Erratum: How is methane formed and oxidized reversibly when catalyzed by ni-containing methyl-coenzyme M reductase? (Chemistry - A European Journal (2012) 18 DOI: 10.1002/chem.201200274);How is methane formed and oxidized reversibly when catalyzed by Ni-containing methyl-coenzyme M reductase?

Chemistry - A European Journal

Volumn 18, Issue 20, 2012, Pages 6309-6315

  Chen, Shi Lu ^a   Blomberg, Margareta R A ^b   Siegbahn, Per E M ^b  

^a BEIJING INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (China)

^b STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

density functional calculations; enzyme catalysis; metalloenzymes; nickel; oxidation

Indexed keywords

CATALYSIS; COENZYMES; CRYSTAL STRUCTURE; DISPERSIONS; METHANE; NICKEL; OXIDATION; REACTION INTERMEDIATES;

ACTIVE-SITE MODELING; ANAEROBIC OXIDATION OF METHANES; ENZYME CATALYSIS; HYBRID DENSITY FUNCTIONAL THEORY; METALLOENZYMES; METHYL-COENZYME M REDUCTASE; OXIDATION OF METHANE; X RAY CRYSTAL STRUCTURES;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 84860754998     PISSN: 09476539     EISSN: 15213765     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/chem.201203134     Document Type: Erratum

References (36)

1. S. W. Ragsdale, J. Biol. Chem. 2009, 284, 18571-18575
2. B. Jaun, R. K. Thauer, in Metal Ions in Life Sciences, Vol. 6 (Eds.:, A. Sigel, H. Sigel, R. K. O. Sigel,), John Wiley and Sons, West Sussex, England, 2009, pp. 115-132
3. B. Jaun, R. K. Thauer, in Metal Ions in Life Sciences, Vol. 2 (Eds.:, A. Sigel, H. Sigel, R. K. O. Sigel,), John Wiley and Sons, West Sussex, England, 2007, pp. 323-356
4. S. W. Ragsdale, in The Porphyrin Handbook, Vol. 11 (Eds.:, K. M. Kadish, K. M. Smith, R. Guilard, R.,), Academic Press, New York, 2003, pp. 205-228.
5. S. Scheller, M. Goenrich, R. Boecher, R. K. Thauer, B. Jaun, Nature 2010, 465, 606-609.
6. J. A. Labinger, J. E. Bercaw, Nature 2002, 417, 507-514
7. D. Schroder, H. Schwarz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 18114-18119.
8. U. Ermler, W. Grabarse, S. Shima, M. Goubeaud, R. K. Thauer, Science 1997, 278, 1457-1462.
9. M. Dey, X. Li, R. C. Kunz, S. W. Ragsdale, Biochemistry 2010, 49, 10902-10911.
10. V. Pelmenschikov, M. R. A. Blomberg, P. E. M. Siegbahn, R. H. Crabtree, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 4039-4049
11. V. Pelmenschikov, P. E. M. Siegbahn, J. Biol. Inorg. Chem. 2003, 8, 653-662.
12. S. L. Chen, V. Pelmenschikov, M. R. A. Blomberg, P. E. M. Siegbahn, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 9912-9913.
13. Y. Ahn, J. A. Krzycki, H. G. Floss, J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4700-4701.
14. M. Goenrich, F. Mahlert, E. C. Duin, C. Bauer, B. Jaun, R. K. Thauer, J. Biol. Inorg. Chem. 2004, 9, 691-705.
15. S. Scheller, M. Goenrich, S. Mayr, R. K. Thauer, B. Jaun, Angew. Chem. 2010, 122, 8289-8292
16. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 8112-8115.
17. S. Grimme, J. Comput. Chem. 2004, 25, 1463-1473
18. S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27, 1787-1799.
19. P. E. M. Siegbahn, M. R. A. Blomberg, S. L. Chen, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 2040-2044
20. S. L. Chen, M. R. A. Blomberg, P. E. M. Siegbahn, J. Phys. Chem. B 2011, 115, 4066-4077.
21. W. Grabarse, F. Mahlert, E. C. Duin, M. Goubeaud, S. Shima, R. K. Thauer, V. Lamzin, U. Ermler, J. Mol. Biol. 2001, 309, 315-330.
22. R. Sarangi, M. Dey, S. W. Ragsdale, Biochemistry 2009, 48, 3146-3156. EXAFS=extended X-ray absorption fine structure.
23. V. Pelmenschikov, K. B. Cho, P. E. M. Siegbahn, J. Comput. Chem. 2004, 25, 311-321.
24. C. C. Lawrence, M. Bennati, H. V. Obias, G. Bar, R. G. Griffin, J. Stubbe, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 8979-8984.
25. J. Harmer, C. Finazzo, R. Piskorski, S. Ebner, E. C. Duin, M. Goenrich, R. K. Thauer, M. Reiher, A. Schweiger, D. Hinderberger, B. Jaun, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10907-10920.
26. R. K. Thauer, Microbiology 1998, 144, 2377-2406.
27. H. Zheng, J. D. Lipscomb, Biochemistry 2006, 45, 1685-1692.
28. A. D. Becke, J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372-1377.
29. Jaguar, version 7.0, Schrodinger, LLC, New York, NY, 2007.
30. Gaussian 03, Revision D.01, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004.
31. P. E. M. Siegbahn, J. Comput. Chem. 2001, 22, 1634-1645
32. P. E. M. Siegbahn, Q. Rev. Biophys. 2003, 36, 91-145
33. F. Himo, P. E. M. Siegbahn, Chem. Rev. 2003, 103, 2421-2456
34. F. Himo, Theor. Chem. Acc. 2006, 116, 232-240
35. F. Himo, P. E. M. Siegbahn, J. Biol. Inorg. Chem. 2009, 14, 643-651
36. P. E. M. Siegbahn, M. R. A Blomberg, Chem. Rev. 2010, 110, 7040-7061.