Unravelling the details of vitamin D photosynthesis by non-adiabatic molecular dynamics simulations

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 47, 2011, Pages 20986-20998

  Tapavicza, Enrico ^a   Meyer, Alexander M ^a   Furche, Filipp ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

1,4 CYCLOHEXADIENE; 1,4-CYCLOHEXADIENE; CYCLOHEXENE DERIVATIVE; VITAMIN D;

ARTICLE; CHEMISTRY; MOLECULAR DYNAMICS; PHOTOSYNTHESIS; QUANTUM THEORY; STEREOISOMERISM; SYNTHESIS;

CYCLOHEXENES; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PHOTOSYNTHESIS; QUANTUM THEORY; STEREOISOMERISM; VITAMIN D;

EID: 82355172953     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1cp21292c     Document Type: Article

References (99)

1. M. F. Holick J. Cell. Biochem. 2003 88 296
2. C. F. Garland E. D. Gorham S. B. Mohr F. C. Garland Ann. Epidemiol. 2009 19 468
3. S. Wang Nutr. Res. Rev. 2009 22 188
4. P. Tuohimaa T. Keisala A. Minasyan J. Cachat A. Kalueff Psychoneuroendocrinology 2009 34 278
5. D. Lawson A. A. Paul A. Black T. Cole A. Mandal M. Davie Br. Med. J. 1979 2 303
6. N. L. Rangel K. S. Williams J. M. Seminario J. Phys. Chem. A 2009 113 6740
7. W. B. A. Windhaus K. Dimroth Justus Liebigs Ann. Chem. 1940 543 240
8. E. Havinga R. J. de Kock M. P. Rappoldt Tetrahedron Lett. 1960 11 276
9. N. J. Turro, Modern Molecular Photochemistry, University Science Books, Sausalito, CA 94965, 1991
10. E. Havinga Cell. Mol. Life Sci. 1973 29 1181
11. P. J. Reid S. J. Doig S. D. Wickham R. A. Mathies J. Am. Chem. Soc. 1993 115 4754
12. P. J. Reid M. K. Lawless S. D. Wickham R. A. Mathies J. Phys. Chem. 1994 98 5597
13. S. A. Trushin W. Fuss T. Schikarski W. E. Schmid K. L. Kompa J. Chem. Phys. 1997 106 9386
14. W. Fuss W. E. Schmid S. A. Trushin J. Chem. Phys. 2000 112 8347
15. M. Garavelli C. S. Page P. Celani M. Olivucci W. E. Schmid S. A. Trushin W. Fuss J. Phys. Chem. A 2001 105 4458
16. N. Kuthirummal F. M. Rudakov C. L. Evans P. M. Weber J. Chem. Phys. 2006 125 133307
17. K. Kosma S. A. Trushin W. Fuss W. E. Schmid Phys. Chem. Chem. Phys. 2009 11 172
18. P. Celani F. Bernardi M. A. Robb M. Olivucci J. Phys. Chem. 1996 100 19364
19. A. Nenov P. Kölle M. A. Robb R. de Vivie-Riedle J. Org. Chem. 2010 75 123
20. R. C. Dudek P. M. Weber J. Phys. Chem. A 2001 105 4167
21. C. Nonnenberg S. Grimm I. Frank J. Chem. Phys. 2003 119 11585
22. Y. Dou S. Yuan G. V. Lo Appl. Surf. Sci. 2007 253 6404
23. A. Li S. Yuan Y. Dou Y. Wang Z. Wen Chem. Phys. Lett. 2009 478 28
24. R. B. Woodward R. Hoffmann Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1969 8 781
25. W. T. A. M. Van der Lugt L. J. Oosterhoff J. Am. Chem. Soc. 1969 91 6042
26. A. Braun, M. Maurette and E. Oliveros, Photochemical technology, Wiley, 1991
27. W. Fuss T. Hofer P. Hering K. L. Kompa S. Lochbrunner T. Schikarski W. E. Schmid J. Chem. Phys. 1996 100 921
28. N. A. Anderson J. J. Shiang R. J. Sension J. Phys. Chem. A 1999 103 10730
29. K.-C. Tang A. Rury M. B. Orozco J. Egendorf K. G. Spears R. J. Sension J. Chem. Phys. 2011 134 104503
30. F. Bernardi M. Olivucci I. N. Ragazos M. A. Robb J. Am. Chem. Soc. 1992 114 8211
31. M. J. Bearpark S. M. Larkin T. Vreven J. Phys. Chem. A 2008 112 7286
32. O. Dmitrenko W. Reischl THEOCHEM 1998 431 229
33. O. Dmitrenko J. H. Frederick W. Reischl J. Photochem. Photobiol., A 2001 139 125
34. H. J. C. Jacobs J. W. J. Gielen E. Havinga Tetrahedron Lett. 1981 22 4013
35. W. Fuss S. Lochbrunner J. Photochem. Photobiol., A 1997 105 159
36. A. W. Norman, Vitamin D: the calcium homeostatic steroid hormone, Academic Press, New York, 1979
37. W. G. Dauben R. B. Phillips J. Am. Chem. Soc. 1982 104 5780
38. J. Saltiel L. Cires A. M. Turek J. Am. Chem. Soc. 2003 125 2866
39. J. K. Yamamoto R. F. Borch Biochemistry 1985 24 3338
40. X. Q. Tian M. F. Holick J. Biol. Chem. 1999 274 4174
41. M. Norval L. O. Bjorn F. R. de Gruijl Photochem. Photobiol. Sci. 2010 9 11
42. W. G. Dauben R. B. Phillips J. Am. Chem. Soc. 1982 104 355
43. J. K. Whitesell M. A. Minton V. D. Tran J. Am. Chem. Soc. 1989 111 1473
44. W. G. Dauben B. Disanayaka D. J. H. Funhoff B. Zhou B. E. Kohler D. E. Schilke J. Am. Chem. Soc. 1991 113 8367
45. A. M. Mueller S. Lochbrunner W. E. Schmid W. Fuss Angew. Chem., Int. Ed. 1998 37 505
46. R. S. H. Liu Acc. Chem. Res. 2001 34 555
47. N. L. Doltsinis D. Marx J. Theor. Comput. Chem. 2002 1 319
48. J. C. Tully J. Chem. Phys. 1990 93 1061
49. E. Fabiano T. Keal W. Thiel Chem. Phys. 2008 349 334
50. I. Antol M. Eckert-Maksic M. Barbatti H. Lischka J. Chem. Phys. 2007 127 234303
51. M. Ruckenbauer M. Barbatti B. Sellner T. Muller H. Lischka J. Phys. Chem. A 2010 114 12585
52. E. Tapavicza I. Tavernelli U. Rothlisberger J. Phys. Chem. A 2009 113 9595
53. N. L. Doltsinis D. Marx Phys. Rev. Lett. 2002 88 166402
54. C. F. Craig W. R. Duncan O. V. Prezhdo Phys. Rev. Lett. 2005 95 163001
55. E. Tapavicza I. Tavernelli U. Rothlisberger Phys. Rev. Lett. 2007 98 023001
56. U. Werner R. Mitrić T. Suzuki V. Bonaić-Koutecký Chem. Phys. 2008 349 319
57. P. Elliot, F. Furche and K. Burke, Reviews in computational chemistry, 2009, p. 91
58. E. K. U. Gross W. Kohn Phys. Rev. Lett. 1985 55 2850
59. B. G. Levine C. Ko J. Quenneville T. J. Martinez Mol. Phys. 2006 104 1039
60. E. Tapavicza I. Tavernelli U. Rothlisberger C. Filippi M. E. Casida J. Chem. Phys. 2008 129 124108
61. M. Huix-Rotllant B. Natarajan A. Ipatov C. Muhavini Wawire T. Deutsch M. E. Casida Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 12811
62. S. Hirata M. Head-Gordon Chem. Phys. Lett. 1999 314 291
63. F. Cordova L. J. Doriol A. Ipatov M. E. Casida C. Filippi A. Vela J. Chem. Phys. 2007 127 164111
64. A. Dreuw J. Weisman M. Head-Gordon J. Chem. Phys. 2003 119 2943
65. M. Häser R. Ahlrichs J. Comput. Chem. 1989 10 104
66. F. Furche R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 2002 117 7433
67. M. Barbatti G. Granucci M. Persico M. Ruckenbauer M. Vazdar M. Eckert-Maksic H. Lischka J. Photochem. Photobiol., A 2007 190 228
68. L. Verlet Phys. Rev. 1967 159 98
69. S. D. Elliott R. Ahlrichs O. Hampe M. M. Kappes Phys. Chem. Chem. Phys. 2000 2 3415
70. V. Chernyak S. Mukamel J. Chem. Phys. 2000 112 3572
71. R. Baer Chem. Phys. Lett. 2002 364 75
72. C. Hu H. Hirai O. Sugino J. Chem. Phys. 2007 127 064103
73. I. Tavernelli E. Tapavicza U. Rothlisberger J. Chem. Phys. 2009 130 124107
74. I. Tavernelli E. Tapavicza U. Rothlisberger THEOCHEM 2009 914 22
75. R. Send F. Furche J. Phys. Chem. 2010 132 044107
76. M. E. Casida, Recent Advances in Density Functional Methods, 1995, p. 155
77. J. Perdew K. Burke M. Ernzerhof Phys. Rev. Lett. 1996 77 3865
78. J. P. Perdew M. Ernzerhof K. Burke J. Chem. Phys. 1996 105 9982
79. O. Christiansen H. Koch P. Jørgensen Chem. Phys. Lett. 1995 243 409
80. A. Schäfer H. Horn R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 1992 2571 97
81. T. H. J. Dunning J. Chem. Phys. 1989 90 1007
82. R. A. Kendall T. H. J. Dunning R. J. Harrison J. Chem. Phys. 1992 96 6796
83. S. Nosé Rev. Mod. Phys. 1984 52 255
84. W. Hoover Phys. Rev. A 1985 31 1695
85. J. Plötner A. Dreuw Chem. Phys. 2008 347 472
86. R. Bauernschmitt R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 1996 104 9047
87. Y. Sugita Y. Okamoto Chem. Phys. Lett. 1999 314 141
88. O. Christiansen H. Koch P. Jørgensen T. Helgaker Chem. Phys. Lett. 1996 263 530
89. O. Christiansen H. Koch A. Halkier P. Jorgensen T. Helgaker A. S. de Meras J. Chem. Phys. 1996 105 6921
90. P. E. Share K. L. Kompa S. D. Peyerimhoff M. C. V. Hemert Chem. Phys. 1988 120 411
91. P. E. Share K. L. Kompa Chem. Phys. 1989 134 429
92. S. H. Pullen N. A. Anderson L. A. Walker II R. J. Sension J. Chem. Phys. 1998 108 556
93. W. G. Dauben G. J. Fonken J. Am. Chem. Soc. 1959 81 4060
94. E. Havinga J. L. M. A. Schlatmann Tetrahedron Lett. 1961 16 146
95. G. Granucci M. Persico J. Chem. Phys. 2007 126 134114
96. F. Boomsman H. Jacobs E. Havinga A. van der Gen Tetrahedron Lett. 1975 16 427
97. A. G. M. Barrett D. H. R. Barton R. A. Russell D. A. Widdowson J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1 1977 631
98. M. Bockmann N. L. Doltsinis D. Marx Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 2008 78 036101
99. M. Bockmann N. L. Doltsinis D. Marx J. Phys. Chem. A 2010 114 745