Crystal structure of the multicopper oxidase from the pathogenic bacterium Campylobacter jejuni CGUG11284: Characterization of a metallo-oxidase

Metallomics

Volumn 4, Issue 1, 2012, Pages 37-47

  Silva, Catarina S ^a   Durão, Paulo ^a   Fillat, Amanda ^a,b   Lindley, Peter F ^a   Martins, Lígia O ^a   Bento, Isabel ^a  

^a INSTITUTO DE TECNOLOGIA QUÍMICA E BIOLÓGICA   (Portugal)

^b UNIVERSITAT POLITÈCNICA DE CATALUNYA   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOCHEMICAL CHARACTERIZATION; CAMPYLOBACTER JEJUNI; CATALYTIC CENTRE; COPPER HOMEOSTASIS; DIOXYGENS; ENZYMATIC EFFICIENCY; LACCASES; METALLIC IONS; MULTI DOMAINS; MULTICOPPER OXIDASE; PATHOGENIC BACTERIUM; PHENOLIC SUBSTRATES; PUTATIVE BINDING SITES; RADICAL OXYGEN SPECIES;

BACTERIA; BINDING SITES; CHARACTERIZATION; ENZYMES; INORGANIC COMPOUNDS; PHENOLS; PHYSIOLOGY;

CRYSTAL STRUCTURE;

COPPER; LACCASE; METAL ION; OXIDOREDUCTASE; REACTIVE OXYGEN METABOLITE;

ARTICLE; BACTERIAL VIRULENCE; BIOCHEMICAL COMPOSITION; CAMPYLOBACTER JEJUNI; CATALYSIS; CRYSTAL STRUCTURE; ENZYME ACTIVITY; ENZYME PURIFICATION; ENZYME SUBSTRATE COMPLEX; HOMEOSTASIS; METAL BINDING; NONHUMAN; OXIDATIVE STRESS; PRIORITY JOURNAL;

BACTERIAL PROTEINS; BINDING SITES; CAMPYLOBACTER JEJUNI; COPPER; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; METALLOPROTEINS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR SEQUENCE DATA; OXIDATION-REDUCTION; OXIDOREDUCTASES; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; RECOMBINANT PROTEINS;

BACTERIA (MICROORGANISMS); CAMPYLOBACTER JEJUNI;

EID: 84855464644     PISSN: 17565901     EISSN: 1756591X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1mt00156f     Document Type: Article

References (71)

1. A. Messerschmidt, Multi-copper Oxidases, World Science Press, Singapore, 1997
2. P. F. Lindley, Multi-copper oxidases, Marcel Dekker, Inc., Basel, New York, 2001
3. P. J. Hoegger S. Kilaru T. Y. James J. R. Thacker U. Kues FEBS J. 2006 273 2308 2326
4. P. Giardina V. Faraco C. Pezzella A. Piscitelli S. Vanhulle G. Sannia Cell. Mol. Life Sci. 2010 67 369 385
5. K. Nakamura N. Go Cell. Mol. Life Sci. 2005 62 2050 2066
6. D. J. Kosman JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2010 15 15 28
7. S. Rodríguez Couto J. L. Toca Herrera Biotechnol. Adv. 2006 24 500 513
8. P. Sharma R. Goel N. Capalash World J. Microbiol. Biotechnol. 2007 23 823 832
9. H. Claus Micron 2004 35 93 96
10. K. Miyazaki Extremophiles 2005 9 415 425
11. A. T. Fernandes J. M. Damas S. Todorovic R. Huber M. C. Baratto R. Pogni C. M. Soares L. O. Martins FEBS J. 2010 277 3176 3189
12. A. T. Fernandes C. M. Soares M. M. Pereira R. Huber G. Grass L. O. Martins FEBS J. 2007 274 2683 2694
13. E. I. Solomon P. Chen M. Metz S. K. Lee A. E. Palmer Angew. Chem., Int. Ed. 2001 40 4570 4590
14. F. J. Enguita L. O. Martins A. O. Henriques M. A. Carrondo J. Biol. Chem. 2003 278 19416 19425
15. I. Bento L. O. Martins G. Gato Lopes M. Armenia Carrondo P. F. Lindley Dalton Trans. 2005 3507 3513
16. I. Bento C. S. Silva Z. Chen L. O. Martins P. F. Lindley C. M. Soares BMC Struct. Biol. 2010 10 28
17. L. O. Martins C. M. Soares M. M. Pereira M. Teixeira T. Costa G. H. Jones A. O. Henriques J. Biol. Chem. 2002 277 18849 18859
18. S. A. Roberts A. Weichsel G. Grass K. Thakali J. T. Hazzard G. Tollin C. Rensing W. R. Montfort Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 2766 2771
19. S. A. Roberts G. F. Wildner G. Grass A. Weichsel A. Ambrus C. Rensing W. R. Montfort J. Biol. Chem. 2003 278 31958 31963
20. K. Kataoka H. Komori Y. Ueki Y. Konno Y. Kamitaka S. Kurose S. Tsujimura Y. Higuchi K. Kano D. Seo T. Sakurai J. Mol. Biol. 2007 373 141 152
21. C. S. Stoj and D. J. Kosman, Copper proteins: oxidases, New York, 2005
22. S. K. Singh S. A. Roberts S. F. McDevitt A. Weichsel G. F. Wildner G. B. Grass C. Rensing W. R. Montfort J. Biol. Chem. 2011 286 37849 37857
23. F. Arnesano L. Banci I. Bertini A. R. Thompsett Structure 2002 10 1337 1347
24. D. L. Huffman J. Huyett F. W. Outten P. E. Doan L. A. Finney B. M. Hoffman T. V. O'Halloran Biochemistry 2002 41 10046 10055
25. F. W. Outten D. L. Huffman J. A. Hale T. V. O'Halloran J. Biol. Chem. 2001 276 30670 30677
26. Z. L. Harris A. P. Durley T. K. Man J. D. Gitlin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 10812 10817
27. A. B. Taylor C. S. Stoj L. Ziegler D. J. Kosman P. J. Hart Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 15459 15464
28. J. Parkhill B. W. Wren K. Mungall J. M. Ketley C. Churcher D. Basham T. Chillingworth R. M. Davies T. Feltwell S. Holroyd K. Jagels A. V. Karlyshev S. Moule M. J. Pallen C. W. Penn M. A. Quail M. A. Rajandream K. M. Rutherford A. H. van Vliet S. Whitehead B. G. Barrell Nature 2000 403 665 668
29. M. C. Peterson West J. Med. 1994 161 148 152
30. K. Palyada D. Threadgill A. Stintzi J. Bacteriol. 2004 186 4714 4729
31. K. Holmes F. Mulholland B. M. Pearson C. Pin J. McNicholl-Kennedy J. M. Ketley J. M. Wells Microbiology 2005 151 243 257
32. S. J. Hall A. Hitchcock C. S. Butler D. J. Kelly J. Bacteriol. 2008 190 8075 8085
33. P. Durão Z. Chen A. T. Fernandes P. Hildebrandt D. H. Murgida S. Todorovic M. M. Pereira E. P. Melo L. O. Martins JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2008 13 183 193
34. P. Durão I. Bento A. T. Fernandes E. P. Melo P. F. Lindley L. O. Martins JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2006 11 514 526
35. S. K. Singh G. Grass C. Rensing W. R. Montfort J. Bacteriol. 2004 186 7815 7817
36. K. A. Kantardjieff B. Rupp Protein Sci. 2003 12 1865 1871
37. A. Leslie, Newsletter on Protein Crystallography, 1992, No. 26
38. A. G. Leslie Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2006 62 48 57
39. R. M. Keegan M. D. Winn Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2007 63 447 457
40. A. Vagin A. Teplyakov J. Appl. Crystallogr. 1997 30 1022 1025
41. A. J. McCoy R. W. Grosse-Kunstleve P. D. Adams M. D. Winn L. C. Storoni R. J. Read J. Appl. Crystallogr. 2007 40 658 674
42. P. D. Adams P. V. Afonine G. Bunkóczi V. B. Chen I. W. Davis N. Echols J. J. Headd L. W. Hung G. J. Kapral R. W. Grosse-Kunstleve A. J. McCoy N. W. Moriarty R. Oeffner R. J. Read D. C. Richardson J. S. Richardson T. C. Terwilliger P. H. Zwart Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2010 66 213 221
43. G. N. Murshudov A. A. Vagin E. J. Dodson Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 1997 53 240 255
44. V. S. Lamzin K. S. Wilson Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 1993 49 129 147
45. W. T. Mooij S. X. Cohen K. Joosten G. N. Murshudov A. Perrakis Structure 2009 17 183 189
46. P. Emsley K. Cowtan Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2004 60 2126 2132
47. G. Bricogne, E. Blanc, M. Brandl, C. Flensburg, P. Keller, W. Paciorek, P. Roversi, O. S. Smart, C. Vonrhein and T. O. Womack, Global Phasing Ltd., Cambridge, UK, version 2.8.0 edn, 2009
48. M. D. Winn M. N. Isupov G. N. Murshudov Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2001 57 122 133
49. S. C. Lovell I. W. Davis W. B. Arendall 3rd P. I. de Bakker J. M. Word M. G. Prisant J. S. Richardson D. C. Richardson Proteins: Struct., Funct., Genet. 2003 50 437 450
50. I. W. Davis A. Leaver-Fay V. B. Chen J. N. Block G. J. Kapral X. Wang L. W. Murray W. B. Arendall J. Snoeyink J. S. Richardson D. C. Richardson Nucleic Acids Res. 2007 35 W375 W383
51. W. L. DeLano, DeLano Scientific, San Carlos, CA, USA, 2002
52. A. J. Brenner E. D. Harris Anal. Biochem. 1995 226 80 84
53. J. D. Bendtsen H. Nielsen G. von Heijne S. Brunak J. Mol. Biol. 2004 340 783 795
54. E. I. Solomon U. M. Sundaram T. E. Machonkin Chem. Rev. 1996 96 2563 2605
55. D. F. Blair G. W. Campbell W. K. Cho A. M. English H. A. Fry V. Lum K. A. Norton J. R. Schoonover S. I. Chan J. Am. Chem. Soc. 1985 5755 5766
56. C. Stoj D. J. Kosman FEBS Lett. 2003 554 422 426
57. Z. Chen P. Durão C. S. Silva M. M. Pereira S. Todorovic P. Hildebrandt I. Bento P. F. Lindley L. O. Martins Dalton Trans. 2010 2875 2882
58. Y. Ueki M. Inoue S. Kurose K. Kataoka T. Sakurai FEBS Lett. 2006 580 4069 4072
59. F. Xu Appl. Biochem. Biotechnol. 2001 95 125 133
60. A. Messerschmidt R. Ladenstein R. Huber M. Bolognesi L. Avigliano R. Petruzzelli A. Rossi A. Finazzi-Agro J. Mol. Biol. 1992 224 179 205
61. N. Hakulinen L. L. Kiiskinen K. Kruus M. Saloheimo A. Paananen A. Koivula J. Rouvinen Nat. Struct. Biol. 2002 9 601 605
62. K. Piontek M. Antorini T. Choinowski J. Biol. Chem. 2002 277 37663 37669
63. K. Kataoka R. Sugiyama S. Hirota M. Inoue K. Urata Y. Minagawa D. Seo T. Sakurai J. Biol. Chem. 2009 284 14405 14413
64. E. I. Solomon A. J. Augustine J. Yoon Dalton Trans. 2008 3921 3932
65. A. J. Augustine L. Quintanar C. S. Stoj D. J. Kosman E. I. Solomon J. Am. Chem. Soc. 2007 129 13118 13126
66. L. Quintanar C. Stoj T. P. Wang D. J. Kosman E. I. Solomon Biochemistry 2005 44 6081 6091
67. V. N. Zaitsev I. Zaitseva M. Papiz P. F. Lindley JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 1999 4 579 587
68. F. J. Enguita D. Marcal L. O. Martins R. Grenha A. O. Henriques P. F. Lindley M. A. Carrondo J. Biol. Chem. 2004 279 23472 23476
69. J. Liang H. Edelsbrunner C. Woodward Protein Sci. 1998 7 1884 1897
70. P. F. Lindley G. Card I. Zaitseva V. Zaitsev B. Reinhammar E. Selin-Lindgren K. Yoshida JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 1997 2 454 463
71. A. W. Smith A. Camara-Artigas M. Wang J. P. Allen W. A. Francisco Biochemistry 2006 45 4378 4387