. J. C. Berendsen J. Chem. Phys. 1996 104 9090
93. P. Jedlovszky L. Turi J. Phys. Chem. B 1997 101 5429
94. J. Phys. Chem. B, 1999, 103, 3510
95. J. F. Nagle Biophys. J. 1993 64 1476
96. J. J. López-Cascales J. García de la Torre S. J. Marrink H. J. C. Berendsen J. Chem. Phys. 1996 104 2713
97. M. Mezei and P. Jedlovszky, in Methods in Molecular Biology, vol. 400: Methods in Membrane Lipids, ed., A. M. Dopico, Humana Press, Totowa, NJ, 2007, pp. 127-144
98. J. P. Douliez A. Léonard E. J. Dufourc Biophys. J. 1995 68 1727