Erratum: Correction to multicolor super-resolution DNA imaging for genetic analysis (Nano Letters 12:7 (3861-3866) DOI:10.1021/nl302069q);Multicolor super-resolution DNA imaging for genetic analysis

Nano Letters

Volumn 12, Issue 7, 2012, Pages 3861-3866

  Baday, Murat ^a   Cravens, Aaron ^b   Hastie, Alex ^d   Kim, Hyeongjun ^b   Kudeki, Deren E ^c   Kwok, Pui Yan ^e   Xiao, Ming ^d,f   Selvin, Paul R ^a,b,c  

^a UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

^b United States of America   (United States)

^c UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

^d USA   (United States)

^e UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^f DREXEL UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

copy number variations; genomic variations; optical DNA mapping; SHREC, DNA; SHRImP; Super resolution

Indexed keywords

DIAGNOSIS; DIFFRACTION; ENZYMES; GENES; MAPPING; NEURODEGENERATIVE DISEASES; OPTICAL RESOLVING POWER;

COPY NUMBER VARIATIONS; GENOMIC VARIATIONS; OPTICAL DNA MAPPINGS; SHREC , DNAS; SHRIMP; SUPER RESOLUTION;

DNA;

DNA; ENDONUCLEASE;

ARTICLE; BACTERIOPHAGE LAMBDA; CHROMOSOME MAP; GENETIC VARIABILITY; GENETICS; HUMAN; METABOLISM;

BACTERIOPHAGE LAMBDA; CHROMOSOME MAPPING; DNA; ENDONUCLEASES; GENETIC VARIATION; HUMANS;

EID: 84863847010     PISSN: 15306984     EISSN: 15306992     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/nl4004249     Document Type: Erratum

References (33)

1. Gonzalez, E.; Kulkarni, H.; Bolivar, H.; Mangano, A.; Sanchez, R.; Catano, G.; Nibbs, R. J.; Freedman, B. I.; Quinones, M. P.; Bamshad, M. J.; Murthy, K. K.; Rovin, B. H.; Bradley, W.; Clark, R. A.; Anderson, S. A.; Oconnell, R. J.; Agan, B. K.; Ahuja, S. S.; Bologna, R.; Sen, L.; Dolan, M. J.; Ahuja, S. K. Science 2005, 307, 1434-1440
2. Hollox, E. J.; Huffmeier, U.; Zeeuwen, P. L. J. M.; Palla, R.; Lascorz, J.; Rodijk-Olthuis, D.; van de Kerkhof, P. C. M.; Traupe, H.; de Jongh, G.; den Heijer, M.; Reis, A.; Armour, J. A. L.; Schalkwijk, J. Nat. Genet. 2008, 40, 23-25
3. Sebat, J.; Lakshmi, B.; Troge, J.; Alexander, J.; Young, J.; Lundin, P.; Månér, S.; Massa, H.; Walker, M.; Chi, M.; Navin, N.; Lucito, R.; Healy, J.; Hicks, J.; Ye, K.; Reiner, A.; Gilliam, T. C.; Trask, B.; Patterson, N.; Zetterberg, A.; Wigler, M. Science 2004, 305, 525-528
4. Wong, K. K.; deLeeuw, R. J.; Dosanjh, N. S.; Kimm, L. R.; Cheng, Z.; Horsman, D. E.; MacAulay, C.; Ng, R. T.; Brown, C. J.; Eichler, E. E.; Lam, W. L. Am. J. Hum. Genet. 2007, 80, 91-104
5. Conrad, D. F.; Andrews, T. D.; Carter, N. P.; Hurles, M. E.; Pritchard, J. K. Nat. Genet. 2005, 38, 75-81
6. Locke, D. P.; Sharp, A. J.; McCarroll, S. A.; McGrath, S. D.; Newman, T. L.; Cheng, Z.; Schwartz, S.; Albertson, D. G.; Pinkel, D.; Altshuler, D. M.; Eichler, E. E. Am. J. Hum. Genet. 2006, 79, 275-290
7. Jing, J.; Reed, J.; Huang, J.; Hu, X.; Clarke, V.; Edington, J.; Housman, D.; Anantharaman, T. S.; Huff, E. J.; Mishra, B.; Porter, B.; Shenker, A.; Wolfson, E.; Hiort, C.; Kantor, R.; Aston, C.; Schwartz, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 8046-8051
8. Xiao, M.; Gordon, M. P.; Phong, A.; Ha, C.; Chan, T.-F.; Cai, D.; Selvin, P. R.; Kwok, P.-Y. Hum. Mutat. 2007, 28, 913-921
9. Xiao, M.; Phong, A.; Ha, C.; Chan, T.-F.; Cai, D.; Leung, L.; Wan, E.; Kistler, A. L.; DeRisi, J. L.; Selvin, P. R.; Kwok, P.-Y. Nucleic Acids Res. 2007, 35, e16-e16
10. Morgan, R. D.; Calvet, C.; Demeter, M.; Agra, R.; Kong, H. Biol. Chem. 2000, 381, 1123-1125
11. Das, S. K.; Austin, M. D.; Akana, M. C.; Deshpande, P.; Cao, H.; Xiao, M. Nucleic Acids Res. 2010, 38, e177
12. Goshtasby, A. Image Vision Comput. 1988, 6, 255-261
13. Goshtasby, A. Pattern Recognit. 1986, 19, 459-466
14. Ley, T. J.; Mardis, E. R.; Ding, L.; Fulton, B.; McLellan, M. D.; Chen, K.; Dooling, D.; Dunford-Shore, B. H.; McGrath, S.; Hickenbotham, M.; Cook, L.; Abbott, R.; Larson, D. E.; Koboldt, D. C.; Pohl, C.; Smith, S.; Hawkins, A.; Abbott, S.; Locke, D.; Hillier, L. W.; Miner, T.; Fulton, L.; Magrini, V.; Wylie, T.; Glasscock, J.; Conyers, J.; Sander, N.; Shi, X.; Osborne, J. R.; Minx, P.; Gordon, D.; Chinwalla, A.; Zhao, Y.; Ries, R. E.; Payton, J. E.; Westervelt, P.; Tomasson, M. H.; Watson, M.; Baty, J.; Ivanovich, J.; Heath, S.; Shannon, W. D.; Nagarajan, R.; Walter, M. J.; Link, D. C.; Graubert, T. A.; DiPersio, J. F.; Wilson, R. K. Nature 2008, 456, 66-72
15. Zhou, S.; Wei, F.; Nguyen, J.; Bechner, M.; Potamousis, K.; Goldstein, S.; Pape, L.; Mehan, M. R.; Churas, C.; Pasternak, S.; Forrest, D. K.; Wise, R.; Ware, D.; Wing, R. A.; Waterman, M. S.; Livny, M.; Schwartz, D. C. PLoS Genet. 2009, 5, e1000711
16. Zhou, S.; Bechner, M. C.; Place, M.; Churas, C. P.; Pape, L.; Leong, S. A.; Runnheim, R.; Forrest, D. K.; Goldstein, S.; Livny, M.; Schwartz, D. C. BMC Genomics 2007, 8, 278
17. Church, D. M.; Goodstadt, L.; Hillier, L. W.; Zody, M. C.; Goldstein, S.; She, X.; Bult, C. J.; Agarwala, R.; Cherry, J. L.; DiCuccio, M.; Hlavina, W.; Kapustin, Y.; Meric, P.; Maglott, D.; Birtle, Z.; Marques, A. C.; Graves, T.; Zhou, S.; Teague, B.; Potamousis, K.; Churas, C.; Place, M.; Herschleb, J.; Runnheim, R.; Forrest, D.; Amos-Landgraf, J.; Schwartz, D. C.; Cheng, Z.; Lindblad-Toh, K.; Eichler, E. E.; Ponting, C. P. The Mouse Genome Sequencing Consortium PLoS Biol 2009, 7, e1000112
18. Teague, B.; Waterman, M. S.; Goldstein, S.; Potamousis, K.; Zhou, S.; Reslewic, S.; Sarkar, D.; Valouev, A.; Churas, C.; Kidd, J. M.; Kohn, S.; Runnheim, R.; Lamers, C.; Forrest, D.; Newton, M. A.; Eichler, E. E.; Kent-First, M.; Surti, U.; Livny, M.; Schwartz, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 10848-10853
19. Wu, C.; Schramm, T. M.; Zhou, S.; Schwartz, D. C.; Talaat, A. M. BMC Genomics 2009, 10, 25
20. Latreille, P.; Norton, S.; Goldman, B. S.; Henkhaus, J.; Miller, N.; Barbazuk, B.; Bode, H. B.; Darby, C.; Du, Z.; Forst, S.; Gaudriault, S.; Goodner, B.; Goodrich-Blair, H.; Slater, S. BMC Genomics 2007, 8, 321
21. Qu, X.; Wu, D.; Mets, L.; Scherer, N. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 11298-11303
22. Gordon, M. P.; Ha, T.; Selvin, P. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 6462-6465
23. Neely, R. K.; Dedecker, P.; Hotta, J.; Urbanavičiute, G.; Klimašauskas, S.; Hofkens, J. Chem. Sci. 2010, 1, 453-460
24. Dervan, P. B.; Bürli, R. W. Curr. Opin. Chem. Biol. 1999, 3, 688-693
25. Chan, E. Y.; Goncalves, N. M.; Haeusler, R. A.; Hatch, A. J.; Larson, J. W.; Maletta, A. M.; Yantz, G. R.; Carstea, E. D.; Fuchs, M.; Wong, G. G.; Gullans, S. R.; Gilmanshin, R. Genome Res. 2004, 14, 1137-1146
26. Bates, M.; Huang, B.; Dempsey, G. T.; Zhuang, X. Science 2007, 317, 1749-1753
27. Rust, M. J.; Bates, M.; Zhuang, X. Nat. Methods 2006, 3, 793-796
28. Linde, S.; van de; Löschberger, A.; Klein, T.; Heidbreder, M.; Wolter, S.; Heilemann, M.; Sauer, M. Nat. Protoc. 2011, 6, 991-1009
29. van de Linde, S.; Krstić, I.; Prisner, T.; Doose, S.; Heilemann, M.; Sauer, M. Photochem. Photobiol. Sci. 2011, 10, 499
30. Kartalov, E. P.; Unger, M. A.; Quake, S. R. BioTechniques 2003, 34, 505-510
31. Aitken, C. E.; Marshall, R. A.; Puglisi, J. D. Biophys. J. 2008, 94, 1826-1835
32. Rasnik, I.; McKinney, S. A.; Ha, T. Nat. Methods 2006, 3, 891-893
33. Lam, E. T.; Hastie, A.; Lin, C.; Ehrlich, D.; Das, S. K.; Austin, M. D.; Deshpande, P.; Cao, H.; Nagarajan, N.; Xiao, M.; Kwok, P.-Y. Nat. Biotechnol. 2012, not supplied.