Systematic isolation of microbial metabolites for natural products depository (NPDepo)

Pure and Applied Chemistry

Volumn 84, Issue 6, 2012, Pages 1407-1420

  Osada, Hiroyuki ^a   Nogawa, Toshihiko ^a  

^a RIKEN   (Japan)

Author keywords

Biosynthesis; Fraction library; Mass spectrometry; Microbial products; MP plot; Natural products; Spectral database; Systematic isolation; UV vis spectroscopy

Indexed keywords

MICROBIAL PRODUCTS; MP PLOT; NATURAL PRODUCTS; SPECTRAL DATABASE; SYSTEMATIC ISOLATION; UV-VIS SPECTROSCOPY;

AMIDES; BIOACTIVITY; BIOMOLECULES; BIOSYNTHESIS; CHROMATOGRAPHY; DATABASE SYSTEMS; MASS SPECTROMETRY; ULTRAVIOLET VISIBLE SPECTROSCOPY;

METABOLITES;

EID: 84859644021     PISSN: 00334545     EISSN: 13653075     Source Type: Journal    
DOI: 10.1351/PAC-CON-11-08-11     Document Type: Article

References (42)

1. D. J. Newman, G. M. Cragg. J. Nat. Prod. 70, 461 (2007).
2. G. M. Cragg, D. J. Newman. Pure Appl. Chem. 77, 7 (2004).
3. K. J. Weissman, P. F. Leadlay. Nat. Rev. Microbiol. 3, 925 (2005).
4. C. M. Dobson. Nature 432, 824 (2004).
5. J. Clardy, C. Walsh. Nature 432, 829 (2004).
6. H. Osada, C. Hertwech. Curr. Opin. Chem. Biol. 13, 133 (2009).
7. H. Osada. Actinomycetology 15, 11 (2001).
8. H. Osada. Curr. Med. Chem. 10, 727 (2003).
9. H. Osada. "Trends in bioprobe research", in Bioprobes, H. Osada (Ed.), pp. 1-14, Springer, Berlin (2000).
10. H. Osada. "Chemical biology based on small molecule-protein interaction", in Protein Targeting with Small Molecules: Chemical Biology Techniques and Applications, H. Osada (Ed.), pp. 1-10, John Wiley, NJ (2009).
11. H. Osada. ACS Chem. Biol. 1, 8 (2006).
12. RIKEN Natural Products Depository (NPDepo),
13. H. Osada. Biosci. Biotechnol. Biochem. 74, 1135 (2010).
14. S. Panthee, S. Takahashi, H. Takagi, T. Nogawa, E. Oowada, M. Uramoto, H. Osada. J. Antibiot. 64, 1 (2011).
15. S. Takahashi, H. Takagi, A. Toyoda, M. Uramoto, T. Nogawa, M. Ueki, Y. Sakaki, H. Osada. J. Bacteriol. 192, 2839 (2010).
16. H. Osada, H. Koshino, K. Isono, H. Takahashi, G. Kawanishi. J. Antibiot. 44, 259 (1991).
17. H. Takahashi, H. Osada, H. Koshino, T. Kudo, S. Amano, S. Shimizu, M. Yoshihara, K. Isono. J. Antibiot. 45, 1409 (1992).
18. T. M. Bugni, B. Richards, L. Bhoite, D. Cimbora, M. K. Harper, C. M. Ireland. J. Nat. Prod. 71, 1095 (2008).
19. N. Kanoh, H. Osada. "Recent developments and advances in chemical array", in Protein Targeting with Small Molecules: Chemical Biology Techniques and Applications, H. Osada (Ed.), pp. 57-80, John Wiley, NJ (2009).
20. I. Miyazaki, S. Simizu, H. Okumura, S. Takagi, H. Osada. Nat. Chem. Biol. 6, 667 (2010).
21. N. Kanoh, A. Asami, M. Kawatani, K. Honda, S. Kumashiro, H. Takayama, S. Shimizu, T. Amemiya, Y. Kondoh, S. Hatakeyama, K. Tsuganezawa, R. Utata, A. Tanaka, S. Yokoyama, H. Tashiro, H. Osada. Chem. Asian J. 1, 789 (2006).
22. ACD/Labs (version 12.01, Advanced Chemistry Development, Inc., Toronto, Canada) was purchased from Fujitsu, Tokyo, Japan.
23. T. Nogawa, A. Okano, S. Takahashi, M. Uramoto, H. Konno, T. Saito, H. Osada. Org. Lett. 12, 4564 (2010).
24. X. C. Cheng, T. Kihara, H. Kusakabe, J. Magae, Y. Kobayashi, R. P. Fang, Z. F. Ni, Y. C. Shen, K. Ko, I. Yamaguchi, K. Isono. J. Antibiot. 40, 907 (1987).
25. J. Magae, C. Watanabe, H. Osada, X. C. Cheng, K. Isono. J. Antibiot. 40, 932 (1988).
26. X. C. Cheng, M. Ubukata, K. Isono. J. Antibiot. 43, 809 (1990).
27. Y. Ogasawara, K. Katayama, A. Minami, M. Otsuka, T. Eguchi, K. Kakinuma. Chem. Biol. 11, 79 (2004).
28. X. C. Cheng, T. Kihara, X. Ying, M. Uramoto, H. Osada, H. Kusakabe, B. N. Wang, Y. Kobayashi, K. Ko, I. Yamaguchi, K. Isono. J. Antibiot. 42, 141 (1989).
29. X. C. Cheng, M. Ubukata, K. Isono. J. Antibiot. 43, 890 (1990).
30. H. Seto, N. Otake. Heterocycles 17, 555 (1982).
31. H. Koshino, H. Takahashi, H. Osada, K. Isono. J. Antibiot. 45, 1420 (1992).
32. A. Höltzel, C. Kempter, J. W. Metzger, G. Jung. J. Antibiot. 51, 699 (1998).
33. Y. Igarashi, T. Iida, R. Yoshida, T. Furumai. J. Antibiot. 55, 764 (2002).
34. J. Niggemann, N. Bedorf, U. Flörke, H. Steinmetz, K. Gerth, H. Reichenbach, G. Höfle. Eur. J. Org. Chem. 23, 5013 (2005).
35. J. Li, L. Li, Y. Si, Y. Jiang, L. Guo, Y. Che. Org. Lett. 13, 2670 (2011).
36. W. Li, J. Ju, S. R. Rajski, H. Osada, B. Shen. J. Biol. Chem. 283, 28607 (2008).
37. H. Ikeda, T. Nonomiya, S. Omura. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 27, 170 (2001).
38. S. Takahashi, A. Toyoda, Y. Sekiyama, H. Takagi, T. Nogawa, M. Uramoto, R. Suzuki, H. Koshino, T. Kumano, T. Dairi, J. Ishikawa, Y. Sakaki, H. Osada. Nat. Chem. Biol. 7, 461 (2011).
39. G. Nakamura, K. Kobayashi, T. Sakurai, K. Isono. J. Antibiot. 34, 1513 (1981).
40. G. Nakamura, K. Isono. J. Antibiot. 36, 1467 (1983).
41. S. Fushimi, S. Nishikawa, A. Shimazu, H. Seto. J. Antibiot. 42, 1019 (1989).
42. S. Fushimi, K. Furihata, H. Seto. J. Antibiot. 42, 1026 (1989).