SERS and computational studies on microRNA chains adsorbed on silver surfaces

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 114, Issue 32, 2010, Pages 13730-13735

  Muniz Miranda, Maurizio ^a   Gellini, Cristina ^a   Pagliai, Marco ^a   Innocenti, Massimo ^a   Salvi, Pier Remigio ^a   Schettino, Vincenzo ^a  

^a UNIVERSITY OF FLORENCE   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTATIONAL STUDIES; DFT CALCULATION; INTERACTION SITE; METAL SUBSTRATE; METAL SURFACES; MICRORNAS; SERS SPECTRUM; SILVER SUBSTRATE; SILVER SURFACE; SPECTRAL FEATURE; STRUCTURAL ARRANGEMENT; SURFACE-ENHANCED RAMAN SCATTERING;

ADSORPTION; RAMAN SCATTERING; SILVER;

SUBSTRATES;

EID: 77956156781     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp103304r     Document Type: Article

References (44)

1. Davis, L. G. Basic Methods in Molecular Biology; Appleton & Lange: Noralk, CT, 1994.
2. Pierstorff, E.; Ho, D. J. Nanosci. Nanotechnol. 2007, 7, 2940.
3. Herne, T. M.; Ahern, A.; Garrell, R. L. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 846.
4. Chang, R. K.; Furtak, T. E. Surface-Enhanced Raman Scattering; Plenum Press: New York, 1981.
5. Otto, A. In Light Scattering in Solids; Cardona, M., Güntherodt, G., Eds.; Springer-Verlag: Berlin, 1984; Vol.IV, p 289.
6. Campion, A.; Kambhampati, P. Chem. Soc. Rev. 1998, 27, 241.
7. Aroca, R. Surface-enhanced Vibrational Spectroscopy; Wiley & Sons: 2006.
8. Kneipp, K.; Wang, Y.; Kneipp, H.; Perelman, L. T.; Itzkan, I.; Dasari, R. R.; Feld, M. S. Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 1667.
9. Nie, S.; Emory, S. R. Science 1997, 275, 1102.
10. Green, M.; Liu, F.-M.; Cohen, L.; Köllensperger, P.; Cass, T. Faraday Discuss. 2006, 132, 269.
11. Barhoumi, A.; Zhang, D.; Tam, F.; Halas, N. J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 5523.
12. Braun, G. J.; Lee, S. J.; Dante, M.; Nguyen, T.-Q.; Moskovits, M.; Reich, N. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 6378.
13. Muniz-Miranda, M.; Pergolese, B.; Bigotto, A. Vib. Spectrosc. 2007, 43, 97.
14. Cardini, G.; Muniz-Miranda, M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6875.
15. Pagliai, M.; Bellucci, L.; Muniz-Miranda, M.; Cardini, G.; Schettino, V. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 171.
16. Geissler, M.; Wolf, H.; Stutz, R.; Delmarche, E.; Grummt, U. W.; Michel, B.; Bietsch, A. Langmuir 2003, 19, 6301.
17. Carlà, F.; Innocenti, M.; Loglio, F.; Muniz-Miranda, M.; Salvi, P. R.; Gellini, C.; Cavallini, M.; Felici, R.; Lastraioli, E.; Salvietti, E.; Foresti, M. L. Mater. Sci. Semicond. Process. 2009, 12, 21.
18. Creighton, J. A.; Blatchford, C. G.; Albrecht, M. G. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 2 1979, 75, 790.
19. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; VReven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
20. Polavarapu, P. L. J. Phys. Chem. 1990, 94, 8106.
21. Keresztury, G.; Holly, S.; Varga, J.; Besenyei, G.; Wang, A. Y.; Durig, J. R. Spectrochim. Acta, Part A 1993, 49, 2007.
22. Keresztury, G. In Handbook of Vibrational Spectroscopy; Chalmers, J. M., Griffiths, P. R., Eds.; Wiley & Sons: Chichester, U.K., 2002; Vol.1, p 71.
23. Giese, B.; McNaughton, D. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 1461.
24. Sánchez-Cortés, S.; García-Ramos, J. V. Surf. Sci. 2001, 473, 133.
25. Koglin, E.; Sequaris, J. M.; Valenta, P. J. Mol. Struct. 1980, 60, 421.
26. Watanabe, T.; Kawanami, O.; Katoh, H.; Honda, K.; Nishimura, Y.; Tsuboi, M. Surf. Sci. 1985, 158, 341.
27. Kim, S. K.; Joo, T. H.; Suh, S. W.; Kim, M. S. J. Raman Spectrosc. 1986, 17, 381.
28. Otto, C.; Van den Tweel, T. J. J.; de Mul, F. F. M.; GReve, J. J. Raman Spectrosc. 1986, 17, 289.
29. Otto, C.; de Mul, F. F. M.; Huizingz, A.; GReve, J. J. Phys. Chem. 1988, 92, 1239.
30. Itoh, K.; Minami, K.; Tsujino, T.; Kim, M. J. Phys. Chem. 1991, 95, 1339.
31. Giese, B.; McNaughton, D. J. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 101.
32. Watanabe, H.; Ishida, Y.; Hayazawa, N.; Inouye, Y.; Kawata, S. Phys. Rev. B 2004, 69, 155418.
33. Li, J.; Fang, Y. Spectrochim. Acta, Part A 2007, 66, 994.
34. Feng, F.; Zhi, G.; Jia, H. S.; Cheng, L.; Tian, Y. T.; Li, X. J. Nanotechnology 2009, 20, 295501.
35. Kundu, J. O.; Neumann, O.; Janesko, B. G.; Zhang, D.; Lal, S.; Barhoumi, A.; Scuseria, G. E.; Halas, N. J. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 14390.
36. Callis, P. R. Annu. Rev. Phys. Chem. 1983, 34, 329.
37. Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Karplus, M. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 5324.
38. Shugar, D.; Psoda, A. In Landolt-Børnstein - New Series:Biophysics of Nucleic Acids; Saenger, W., Ed.; Springer: Berlin, 1990; Vol.VII/1d, p 308.
39. Creighton, J. A. In Spectroscopy of Surfaces; Clark, R. J. H., Hester, R. E., Eds.; Wiley: Chichester, U.K., 1988; pp 37-85.
40. Brahms, J.; Michelson, A. M.; Van Holde, K. E. J. Mol. Biol. 1966, 15, 467.
41. Holcomb, D. N.; Tinoco, I., Jr. Biopolymers 1965, 3, 121.
42. Poland, D.; Vournakis, J. N.; Scheraga, H. A. Biopolymers 1966, 4, 223.
43. Saenger, W.; Riecke, J.; Suck, D. J. Mol. Biol. 1975, 93, 529.
44. Suck, D.; Manor, P. C.; Saenger, W. Acta Crystallogr., Sect. B 1976, 32, 1727.