X-ray reduction correlates with soaking accessibility as judged from four non-crystallographically related diiron sites

Metallomics

Volumn 4, Issue 9, 2012, Pages 894-898

  Griese, Julia J ^a   Högbom, Martin ^a  

^a STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COFACTORS; CORYNEBACTERIUM; DIFFUSION COMPONENTS; METAL SITES; METALLOPROTEIN; REDOX STATE; REDOX-ACTIVE METALS; REDUCTION PROCESS; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE; STRUCTURAL DAMAGES; X-RAY DOSE;

CRYSTAL ATOMIC STRUCTURE; METALS; PROTEINS; REDOX REACTIONS; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

X RAYS;

IRON; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE;

ARTICLE; CORRELATION ANALYSIS; CORYNEBACTERIUM; CORYNEBACTERIUM AMMONIAGENES; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; RADIATION DOSE; REDUCTION; X RAY; X RAY CRYSTALLOGRAPHY; X RAY REDUCTION;

COMPUTER SIMULATION; CORYNEBACTERIUM; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; IRON COMPOUNDS; MODELS, MOLECULAR; OXIDATION-REDUCTION; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASES;

CORYNEBACTERIUM AMMONIAGENES;

EID: 84865509582     PISSN: 17565901     EISSN: 1756591X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2mt20080e     Document Type: Article

References (38)

1. E. F. Garman Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2010 66 339 351
2. J. M. Holton J. Synchrotron Radiat. 2009 16 133 142
3. Y. Lindqvist W. Huang G. Schneider J. Shanklin EMBO J. 1996 15 4081 4092
4. D. T. Logan X. D. Su A. Aberg K. Regnstrom J. Hajdu H. Eklund P. Nordlund Structure 1996 4 1053 1064
5. M. Eriksson A. Jordan H. Eklund Biochemistry 1998 37 13359 13369
6. I. Schlichting J. Berendzen K. Chu A. M. Stock S. A. Maves D. E. Benson R. M. Sweet D. Ringe G. A. Petsko S. G. Sligar Science 2000 287 1615 1622
7. G. I. Berglund G. H. Carlsson A. T. Smith H. Szoke A. Henriksen J. Hajdu Nature 2002 417 463 468
8. M. Hogbom Y. Huque B. M. Sjoberg P. Nordlund Biochemistry 2002 41 1381 1389
9. V. Adam A. Royant V. Niviere F. P. Molina-Heredia D. Bourgeois Structure 2004 12 1729 1740
10. J. Wuerges J. W. Lee Y. I. Yim H. S. Yim S. O. Kang K. Djinovic Carugo Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 8569 8574
11. T. Beitlich K. Kuhnel C. Schulze-Briese R. L. Shoeman I. Schlichting J. Synchrotron Radiat. 2007 14 11 23
12. K. Kuhnel E. Derat J. Terner S. Shaik I. Schlichting Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 99 104
13. M. A. Hough S. V. Antonyuk R. W. Strange R. R. Eady S. S. Hasnain J. Mol. Biol. 2008 378 353 361
14. J. Yano J. Kern K. D. Irrgang M. J. Latimer U. Bergmann P. Glatzel Y. Pushkar J. Biesiadka B. Loll K. Sauer J. Messinger A. Zouni V. K. Yachandra Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 12047 12052
15. J. A. Cotruvo, Jr. J. Stubbe Biochemistry 2010 49 1297 1309
16. N. Cox H. Ogata P. Stolle E. Reijerse G. Auling W. Lubitz J. Am. Chem. Soc. 2010 132 11197 11213
17. A. K. Boal J. A. Cotruvo, Jr. J. Stubbe A. C. Rosenzweig Science 2010 329 1526 1530
18. Y. Huque F. Fieschi E. Torrents I. Gibert R. Eliasson P. Reichard M. Sahlin B. M. Sjoberg J. Biol. Chem. 2000 275 25365 25371
19. A. T. Brunger P. D. Adams G. M. Clore W. L. DeLano P. Gros R. W. Grosse-Kunstleve J. S. Jiang J. Kuszewski M. Nilges N. S. Pannu R. J. Read L. M. Rice T. Simonson G. L. Warren Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 1998 54 905 921
20. P. Nordlund B. M. Sjoberg H. Eklund Nature 1990 345 593 598
21. P. Nordlund H. Eklund J. Mol. Biol. 1993 232 123 164
22. M. Hogbom M. Galander M. Andersson M. Kolberg W. Hofbauer G. Lassmann P. Nordlund F. Lendzian Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 3209 3214
23. G. D. Jones J. S. Lea M. C. Symons F. A. Taiwo Nature 1987 330 772 773
24. R. J. Southworth-Davies E. F. Garman J. Synchrotron Radiat. 2007 14 73 83
25. R. B. Ravelli S. M. McSweeney Structure 2000 8 315 328
26. M. Weik R. B. Ravelli G. Kryger S. McSweeney M. L. Raves M. Harel P. Gros I. Silman J. Kroon J. L. Sussman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 623 628
27. M. Weik J. Berges M. L. Raves P. Gros S. McSweeney I. Silman J. L. Sussman C. Houee-Levin R. B. Ravelli J. Synchrotron Radiat. 2002 9 342 346
28. W. P. Burmeister Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2000 56 328 341
29. E. Fioravanti F. M. Vellieux P. Amara D. Madern M. Weik J. Synchrotron Radiat. 2007 14 84 91
30. J. M. Holton J. Synchrotron Radiat. 2007 14 51 72
31. B. B. Nielsen B. Kauppi M. Thelander L. Thelander I. K. Larsen H. Eklund FEBS Lett. 1995 373 310 312
32. B. Kauppi B. B. Nielsen S. Ramaswamy I. K. Larsen M. Thelander L. Thelander H. Eklund J. Mol. Biol. 1996 262 706 720
33. M. Hogbom P. Stenmark N. Voevodskaya G. McClarty A. Graslund P. Nordlund Science 2004 305 245 248
34. K. R. Strand S. Karlsen M. Kolberg A. K. Rohr C. H. Gorbitz K. K. Andersson J. Biol. Chem. 2004 279 46794 46801
35. C. S. Andersson M. Hogbom Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 5633 5638
36. M. P. Hendrich T. E. Elgren L. Que, Jr. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1991 176 705 710
37. R. Davydov S. Kuprin A. Graslund A. Ehrenberg J. Am. Chem. Soc. 1994 116 11120 11128
38. R. A. Laskowski M. W. Macarthur D. S. Moss J. M. Thornton J. Appl. Crystallogr. 1993 26 283 291