Diffusion and aggregation of sodium fluorescein in aqueous solutions

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 44, 2011, Pages 12896-12904

  Casalini, Tommaso ^a   Salvalaglio, Matteo ^a   Perale, Giuseppe ^a   Masi, Maurizio ^a   Cavallotti, Carlo ^a  

^a POLITECNICO DI MILANO   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DENSITY FUNCTIONAL THEORY; DIFFUSION; DIMERS; MOLECULAR DYNAMICS; SODIUM; SOLUTIONS; SULFUR COMPOUNDS;

AGGREGATION PHENOMENA; ATOMIC CHARGE; BOUNDARY SURFACES; CHARGE REPULSION; COMPUTATIONAL METHODOLOGY; DFT CALCULATION; DFT LEVELS; DIMER STRUCTURE; EINSTEIN EQUATIONS; EXPERIMENTAL DATA; EXPLICIT WATER; FUNCTIONALS; INTERACTION ENERGIES; MD SIMULATION; MEAN SQUARE DISPLACEMENT; MINIMUM ENERGY; MINIMUM-ENERGY STRUCTURES; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; SELF-DIFFUSION COEFFICIENTS; SOLVATION THEORY; UMBRELLA SAMPLING;

AGGLOMERATION;

EID: 80455127033     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp207459k     Document Type: Article

References (57)

1. Perale, G.; Arosio, P.; Moscatelli, D.; Barri, V.; Muller, M.; Maccagnan, S.; Masi, M. J. Controlled Release 2009, 136, 196
2. Santoro, M.; Marchetti, P.; Rossi, F.; Perale, G.; Castiglione, F.; Mele, A.; Masi, M. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 2503
3. Perale, G.; Rossi, F.; Santoro, M.; Marchetti, P.; Mele, A.; Castiglione, F.; Raffa, E.; Masi, M. J. Biomed. Nanotechnol. 2011, 7, 1
4. Perale, G.; Veglianese, P.; Rossi, F.; Peviani, M.; Santoro, M.; Llupi, D.; Micotti, E.; Forloni, G.; Masi, M. Mater. Lett. 2011, 65, 1688
5. Rossi, F.; Perale, G.; Masi, M. Chem. Pap. 2010, 64, 573
6. Lòpez Arbeloa, I. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1981, 77, 1725
7. Lòpez Arbeloa, I. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1981, 77, 1735
8. Leonhardt, H.; Gordon, L.; Livingston, R. J. Phys. Chem. 1971, 76, 245
9. Sjoback, R.; Nygren, J.; Kubista, M. Spectrochim. Acta, Part A 1995, 51, L7
10. Krol, M.; Wrona, M.; Page, C. S.; Bates, P. A. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 1520
11. Jang, Y. H.; Hwang, S.; Chung, D. S. Abstr. Pap. Am. Chem. Soc. 2003, 225, U772
12. Jang, Y. H.; Hwang, S. G.; Chung, D. S. Chem. Lett. 2001, 1316
13. Batistela, V. R.; Cedran, J. C.; de Oliveira, H. P. M.; Scarminio, I. S.; Ueno, L. T.; Machado, A. E. D.; Hioka, N. Dyes Pigm. 2010, 86, 15
14. Saltzman, W. M.; Radomsky, M. L.; Whaley, K. J.; Cone, R. A. Biophys. J. 1994, 66, 508
15. Radomsky, M. L.; Whaley, K. J.; Cone, R. A.; Saltzman, W. M. Biomaterials 1990, 11, 619
16. Soeller, C.; Jacobs, M. D.; Donaldson, P. J.; Cannell, M. B. J. Biomed. Opt. 2003, 8, 418
17. Valdes-Aguilera, O.; Neckers, D. C. Acc. Chem. Res. 1989, 22, 171
18. Rohatgi, K. K.; Singhal, G. S. J. Chem. Phys. 1966, 70, 1695
19. Lòpez Arbeloa, I. Dyes Pigm. 1983, 4, 213
20. Lòpez Arbeloa, I. Thermochim. Acta 1983, 60, 219
21. Lòpez Arbeloa, I. J. Photochem. 1982, 18, 161
22. Rohatgi, K. K.; Mukhopahyay, A. K. J. Phys. Chem. 1972, 76, 3970
23. De, S.; Das, S.; Girigoswami, A. Spectrochim. Acta, Part A 2005, 61, 1821
24. Das, S.; Chattopadhyay, A. P.; De, S. J. Photochem. Photobiol., A 2008, 197, 402
25. Daré-Doyen, S.; Doizi, D.; Guilbaud, P.; Djedaini-Pilard, F.; Perly, B.; Millié, P. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 13803
26. Chuichay, P.; Vladimirov, E.; Siriwong, K.; Hannongbua, S.; Rosch, N. J. Mol. Model. 2006, 12, 885
27. Ivanova, A.; Jezierski, G.; Vladimirov, E.; Rosch, N. Biomacromolecules 2007, 8, 3429
28. Ilich, P.; Mishra, P. K.; Macura, S.; Burghardt, T. P. Spectrochim. Acta, Part A 1996, 52, 1323
29. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648
30. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785
31. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, J.; J., A.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, N. J.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, Ö.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian 09, Revision A.1; Gaussian, Inc.: Wallingford CT, 2009.
32. Ditchfield, R.; Hehre, W. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1971, 54, 724
33. Mennucci, B.; Cances, E.; Tomasi, J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 10506
34. Duan, Y.; Wu, C.; Chowdhury, S.; Lee, M. C.; Xiong, G. M.; Zhang, W.; Yang, R.; Cieplak, P.; Luo, R.; Lee, T.; Caldwell, J.; Wang, J. M.; Kollman, P. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1999
35. Clark, T.; Chandrasekhar, J.; Spitznagel, G. W.; Schleyer, P. v. R. J. Comput. Chem. 1983, 4, 294
36. Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell, W. D.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269
37. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9620
38. Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, I.; T.E.; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Crowley, M.; Walker, R. C.; Zhang, W.; Merz, K. M.; Wang, B.; Hayik, S.; Roitberg, A.; Seabra, G.; Kolossváry, I.; Wong, K. F.; Paesani, F.; Vanicek, J.; Wu, X.; Brozell, S. R.; Steinbrecher, T.; Gohlke, H.; Yang, L.; Tan, C.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Mathews, D. H.; Seetin, M. G.; Sagui, C.; Babin, V.; Kollman, P. A. Amber 10; University of California: San Francisco, 2008.
39. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926
40. Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327
41. Frenkel, D.; Smit, B. Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications, 2 nd ed.; Academic Press: San Diego, 2002.
42. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 2008, 120, 215
43. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Chem. Phys. Lett. 2011, 502, 1
44. Gu, J.; Wang, J.; Leszczynski, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F., III Chem. Phys. Lett. 2008, 459, 164
45. Frisch, M. J.; Pople, J. A.; Binkley, J. S. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3265
46. Tomasi, J.; Mennucci, B.; Cammi, R. Chem. Rev. 2005, 105, 2999
47. Roux, B. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 275
48. Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011
49. Kastner, J.; Thiel, W. J. Chem. Phys. 2005, 123
50. Kobrak, M. N. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1437
51. Lee, E. C.; Kim, D.; Jurecka, P.; Tarakeshwar, P.; Hobza, P.; Kim, K. S. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 3446
52. Zhao, Y.; Schultz, N. E.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 364
53. Suresh, C. H.; Mohan, N.; Vijayalakshmi, K. P.; George, R.; Mathew, J. M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1392
54. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6908
55. Iikura, H.; Tsuneda, T.; Yanai, T.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2001, 115, 3540
56. Moiani, D.; Cavallotti, C.; Famulari, A.; Schmuck, C. Chem.-Eur. J. 2008, 14, 5207
57. Salvalaglio, M.; Muscionico, I.; Cavallotti, C. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 14860