A DFT investigation of surface-enhanced raman scattering of adenine and 2′-deoxyadenosine 5′-monophosphate on Ag20 nanoclusters

ChemPhysChem

Volumn 12, Issue 13, 2011, Pages 2468-2475

  Lang, Xiu Feng ^a   Yin, Peng Gang ^a   You, Ting Ting ^a   Jiang, Li ^a   Guo, Lin ^a  

^a BEIHANG UNIVERSITY   (China)

Author keywords

density functional calculations; nucleobases; nucleosides; Raman spectroscopy; silver nanoclusters

Indexed keywords

COLLOIDS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; NANOCLUSTERS; RAMAN SCATTERING; RAMAN SPECTROSCOPY; SILVER;

ADSORPTION SITE; NUCLEOBASES; NUCLEOSIDES; PHOSPHATE GROUP; SILVER NANOCLUSTERS; SILVER SURFACE; SPECTRAL FEATURE; SURFACE ENHANCED RAMAN SCATTERING (SERS);

SURFACE SCATTERING;

EID: 80052436942     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.201100187     Document Type: Article

References (44)

1. L. G. Davis, Basic Methods in Molecular Biology, Appleton & Lange, Noralk, 1994.
2. T. M. Herne, A. Ahern, R. L. Garrell, J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 846-854.
3. E. Pierstorff, D. Ho, J. Nanosci. Nanotechnol. 2007, 7, 2949-2968.
4. M. Moskovits, Rev. Mod. Phys. 1985, 57, 783-826.
5. K. Kneipp, H. Kneipp, I. Itzkan, R. R. Dasari, M. S. Feld, Chem. Rev. 1999, 99, 2957-2975.
6. S. M. Nie, S. R. Emory, Science 1997, 275, 1102-1106.
7. A. M. Michaels, M. Nirmal, L. E. Brus, J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9932-9939.
8. E. Koglin, J. M. Sequaris, P. Valenta, J. Mol. Struct. 1980, 60, 421-425.
9. B. Giese, D. McNaughton, J. Phys. Chem. B 2002, 106, 101-112.
10. A. Otto, A. Bruckbauer, Y. X. Chen, J. Mol. Struct. 2003, 661, 501-514.
11. Y. J. Xiao, Y. F. Chen, X. X. Gao, Spectrochim. Acta Part A 1999, 55, 1209-1218.
12. L. Cui, D. Y. Wu, A. Wang, B. Ren, Z. Q. Tian, J. Phys. Chem. C 2010, 114, 16588-16595.
13. S. E. J. Bell, N. M. S. Sirimuthu, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 15580-15581.
14. A. Rasmussen, V. Deckert, J. Raman Spectrosc. 2006, 37, 311-317.
15. E. J. Blackie, E. C. Le Ru, P. G. Etchegoin, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 14466-14472.
16. E. Papadopoulou, S. E. J. Bell, J. Phys. Chem. C 2010, 114, 22644-22651.
17. A. Barhoumi, D. Zhang, F. Tam, N. J. Halas, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 5523-5529.
18. J. Kundu, O. Neumann, B. G. Janesko, D. Zhang, S. Lal, A. Barhoumi, G. E. Scuseria, N. J. Halas, J. Phys. Chem. C 2009, 113, 14390-14397.
19. H. Watanabe, Y. Ishida, N. Hayazawa, Y. Inouye, S. Kawata, Phys. Rev. B 2004, 69, 155418.
20. F. Feng, G. Zhi, H. S. Jia, L. Cheng, Y. T. Tian, X. J. Li, Nanotechnology 2009, 20, 295501.
21. M. Muniz-Miranda, C. Gellini, M. Pagliai, M. Innocenti, P. R. Salvi, V. Schettino, J. Phys. Chem. C 2010, 114, 13730-13735.
22. J. S. Suh, M. Moskovits, J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 4711-4718.
23. L. Jensen, J. Phys. Chem. A 2009, 113, 4437-4444.
24. L. Peyser-Capadona, J. Zheng, González, T. H. Lee, S. A. Patel, R. M. Dickson, Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 058301.
25. L. Jensen, C. M. Aikens, G. C. Schatz, Chem. Soc. Rev. 2008, 37, 1061-1073.
26. L. L. Zhao, L. Jensen, G. C. Schatz, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 2911-2919.
27. L. L. Zhao, L. Jensen, G. C. Schatz, Nano Lett. 2006, 6, 1229-1234.
28. K. E. Brewer, C. M. Aikens, J. Phys. Chem. A 2010, 114, 8858-8863.
29. S. M. Morton, L. Jensen, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4090-4098.
30. D. Y. Wu, X. M. Liu, S. Duan, X. Xu, B. Ren, S. H. Lin, Z. Q. Tian, J. Phys. Chem. C 2008, 112, 4195-4204.
31. E. M. Fernández, J. M. Soler, I. L. Garzõn, L. C. Balbás, Phys. Rev. B 2004, 70, 165403.
32. J. Wiorkiewicz-Kuczera, M. Karplus, J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 5324-5340.
33. K. Kneipp, H. Kneipp, V. B. Kartha, R. Manoharan, G. Deinum, I. Itzkan, Phys. Rev. E 1998, 57, R 6281-R 6284.
34. M. Futamata, Faraday Discuss. 2006, 132, 45-61.
35. E. Papadopoulou, S. E. J. Bell, Analyst 2010, 135, 3034-3037.
36. S. K. Saikin, R. O. Amaya, D. Rappoport, M. Stopa, A. Aspuru-Guzik, Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 9401-9411.
37. Gaussian 03 (Revision E.01), M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schiegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, T. Vreven, Jr., K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. J. Salvador, J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Rahgavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piksorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003.
38. C. Lee, W. Yang, R. G. Parr, Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.
39. A. D. Becke, J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5642.
40. P. J. Hay, W. R. Wadt, J. Chem. Phys. 1985, 82, 270-283.
41. J. Neugebauer, M. Reiher, C. Kind, B. A. Hess, J. Comput. Chem. 2002, 23, 895-910.
42. R. Bauernschmitt, R. Ahlrichs, Chem. Phys. Lett. 1996, 256, 454-464.
43. C. E. Dykstra, P. G. Jasien, Chem. Phys. Lett. 1984, 109, 388-393.
44. D. Y. Wu, X. M. Liu, Y. F. Huang, B. Ren, X. Xu, Z. Q. Tian, J. Phys. Chem. C 2009, 113, 18212-18222.