Theoretical investigation of carbon nanotube binding to DNA in view of drug delivery

Journal of Computational and Theoretical Nanoscience

Volumn 8, Issue 7, 2011, Pages 1212-1219

  Ghalandari, B ^a   MonajjemiM , ^a   Mollaamin, F ^b  

^a ISLAMIC AZAD UNIVERSITY   (Iran)

^b ISLAMIC AZAD UNIVERSITY   (Iran)

Author keywords

DFT; Dielectric Constant; Dihedral Angle; Interaction Energy; Onsager; Single Strand DNA; Single Walled Carbon Nanotube (SWNT); Solvent Effect

Indexed keywords

DFT; DIELECTRIC CONSTANTS; INTERACTION ENERGIES; ONSAGER; SINGLE STRAND DNA; SINGLE-WALLED CARBON; SOLVENT EFFECT;

BIOMOLECULES; CHEMICAL PROPERTIES; DIHEDRAL ANGLE; DNA; DRUG DELIVERY; DRUG INTERACTIONS; QUANTUM THEORY; STABILITY; VACUUM;

CARBON NANOTUBES;

EID: 81155132010     PISSN: 15461955     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1166/jctn.2011.1801     Document Type: Article

References (39)

1. S. M. Moghimi, A. C. Hunter, and J. C. Murray, The FASEB Journal 19, 311 (2005).
2. M. Trojanowicz, Trends in Analytical Chemistry 25, 480 (2006).
3. T. Zhou, C. Xu, X. Zhang, C. Cheng, L. Chen, and Y. Xu, Acta. Physic. Chimica. Sinica. 24, 1579 (2008).
4. Z. Guo, P. J. Sadler, and S. C. Tsang, Adv. Mater. 10, 701 (1998).
5. E. Herzog, A. Casey, F. M. Lyng, G. Chambers, H. J. Byrne, and M. Davoren, Toxicology. Lett. 174, 49 (2007).
6. C. Zhao, L. Ji, H. Liu, G. Hu, S. Zhang, M. Yang, and Z. Yang, J. Solid. State. Chem. 177, 4394 (2004).
7. J. Li, Q. Liu, Y. Liu, S. Liu, and S. Yao, Analytical Biochemistry 346, 107 (2005).
8. T. Belin and F. Epron, Mater. Sci. Eng., B 119, 105 (2005).
9. G. Lu, P. Maragakis, and E. Kaxiras, Nano Lett. 5, 897 (2005).
10. X. Li, Y. Peng, and X. Qu, Nucleic Acids Res. 34, 3670 (2006).
11. X. Zhao and J. K. Johnson, J. Am. Chem. Soc. 129, 10438 (2007).
12. T. Ramanathan, F. T. Fisher, R. S. Ruoff, and L. C. Brinson, Chem. Mater. 17, 1290 (2005).
13. S. Meng, W. L. Wang, P. Maragakis, and E. Kaxiras, Nano. Lett. 7, 2312 (2007).
14. A. Star, E. Tu, J. Niemann, J. Christophe, P. Gabriel, C. S. Joiner, and C. Valcke, PNAS 103, 921 (2006).
15. C. Hu, Y. Zhang, G. Bao, Y. Zhang, M. Liu, and Z. L. Wang, J. Phys. Chem B 109, 20072 (2005).
16. M. E. Hughes, E. Brandin, and J. A. Golovchenko, Nano. Lett. 7, 1191 (2007).
17. S. Meng, P. Maragakis, C. Papaloukas, and E. Kaxiras, Nano. Lett. 7, 45 (2007).
18. G. Rink, Y. Kong, and T. Koslowski, Chem. Phys. 327, 98 (2006).
19. H. Gao, Y. Kong, and D. Cui, Nano. Lett. 3, 471 (2003).
20. W. Yang, M. J. Moghaddam, S. Taylor, B. Bojarski, and L. Wieczorek, Chem. Phys. Lett. 443, 169 (2007).
21. S. Daniel, T. P. Rao, K. S. Rao, S. U. Rani, G. R. K. Naidu, H. Y. Lee, and T. Kawai, Sens. Actuators, B 122, 672 (2007).
22. S. Gowtham, R. H. Scheicher, R. Ahuja, R. Pandey, and S. P. Karna, Phys. Rev. B 76, 033401 (2007).
23. M. J. Moghaddam, S. Taylor, M. Gao, S. Huang, L. Dai, and J. McCall, Nano. Lett. 1, 89 (2004).
24. A. Das, A. K. Sood, P. K. Maiti, M. Das, R. Varadarajan, and C. N. R. Rao, Chem. Phys. Lett. 453, 266 (2008).
25. N. Allinger, P. Kollman, W. Jorgensen, M. Karplus, J. R. Pojack, R. Huber, L. C. Sieker, T. L. Blundell, S. H. Kim, and M. M. Teeter, Hyperchem, Version 6.0, Hypercube, USA (2000).
26. Hyperchem, Version 6.0, Hypercube, USA.
27. G. Kaminski and W. L. Jorgensen, J. Phys. Chem. 100, 18010 (1996).
28. W. L. Jorgensen, D. S. Maxwell, and T. T. Rives, J. Am. Chem. Soc. 118, 11225 (1996).
29. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, Jr., R. E. Stratmann, J. C. Burant, S. Dapprich, J. M. Millam, A. D. Daniels, K. N. Kudin, M. C. Strain, O. Farkas, J. Tomasi, V. Barone, M. Cossi, R. Cammi, B. Mennucci, C. Pomelli, C. Adamo, S. Clifford, J. Ochterski, G. A. Petersson, P. Y. Ayala, Q. Cui, K. Morokuma, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. Cioslowski, J. V. Ortiz, A. G. Baboul, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, C. Gonzalez, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, C. Gonzalez, M. Head-Gordon, E. S. Replogle, and J. A. Pople, Gaussian 98, Revision A.7, Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA (1998).
30. M. Monajjemi, M. H Razavian, F. Mollaamin, F. Naderi, and B. Honarparvar, Russian J. Phys. Chem. A 82, 2346 (2008).
31. F. Mollaamin, M. T. Baei, M. Monajjemi, R. Zhiani, and B. Honarparvar, Russian J. Phys. Chem A 82, 2354 (2008).
32. A. Maiti, Microelectronics 39, 208 (2008).
33. D. Srivastava and S. N. Atluri, CMES 5, 531 (2002).
34. A. D. Beck, J. Chem. Phys. 98, 5648 (1993).
35. C. Lee, W. Yang, and R. G. Parr, Phys. Rev. B 37, 785 (1998).
36. A. Tsolakidis and E. Kaxiras, J. Phys. Chem. A 109, 2373 (2005).
37. A. Szarecka, J. Rychlewski, and U. Rychlewska, Computational Methods in Science and Technology 4, 25 (1998).
38. M. Karelson and A. Lomaka, Arkivoc 2, 51 (2001).
39. X. Y. Li, Q. Zhu, L. L. Zhao, S. Q. Xiao, and F. Liu, Theor. Chem. Acc. 107, 282 (2002).