The ribosome modulates nascent protein folding

Science

Volumn 334, Issue 6063, 2011, Pages 1723-1727

  Kaiser, Christian M ^a,b   Goldman, Daniel H ^b   Chodera, John D ^a   Tinoco Jr , Ignacio ^a,b   Bustamante, Carlos ^a,b  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

LYSOZYME; POLYPEPTIDE;

ENZYME ACTIVITY; EXPERIMENTAL STUDY; MOLECULAR ANALYSIS; PEPTIDE; PROTEIN;

ARTICLE; CELL FUNCTION; IN VITRO STUDY; OPTICAL TWEEZERS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN FOLDING; PROTEIN SYNTHESIS; RIBOSOME; SURFACE PROPERTY;

EID: 84455194188     PISSN: 00368075     EISSN: 10959203     Source Type: Journal    
DOI: 10.1126/science.1209740     Document Type: Article

References (49)

1. C. B. Anfinsen, Science 181, 223 (1973).
2. J. Kubelka, T. K. Chiu, D. R. Davies, W. A. Eaton, J. Hofrichter, J. Mol. Biol. 359, 546 (2006).
3. K. W. Plaxco, K. T. Simons, D. Baker, J. Mol. Biol. 277, 985 (1998).
4. D. J. Brockwell, S. E. Radford, Curr. Opin. Struct. Biol. 17, 30 (2007).
5. J. B. Udgaonkar, Annu. Rev. Biophys. 37, 489 (2008).
6. J. P. Ellis, C. K. Bakke, R. N. Kirchdoerfer, L. M. Jungbauer, S. Cavagnero, ACS Chem. Biol. 3, 555 (2008).
7. M. S. Evans, I. M. Sander, P. L. Clark, J. Mol. Biol. 383, 683 (2008).
8. S. T. Hsu et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104, 16516 (2007).
9. A. Khushoo, Z. Yang, A. E. Johnson, W. R. Skach, Mol. Cell 41, 682 (2011).
10. J. Lu, C. Deutsch, Nat. Struct. Mol. Biol. 12, 1123 (2005).
11. C. A. Woolhead, P. J. McCormick, A. E. Johnson, Cell 116, 725 (2004).
12. S. Bhushan et al., Nat. Struct. Mol. Biol. 17, 313 (2010).
13. R. Green, H. F. Noller, Annu. Rev. Biochem. 66, 679 (1997).
14. S. Varenne, J. Buc, R. Lloubes, C. Lazdunski, J. Mol. Biol. 180, 549 (1984).
15. G. Cannarozzi et al., Cell 141, 355 (2010).
16. X. Qu et al., Nature 475, 118 (2011).
17. C. Kimchi-Sarfaty et al., Science 315, 525 (2007).
18. G. Zhang, M. Hubalewska, Z. Ignatova, Nat. Struct. Mol. Biol. 16, 274 (2009).
19. E. Siller, D. C. DeZwaan, J. F. Anderson, B. C. Freeman, J. M. Barral, J. Mol. Biol. 396, 1310 (2010).
20. S. T. Liang, Y. C. Xu, P. Dennis, H. Bremer, J. Bacteriol. 182, 3037 (2000).
21. C. C. Chow et al., Biochemistry 42, 7090 (2003).
22. A. H. Elcock, PLoS Comput. Biol. 2, e98 (2006).
23. E. P. O'Brien, S. T. Hsu, J. Christodoulou, M. Vendruscolo, C. M. Dobson, J. Am. Chem. Soc. 132, 16928 (2010).
24. J. R. Moffitt, Y. R. Chemla, S. B. Smith, C. Bustamante, Annu. Rev. Biochem. 77, 205 (2008).
25. A. Ashkin, J. M. Dziedzic, J. E. Bjorkholm, S. Chu, Opt. Lett. 11, 288 (1986).
26. H. Dietz, M. Rief, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 1244 (2006).
27. E. A. Shank, C. Cecconi, J. W. Dill, S. Marqusee, C. Bustamante, Nature 465, 637 (2010).
28. M. Matsumura, B. W. Matthews, Science 243, 792 (1989).
29. J. Cellitti et al., Protein Sci. 16, 842 (2007).
30. M. Llinás, S. Marqusee, Protein Sci. 7, 96 (1998).
31. W. A. Baase, L. Liu, D. E. Tronrud, B. W. Matthews, Protein Sci. 19, 631 (2010).
32. Materials and methods and additional information are available as supporting material on Science Online.
33. N. R. Voss, M. Gerstein, T. A. Steitz, P. B. Moore, J. Mol. Biol. 360, 893 (2006).
34. C. Bustamante, J. F. Marko, E. D. Siggia, S. Smith, Science 265, 1599 (1994).
35. O. K. Dudko, G. Hummer, A. Szabo, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105, 15755 (2008).
36. P. Weinkam, E. V. Pletneva, H. B. Gray, J. R. Winkler, P. G. Wolynes, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106, 1796 (2009).
37. J. Cellitti, R. Bernstein, S. Marqusee, Protein Sci. 16, 852 (2007).
38. C. Bustamante, Y. R. Chemla, N. R. Forde, D. Izhaky, Annu. Rev. Biochem. 73, 705 (2004).
39. R. Liu, J. E. Barrick, J. W. Szostak, R. W. Roberts, Methods Enzymol. 318, 268 (2000).
40. C. Voisset, S. J. Saupe, M. Blondel, Biotechnol. J. 6, 668 (2011).
41. G. de Prat Gay et al., J. Mol. Biol. 254, 968 (1995).
42. J. L. Neira, A. R. Fersht, J. Mol. Biol. 285, 1309 (1999).
43. H. Taniuchi, J. Biol. Chem. 245, 5459 (1970).
44. F. U. Hartl, M. Hayer-Hartl, Science 295, 1852 (2002).
45. B. Schuler, E. A. Lipman, W. A. Eaton, Nature 419, 743 (2002).
46. F. Brandt et al., Cell 136, 261 (2009).
47. H. X. Zhou, K. A. Dill, Biochemistry 40, 11289 (2001).
48. J. Mittal, R. B. Best, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105, 20233 (2008).
49. J. Kiraga et al., BMC Genomics 8, 163 (2007).