Solvent effects on electron-driven proton-transfer processes: Adenine-thymine base pairs

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 14, Issue 25, 2012, Pages 8981-8989

  Dargiewicz, Monika ^a   Biczysko, Malgorzata ^a,b   Improta, Roberto ^c   Barone, Vincenzo ^d  

^a Università degli Stud di Napoli Federico II   (Italy)

^b CENTER FOR NANOTECHNOLOGY INNOVATION NEST   (Italy)

^c Istituto Biostrutture e Bioimmagini CNRs   (Italy)

^d SCUOLA NORMALE SUPERIORE   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENINE; PROTON; SOLVENT; THYMINE;

ARTICLE; BASE PAIRING; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ELECTRON; GAS; QUANTUM THEORY;

ADENINE; BASE PAIRING; ELECTRONS; GASES; MODELS, MOLECULAR; PROTONS; QUANTUM THEORY; SOLVENTS; THYMINE;

EID: 84862292644     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp23890j     Document Type: Article

References (51)

1. G.-J. Zhao K.-L. Han Acc. Chem. Res. 2011 10.1021/ar200135h
2. C. Middleton K. de La Harpe C. Su Annu. Rev. Phys. Chem. 2009 60 217 239
3. C. Crespo-Hernández B. Cohen P. Hare B. Kohler Chem. Rev. 2004 104 1977
4. E. Samoylova V. Smith H. Ritze W. Radloff M. Kabelac T. Schultz J. Am. Chem. Soc. 2006 128 15652 15656
5. T. Schultz E. Samoylova W. Radloff I. Hertel A. Sobolewski W. Domcke Science 2004 306 1765 1768
6. A. Sobolewski W. Domcke C. Hattig Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 17903 17906
7. A. Sobolewski W. Domcke Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 2763 2771
8. A. Abo-Riziq L. Grace E. Nir M. Kabelac P. Hobza M. S. de Vries Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 20 23
9. P. Markwick N. Doltsinis J. Chem. Phys. 2007 126 175102
10. G. Groenhof L. Schafer M. Boggio-Pasqua M. Goette H. Grubmüller M. Robb J. Am. Chem. Soc. 2007 129 6812 6819
11. O. Christiansen H. Koch P. Jorgensen Chem. Phys. Lett. 1995 243 409
12. C. Hattig F. Weigend J. Chem. Phys. 2000 113 5154
13. S. Perun A. Sobolewski W. Domcke J. Phys. Chem. A 2006 110 9031 9038
14. Y.-J. Ai F. Zhanf G.-L. Cui Y. Luo W.-H. Fang J. Chem. Phys. 2010 133 064302
15. F. Santoro V. Barone C. Benzi R. Improta Theor. Chem. Acc. 2007 117 1073 1084
16. N. Schwalb T. Michalak F. Temps J. Phys. Chem. B 2009 113 16365 16376
17. N. Schwalb F. Temps Science 2008 322 243 245
18. L. Biemann S. Kovalenko K. Kleinermanns R. Mahrwald M. Markert R. Improta J. Am. Chem. Soc. 2011 133 19664 19667
19. F. Santoro V. Barone R. Improta J. Am. Chem. Soc. 2009 131 15232 15245
20. F. Santoro V. Barone R. Improta Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 9931 9937
21. Y. Zhao N. E. Schults D. G. Truhlar J. Chem. Theory Comput. 2006 2 364
22. C. Adamo V. Barone J. Chem. Phys. 2000 110 6158
23. R. Improta V. Barone Angew. Chem., Int. Ed. 2011 10.1002/anie.201104382
24. G. Pietraperzia M. Pasquini N. Schiccheri G. Piani M. Becucci E. Castellucci M. Biczysko J. Bloino V. Barone J. Phys. Chem. A 2009 113 14343 14351
25. G. Pietraperzia M. Pasquini F. Mazzoni G. Piani M. Becucci M. Biczysko D. Michalski J. Bloino V. Barone J. Phys. Chem. A 2011 115 9603 9611
26. J. Tomasi B. Mennucci R. Cammi Chem. Rev. 2005 105 2999
27. R. Cammi S. Corni B. Mennucci J. Tomasi J. Chem. Phys. 2005 122 104513
28. R. Improta V. Barone G. Scalmani M. Frisch J. Chem. Phys. 2006 125 54103
29. R. Improta G. Scalmani M. Frisch V. Barone J. Chem. Phys. 2007 127 74504
30. R. Improta Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 2656 2664
31. C. Hsieh C. Jiang P. Chou Acc. Chem. Res. 2010 43 1364 1374
32. G. Scalmani M. J. Frish B. Menucci J. Tomasi R. Cammi V. Barone J. Chem. Phys. 2006 124 094107
33. A. C. Chamberlin C. J. Cramer D. G. Truhlar J. Phys. Chem. B 2006 110 5665 5675
34. S. Hofinger F. Zerbetto Chem. Phys. Lett. 2009 480 313 317
35. V. Karunakaran K. Kleinermanns R. Improta S. Kovalenko J. Am. Chem. Soc. 2009 131 5839 5850
36. F. Santoro V. Barone T. Gustavsson R. Improta J. Am. Chem. Soc. 2006 128 16312 16322
37. T. Gustavsson R. Improta D. Markovitsi J. Phys. Chem. Lett. 2010 1 2025 2030
38. V. Barone M. Cossi J. Tomasi J. Chem. Phys. 1997 107 3210
39. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. R. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. R. Montgomery Jr., J. A. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski and D. J. Fox, Gaussian 09 Revision B.01, 2009, Gaussian Inc, Wallingford, CT, 2009
40. L. Blancafort J. Am. Chem. Soc. 2006 128 210 219
41. L. Serrano-Andrés M. Merchàn A. Borin Chem.-Eur. J. 2006 12 6559 6571
42. L. Serrano-Andrés M. Merchàn A. C. Borin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 8691
43. Z. Lan Y. Lu E. Fabiano W. Thiel Comput. Phys. Commun. 2011 12 1989 1998
44. M. Schreiber M. M. R. Silva-Junior S. Sauer W. Thiel J. Chem. Phys. 2008 128 134110
45. S. Höfinger T. Simonson J. Comput. Chem. 2001 22 290 305
46. A. W. Lange J. M. Herbert J. Am. Chem. Soc. 2009 131 3911 3922
47. T. Yanai D. P. Tew N. C. Handy Chem. Phys. Lett. 2004 393 51
48. Y. Zhao D. G. Truhlar Theor. Chem. Acc. 2008 120 215
49. V. Barone J. Bloino M. Biczysko Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 1092 1101
50. J. Bloino M. Biczysko F. Santoro V. Barone J. Chem. Theory Comput. 2010 6 1256 1274
51. M. Biczysko P. Panek V. Barone Chem. Phys. Lett. 2009 475 105